MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_016842	TTC	2	6	936301	936306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973372
18503	NC_016842	CT	3	6	936343	936348	0 %	50 %	0 %	50 %	378973372
18504	NC_016842	ACC	2	6	936427	936432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973372
18505	NC_016842	AGC	2	6	936470	936475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18506	NC_016842	ATC	2	6	936490	936495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973372
18507	NC_016842	TC	3	6	936519	936524	0 %	50 %	0 %	50 %	378973372
18508	NC_016842	GCA	2	6	936570	936575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18509	NC_016842	GTGG	2	8	936606	936613	0 %	25 %	75 %	0 %	378973372
18510	NC_016842	GAG	2	6	936640	936645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973372
18511	NC_016842	CCA	2	6	936671	936676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973372
18512	NC_016842	TGC	2	6	936745	936750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18513	NC_016842	CTG	2	6	936762	936767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18514	NC_016842	GTA	2	6	936773	936778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973372
18515	NC_016842	TGC	2	6	936781	936786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18516	NC_016842	GAA	2	6	936789	936794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973372
18517	NC_016842	GACA	2	8	936852	936859	50 %	0 %	25 %	25 %	378973372
18518	NC_016842	TGC	2	6	936863	936868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973372
18519	NC_016842	CCA	3	9	936920	936928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973372
18520	NC_016842	GAGTGG	2	12	937067	937078	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378973372
18521	NC_016842	GC	3	6	937087	937092	0 %	0 %	50 %	50 %	378973372
18522	NC_016842	CAG	2	6	937143	937148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973372
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18524	NC_016842	GCG	2	6	937311	937316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973374
18525	NC_016842	GT	4	8	937320	937327	0 %	50 %	50 %	0 %	378973374
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18528	NC_016842	CCT	2	6	937407	937412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973374
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18533	NC_016842	CGG	2	6	937650	937655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973374
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18536	NC_016842	CTT	2	6	937707	937712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973374
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18539	NC_016842	T	6	6	937762	937767	0 %	100 %	0 %	0 %	378973374
18540	NC_016842	CGGG	3	12	937815	937826	0 %	0 %	75 %	25 %	378973374
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18543	NC_016842	ACC	2	6	938051	938056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973374
18544	NC_016842	TCAA	2	8	938170	938177	50 %	25 %	0 %	25 %	378973374
18545	NC_016842	GCG	3	9	938216	938224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973374
18546	NC_016842	CTTGCG	2	12	938281	938292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973374
18547	NC_016842	GCG	2	6	938386	938391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973374
18548	NC_016842	CAG	2	6	938458	938463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973374
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18550	NC_016842	TCGTAT	2	12	938518	938529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973374
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18554	NC_016842	GCCGC	2	10	938805	938814	0 %	0 %	40 %	60 %	378973374
18555	NC_016842	A	6	6	938979	938984	100 %	0 %	0 %	0 %	378973375
18556	NC_016842	CGC	2	6	939114	939119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973375
18557	NC_016842	GC	4	8	939118	939125	0 %	0 %	50 %	50 %	378973375
18558	NC_016842	T	6	6	939150	939155	0 %	100 %	0 %	0 %	378973375
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18570	NC_016842	ACG	2	6	939734	939739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973375
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18988	NC_016842	ATA	2	6	961283	961288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973398
18989	NC_016842	TCA	2	6	961347	961352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973398
18990	NC_016842	TAA	2	6	961388	961393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973398
18991	NC_016842	CT	3	6	961403	961408	0 %	50 %	0 %	50 %	378973398
18992	NC_016842	GTATC	2	10	961427	961436	20 %	40 %	20 %	20 %	378973398
18993	NC_016842	A	6	6	961527	961532	100 %	0 %	0 %	0 %	378973398
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19000	NC_016842	TGC	2	6	961743	961748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973398

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