MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016148	GAG	2	6	160771	160776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419002
3002	NC_016148	CCA	2	6	160852	160857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419003
3003	NC_016148	ATG	2	6	160860	160865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419003
3004	NC_016148	CAT	2	6	160949	160954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419003
3005	NC_016148	T	7	7	160954	160960	0 %	100 %	0 %	0 %	357419003
3006	NC_016148	CAT	3	9	161039	161047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419003
3007	NC_016148	CAC	2	6	161048	161053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419003
3008	NC_016148	TCG	2	6	161127	161132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419003
3009	NC_016148	AAG	2	6	161201	161206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419003
3010	NC_016148	TCT	2	6	161214	161219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419003
3011	NC_016148	ATC	2	6	161226	161231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419003
3012	NC_016148	TCC	2	6	161273	161278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419003
3013	NC_016148	TAT	2	6	161294	161299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419003
3014	NC_016148	GAAGGC	2	12	161402	161413	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357419003
3015	NC_016148	A	6	6	161436	161441	100 %	0 %	0 %	0 %	357419003
3016	NC_016148	GCG	2	6	161466	161471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419003
3017	NC_016148	TGC	2	6	161479	161484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419003
3018	NC_016148	TAC	2	6	161510	161515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419003
3019	NC_016148	ATC	2	6	161601	161606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419003
3020	NC_016148	TCC	2	6	161615	161620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419004
3021	NC_016148	GGC	2	6	161686	161691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419004
3022	NC_016148	T	6	6	161715	161720	0 %	100 %	0 %	0 %	357419004
3023	NC_016148	CGT	2	6	161721	161726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419004
3024	NC_016148	TAG	2	6	161729	161734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419004
3025	NC_016148	CGT	2	6	161787	161792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419004
3026	NC_016148	GCT	2	6	161818	161823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419004
3027	NC_016148	AAG	2	6	161896	161901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419004
3028	NC_016148	TA	3	6	161935	161940	50 %	50 %	0 %	0 %	357419004
3029	NC_016148	CCA	2	6	162003	162008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419004
3030	NC_016148	TCC	2	6	162038	162043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419004
3031	NC_016148	GAA	2	6	162057	162062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419004
3032	NC_016148	T	6	6	162064	162069	0 %	100 %	0 %	0 %	357419004
3033	NC_016148	CAC	2	6	162091	162096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419004
3034	NC_016148	ACCC	2	8	162146	162153	25 %	0 %	0 %	75 %	357419004
3035	NC_016148	GGA	2	6	162176	162181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419004
3036	NC_016148	CTT	2	6	162292	162297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419004
3037	NC_016148	GTT	3	9	162325	162333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419004
3038	NC_016148	AGG	2	6	162442	162447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419005
3039	NC_016148	TC	4	8	162449	162456	0 %	50 %	0 %	50 %	357419005
3040	NC_016148	ACC	2	6	162484	162489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419005
3041	NC_016148	CCT	2	6	162500	162505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419005
3042	NC_016148	TGA	2	6	162548	162553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419005
3043	NC_016148	TCT	2	6	162563	162568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419005
3044	NC_016148	CGCTG	2	10	162603	162612	0 %	20 %	40 %	40 %	357419005
3045	NC_016148	CTTC	2	8	162619	162626	0 %	50 %	0 %	50 %	357419005
3046	NC_016148	T	6	6	162699	162704	0 %	100 %	0 %	0 %	357419005
3047	NC_016148	CCG	2	6	162809	162814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419005
3048	NC_016148	A	7	7	163017	163023	100 %	0 %	0 %	0 %	357419005
3049	NC_016148	ATT	2	6	163144	163149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419005
3050	NC_016148	GCTG	2	8	163206	163213	0 %	25 %	50 %	25 %	357419005
3051	NC_016148	CAAC	2	8	163214	163221	50 %	0 %	0 %	50 %	357419005
3052	NC_016148	TCC	2	6	163228	163233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419005
3053	NC_016148	A	7	7	163283	163289	100 %	0 %	0 %	0 %	357419005
3054	NC_016148	TCC	2	6	163902	163907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419006
3055	NC_016148	TTA	2	6	163909	163914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419006
3056	NC_016148	CTC	2	6	163970	163975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419006
3057	NC_016148	GGC	2	6	164042	164047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419006
3058	NC_016148	TGTT	2	8	164073	164080	0 %	75 %	25 %	0 %	357419006
3059	NC_016148	AGG	2	6	164115	164120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419006
3060	NC_016148	ATC	2	6	164241	164246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419006
3061	NC_016148	CAG	2	6	164406	164411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419006
3062	NC_016148	TCA	2	6	164446	164451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419006
3063	NC_016148	TAT	2	6	164490	164495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419007
3064	NC_016148	CAG	2	6	164507	164512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419007
3065	NC_016148	GCCG	2	8	164520	164527	0 %	0 %	50 %	50 %	357419007
3066	NC_016148	GGT	2	6	164598	164603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419007
3067	NC_016148	CCG	2	6	164689	164694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419007
3068	NC_016148	GAA	2	6	164763	164768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419007
3069	NC_016148	GAA	2	6	164877	164882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419007
3070	NC_016148	CTATGG	2	12	164924	164935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357419007
3071	NC_016148	CTT	2	6	164982	164987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419007
3072	NC_016148	CATTTC	2	12	165006	165017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	357419007
3073	NC_016148	CCT	2	6	165059	165064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419007
3074	NC_016148	TTC	2	6	165075	165080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419007
3075	NC_016148	CTT	2	6	165084	165089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419007
3076	NC_016148	AGCC	2	8	165128	165135	25 %	0 %	25 %	50 %	357419007
3077	NC_016148	TGA	2	6	165179	165184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419007
3078	NC_016148	GAG	2	6	165231	165236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419007
3079	NC_016148	TACA	2	8	165278	165285	50 %	25 %	0 %	25 %	357419007
3080	NC_016148	AGT	2	6	165386	165391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419007
3081	NC_016148	GAA	2	6	165396	165401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419007
3082	NC_016148	AGCC	2	8	165418	165425	25 %	0 %	25 %	50 %	357419007
3083	NC_016148	AGG	2	6	165479	165484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419007
3084	NC_016148	ACC	2	6	165544	165549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419007
3085	NC_016148	GAC	2	6	165624	165629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419007
3086	NC_016148	CGA	2	6	165632	165637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419007
3087	NC_016148	AG	3	6	165652	165657	50 %	0 %	50 %	0 %	357419007
3088	NC_016148	TGC	2	6	165729	165734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419007
3089	NC_016148	CCT	2	6	165822	165827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419008
3090	NC_016148	TTC	2	6	165853	165858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419008
3091	NC_016148	TCT	2	6	165951	165956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419008
3092	NC_016148	TCG	2	6	166124	166129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419008
3093	NC_016148	AGA	2	6	166137	166142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419008
3094	NC_016148	AGG	2	6	166335	166340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419008
3095	NC_016148	GT	3	6	166403	166408	0 %	50 %	50 %	0 %	357419008
3096	NC_016148	GC	3	6	166465	166470	0 %	0 %	50 %	50 %	357419008
3097	NC_016148	ATG	2	6	166499	166504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419008
3098	NC_016148	CTT	2	6	166545	166550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419008
3099	NC_016148	GCCC	2	8	166561	166568	0 %	0 %	25 %	75 %	357419008
3100	NC_016148	ACG	2	6	166589	166594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419008
3101	NC_016148	GGA	2	6	166678	166683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419008
3102	NC_016148	CCT	2	6	166686	166691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419008
3103	NC_016148	TCC	2	6	166709	166714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419008
3104	NC_016148	GAA	2	6	166833	166838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419008
3105	NC_016148	TCA	2	6	166863	166868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419008
3106	NC_016148	CTC	2	6	166870	166875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419008
3107	NC_016148	TAC	2	6	166903	166908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419008
3108	NC_016148	TGC	2	6	167017	167022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419008
3109	NC_016148	GAG	2	6	167267	167272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419009
3110	NC_016148	TTC	2	6	167297	167302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419009
3111	NC_016148	GCT	2	6	167313	167318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419009
3112	NC_016148	T	6	6	167318	167323	0 %	100 %	0 %	0 %	357419009
3113	NC_016148	TAT	2	6	167348	167353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419009
3114	NC_016148	TGC	2	6	167361	167366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419009
3115	NC_016148	T	6	6	167374	167379	0 %	100 %	0 %	0 %	357419009
3116	NC_016148	TGC	2	6	167542	167547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419009
3117	NC_016148	CCT	2	6	167581	167586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419009
3118	NC_016148	GCT	2	6	167590	167595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419009
3119	NC_016148	GGGT	2	8	167689	167696	0 %	25 %	75 %	0 %	357419009
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3121	NC_016148	CTT	2	6	167714	167719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419009
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3243	NC_016148	CTA	2	6	175369	175374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419016
3244	NC_016148	TAC	2	6	175388	175393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419016
3245	NC_016148	CTT	2	6	175414	175419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419016
3246	NC_016148	GCT	2	6	175440	175445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419016
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3272	NC_016148	TGA	2	6	177814	177819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419017
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3339	NC_016148	AT	3	6	182315	182320	50 %	50 %	0 %	0 %	357419021
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3352	NC_016148	CCA	2	6	183359	183364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419022
3353	NC_016148	TGG	2	6	183374	183379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419022
3354	NC_016148	GCT	2	6	183385	183390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419022
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3359	NC_016148	T	6	6	183611	183616	0 %	100 %	0 %	0 %	357419022
3360	NC_016148	TCT	2	6	183694	183699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419022
3361	NC_016148	GGT	2	6	183741	183746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419022
3362	NC_016148	T	6	6	183787	183792	0 %	100 %	0 %	0 %	357419022
3363	NC_016148	AGC	2	6	183807	183812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419022
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3365	NC_016148	CCCAAT	2	12	183913	183924	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	357419022
3366	NC_016148	A	6	6	183957	183962	100 %	0 %	0 %	0 %	357419022
3367	NC_016148	TCA	2	6	184102	184107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419023
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3369	NC_016148	C	6	6	184243	184248	0 %	0 %	0 %	100 %	357419023
3370	NC_016148	CTA	2	6	184278	184283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419023
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3386	NC_016148	CCT	2	6	185019	185024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419024
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3395	NC_016148	ACT	2	6	185771	185776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419025
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3402	NC_016148	CAC	2	6	186292	186297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419025
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3483	NC_016148	GGA	2	6	190839	190844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419028
3484	NC_016148	ACCGT	2	10	190846	190855	20 %	20 %	20 %	40 %	357419028
3485	NC_016148	CATG	2	8	190935	190942	25 %	25 %	25 %	25 %	357419028
3486	NC_016148	AGTG	2	8	191172	191179	25 %	25 %	50 %	0 %	357419029
3487	NC_016148	TTCC	2	8	191190	191197	0 %	50 %	0 %	50 %	357419029
3488	NC_016148	TTA	2	6	191331	191336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419029
3489	NC_016148	TCC	2	6	191341	191346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419029
3490	NC_016148	ACGT	2	8	191405	191412	25 %	25 %	25 %	25 %	357419029
3491	NC_016148	TTGG	2	8	191473	191480	0 %	50 %	50 %	0 %	357419029
3492	NC_016148	GCT	2	6	191574	191579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419029
3493	NC_016148	TA	3	6	191644	191649	50 %	50 %	0 %	0 %	357419029
3494	NC_016148	TGC	3	9	191653	191661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419029
3495	NC_016148	AGC	2	6	191704	191709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419029
3496	NC_016148	CTA	2	6	191949	191954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419029
3497	NC_016148	GCA	2	6	191994	191999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419029
3498	NC_016148	GAA	2	6	192016	192021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419029
3499	NC_016148	CAC	2	6	192076	192081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419029
3500	NC_016148	ACC	2	6	192087	192092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419029

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