MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016842	TCC	2	6	884910	884915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973325
17503	NC_016842	TCT	2	6	884974	884979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973325
17504	NC_016842	CGA	3	9	885050	885058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973325
17505	NC_016842	GC	3	6	885101	885106	0 %	0 %	50 %	50 %	378973325
17506	NC_016842	TTA	2	6	885124	885129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973325
17507	NC_016842	CGC	3	9	885161	885169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973325
17508	NC_016842	AC	3	6	885181	885186	50 %	0 %	0 %	50 %	378973325
17509	NC_016842	AAAACT	2	12	885190	885201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378973325
17510	NC_016842	T	6	6	885228	885233	0 %	100 %	0 %	0 %	378973326
17511	NC_016842	GAGGG	2	10	885241	885250	20 %	0 %	80 %	0 %	378973326
17512	NC_016842	TC	4	8	885257	885264	0 %	50 %	0 %	50 %	378973326
17513	NC_016842	GCTG	2	8	885304	885311	0 %	25 %	50 %	25 %	378973326
17514	NC_016842	GT	3	6	885317	885322	0 %	50 %	50 %	0 %	378973326
17515	NC_016842	CGT	2	6	885420	885425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973326
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17517	NC_016842	TGA	2	6	885474	885479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973328
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17519	NC_016842	CG	3	6	885641	885646	0 %	0 %	50 %	50 %	378973328
17520	NC_016842	CAAACA	2	12	885674	885685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973328
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17525	NC_016842	GC	3	6	885891	885896	0 %	0 %	50 %	50 %	378973328
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17537	NC_016842	CTGA	2	8	886656	886663	25 %	25 %	25 %	25 %	378973329
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17542	NC_016842	CA	3	6	886930	886935	50 %	0 %	0 %	50 %	378973329
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17546	NC_016842	TTTGA	2	10	887300	887309	20 %	60 %	20 %	0 %	378973330
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17549	NC_016842	A	7	7	887519	887525	100 %	0 %	0 %	0 %	378973330
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17569	NC_016842	ATGC	2	8	888456	888463	25 %	25 %	25 %	25 %	378973330
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17598	NC_016842	A	6	6	889923	889928	100 %	0 %	0 %	0 %	378973333
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17606	NC_016842	ACGCG	2	10	890360	890369	20 %	0 %	40 %	40 %	378973333
17607	NC_016842	TACG	2	8	890523	890530	25 %	25 %	25 %	25 %	378973334
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17621	NC_016842	TCA	2	6	891040	891045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973334
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17988	NC_016842	CAT	2	6	910798	910803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973352
17989	NC_016842	ACCCA	2	10	910828	910837	40 %	0 %	0 %	60 %	378973352
17990	NC_016842	TCA	2	6	910968	910973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973352
17991	NC_016842	CG	4	8	911061	911068	0 %	0 %	50 %	50 %	378973352
17992	NC_016842	GCGATA	2	12	911075	911086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378973352
17993	NC_016842	TGA	2	6	911093	911098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973352
17994	NC_016842	A	6	6	911126	911131	100 %	0 %	0 %	0 %	378973352
17995	NC_016842	CAA	2	6	911181	911186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973352
17996	NC_016842	AC	3	6	911383	911388	50 %	0 %	0 %	50 %	378973353
17997	NC_016842	CAA	2	6	911519	911524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973353
17998	NC_016842	GTAC	2	8	911674	911681	25 %	25 %	25 %	25 %	378973353
17999	NC_016842	TCGC	2	8	911698	911705	0 %	25 %	25 %	50 %	378973353
18000	NC_016842	CTG	2	6	911755	911760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973353

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