MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016842	CAC	2	6	857910	857915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973302
17003	NC_016842	CCA	2	6	857975	857980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973302
17004	NC_016842	ACA	2	6	857989	857994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973302
17005	NC_016842	CAA	2	6	858005	858010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973302
17006	NC_016842	ACA	2	6	858011	858016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973302
17007	NC_016842	CA	4	8	858101	858108	50 %	0 %	0 %	50 %	378973302
17008	NC_016842	GAG	2	6	858132	858137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973302
17009	NC_016842	ACGCC	2	10	858173	858182	20 %	0 %	20 %	60 %	378973302
17010	NC_016842	GGT	2	6	858255	858260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973302
17011	NC_016842	A	7	7	858271	858277	100 %	0 %	0 %	0 %	378973302
17012	NC_016842	ATT	2	6	858286	858291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973302
17013	NC_016842	GAG	2	6	858349	858354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973302
17014	NC_016842	ACTA	2	8	858372	858379	50 %	25 %	0 %	25 %	378973302
17015	NC_016842	CA	3	6	858455	858460	50 %	0 %	0 %	50 %	378973302
17016	NC_016842	AAG	2	6	858514	858519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973302
17017	NC_016842	GGC	2	6	858530	858535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973302
17018	NC_016842	ACAA	2	8	858544	858551	75 %	0 %	0 %	25 %	378973302
17019	NC_016842	ATT	2	6	858559	858564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973302
17020	NC_016842	CAC	2	6	858570	858575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973302
17021	NC_016842	CG	3	6	858699	858704	0 %	0 %	50 %	50 %	378973302
17022	NC_016842	ACT	2	6	858729	858734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973302
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17024	NC_016842	CG	3	6	858785	858790	0 %	0 %	50 %	50 %	378973302
17025	NC_016842	AGACT	2	10	858791	858800	40 %	20 %	20 %	20 %	378973302
17026	NC_016842	TCA	2	6	858871	858876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973302
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17028	NC_016842	ATA	2	6	858895	858900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973302
17029	NC_016842	GA	3	6	858940	858945	50 %	0 %	50 %	0 %	378973302
17030	NC_016842	AAGA	2	8	859008	859015	75 %	0 %	25 %	0 %	378973302
17031	NC_016842	ACG	2	6	859024	859029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973302
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17033	NC_016842	AGCGT	2	10	859154	859163	20 %	20 %	40 %	20 %	378973302
17034	NC_016842	A	6	6	859179	859184	100 %	0 %	0 %	0 %	378973302
17035	NC_016842	GC	3	6	859193	859198	0 %	0 %	50 %	50 %	378973302
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17040	NC_016842	ATC	2	6	859681	859686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973303
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17042	NC_016842	AC	3	6	859728	859733	50 %	0 %	0 %	50 %	378973304
17043	NC_016842	GTCC	2	8	859740	859747	0 %	25 %	25 %	50 %	378973304
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17046	NC_016842	ACC	2	6	859924	859929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973304
17047	NC_016842	GGC	2	6	859965	859970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973304
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17049	NC_016842	TC	3	6	860018	860023	0 %	50 %	0 %	50 %	378973304
17050	NC_016842	GCCA	2	8	860050	860057	25 %	0 %	25 %	50 %	378973304
17051	NC_016842	CG	3	6	860097	860102	0 %	0 %	50 %	50 %	378973304
17052	NC_016842	TAA	2	6	860307	860312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973304
17053	NC_016842	GC	3	6	860316	860321	0 %	0 %	50 %	50 %	378973304
17054	NC_016842	AGC	2	6	860394	860399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973304
17055	NC_016842	TGG	2	6	860438	860443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973304
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17058	NC_016842	TAT	2	6	860812	860817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973305
17059	NC_016842	GCTC	2	8	860868	860875	0 %	25 %	25 %	50 %	378973305
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17062	NC_016842	T	6	6	860910	860915	0 %	100 %	0 %	0 %	378973305
17063	NC_016842	CGC	3	9	860916	860924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973305
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17065	NC_016842	GCT	2	6	861054	861059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973305
17066	NC_016842	GA	3	6	861065	861070	50 %	0 %	50 %	0 %	378973305
17067	NC_016842	CAT	2	6	861093	861098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973305
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17069	NC_016842	CA	3	6	861152	861157	50 %	0 %	0 %	50 %	378973305
17070	NC_016842	CG	3	6	861158	861163	0 %	0 %	50 %	50 %	378973305
17071	NC_016842	GAT	2	6	861334	861339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973305
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17073	NC_016842	TTCA	2	8	861404	861411	25 %	50 %	0 %	25 %	378973305
17074	NC_016842	TAC	2	6	861490	861495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973305
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17077	NC_016842	CAT	3	9	861568	861576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973305
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17081	NC_016842	CGG	2	6	861638	861643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973305
17082	NC_016842	AAGA	2	8	861670	861677	75 %	0 %	25 %	0 %	378973305
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17084	NC_016842	A	6	6	861709	861714	100 %	0 %	0 %	0 %	378973305
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17092	NC_016842	CAG	2	6	862156	862161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973305
17093	NC_016842	ATC	2	6	862201	862206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973305
17094	NC_016842	AG	3	6	862291	862296	50 %	0 %	50 %	0 %	378973306
17095	NC_016842	CA	3	6	862407	862412	50 %	0 %	0 %	50 %	378973306
17096	NC_016842	GT	3	6	862468	862473	0 %	50 %	50 %	0 %	378973306
17097	NC_016842	TG	3	6	862476	862481	0 %	50 %	50 %	0 %	378973306
17098	NC_016842	GC	4	8	862490	862497	0 %	0 %	50 %	50 %	378973306
17099	NC_016842	T	6	6	862598	862603	0 %	100 %	0 %	0 %	378973306
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17102	NC_016842	GAT	2	6	862708	862713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973306
17103	NC_016842	A	7	7	862780	862786	100 %	0 %	0 %	0 %	378973306
17104	NC_016842	TGC	2	6	862886	862891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973306
17105	NC_016842	GCA	2	6	863006	863011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973306
17106	NC_016842	GC	3	6	863028	863033	0 %	0 %	50 %	50 %	378973306
17107	NC_016842	G	6	6	863040	863045	0 %	0 %	100 %	0 %	378973306
17108	NC_016842	TGA	3	9	863171	863179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973306
17109	NC_016842	CGCA	2	8	863340	863347	25 %	0 %	25 %	50 %	378973306
17110	NC_016842	CTCA	2	8	863428	863435	25 %	25 %	0 %	50 %	378973306
17111	NC_016842	A	6	6	863449	863454	100 %	0 %	0 %	0 %	378973306
17112	NC_016842	GCGCT	2	10	863539	863548	0 %	20 %	40 %	40 %	378973307
17113	NC_016842	CGCA	2	8	863587	863594	25 %	0 %	25 %	50 %	378973307
17114	NC_016842	CA	4	8	863600	863607	50 %	0 %	0 %	50 %	378973307
17115	NC_016842	ATG	2	6	863610	863615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973307
17116	NC_016842	T	6	6	863633	863638	0 %	100 %	0 %	0 %	378973307
17117	NC_016842	AC	3	6	863639	863644	50 %	0 %	0 %	50 %	378973307
17118	NC_016842	CACG	2	8	863696	863703	25 %	0 %	25 %	50 %	378973308
17119	NC_016842	GC	3	6	863725	863730	0 %	0 %	50 %	50 %	378973308
17120	NC_016842	GCATCT	2	12	863833	863844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973308
17121	NC_016842	GT	3	6	863884	863889	0 %	50 %	50 %	0 %	378973308
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17123	NC_016842	ATG	2	6	863919	863924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973308
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17241	NC_016842	CAG	2	6	869321	869326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973313
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17245	NC_016842	ATTCC	2	10	869444	869453	20 %	40 %	0 %	40 %	378973313
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17491	NC_016842	CGCAG	2	10	884327	884336	20 %	0 %	40 %	40 %	378973325
17492	NC_016842	GGT	2	6	884388	884393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973325
17493	NC_016842	GCAG	2	8	884480	884487	25 %	0 %	50 %	25 %	378973325
17494	NC_016842	GAA	2	6	884514	884519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973325
17495	NC_016842	GAGT	2	8	884642	884649	25 %	25 %	50 %	0 %	378973325
17496	NC_016842	CTT	2	6	884693	884698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973325
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17499	NC_016842	TGA	2	6	884744	884749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973325
17500	NC_016842	GAT	2	6	884786	884791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973325

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