MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016843	GCA	3	9	263482	263490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973823
5002	NC_016843	TGC	2	6	263493	263498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973823
5003	NC_016843	TA	3	6	263501	263506	50 %	50 %	0 %	0 %	378973823
5004	NC_016843	GGTT	2	8	263530	263537	0 %	50 %	50 %	0 %	378973823
5005	NC_016843	AGC	2	6	263571	263576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973823
5006	NC_016843	AGT	2	6	263577	263582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973823
5007	NC_016843	CT	3	6	263643	263648	0 %	50 %	0 %	50 %	378973824
5008	NC_016843	GCG	2	6	263772	263777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973824
5009	NC_016843	GCT	2	6	263802	263807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973824
5010	NC_016843	AG	3	6	264017	264022	50 %	0 %	50 %	0 %	378973825
5011	NC_016843	GTT	2	6	264097	264102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973825
5012	NC_016843	G	6	6	264140	264145	0 %	0 %	100 %	0 %	378973825
5013	NC_016843	GCGT	2	8	264185	264192	0 %	25 %	50 %	25 %	378973825
5014	NC_016843	GGT	2	6	264228	264233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973825
5015	NC_016843	TG	3	6	264250	264255	0 %	50 %	50 %	0 %	378973825
5016	NC_016843	GTGCG	2	10	264287	264296	0 %	20 %	60 %	20 %	378973825
5017	NC_016843	TGT	2	6	264363	264368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973826
5018	NC_016843	CT	3	6	264395	264400	0 %	50 %	0 %	50 %	378973826
5019	NC_016843	CTC	2	6	264456	264461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973826
5020	NC_016843	G	7	7	264507	264513	0 %	0 %	100 %	0 %	378973826
5021	NC_016843	GCG	2	6	264614	264619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973826
5022	NC_016843	TGG	2	6	264640	264645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
5023	NC_016843	GCG	2	6	264658	264663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973826
5024	NC_016843	TG	3	6	264685	264690	0 %	50 %	50 %	0 %	378973826
5025	NC_016843	GT	3	6	264801	264806	0 %	50 %	50 %	0 %	378973826
5026	NC_016843	TGG	2	6	264822	264827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
5027	NC_016843	TG	3	6	264951	264956	0 %	50 %	50 %	0 %	378973826
5028	NC_016843	TGG	2	6	264986	264991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
5029	NC_016843	CGG	2	6	265057	265062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973826
5030	NC_016843	TGG	2	6	265143	265148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
5031	NC_016843	CAG	2	6	265208	265213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973826
5032	NC_016843	TAT	2	6	265270	265275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973826
5033	NC_016843	GAC	2	6	265283	265288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973826
5034	NC_016843	AAG	2	6	265295	265300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973826
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5036	NC_016843	GCG	2	6	265340	265345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973826
5037	NC_016843	CTT	2	6	265346	265351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973826
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5039	NC_016843	CTT	2	6	265465	265470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973826
5040	NC_016843	GC	3	6	265484	265489	0 %	0 %	50 %	50 %	378973826
5041	NC_016843	GTG	2	6	265602	265607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
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5043	NC_016843	GTGC	2	8	265718	265725	0 %	25 %	50 %	25 %	378973826
5044	NC_016843	TGG	2	6	265806	265811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
5045	NC_016843	CATGCG	2	12	265830	265841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973826
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5047	NC_016843	T	7	7	265877	265883	0 %	100 %	0 %	0 %	378973826
5048	NC_016843	ATTG	2	8	265903	265910	25 %	50 %	25 %	0 %	378973826
5049	NC_016843	TGG	2	6	265912	265917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973826
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5052	NC_016843	CG	3	6	266127	266132	0 %	0 %	50 %	50 %	378973827
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5055	NC_016843	GGGAA	2	10	266291	266300	40 %	0 %	60 %	0 %	378973827
5056	NC_016843	CGT	2	6	266356	266361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973827
5057	NC_016843	CGT	2	6	266621	266626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973828
5058	NC_016843	CGG	2	6	266720	266725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973828
5059	NC_016843	GAA	2	6	266729	266734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973828
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5063	NC_016843	TGAT	2	8	266896	266903	25 %	50 %	25 %	0 %	378973828
5064	NC_016843	ATGC	2	8	266922	266929	25 %	25 %	25 %	25 %	378973828
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5070	NC_016843	TC	3	6	267139	267144	0 %	50 %	0 %	50 %	378973828
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5093	NC_016843	T	6	6	268402	268407	0 %	100 %	0 %	0 %	378973829
5094	NC_016843	CAG	2	6	268433	268438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973829
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5096	NC_016843	GTT	2	6	268608	268613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973830
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5099	NC_016843	TGC	2	6	268663	268668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973830
5100	NC_016843	TTTTC	2	10	268670	268679	0 %	80 %	0 %	20 %	378973830
5101	NC_016843	TTA	2	6	268706	268711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973830
5102	NC_016843	CG	3	6	268712	268717	0 %	0 %	50 %	50 %	378973830
5103	NC_016843	TTTTTC	2	12	268825	268836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378973830
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5107	NC_016843	TGGC	2	8	268999	269006	0 %	25 %	50 %	25 %	378973830
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5109	NC_016843	GCC	2	6	269038	269043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973830
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5111	NC_016843	CTT	2	6	269077	269082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973830
5112	NC_016843	T	8	8	269081	269088	0 %	100 %	0 %	0 %	378973830
5113	NC_016843	T	6	6	269102	269107	0 %	100 %	0 %	0 %	378973830
5114	NC_016843	GT	3	6	269124	269129	0 %	50 %	50 %	0 %	378973830
5115	NC_016843	TG	3	6	269289	269294	0 %	50 %	50 %	0 %	378973831
5116	NC_016843	G	9	9	269302	269310	0 %	0 %	100 %	0 %	378973831
5117	NC_016843	GCA	2	6	269441	269446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973831
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5119	NC_016843	TGAC	2	8	269509	269516	25 %	25 %	25 %	25 %	378973831
5120	NC_016843	AGA	2	6	269582	269587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973831
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5122	NC_016843	CG	3	6	269623	269628	0 %	0 %	50 %	50 %	378973831
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5494	NC_016843	GCCG	2	8	295362	295369	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5495	NC_016843	ATC	2	6	295382	295387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973854
5496	NC_016843	AGC	2	6	295418	295423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973854
5497	NC_016843	GTC	2	6	295428	295433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973854
5498	NC_016843	GC	3	6	295452	295457	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5499	NC_016843	TTCT	2	8	295474	295481	0 %	75 %	0 %	25 %	378973854
5500	NC_016843	CGC	2	6	295498	295503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973854

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