MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016148	GGT	2	6	220686	220691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419058
4002	NC_016148	ACA	2	6	220828	220833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419058
4003	NC_016148	A	6	6	220953	220958	100 %	0 %	0 %	0 %	357419058
4004	NC_016148	AG	3	6	221048	221053	50 %	0 %	50 %	0 %	357419058
4005	NC_016148	AGA	2	6	221078	221083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419058
4006	NC_016148	ATG	2	6	221163	221168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419058
4007	NC_016148	ACA	2	6	221227	221232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419058
4008	NC_016148	CCTT	2	8	221283	221290	0 %	50 %	0 %	50 %	357419058
4009	NC_016148	CGG	2	6	221306	221311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419058
4010	NC_016148	CTGC	2	8	221393	221400	0 %	25 %	25 %	50 %	357419058
4011	NC_016148	CCCA	2	8	221519	221526	25 %	0 %	0 %	75 %	357419059
4012	NC_016148	GA	3	6	221614	221619	50 %	0 %	50 %	0 %	357419059
4013	NC_016148	TGG	2	6	221634	221639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419059
4014	NC_016148	AG	3	6	221648	221653	50 %	0 %	50 %	0 %	357419059
4015	NC_016148	CTG	2	6	221772	221777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419059
4016	NC_016148	TGA	2	6	221779	221784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419059
4017	NC_016148	GT	3	6	222224	222229	0 %	50 %	50 %	0 %	357419059
4018	NC_016148	TTG	2	6	222240	222245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419059
4019	NC_016148	ACA	2	6	222288	222293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419059
4020	NC_016148	CTT	2	6	222325	222330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419059
4021	NC_016148	AGG	2	6	222389	222394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419059
4022	NC_016148	CAG	2	6	222401	222406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419059
4023	NC_016148	GCA	2	6	222424	222429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419059
4024	NC_016148	TCCT	2	8	222492	222499	0 %	50 %	0 %	50 %	357419059
4025	NC_016148	GGA	2	6	222541	222546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419059
4026	NC_016148	GCA	2	6	222601	222606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419059
4027	NC_016148	GCC	2	6	222612	222617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419059
4028	NC_016148	CAGT	2	8	222630	222637	25 %	25 %	25 %	25 %	357419059
4029	NC_016148	GGC	2	6	222652	222657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419059
4030	NC_016148	TTC	2	6	222709	222714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419059
4031	NC_016148	CTG	2	6	222741	222746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419059
4032	NC_016148	AAAG	2	8	222760	222767	75 %	0 %	25 %	0 %	357419059
4033	NC_016148	TAT	2	6	222881	222886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419060
4034	NC_016148	TGG	3	9	222987	222995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419060
4035	NC_016148	ACAT	2	8	223014	223021	50 %	25 %	0 %	25 %	357419060
4036	NC_016148	GGT	2	6	223081	223086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419060
4037	NC_016148	TCT	2	6	223262	223267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419060
4038	NC_016148	TGG	2	6	223278	223283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419060
4039	NC_016148	GC	3	6	223457	223462	0 %	0 %	50 %	50 %	357419061
4040	NC_016148	GGC	2	6	223498	223503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419061
4041	NC_016148	AAGA	2	8	223549	223556	75 %	0 %	25 %	0 %	357419061
4042	NC_016148	GAA	2	6	223620	223625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419061
4043	NC_016148	GTT	2	6	223654	223659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419061
4044	NC_016148	ATG	2	6	223708	223713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419061
4045	NC_016148	GCT	2	6	223744	223749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419061
4046	NC_016148	TTTTG	2	10	223812	223821	0 %	80 %	20 %	0 %	357419061
4047	NC_016148	CAT	2	6	223857	223862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419061
4048	NC_016148	CGGG	2	8	223964	223971	0 %	0 %	75 %	25 %	357419061
4049	NC_016148	CTG	2	6	224107	224112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419061
4050	NC_016148	ATG	2	6	224162	224167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419061
4051	NC_016148	AGG	2	6	224273	224278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419061
4052	NC_016148	GCCT	2	8	224303	224310	0 %	25 %	25 %	50 %	357419061
4053	NC_016148	AGA	2	6	224372	224377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419061
4054	NC_016148	CTG	2	6	224984	224989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419062
4055	NC_016148	GCCA	2	8	224995	225002	25 %	0 %	25 %	50 %	357419062
4056	NC_016148	CCTG	2	8	225146	225153	0 %	25 %	25 %	50 %	357419062
4057	NC_016148	AGC	2	6	225200	225205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419062
4058	NC_016148	GAG	2	6	225236	225241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419062
4059	NC_016148	GCC	2	6	225334	225339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419063
4060	NC_016148	GCA	2	6	225363	225368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419063
4061	NC_016148	GCC	2	6	225383	225388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419063
4062	NC_016148	CGA	2	6	225403	225408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419063
4063	NC_016148	ATG	2	6	225579	225584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419064
4064	NC_016148	AGC	2	6	225737	225742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419065
4065	NC_016148	TTC	2	6	226324	226329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419066
4066	NC_016148	ACG	2	6	226422	226427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419066
4067	NC_016148	CAG	2	6	226493	226498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419066
4068	NC_016148	GTA	2	6	226545	226550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419066
4069	NC_016148	GAG	2	6	226587	226592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419066
4070	NC_016148	AGG	2	6	226638	226643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419066
4071	NC_016148	GA	3	6	226667	226672	50 %	0 %	50 %	0 %	357419066
4072	NC_016148	GAA	2	6	226737	226742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419066
4073	NC_016148	TG	3	6	226773	226778	0 %	50 %	50 %	0 %	357419066
4074	NC_016148	G	6	6	226849	226854	0 %	0 %	100 %	0 %	357419066
4075	NC_016148	T	6	6	226856	226861	0 %	100 %	0 %	0 %	357419066
4076	NC_016148	GGTT	2	8	226863	226870	0 %	50 %	50 %	0 %	357419066
4077	NC_016148	GAC	2	6	226911	226916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419066
4078	NC_016148	GAG	2	6	226940	226945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419066
4079	NC_016148	TGT	2	6	227089	227094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419066
4080	NC_016148	TGA	2	6	227095	227100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419066
4081	NC_016148	GAA	2	6	227118	227123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419066
4082	NC_016148	GAC	2	6	227216	227221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419066
4083	NC_016148	GA	3	6	227232	227237	50 %	0 %	50 %	0 %	357419066
4084	NC_016148	GAG	2	6	227244	227249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419066
4085	NC_016148	TTC	2	6	227320	227325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419066
4086	NC_016148	ACA	2	6	227335	227340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419066
4087	NC_016148	TGG	2	6	227348	227353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419066
4088	NC_016148	AAT	2	6	227619	227624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419067
4089	NC_016148	GAA	2	6	227764	227769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419067
4090	NC_016148	CTTG	2	8	227787	227794	0 %	50 %	25 %	25 %	357419067
4091	NC_016148	GT	3	6	227801	227806	0 %	50 %	50 %	0 %	357419067
4092	NC_016148	ATT	2	6	227815	227820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419067
4093	NC_016148	A	8	8	227821	227828	100 %	0 %	0 %	0 %	357419067
4094	NC_016148	AAT	2	6	227865	227870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419067
4095	NC_016148	T	6	6	227928	227933	0 %	100 %	0 %	0 %	357419067
4096	NC_016148	TA	3	6	227959	227964	50 %	50 %	0 %	0 %	357419067
4097	NC_016148	ACC	2	6	228014	228019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419067
4098	NC_016148	TGA	2	6	228039	228044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419067
4099	NC_016148	A	7	7	228056	228062	100 %	0 %	0 %	0 %	357419067
4100	NC_016148	TAA	2	6	228078	228083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419067
4101	NC_016148	CAAA	2	8	228132	228139	75 %	0 %	0 %	25 %	357419067
4102	NC_016148	AGCA	2	8	228393	228400	50 %	0 %	25 %	25 %	357419068
4103	NC_016148	TGA	2	6	228410	228415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419068
4104	NC_016148	TAT	2	6	228435	228440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419068
4105	NC_016148	GCC	2	6	228474	228479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419068
4106	NC_016148	AAGT	2	8	228521	228528	50 %	25 %	25 %	0 %	357419068
4107	NC_016148	AAG	2	6	228611	228616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419068
4108	NC_016148	CGC	2	6	228669	228674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419068
4109	NC_016148	A	6	6	228772	228777	100 %	0 %	0 %	0 %	357419068
4110	NC_016148	AGT	2	6	228786	228791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419068
4111	NC_016148	T	6	6	228791	228796	0 %	100 %	0 %	0 %	357419068
4112	NC_016148	AGA	2	6	228852	228857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419068
4113	NC_016148	CAG	2	6	228896	228901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419068
4114	NC_016148	TGT	2	6	228930	228935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419068
4115	NC_016148	TGCC	2	8	229001	229008	0 %	25 %	25 %	50 %	357419068
4116	NC_016148	AAGA	2	8	229017	229024	75 %	0 %	25 %	0 %	357419068
4117	NC_016148	AT	3	6	229041	229046	50 %	50 %	0 %	0 %	357419068
4118	NC_016148	CGCT	2	8	229049	229056	0 %	25 %	25 %	50 %	357419068
4119	NC_016148	TGG	2	6	229099	229104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419068
4120	NC_016148	GAAAAA	2	12	229117	229128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	357419068
4121	NC_016148	AAG	2	6	229170	229175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419068
4122	NC_016148	TAA	2	6	229211	229216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419068
4123	NC_016148	AAGA	2	8	229253	229260	75 %	0 %	25 %	0 %	357419068
4124	NC_016148	GAA	2	6	229305	229310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419068
4125	NC_016148	AATAA	2	10	229353	229362	80 %	20 %	0 %	0 %	357419068
4126	NC_016148	GAA	2	6	229400	229405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419069
4127	NC_016148	TCTT	2	8	229438	229445	0 %	75 %	0 %	25 %	357419069
4128	NC_016148	AT	3	6	229452	229457	50 %	50 %	0 %	0 %	357419069
4129	NC_016148	AAATT	2	10	229462	229471	60 %	40 %	0 %	0 %	357419069
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4131	NC_016148	TA	3	6	229587	229592	50 %	50 %	0 %	0 %	357419069
4132	NC_016148	TGCT	2	8	229610	229617	0 %	50 %	25 %	25 %	357419069
4133	NC_016148	TTGAT	2	10	229658	229667	20 %	60 %	20 %	0 %	357419069
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4181	NC_016148	A	7	7	232256	232262	100 %	0 %	0 %	0 %	357419071
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4233	NC_016148	GCT	2	6	238347	238352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419075
4234	NC_016148	CTTT	2	8	238372	238379	0 %	75 %	0 %	25 %	357419075
4235	NC_016148	TCA	2	6	238389	238394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419075
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4237	NC_016148	CGA	2	6	238468	238473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419075
4238	NC_016148	ACC	2	6	238474	238479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419075
4239	NC_016148	GTTC	2	8	238495	238502	0 %	50 %	25 %	25 %	357419075
4240	NC_016148	CTC	2	6	238510	238515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419075
4241	NC_016148	TG	3	6	238559	238564	0 %	50 %	50 %	0 %	357419075
4242	NC_016148	TG	3	6	238614	238619	0 %	50 %	50 %	0 %	357419075
4243	NC_016148	CCA	2	6	238629	238634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419075
4244	NC_016148	CTT	2	6	238691	238696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419075
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4246	NC_016148	GTAT	2	8	238762	238769	25 %	50 %	25 %	0 %	357419075
4247	NC_016148	GCG	2	6	238794	238799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419075
4248	NC_016148	TAGC	2	8	238819	238826	25 %	25 %	25 %	25 %	357419075
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4263	NC_016148	GTT	3	9	240089	240097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419077
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4267	NC_016148	A	6	6	240173	240178	100 %	0 %	0 %	0 %	357419077
4268	NC_016148	A	6	6	240201	240206	100 %	0 %	0 %	0 %	357419077
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4357	NC_016148	CGA	2	6	246021	246026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419080
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4363	NC_016148	AAT	2	6	247252	247257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419081
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4492	NC_016148	GTC	2	6	253502	253507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419088
4493	NC_016148	TCA	2	6	253563	253568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419088
4494	NC_016148	TGG	2	6	253588	253593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419088
4495	NC_016148	GCTC	2	8	253639	253646	0 %	25 %	25 %	50 %	357419088
4496	NC_016148	AGC	2	6	253734	253739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419088
4497	NC_016148	GTT	2	6	253804	253809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419088
4498	NC_016148	CCA	2	6	253849	253854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419088
4499	NC_016148	CAT	2	6	253867	253872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419088
4500	NC_016148	AATA	2	8	253877	253884	75 %	25 %	0 %	0 %	357419088

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