MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_016842	CAG	2	6	559540	559545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973023
11004	NC_016842	T	6	6	559609	559614	0 %	100 %	0 %	0 %	378973023
11005	NC_016842	T	6	6	559640	559645	0 %	100 %	0 %	0 %	378973023
11006	NC_016842	TGT	2	6	559683	559688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973023
11007	NC_016842	AC	3	6	559725	559730	50 %	0 %	0 %	50 %	378973023
11008	NC_016842	AT	3	6	559790	559795	50 %	50 %	0 %	0 %	378973023
11009	NC_016842	GCA	2	6	559839	559844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973023
11010	NC_016842	ATG	2	6	559959	559964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973023
11011	NC_016842	TGA	2	6	560030	560035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973024
11012	NC_016842	GCT	2	6	560113	560118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973024
11013	NC_016842	GAAA	3	12	560217	560228	75 %	0 %	25 %	0 %	378973024
11014	NC_016842	AAG	2	6	560229	560234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973024
11015	NC_016842	TAT	2	6	560235	560240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973024
11016	NC_016842	CTC	2	6	560244	560249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973024
11017	NC_016842	TGT	2	6	560261	560266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973024
11018	NC_016842	CGA	2	6	560391	560396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973024
11019	NC_016842	TCG	2	6	560405	560410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973024
11020	NC_016842	TCAGTA	2	12	560444	560455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973024
11021	NC_016842	GT	3	6	560479	560484	0 %	50 %	50 %	0 %	378973024
11022	NC_016842	GCAG	2	8	560618	560625	25 %	0 %	50 %	25 %	378973024
11023	NC_016842	TGC	2	6	560694	560699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973025
11024	NC_016842	TAGA	2	8	560742	560749	50 %	25 %	25 %	0 %	378973025
11025	NC_016842	TTA	2	6	560791	560796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973025
11026	NC_016842	GGA	2	6	560819	560824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973025
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11028	NC_016842	GA	3	6	560889	560894	50 %	0 %	50 %	0 %	378973025
11029	NC_016842	GA	3	6	560908	560913	50 %	0 %	50 %	0 %	378973025
11030	NC_016842	GTGCA	2	10	561006	561015	20 %	20 %	40 %	20 %	378973025
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11032	NC_016842	TCT	2	6	561058	561063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973025
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11034	NC_016842	CGCAG	2	10	561118	561127	20 %	0 %	40 %	40 %	378973025
11035	NC_016842	TAA	2	6	561157	561162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973025
11036	NC_016842	TCT	2	6	561193	561198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973025
11037	NC_016842	TTG	2	6	561212	561217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973025
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11039	NC_016842	AGT	2	6	561295	561300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973025
11040	NC_016842	TACT	2	8	561317	561324	25 %	50 %	0 %	25 %	378973025
11041	NC_016842	TCA	2	6	561334	561339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973025
11042	NC_016842	AAG	2	6	561455	561460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973025
11043	NC_016842	TTAA	2	8	561472	561479	50 %	50 %	0 %	0 %	378973025
11044	NC_016842	GGC	2	6	561576	561581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973025
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11046	NC_016842	TTTG	2	8	561662	561669	0 %	75 %	25 %	0 %	378973025
11047	NC_016842	A	6	6	561760	561765	100 %	0 %	0 %	0 %	378973025
11048	NC_016842	AAT	2	6	561825	561830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973025
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11050	NC_016842	ATA	2	6	561910	561915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973025
11051	NC_016842	T	7	7	562024	562030	0 %	100 %	0 %	0 %	378973025
11052	NC_016842	CAT	2	6	562031	562036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973025
11053	NC_016842	TC	3	6	563253	563258	0 %	50 %	0 %	50 %	378973026
11054	NC_016842	GAT	2	6	563262	563267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973026
11055	NC_016842	GT	3	6	563276	563281	0 %	50 %	50 %	0 %	378973026
11056	NC_016842	TG	3	6	563361	563366	0 %	50 %	50 %	0 %	378973026
11057	NC_016842	GGT	2	6	563398	563403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973026
11058	NC_016842	A	7	7	563441	563447	100 %	0 %	0 %	0 %	378973026
11059	NC_016842	A	6	6	563480	563485	100 %	0 %	0 %	0 %	378973026
11060	NC_016842	TACC	2	8	563538	563545	25 %	25 %	0 %	50 %	378973026
11061	NC_016842	ATG	2	6	563564	563569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973026
11062	NC_016842	CA	3	6	563594	563599	50 %	0 %	0 %	50 %	378973026
11063	NC_016842	TG	3	6	563684	563689	0 %	50 %	50 %	0 %	378973026
11064	NC_016842	T	6	6	563690	563695	0 %	100 %	0 %	0 %	378973026
11065	NC_016842	TCGG	2	8	563699	563706	0 %	25 %	50 %	25 %	378973026
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11068	NC_016842	TTC	2	6	563854	563859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973026
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11073	NC_016842	ATC	2	6	564154	564159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973026
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11089	NC_016842	CG	3	6	564739	564744	0 %	0 %	50 %	50 %	378973027
11090	NC_016842	GGA	2	6	564769	564774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973027
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11093	NC_016842	CAA	2	6	564892	564897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973027
11094	NC_016842	CTG	2	6	564898	564903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973027
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11100	NC_016842	GT	3	6	565083	565088	0 %	50 %	50 %	0 %	378973028
11101	NC_016842	AGGA	2	8	565122	565129	50 %	0 %	50 %	0 %	378973028
11102	NC_016842	GCA	2	6	565196	565201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973028
11103	NC_016842	GA	3	6	565326	565331	50 %	0 %	50 %	0 %	378973028
11104	NC_016842	TGAA	2	8	565373	565380	50 %	25 %	25 %	0 %	378973028
11105	NC_016842	AAGG	2	8	565492	565499	50 %	0 %	50 %	0 %	378973028
11106	NC_016842	CG	3	6	565517	565522	0 %	0 %	50 %	50 %	378973028
11107	NC_016842	TCC	2	6	565546	565551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973028
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11109	NC_016842	A	8	8	565620	565627	100 %	0 %	0 %	0 %	378973028
11110	NC_016842	CTG	2	6	565659	565664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973028
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11112	NC_016842	CCCT	2	8	565834	565841	0 %	25 %	0 %	75 %	378973028
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11123	NC_016842	GA	3	6	566248	566253	50 %	0 %	50 %	0 %	378973029
11124	NC_016842	CTT	2	6	566296	566301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973029
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11131	NC_016842	GC	3	6	566567	566572	0 %	0 %	50 %	50 %	378973029
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11235	NC_016842	A	7	7	571510	571516	100 %	0 %	0 %	0 %	378973032
11236	NC_016842	GCACG	2	10	571569	571578	20 %	0 %	40 %	40 %	378973032
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11241	NC_016842	GC	3	6	571743	571748	0 %	0 %	50 %	50 %	378973033
11242	NC_016842	CTC	2	6	571788	571793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973033
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11244	NC_016842	TCC	2	6	571957	571962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973033
11245	NC_016842	GCA	2	6	571996	572001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973033
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11247	NC_016842	GCA	2	6	572113	572118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973033
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11253	NC_016842	TGG	2	6	572324	572329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973033
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11365	NC_016842	AC	3	6	578001	578006	50 %	0 %	0 %	50 %	378973038
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11368	NC_016842	AGC	2	6	578218	578223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973038
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11370	NC_016842	CGAGC	2	10	578247	578256	20 %	0 %	40 %	40 %	378973038
11371	NC_016842	CGTG	2	8	578353	578360	0 %	25 %	50 %	25 %	378973038
11372	NC_016842	CTG	2	6	578385	578390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973038
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11489	NC_016842	CG	3	6	584072	584077	0 %	0 %	50 %	50 %	378973049
11490	NC_016842	TTGC	2	8	584080	584087	0 %	50 %	25 %	25 %	378973049
11491	NC_016842	CGA	2	6	584127	584132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973049
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11493	NC_016842	TGC	2	6	584162	584167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973049
11494	NC_016842	CGC	2	6	584196	584201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973049
11495	NC_016842	CTG	2	6	584216	584221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973049
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