MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19504	NC_016842	ACC	2	6	986030	986035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973417
19505	NC_016842	TCC	2	6	986057	986062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973417
19506	NC_016842	AAAG	2	8	986091	986098	75 %	0 %	25 %	0 %	378973417
19507	NC_016842	CGC	2	6	986118	986123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973417
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19509	NC_016842	TCA	2	6	986203	986208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973417
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19511	NC_016842	CGC	2	6	986215	986220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973417
19512	NC_016842	CT	3	6	986253	986258	0 %	50 %	0 %	50 %	378973417
19513	NC_016842	CG	3	6	986339	986344	0 %	0 %	50 %	50 %	378973417
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19517	NC_016842	CAA	2	6	986482	986487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973417
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19555	NC_016842	TAC	2	6	988128	988133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973418
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19567	NC_016842	GCGCG	2	10	988559	988568	0 %	0 %	60 %	40 %	378973420
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19593	NC_016842	GA	3	6	989992	989997	50 %	0 %	50 %	0 %	378973423
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19610	NC_016842	GTA	2	6	990562	990567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973425
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19612	NC_016842	A	6	6	990611	990616	100 %	0 %	0 %	0 %	378973425
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19868	NC_016842	GCA	2	6	1002560	1002565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973440
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19873	NC_016842	CTA	2	6	1002731	1002736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973440
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19885	NC_016842	CG	3	6	1003038	1003043	0 %	0 %	50 %	50 %	378973440
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19933	NC_016842	CGT	2	6	1005307	1005312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973442
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19958	NC_016842	CG	3	6	1006560	1006565	0 %	0 %	50 %	50 %	378973442
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19962	NC_016842	A	6	6	1006751	1006756	100 %	0 %	0 %	0 %	378973442
19963	NC_016842	AGGT	2	8	1006761	1006768	25 %	25 %	50 %	0 %	378973442
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19967	NC_016842	GC	3	6	1006924	1006929	0 %	0 %	50 %	50 %	378973442
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19972	NC_016842	GGT	2	6	1007477	1007482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973444
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19975	NC_016842	CTT	2	6	1007605	1007610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973444
19976	NC_016842	A	6	6	1007639	1007644	100 %	0 %	0 %	0 %	378973444
19977	NC_016842	GGC	2	6	1007687	1007692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973444
19978	NC_016842	ATGG	2	8	1007695	1007702	25 %	25 %	50 %	0 %	378973444
19979	NC_016842	GGC	2	6	1007725	1007730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973444
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19982	NC_016842	GGC	2	6	1008009	1008014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973445
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