MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016842	TGC	2	6	1058274	1058279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973494
21003	NC_016842	CTT	2	6	1058316	1058321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973494
21004	NC_016842	C	7	7	1058327	1058333	0 %	0 %	0 %	100 %	378973494
21005	NC_016842	C	6	6	1058379	1058384	0 %	0 %	0 %	100 %	378973494
21006	NC_016842	AGG	2	6	1058474	1058479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973494
21007	NC_016842	TCC	2	6	1058483	1058488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973494
21008	NC_016842	GC	3	6	1058568	1058573	0 %	0 %	50 %	50 %	378973494
21009	NC_016842	CTC	2	6	1058612	1058617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973494
21010	NC_016842	CT	3	6	1058641	1058646	0 %	50 %	0 %	50 %	378973494
21011	NC_016842	GAT	2	6	1058647	1058652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973494
21012	NC_016842	A	6	6	1058679	1058684	100 %	0 %	0 %	0 %	378973494
21013	NC_016842	CGTGC	2	10	1058758	1058767	0 %	20 %	40 %	40 %	378973494
21014	NC_016842	AGG	2	6	1058768	1058773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973494
21015	NC_016842	ACA	2	6	1058853	1058858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973494
21016	NC_016842	CGC	2	6	1058863	1058868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973494
21017	NC_016842	CAT	2	6	1058895	1058900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973494
21018	NC_016842	TGG	2	6	1058954	1058959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973494
21019	NC_016842	TGG	2	6	1058990	1058995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973494
21020	NC_016842	ATG	2	6	1059059	1059064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973494
21021	NC_016842	ACGC	2	8	1059085	1059092	25 %	0 %	25 %	50 %	378973494
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21024	NC_016842	GC	3	6	1059238	1059243	0 %	0 %	50 %	50 %	378973494
21025	NC_016842	GCT	2	6	1059290	1059295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973494
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21039	NC_016842	GC	3	6	1060299	1060304	0 %	0 %	50 %	50 %	378973496
21040	NC_016842	GC	3	6	1060318	1060323	0 %	0 %	50 %	50 %	378973496
21041	NC_016842	GGTGA	2	10	1060338	1060347	20 %	20 %	60 %	0 %	378973496
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21054	NC_016842	GGT	2	6	1060945	1060950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973497
21055	NC_016842	CTCA	2	8	1060952	1060959	25 %	25 %	0 %	50 %	378973497
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21057	NC_016842	CTG	2	6	1061108	1061113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973497
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21064	NC_016842	CG	4	8	1061511	1061518	0 %	0 %	50 %	50 %	378973497
21065	NC_016842	GTT	2	6	1061552	1061557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973497
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21073	NC_016842	TCCT	2	8	1061961	1061968	0 %	50 %	0 %	50 %	378973497
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21099	NC_016842	ATCG	2	8	1063550	1063557	25 %	25 %	25 %	25 %	378973499
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21103	NC_016842	GTA	2	6	1063998	1064003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973500
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21111	NC_016842	ATC	2	6	1064313	1064318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973500
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21473	NC_016842	TCC	2	6	1085580	1085585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973521
21474	NC_016842	AG	3	6	1085599	1085604	50 %	0 %	50 %	0 %	378973521
21475	NC_016842	TCA	2	6	1085658	1085663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973521
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21477	NC_016842	T	6	6	1085724	1085729	0 %	100 %	0 %	0 %	378973521
21478	NC_016842	CAGA	2	8	1085743	1085750	50 %	0 %	25 %	25 %	378973521
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21485	NC_016842	AGAA	2	8	1086048	1086055	75 %	0 %	25 %	0 %	378973521
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21491	NC_016842	ACGT	2	8	1086443	1086450	25 %	25 %	25 %	25 %	378973522
21492	NC_016842	GTA	2	6	1086461	1086466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973522
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