MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_016842	CCT	2	6	1009373	1009378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973445
20005	NC_016842	AC	3	6	1009399	1009404	50 %	0 %	0 %	50 %	378973445
20006	NC_016842	A	6	6	1009454	1009459	100 %	0 %	0 %	0 %	378973445
20007	NC_016842	GTAC	2	8	1009465	1009472	25 %	25 %	25 %	25 %	378973445
20008	NC_016842	TCC	2	6	1009474	1009479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973445
20009	NC_016842	ACA	2	6	1009489	1009494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973445
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20011	NC_016842	CG	3	6	1009577	1009582	0 %	0 %	50 %	50 %	378973445
20012	NC_016842	GT	3	6	1009615	1009620	0 %	50 %	50 %	0 %	378973445
20013	NC_016842	ACG	2	6	1009638	1009643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973445
20014	NC_016842	GCACA	2	10	1009691	1009700	40 %	0 %	20 %	40 %	378973445
20015	NC_016842	AGC	2	6	1009724	1009729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973445
20016	NC_016842	AGC	2	6	1009731	1009736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973445
20017	NC_016842	A	6	6	1009774	1009779	100 %	0 %	0 %	0 %	378973445
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20049	NC_016842	GAG	2	6	1011353	1011358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973449
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20051	NC_016842	C	6	6	1011505	1011510	0 %	0 %	0 %	100 %	378973449
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20053	NC_016842	GTA	2	6	1011605	1011610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973449
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20119	NC_016842	ATAA	2	8	1015281	1015288	75 %	25 %	0 %	0 %	378973452
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20133	NC_016842	CT	3	6	1015991	1015996	0 %	50 %	0 %	50 %	378973452
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20472	NC_016842	GA	3	6	1033888	1033893	50 %	0 %	50 %	0 %	378973470
20473	NC_016842	GTC	2	6	1033926	1033931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973470
20474	NC_016842	GC	3	6	1033942	1033947	0 %	0 %	50 %	50 %	378973470
20475	NC_016842	CG	3	6	1034026	1034031	0 %	0 %	50 %	50 %	378973470
20476	NC_016842	GCAC	2	8	1034066	1034073	25 %	0 %	25 %	50 %	378973470
20477	NC_016842	AAC	2	6	1034127	1034132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973470
20478	NC_016842	GAA	2	6	1034135	1034140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973470
20479	NC_016842	T	6	6	1034172	1034177	0 %	100 %	0 %	0 %	378973471
20480	NC_016842	CGT	2	6	1034200	1034205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973471
20481	NC_016842	ACG	3	9	1034214	1034222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973471
20482	NC_016842	CG	3	6	1034232	1034237	0 %	0 %	50 %	50 %	378973471
20483	NC_016842	CAC	2	6	1034240	1034245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973471
20484	NC_016842	GC	4	8	1034256	1034263	0 %	0 %	50 %	50 %	378973471
20485	NC_016842	TCC	2	6	1034326	1034331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973472
20486	NC_016842	CTC	2	6	1034410	1034415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973472
20487	NC_016842	GAG	2	6	1034418	1034423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973472
20488	NC_016842	GC	3	6	1034481	1034486	0 %	0 %	50 %	50 %	378973473
20489	NC_016842	CTT	2	6	1034563	1034568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973473
20490	NC_016842	A	7	7	1034574	1034580	100 %	0 %	0 %	0 %	378973473
20491	NC_016842	TGT	2	6	1034641	1034646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973473
20492	NC_016842	GCA	2	6	1034811	1034816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973473
20493	NC_016842	T	6	6	1034850	1034855	0 %	100 %	0 %	0 %	378973473
20494	NC_016842	GCAAC	2	10	1034899	1034908	40 %	0 %	20 %	40 %	378973473
20495	NC_016842	ACC	2	6	1034960	1034965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973473
20496	NC_016842	CCT	2	6	1035025	1035030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973473
20497	NC_016842	A	6	6	1035078	1035083	100 %	0 %	0 %	0 %	378973473
20498	NC_016842	GCC	2	6	1035091	1035096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973473
20499	NC_016842	ACC	2	6	1035117	1035122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973473
20500	NC_016842	GC	3	6	1035149	1035154	0 %	0 %	50 %	50 %	378973473

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