MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_016148	GCC	2	6	1965662	1965667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420699
34502	NC_016148	TAT	2	6	1965707	1965712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420699
34503	NC_016148	CCT	2	6	1965847	1965852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420699
34504	NC_016148	GCC	2	6	1965872	1965877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420699
34505	NC_016148	TCC	2	6	1965933	1965938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420699
34506	NC_016148	G	7	7	1965945	1965951	0 %	0 %	100 %	0 %	357420699
34507	NC_016148	A	6	6	1966161	1966166	100 %	0 %	0 %	0 %	357420699
34508	NC_016148	G	6	6	1966186	1966191	0 %	0 %	100 %	0 %	357420699
34509	NC_016148	TCA	2	6	1966206	1966211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420699
34510	NC_016148	AGG	2	6	1966212	1966217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420699
34511	NC_016148	TCAG	2	8	1966236	1966243	25 %	25 %	25 %	25 %	357420699
34512	NC_016148	TGC	2	6	1966454	1966459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420699
34513	NC_016148	GCTCT	2	10	1966580	1966589	0 %	40 %	20 %	40 %	357420700
34514	NC_016148	CTC	2	6	1966637	1966642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420700
34515	NC_016148	AGG	2	6	1966652	1966657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420700
34516	NC_016148	GGC	2	6	1966667	1966672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420700
34517	NC_016148	CCT	2	6	1966689	1966694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420700
34518	NC_016148	TTC	2	6	1966702	1966707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420700
34519	NC_016148	TCT	2	6	1966784	1966789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420700
34520	NC_016148	AGA	2	6	1966806	1966811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420700
34521	NC_016148	GGA	2	6	1966812	1966817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420700
34522	NC_016148	CTC	2	6	1966919	1966924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420700
34523	NC_016148	TTC	2	6	1966943	1966948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420700
34524	NC_016148	GGT	2	6	1966967	1966972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420700
34525	NC_016148	GCA	2	6	1967013	1967018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420700
34526	NC_016148	CT	3	6	1967076	1967081	0 %	50 %	0 %	50 %	357420700
34527	NC_016148	CCA	2	6	1967122	1967127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420700
34528	NC_016148	A	6	6	1967160	1967165	100 %	0 %	0 %	0 %	357420700
34529	NC_016148	TC	4	8	1967166	1967173	0 %	50 %	0 %	50 %	357420700
34530	NC_016148	GCG	2	6	1967199	1967204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420700
34531	NC_016148	TGA	2	6	1967265	1967270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420700
34532	NC_016148	A	7	7	1967274	1967280	100 %	0 %	0 %	0 %	357420700
34533	NC_016148	GAAG	2	8	1967289	1967296	50 %	0 %	50 %	0 %	357420700
34534	NC_016148	CAC	2	6	1967354	1967359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420700
34535	NC_016148	TCTT	2	8	1967367	1967374	0 %	75 %	0 %	25 %	357420700
34536	NC_016148	CCA	2	6	1967386	1967391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420700
34537	NC_016148	ATT	2	6	1967444	1967449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420700
34538	NC_016148	GCA	2	6	1967475	1967480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420700
34539	NC_016148	TCCA	2	8	1967486	1967493	25 %	25 %	0 %	50 %	357420700
34540	NC_016148	TTA	2	6	1967506	1967511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420700

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.