MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016842	CA	3	6	911805	911810	50 %	0 %	0 %	50 %	378973353
18003	NC_016842	TTTC	2	8	911967	911974	0 %	75 %	0 %	25 %	378973353
18004	NC_016842	AG	3	6	912055	912060	50 %	0 %	50 %	0 %	378973353
18005	NC_016842	CGC	2	6	912061	912066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973353
18006	NC_016842	ACTC	2	8	912084	912091	25 %	25 %	0 %	50 %	378973353
18007	NC_016842	AG	4	8	912289	912296	50 %	0 %	50 %	0 %	378973353
18008	NC_016842	ACCA	2	8	912300	912307	50 %	0 %	0 %	50 %	378973353
18009	NC_016842	GT	3	6	912322	912327	0 %	50 %	50 %	0 %	378973353
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18011	NC_016842	TTCG	2	8	912529	912536	0 %	50 %	25 %	25 %	378973354
18012	NC_016842	CTG	2	6	912572	912577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973354
18013	NC_016842	TGCA	2	8	912617	912624	25 %	25 %	25 %	25 %	378973354
18014	NC_016842	CTT	2	6	912631	912636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973354
18015	NC_016842	TG	3	6	912658	912663	0 %	50 %	50 %	0 %	378973354
18016	NC_016842	T	6	6	912792	912797	0 %	100 %	0 %	0 %	378973354
18017	NC_016842	T	6	6	912815	912820	0 %	100 %	0 %	0 %	378973354
18018	NC_016842	TCA	2	6	912852	912857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973354
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18022	NC_016842	TACC	2	8	913050	913057	25 %	25 %	0 %	50 %	378973354
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18035	NC_016842	T	6	6	913673	913678	0 %	100 %	0 %	0 %	378973354
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18040	NC_016842	TGC	2	6	914001	914006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973354
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18044	NC_016842	TCG	2	6	914127	914132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973354
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18046	NC_016842	AC	3	6	914159	914164	50 %	0 %	0 %	50 %	378973354
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18048	NC_016842	TGC	2	6	914226	914231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973354
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18051	NC_016842	TACCG	2	10	914396	914405	20 %	20 %	20 %	40 %	378973354
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18054	NC_016842	ACGC	2	8	914514	914521	25 %	0 %	25 %	50 %	378973354
18055	NC_016842	CTG	2	6	914591	914596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973354
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18057	NC_016842	C	6	6	914758	914763	0 %	0 %	0 %	100 %	378973355
18058	NC_016842	CCTC	2	8	914822	914829	0 %	25 %	0 %	75 %	378973355
18059	NC_016842	CACG	2	8	914858	914865	25 %	0 %	25 %	50 %	378973355
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18488	NC_016842	ACA	2	6	935850	935855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973371
18489	NC_016842	GC	3	6	935895	935900	0 %	0 %	50 %	50 %	378973372
18490	NC_016842	GGC	2	6	935927	935932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973372
18491	NC_016842	GCC	2	6	935944	935949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973372
18492	NC_016842	TTTCT	2	10	935950	935959	0 %	80 %	0 %	20 %	378973372
18493	NC_016842	CG	3	6	935961	935966	0 %	0 %	50 %	50 %	378973372
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18496	NC_016842	ACAT	2	8	936048	936055	50 %	25 %	0 %	25 %	378973372
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