MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_016842	ACA	3	9	784464	784472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
15503	NC_016842	AAG	2	6	784473	784478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973222
15504	NC_016842	GCAA	2	8	784487	784494	50 %	0 %	25 %	25 %	378973222
15505	NC_016842	TGC	2	6	784531	784536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973222
15506	NC_016842	CCCT	2	8	784544	784551	0 %	25 %	0 %	75 %	378973222
15507	NC_016842	TAA	2	6	784599	784604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973222
15508	NC_016842	TCCA	2	8	784645	784652	25 %	25 %	0 %	50 %	378973222
15509	NC_016842	A	7	7	784660	784666	100 %	0 %	0 %	0 %	378973222
15510	NC_016842	CTT	3	9	784704	784712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973222
15511	NC_016842	GCA	2	6	784787	784792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973222
15512	NC_016842	TAA	2	6	784821	784826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973222
15513	NC_016842	ATG	2	6	784850	784855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973222
15514	NC_016842	TCC	2	6	784894	784899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973222
15515	NC_016842	CAC	2	6	784900	784905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973222
15516	NC_016842	AGTCCA	2	12	784985	784996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973222
15517	NC_016842	CAA	2	6	785011	785016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
15518	NC_016842	CAA	2	6	785052	785057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
15519	NC_016842	AAGAT	2	10	785087	785096	60 %	20 %	20 %	0 %	378973222
15520	NC_016842	AAC	2	6	785137	785142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973222
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15529	NC_016842	CTT	2	6	785662	785667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973223
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15535	NC_016842	A	6	6	785829	785834	100 %	0 %	0 %	0 %	378973223
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15537	NC_016842	A	7	7	785888	785894	100 %	0 %	0 %	0 %	378973223
15538	NC_016842	A	6	6	785905	785910	100 %	0 %	0 %	0 %	378973223
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15541	NC_016842	TGGA	2	8	786085	786092	25 %	25 %	50 %	0 %	378973223
15542	NC_016842	GTA	2	6	786097	786102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973223
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15544	NC_016842	GCAA	2	8	786157	786164	50 %	0 %	25 %	25 %	378973223
15545	NC_016842	CTT	2	6	786233	786238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973223
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15551	NC_016842	GAA	2	6	786445	786450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973224
15552	NC_016842	AAAC	2	8	786463	786470	75 %	0 %	0 %	25 %	378973224
15553	NC_016842	AG	3	6	786500	786505	50 %	0 %	50 %	0 %	378973224
15554	NC_016842	TAA	2	6	786533	786538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973224
15555	NC_016842	A	7	7	786603	786609	100 %	0 %	0 %	0 %	378973224
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15559	NC_016842	CCT	2	6	786702	786707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973224
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15561	NC_016842	A	7	7	786844	786850	100 %	0 %	0 %	0 %	378973224
15562	NC_016842	TAA	2	6	786886	786891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973224
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15571	NC_016842	GAG	2	6	787253	787258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973225
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15590	NC_016842	ACGC	2	8	788262	788269	25 %	0 %	25 %	50 %	378973226
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15594	NC_016842	CG	4	8	788397	788404	0 %	0 %	50 %	50 %	378973227
15595	NC_016842	GC	3	6	788413	788418	0 %	0 %	50 %	50 %	378973227
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15599	NC_016842	GC	3	6	788582	788587	0 %	0 %	50 %	50 %	378973227
15600	NC_016842	GC	3	6	788634	788639	0 %	0 %	50 %	50 %	378973227
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15606	NC_016842	CG	3	6	788831	788836	0 %	0 %	50 %	50 %	378973227
15607	NC_016842	GCT	2	6	788850	788855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973227
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15610	NC_016842	GA	3	6	789033	789038	50 %	0 %	50 %	0 %	378973227
15611	NC_016842	TCA	2	6	789066	789071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973227
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15868	NC_016842	GGT	2	6	801812	801817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973242
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15987	NC_016842	TAACGT	2	12	807171	807182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973248
15988	NC_016842	CGC	2	6	807204	807209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973248
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