MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016842	GC	3	6	704893	704898	0 %	0 %	50 %	50 %	378973150
14003	NC_016842	GC	3	6	704900	704905	0 %	0 %	50 %	50 %	378973150
14004	NC_016842	CA	3	6	704954	704959	50 %	0 %	0 %	50 %	378973150
14005	NC_016842	CTG	2	6	704960	704965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973150
14006	NC_016842	CAGTA	2	10	705041	705050	40 %	20 %	20 %	20 %	378973150
14007	NC_016842	ACG	2	6	705128	705133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973150
14008	NC_016842	A	7	7	705158	705164	100 %	0 %	0 %	0 %	378973150
14009	NC_016842	GAA	2	6	705172	705177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973150
14010	NC_016842	TGA	2	6	705261	705266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973150
14011	NC_016842	GTC	2	6	705462	705467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973150
14012	NC_016842	AGA	2	6	705477	705482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973150
14013	NC_016842	GT	3	6	705596	705601	0 %	50 %	50 %	0 %	378973150
14014	NC_016842	AACAA	2	10	705668	705677	80 %	0 %	0 %	20 %	378973150
14015	NC_016842	CG	3	6	705684	705689	0 %	0 %	50 %	50 %	378973150
14016	NC_016842	GTT	2	6	705709	705714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973150
14017	NC_016842	GCAC	2	8	705739	705746	25 %	0 %	25 %	50 %	378973150
14018	NC_016842	GT	3	6	705759	705764	0 %	50 %	50 %	0 %	378973150
14019	NC_016842	GAA	2	6	705850	705855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973150
14020	NC_016842	GA	3	6	705885	705890	50 %	0 %	50 %	0 %	378973150
14021	NC_016842	CGC	2	6	705906	705911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973150
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14023	NC_016842	GATC	2	8	705963	705970	25 %	25 %	25 %	25 %	378973150
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14026	NC_016842	AT	4	8	706133	706140	50 %	50 %	0 %	0 %	378973150
14027	NC_016842	CTTT	2	8	706186	706193	0 %	75 %	0 %	25 %	378973150
14028	NC_016842	TGC	2	6	706208	706213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973150
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14031	NC_016842	ATC	2	6	706285	706290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973150
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14034	NC_016842	AAC	2	6	706448	706453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973151
14035	NC_016842	AGA	3	9	706466	706474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973151
14036	NC_016842	TAT	2	6	706517	706522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973151
14037	NC_016842	GC	3	6	706524	706529	0 %	0 %	50 %	50 %	378973151
14038	NC_016842	CGA	2	6	706595	706600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973151
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14042	NC_016842	TACG	2	8	706763	706770	25 %	25 %	25 %	25 %	378973151
14043	NC_016842	GCA	2	6	706857	706862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973151
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14045	NC_016842	CAC	2	6	706920	706925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973151
14046	NC_016842	CAAA	2	8	706928	706935	75 %	0 %	0 %	25 %	378973151
14047	NC_016842	A	7	7	706973	706979	100 %	0 %	0 %	0 %	378973151
14048	NC_016842	ACTG	2	8	707007	707014	25 %	25 %	25 %	25 %	378973151
14049	NC_016842	TCTG	2	8	707164	707171	0 %	50 %	25 %	25 %	378973152
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14052	NC_016842	TCT	2	6	707295	707300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973152
14053	NC_016842	AATT	2	8	707440	707447	50 %	50 %	0 %	0 %	378973152
14054	NC_016842	AT	3	6	707452	707457	50 %	50 %	0 %	0 %	378973152
14055	NC_016842	CGG	2	6	707495	707500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973152
14056	NC_016842	ATG	2	6	707870	707875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973152
14057	NC_016842	GTG	2	6	708042	708047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973152
14058	NC_016842	TGC	2	6	708108	708113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973152
14059	NC_016842	TACC	2	8	708235	708242	25 %	25 %	0 %	50 %	378973152
14060	NC_016842	CG	3	6	708279	708284	0 %	0 %	50 %	50 %	378973152
14061	NC_016842	CTG	2	6	708296	708301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973152
14062	NC_016842	TC	3	6	708475	708480	0 %	50 %	0 %	50 %	378973152
14063	NC_016842	AGCCA	2	10	708651	708660	40 %	0 %	20 %	40 %	378973153
14064	NC_016842	AC	3	6	708716	708721	50 %	0 %	0 %	50 %	378973153
14065	NC_016842	TGCG	2	8	708798	708805	0 %	25 %	50 %	25 %	378973153
14066	NC_016842	CG	3	6	708815	708820	0 %	0 %	50 %	50 %	378973153
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14071	NC_016842	TGC	2	6	709108	709113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973154
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14073	NC_016842	AG	3	6	709228	709233	50 %	0 %	50 %	0 %	378973154
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14081	NC_016842	CTG	2	6	709563	709568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973154
14082	NC_016842	GCAT	2	8	709576	709583	25 %	25 %	25 %	25 %	378973154
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14093	NC_016842	A	6	6	710079	710084	100 %	0 %	0 %	0 %	378973154
14094	NC_016842	AGC	2	6	710210	710215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973155
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14103	NC_016842	CA	3	6	710787	710792	50 %	0 %	0 %	50 %	378973155
14104	NC_016842	CAAAC	2	10	710857	710866	60 %	0 %	0 %	40 %	378973155
14105	NC_016842	AGC	2	6	710885	710890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973155
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14107	NC_016842	GC	3	6	710968	710973	0 %	0 %	50 %	50 %	378973155
14108	NC_016842	CGCT	2	8	711140	711147	0 %	25 %	25 %	50 %	378973155
14109	NC_016842	AC	3	6	711185	711190	50 %	0 %	0 %	50 %	378973155
14110	NC_016842	TGCA	2	8	711322	711329	25 %	25 %	25 %	25 %	378973155
14111	NC_016842	TC	3	6	711369	711374	0 %	50 %	0 %	50 %	378973155
14112	NC_016842	TAA	2	6	711375	711380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973155
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14117	NC_016842	GA	3	6	711722	711727	50 %	0 %	50 %	0 %	378973156
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14119	NC_016842	AC	3	6	711847	711852	50 %	0 %	0 %	50 %	378973156
14120	NC_016842	GT	3	6	711891	711896	0 %	50 %	50 %	0 %	378973156
14121	NC_016842	ACGC	2	8	711932	711939	25 %	0 %	25 %	50 %	378973156
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14123	NC_016842	ATC	2	6	711983	711988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973156
14124	NC_016842	CG	3	6	712035	712040	0 %	0 %	50 %	50 %	378973156
14125	NC_016842	AGAA	2	8	712098	712105	75 %	0 %	25 %	0 %	378973156
14126	NC_016842	ATGCA	2	10	712121	712130	40 %	20 %	20 %	20 %	378973156
14127	NC_016842	CAGGAT	2	12	712135	712146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378973156
14128	NC_016842	A	6	6	712150	712155	100 %	0 %	0 %	0 %	378973156
14129	NC_016842	TCT	2	6	712231	712236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973156
14130	NC_016842	CAT	2	6	712252	712257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973156
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14134	NC_016842	CG	3	6	712434	712439	0 %	0 %	50 %	50 %	378973156
14135	NC_016842	TCT	2	6	712521	712526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973156
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14137	NC_016842	CGCGC	2	10	712703	712712	0 %	0 %	40 %	60 %	378973156
14138	NC_016842	CTG	2	6	712723	712728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973156
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14141	NC_016842	ACGT	2	8	712884	712891	25 %	25 %	25 %	25 %	378973156
14142	NC_016842	ACA	2	6	712939	712944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973156
14143	NC_016842	GCT	2	6	712977	712982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973156
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14145	NC_016842	GC	3	6	713069	713074	0 %	0 %	50 %	50 %	378973156
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14155	NC_016842	TCC	2	6	713722	713727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973157
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14244	NC_016842	TGG	2	6	719137	719142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973161
14245	NC_016842	G	7	7	719247	719253	0 %	0 %	100 %	0 %	378973161
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14250	NC_016842	CTG	2	6	719387	719392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973162
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14252	NC_016842	GGC	2	6	719400	719405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973162
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14260	NC_016842	GC	3	6	719748	719753	0 %	0 %	50 %	50 %	378973162
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14271	NC_016842	ACT	2	6	720147	720152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973162
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14273	NC_016842	TTCT	2	8	720214	720221	0 %	75 %	0 %	25 %	378973163
14274	NC_016842	TC	3	6	720230	720235	0 %	50 %	0 %	50 %	378973163
14275	NC_016842	CCTGTA	2	12	720275	720286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973163
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14282	NC_016842	TAT	2	6	720576	720581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973163
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14333	NC_016842	TGA	2	6	723271	723276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973167
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14344	NC_016842	CT	3	6	723730	723735	0 %	50 %	0 %	50 %	378973167
14345	NC_016842	TGC	2	6	723764	723769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973167
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14348	NC_016842	CCA	2	6	723931	723936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973167
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14350	NC_016842	GGC	2	6	723956	723961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973167
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14352	NC_016842	CCCATC	2	12	724085	724096	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378973167
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14354	NC_016842	A	7	7	724142	724148	100 %	0 %	0 %	0 %	378973167
14355	NC_016842	CAC	2	6	724331	724336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973167
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14357	NC_016842	CTCATC	2	12	724436	724447	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378973167
14358	NC_016842	CCA	2	6	724489	724494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973167
14359	NC_016842	TGA	3	9	724662	724670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973167
14360	NC_016842	ACAG	2	8	724737	724744	50 %	0 %	25 %	25 %	378973167
14361	NC_016842	GCCA	2	8	724750	724757	25 %	0 %	25 %	50 %	378973167
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14363	NC_016842	GTCT	2	8	724865	724872	0 %	50 %	25 %	25 %	378973167
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14482	NC_016842	A	6	6	730807	730812	100 %	0 %	0 %	0 %	378973174
14483	NC_016842	ATG	2	6	730876	730881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973174
14484	NC_016842	GCAC	2	8	731017	731024	25 %	0 %	25 %	50 %	378973174
14485	NC_016842	CGGTA	2	10	731028	731037	20 %	20 %	40 %	20 %	378973174
14486	NC_016842	C	6	6	731045	731050	0 %	0 %	0 %	100 %	378973174
14487	NC_016842	TGGCA	2	10	731201	731210	20 %	20 %	40 %	20 %	378973174
14488	NC_016842	A	6	6	731260	731265	100 %	0 %	0 %	0 %	378973174
14489	NC_016842	CG	3	6	731280	731285	0 %	0 %	50 %	50 %	378973174
14490	NC_016842	CCA	2	6	731318	731323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973174
14491	NC_016842	CAC	2	6	731634	731639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973175
14492	NC_016842	A	7	7	731649	731655	100 %	0 %	0 %	0 %	378973175
14493	NC_016842	CG	3	6	731668	731673	0 %	0 %	50 %	50 %	378973175
14494	NC_016842	AC	3	6	731689	731694	50 %	0 %	0 %	50 %	378973175
14495	NC_016842	CAT	2	6	731778	731783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973175
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14497	NC_016842	CAGCAT	2	12	731892	731903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973175
14498	NC_016842	GCA	2	6	731906	731911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973175
14499	NC_016842	ACCGA	2	10	731929	731938	40 %	0 %	20 %	40 %	378973175
14500	NC_016842	GA	3	6	732118	732123	50 %	0 %	50 %	0 %	378973175

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