MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 plasmid pTLIE01

Total Repeats: 529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016149	TTC	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418825
2	NC_016149	ACG	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418825
3	NC_016149	CAG	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418825
4	NC_016149	GTA	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418825
5	NC_016149	GAG	2	6	449	454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418825
6	NC_016149	AGG	2	6	500	505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418825
7	NC_016149	GA	3	6	529	534	50 %	0 %	50 %	0 %	357418825
8	NC_016149	T	6	6	562	567	0 %	100 %	0 %	0 %	357418825
9	NC_016149	GAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418825
10	NC_016149	TG	3	6	635	640	0 %	50 %	50 %	0 %	357418825
11	NC_016149	G	6	6	711	716	0 %	0 %	100 %	0 %	357418825
12	NC_016149	T	6	6	718	723	0 %	100 %	0 %	0 %	357418825
13	NC_016149	GGTT	2	8	725	732	0 %	50 %	50 %	0 %	357418825
14	NC_016149	GAC	2	6	773	778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418825
15	NC_016149	GAG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418825
16	NC_016149	TGT	2	6	951	956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418825
17	NC_016149	TGA	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418825
18	NC_016149	GAA	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418825
19	NC_016149	GAC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418825
20	NC_016149	GA	3	6	1094	1099	50 %	0 %	50 %	0 %	357418825
21	NC_016149	GAG	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418825
22	NC_016149	TTC	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418825
23	NC_016149	ACA	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418825
24	NC_016149	TGG	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418825
25	NC_016149	TCA	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418826
26	NC_016149	TGA	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418826
27	NC_016149	ACTC	2	8	1655	1662	25 %	25 %	0 %	50 %	357418826
28	NC_016149	AAG	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418826
29	NC_016149	ATG	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418826
30	NC_016149	AGG	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418826
31	NC_016149	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418826
32	NC_016149	AAGC	2	8	2170	2177	50 %	0 %	25 %	25 %	357418826
33	NC_016149	A	6	6	2219	2224	100 %	0 %	0 %	0 %	357418826
34	NC_016149	GAAC	2	8	2393	2400	50 %	0 %	25 %	25 %	357418827
35	NC_016149	TGA	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418827
36	NC_016149	GAA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418827
37	NC_016149	G	6	6	2499	2504	0 %	0 %	100 %	0 %	357418827
38	NC_016149	AGG	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418827
39	NC_016149	AGG	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418827
40	NC_016149	CTA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418827
41	NC_016149	A	6	6	2631	2636	100 %	0 %	0 %	0 %	357418827
42	NC_016149	CAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418827
43	NC_016149	TATT	2	8	2715	2722	25 %	75 %	0 %	0 %	357418827
44	NC_016149	A	6	6	2750	2755	100 %	0 %	0 %	0 %	357418827
45	NC_016149	AGAT	2	8	2770	2777	50 %	25 %	25 %	0 %	357418827
46	NC_016149	CTGC	2	8	2779	2786	0 %	25 %	25 %	50 %	357418827
47	NC_016149	CAT	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418827
48	NC_016149	AT	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	357418827
49	NC_016149	TCA	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418827
50	NC_016149	TTA	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418827
51	NC_016149	ACA	2	6	2985	2990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418827
52	NC_016149	CTT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418827
53	NC_016149	CTA	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418827
54	NC_016149	TGA	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418827
55	NC_016149	GAA	2	6	3048	3053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418827
56	NC_016149	TAA	2	6	3073	3078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418827
57	NC_016149	AC	3	6	3175	3180	50 %	0 %	0 %	50 %	357418827
58	NC_016149	AT	3	6	3202	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	357418827
59	NC_016149	TAG	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418827
60	NC_016149	GGC	2	6	3246	3251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418827
61	NC_016149	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418827
62	NC_016149	CAG	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418827
63	NC_016149	GAG	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418827
64	NC_016149	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418827
65	NC_016149	TCG	2	6	3403	3408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418827
66	NC_016149	A	6	6	3416	3421	100 %	0 %	0 %	0 %	357418827
67	NC_016149	A	7	7	3489	3495	100 %	0 %	0 %	0 %	357418827
68	NC_016149	ATA	2	6	3540	3545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418827
69	NC_016149	ATA	2	6	3594	3599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418827
70	NC_016149	AAAC	2	8	3601	3608	75 %	0 %	0 %	25 %	357418827
71	NC_016149	GAA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418827
72	NC_016149	AGC	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418827
73	NC_016149	GCA	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418827
74	NC_016149	CAG	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418827
75	NC_016149	GGA	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418827
76	NC_016149	ACTT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	0 %	25 %	357418827
77	NC_016149	C	6	6	3954	3959	0 %	0 %	0 %	100 %	357418827
78	NC_016149	ACC	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418828
79	NC_016149	TTG	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418828
80	NC_016149	TGC	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418828
81	NC_016149	ACT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418828
82	NC_016149	TG	3	6	4997	5002	0 %	50 %	50 %	0 %	357418828
83	NC_016149	ATT	2	6	5063	5068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418829
84	NC_016149	CCT	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418829
85	NC_016149	CTG	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418829
86	NC_016149	TCG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418829
87	NC_016149	CTC	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418829
88	NC_016149	CGG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418829
89	NC_016149	TGG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418829
90	NC_016149	TCGTT	2	10	5386	5395	0 %	60 %	20 %	20 %	357418829
91	NC_016149	ATC	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418829
92	NC_016149	AAC	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418829
93	NC_016149	GCCG	2	8	5623	5630	0 %	0 %	50 %	50 %	357418829
94	NC_016149	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418829
95	NC_016149	TCCC	2	8	5696	5703	0 %	25 %	0 %	75 %	357418829
96	NC_016149	GCC	2	6	5747	5752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418829
97	NC_016149	GCT	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418829
98	NC_016149	GTC	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418829
99	NC_016149	TCA	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418829
100	NC_016149	TGG	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418829
101	NC_016149	GCTC	2	8	5977	5984	0 %	25 %	25 %	50 %	357418829
102	NC_016149	AGC	2	6	6072	6077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418829
103	NC_016149	GTT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418829
104	NC_016149	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418829
105	NC_016149	CAT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418829
106	NC_016149	AATA	2	8	6215	6222	75 %	25 %	0 %	0 %	357418829
107	NC_016149	TTCT	2	8	6431	6438	0 %	75 %	0 %	25 %	357418830
108	NC_016149	TCT	2	6	6493	6498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418830
109	NC_016149	TGC	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418830
110	NC_016149	TCC	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418830
111	NC_016149	TCT	2	6	6710	6715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418830
112	NC_016149	TAA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418830
113	NC_016149	ATCCTT	2	12	6759	6770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	357418830
114	NC_016149	TTG	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418830
115	NC_016149	CT	3	6	6947	6952	0 %	50 %	0 %	50 %	357418830
116	NC_016149	AGC	2	6	6984	6989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418830
117	NC_016149	GAT	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418830
118	NC_016149	TA	3	6	7098	7103	50 %	50 %	0 %	0 %	357418830
119	NC_016149	AAT	2	6	7104	7109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418830
120	NC_016149	AAG	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418831
121	NC_016149	GA	3	6	7168	7173	50 %	0 %	50 %	0 %	357418831
122	NC_016149	GCG	2	6	7196	7201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418831
123	NC_016149	TCA	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418831
124	NC_016149	CAG	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418831
125	NC_016149	CAT	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418831
126	NC_016149	AAG	2	6	7369	7374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418831
127	NC_016149	CAAA	2	8	7403	7410	75 %	0 %	0 %	25 %	357418831
128	NC_016149	AGAT	2	8	7443	7450	50 %	25 %	25 %	0 %	357418831
129	NC_016149	TAG	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418831
130	NC_016149	CGG	2	6	7552	7557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418831
131	NC_016149	TCCA	2	8	7564	7571	25 %	25 %	0 %	50 %	357418831
132	NC_016149	CGA	2	6	7584	7589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418831
133	NC_016149	AAAT	2	8	7626	7633	75 %	25 %	0 %	0 %	357418831
134	NC_016149	AT	4	8	7668	7675	50 %	50 %	0 %	0 %	357418831
135	NC_016149	CCCT	2	8	7687	7694	0 %	25 %	0 %	75 %	357418831
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268	NC_016149	CCA	2	6	15082	15087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418837
269	NC_016149	CCCCT	2	10	15151	15160	0 %	20 %	0 %	80 %	357418837
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383	NC_016149	TGCTC	2	10	23226	23235	0 %	40 %	20 %	40 %	357418844
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395	NC_016149	TGG	2	6	23892	23897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418844
396	NC_016149	A	6	6	23902	23907	100 %	0 %	0 %	0 %	357418844
397	NC_016149	TCC	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418844
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399	NC_016149	T	6	6	23985	23990	0 %	100 %	0 %	0 %	357418844
400	NC_016149	TTC	2	6	23996	24001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418844
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