MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016843	TCG	2	6	238851	238856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973803
4502	NC_016843	GAA	2	6	238877	238882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973803
4503	NC_016843	GTC	2	6	238893	238898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973803
4504	NC_016843	GCG	2	6	238940	238945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973803
4505	NC_016843	GCCG	2	8	238995	239002	0 %	0 %	50 %	50 %	378973803
4506	NC_016843	TCC	2	6	239052	239057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973803
4507	NC_016843	GCACA	2	10	239114	239123	40 %	0 %	20 %	40 %	378973803
4508	NC_016843	AAC	2	6	239131	239136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973803
4509	NC_016843	T	6	6	239165	239170	0 %	100 %	0 %	0 %	378973803
4510	NC_016843	GTT	2	6	239215	239220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973803
4511	NC_016843	GGA	2	6	239251	239256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973803
4512	NC_016843	TGC	2	6	239280	239285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973803
4513	NC_016843	CA	3	6	239301	239306	50 %	0 %	0 %	50 %	378973803
4514	NC_016843	CGTG	2	8	239379	239386	0 %	25 %	50 %	25 %	378973804
4515	NC_016843	TGC	2	6	239387	239392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4516	NC_016843	TTC	2	6	239480	239485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973804
4517	NC_016843	CTG	2	6	239488	239493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4518	NC_016843	GGT	2	6	239499	239504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973804
4519	NC_016843	ATC	2	6	239526	239531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973804
4520	NC_016843	TG	3	6	239605	239610	0 %	50 %	50 %	0 %	378973804
4521	NC_016843	TG	3	6	239626	239631	0 %	50 %	50 %	0 %	378973804
4522	NC_016843	GGT	2	6	239633	239638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973804
4523	NC_016843	TCT	2	6	239667	239672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973804
4524	NC_016843	CTT	2	6	239677	239682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973804
4525	NC_016843	GC	3	6	239766	239771	0 %	0 %	50 %	50 %	378973804
4526	NC_016843	GC	3	6	239822	239827	0 %	0 %	50 %	50 %	378973804
4527	NC_016843	TATC	2	8	239861	239868	25 %	50 %	0 %	25 %	378973804
4528	NC_016843	CTCA	2	8	239886	239893	25 %	25 %	0 %	50 %	378973804
4529	NC_016843	AGG	2	6	239905	239910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973804
4530	NC_016843	GGC	2	6	239933	239938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973804
4531	NC_016843	GGC	2	6	239983	239988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973804
4532	NC_016843	GAA	2	6	240078	240083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973804
4533	NC_016843	TGC	2	6	240217	240222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4534	NC_016843	G	6	6	240223	240228	0 %	0 %	100 %	0 %	378973804
4535	NC_016843	CGT	2	6	240234	240239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4536	NC_016843	G	8	8	240263	240270	0 %	0 %	100 %	0 %	378973804
4537	NC_016843	CCG	2	6	240273	240278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973804
4538	NC_016843	GGT	2	6	240287	240292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973804
4539	NC_016843	CT	3	6	240318	240323	0 %	50 %	0 %	50 %	378973804
4540	NC_016843	TGG	2	6	240331	240336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973804
4541	NC_016843	AGG	2	6	240355	240360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973804
4542	NC_016843	TCG	2	6	240389	240394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4543	NC_016843	GCAAT	2	10	240489	240498	40 %	20 %	20 %	20 %	378973804
4544	NC_016843	GGCA	2	8	240510	240517	25 %	0 %	50 %	25 %	378973804
4545	NC_016843	GCC	2	6	240524	240529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973804
4546	NC_016843	TCAT	2	8	240548	240555	25 %	50 %	0 %	25 %	378973804
4547	NC_016843	CGG	2	6	240569	240574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973804
4548	NC_016843	TGCGC	2	10	240650	240659	0 %	20 %	40 %	40 %	378973804
4549	NC_016843	GCA	2	6	240671	240676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4550	NC_016843	CG	3	6	240693	240698	0 %	0 %	50 %	50 %	378973804
4551	NC_016843	CGC	2	6	240815	240820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973804
4552	NC_016843	TGA	2	6	240838	240843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973804
4553	NC_016843	TCA	2	6	240889	240894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973804
4554	NC_016843	GGT	2	6	240923	240928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973804
4555	NC_016843	GT	3	6	240927	240932	0 %	50 %	50 %	0 %	378973804
4556	NC_016843	GCA	2	6	240935	240940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4557	NC_016843	GTTT	2	8	241022	241029	0 %	75 %	25 %	0 %	378973804
4558	NC_016843	GCA	2	6	241033	241038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4559	NC_016843	CGC	2	6	241061	241066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973804
4560	NC_016843	GT	3	6	241133	241138	0 %	50 %	50 %	0 %	378973804
4561	NC_016843	GGCA	2	8	241151	241158	25 %	0 %	50 %	25 %	378973804
4562	NC_016843	CTG	2	6	241176	241181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4563	NC_016843	CAT	2	6	241189	241194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973804
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4565	NC_016843	CAG	2	6	241206	241211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973804
4566	NC_016843	GC	3	6	241215	241220	0 %	0 %	50 %	50 %	378973804
4567	NC_016843	CGG	2	6	241246	241251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973804
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4570	NC_016843	GCGGGT	2	12	241476	241487	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378973805
4571	NC_016843	TGC	2	6	241568	241573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973805
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4578	NC_016843	TGCG	2	8	241769	241776	0 %	25 %	50 %	25 %	378973805
4579	NC_016843	CATA	2	8	241786	241793	50 %	25 %	0 %	25 %	378973805
4580	NC_016843	CG	3	6	241893	241898	0 %	0 %	50 %	50 %	378973805
4581	NC_016843	CGTG	2	8	241915	241922	0 %	25 %	50 %	25 %	378973805
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4587	NC_016843	GTATT	2	10	242471	242480	20 %	60 %	20 %	0 %	378973806
4588	NC_016843	TCC	2	6	242506	242511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973806
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4593	NC_016843	CGG	2	6	243087	243092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973807
4594	NC_016843	GCG	2	6	243127	243132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973807
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4602	NC_016843	AACG	2	8	243678	243685	50 %	0 %	25 %	25 %	378973809
4603	NC_016843	AAG	2	6	243739	243744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973809
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4605	NC_016843	TTG	2	6	243778	243783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973809
4606	NC_016843	GGA	2	6	243812	243817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973809
4607	NC_016843	GT	3	6	243820	243825	0 %	50 %	50 %	0 %	378973809
4608	NC_016843	T	6	6	243858	243863	0 %	100 %	0 %	0 %	378973809
4609	NC_016843	TTC	2	6	243867	243872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973809
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4611	NC_016843	T	6	6	243975	243980	0 %	100 %	0 %	0 %	378973809
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4623	NC_016843	GC	3	6	244547	244552	0 %	0 %	50 %	50 %	378973810
4624	NC_016843	TGC	2	6	244621	244626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973810
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4630	NC_016843	TGC	2	6	244935	244940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973811
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4644	NC_016843	CGTG	2	8	245523	245530	0 %	25 %	50 %	25 %	378973812
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4992	NC_016843	CG	3	6	262783	262788	0 %	0 %	50 %	50 %	378973823
4993	NC_016843	TGC	2	6	262804	262809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973823
4994	NC_016843	GTT	2	6	262885	262890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973823
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