MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

< Previous12...58596061626364656667686970Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_016148	TTC	2	6	1937203	1937208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420671
34003	NC_016148	TCA	2	6	1937226	1937231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420671
34004	NC_016148	ACA	2	6	1937232	1937237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420671
34005	NC_016148	GTC	2	6	1937410	1937415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420671
34006	NC_016148	CAAC	2	8	1937455	1937462	50 %	0 %	0 %	50 %	357420671
34007	NC_016148	A	6	6	1937465	1937470	100 %	0 %	0 %	0 %	357420671
34008	NC_016148	C	6	6	1937472	1937477	0 %	0 %	0 %	100 %	357420671
34009	NC_016148	CTC	2	6	1937482	1937487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420671
34010	NC_016148	CA	3	6	1937548	1937553	50 %	0 %	0 %	50 %	357420671
34011	NC_016148	TTC	2	6	1937584	1937589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420671
34012	NC_016148	A	6	6	1937621	1937626	100 %	0 %	0 %	0 %	357420671
34013	NC_016148	TC	3	6	1937654	1937659	0 %	50 %	0 %	50 %	357420671
34014	NC_016148	CCT	2	6	1937683	1937688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420671
34015	NC_016148	CTC	2	6	1937734	1937739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420671
34016	NC_016148	TAC	2	6	1937776	1937781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420671
34017	NC_016148	CTC	2	6	1937816	1937821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420671
34018	NC_016148	CTG	2	6	1937828	1937833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420671
34019	NC_016148	TCG	2	6	1937898	1937903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420671
34020	NC_016148	GAA	2	6	1937997	1938002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420671
34021	NC_016148	CT	3	6	1938435	1938440	0 %	50 %	0 %	50 %	357420672
34022	NC_016148	CTT	2	6	1938470	1938475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420672
34023	NC_016148	CTT	2	6	1938496	1938501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420672
34024	NC_016148	CTC	3	9	1938502	1938510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420672
34025	NC_016148	ATC	2	6	1938527	1938532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420672
34026	NC_016148	A	6	6	1938559	1938564	100 %	0 %	0 %	0 %	357420672
34027	NC_016148	CGG	2	6	1938649	1938654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420672
34028	NC_016148	AGA	2	6	1938669	1938674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420672
34029	NC_016148	TTC	2	6	1938701	1938706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420672
34030	NC_016148	CTT	2	6	1938757	1938762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420672
34031	NC_016148	CT	3	6	1938889	1938894	0 %	50 %	0 %	50 %	357420672
34032	NC_016148	CCT	2	6	1938963	1938968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420672
34033	NC_016148	TCC	2	6	1938972	1938977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420672
34034	NC_016148	GGC	2	6	1939071	1939076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420672
34035	NC_016148	TCG	2	6	1939091	1939096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420672
34036	NC_016148	CAA	2	6	1939149	1939154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420672
34037	NC_016148	CT	3	6	1939180	1939185	0 %	50 %	0 %	50 %	357420672
34038	NC_016148	CT	3	6	1939260	1939265	0 %	50 %	0 %	50 %	357420672
34039	NC_016148	CTC	2	6	1939279	1939284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420672
34040	NC_016148	TC	3	6	1939308	1939313	0 %	50 %	0 %	50 %	357420672
34041	NC_016148	C	6	6	1939346	1939351	0 %	0 %	0 %	100 %	357420672
34042	NC_016148	CCA	2	6	1939449	1939454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420672
34043	NC_016148	AGG	2	6	1939467	1939472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420672
34044	NC_016148	CCT	2	6	1939536	1939541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420672
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34047	NC_016148	CGC	2	6	1939734	1939739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420673
34048	NC_016148	CAG	2	6	1939773	1939778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420673
34049	NC_016148	CGC	2	6	1939864	1939869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420673
34050	NC_016148	GCTCTT	2	12	1939892	1939903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357420673
34051	NC_016148	GTT	2	6	1939945	1939950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420673
34052	NC_016148	GCC	2	6	1939991	1939996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420673
34053	NC_016148	TCC	2	6	1940147	1940152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420673
34054	NC_016148	T	6	6	1940183	1940188	0 %	100 %	0 %	0 %	357420673
34055	NC_016148	TCT	2	6	1940195	1940200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420673
34056	NC_016148	TTC	2	6	1940223	1940228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420673
34057	NC_016148	GGCTAT	2	12	1940296	1940307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357420673
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34060	NC_016148	TCT	2	6	1940355	1940360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420673
34061	NC_016148	ATC	2	6	1940419	1940424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420673
34062	NC_016148	CT	3	6	1940447	1940452	0 %	50 %	0 %	50 %	357420673
34063	NC_016148	CT	3	6	1940462	1940467	0 %	50 %	0 %	50 %	357420673
34064	NC_016148	TCC	2	6	1940495	1940500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420673
34065	NC_016148	AGC	2	6	1940533	1940538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420673
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34067	NC_016148	ACC	2	6	1940696	1940701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420673
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34070	NC_016148	AAAG	2	8	1940795	1940802	75 %	0 %	25 %	0 %	357420673
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34073	NC_016148	T	7	7	1941212	1941218	0 %	100 %	0 %	0 %	357420674
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34075	NC_016148	A	7	7	1941414	1941420	100 %	0 %	0 %	0 %	357420674
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34084	NC_016148	TGCAGG	2	12	1941734	1941745	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357420674
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34086	NC_016148	CAATGG	2	12	1941788	1941799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357420674
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34088	NC_016148	CTT	2	6	1941898	1941903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420674
34089	NC_016148	GA	3	6	1941907	1941912	50 %	0 %	50 %	0 %	357420674
34090	NC_016148	TCT	2	6	1941981	1941986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420674
34091	NC_016148	ATT	2	6	1942002	1942007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420674
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34093	NC_016148	TC	3	6	1942099	1942104	0 %	50 %	0 %	50 %	357420674
34094	NC_016148	TCT	2	6	1942135	1942140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420674
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34098	NC_016148	ACA	2	6	1942312	1942317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420675
34099	NC_016148	CACAGG	2	12	1942325	1942336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420675
34100	NC_016148	TAG	2	6	1942394	1942399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420675
34101	NC_016148	TCC	2	6	1942428	1942433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420675
34102	NC_016148	AGCAAT	2	12	1942464	1942475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357420675
34103	NC_016148	CAT	2	6	1942541	1942546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420675
34104	NC_016148	GCT	2	6	1942588	1942593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420675
34105	NC_016148	CAG	2	6	1942622	1942627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420675
34106	NC_016148	CTA	2	6	1942628	1942633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420675
34107	NC_016148	ATT	2	6	1942639	1942644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420675
34108	NC_016148	TTA	2	6	1942654	1942659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420675
34109	NC_016148	CTT	2	6	1942721	1942726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420675
34110	NC_016148	ATG	2	6	1942740	1942745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420675
34111	NC_016148	TATGCA	2	12	1942784	1942795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357420675
34112	NC_016148	A	6	6	1942835	1942840	100 %	0 %	0 %	0 %	357420675
34113	NC_016148	TGG	2	6	1942873	1942878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420675
34114	NC_016148	AAG	2	6	1942908	1942913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420675
34115	NC_016148	TTC	2	6	1942915	1942920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420675
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34117	NC_016148	TTCA	2	8	1943023	1943030	25 %	50 %	0 %	25 %	357420676
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34232	NC_016148	CCAC	2	8	1949320	1949327	25 %	0 %	0 %	75 %	357420683
34233	NC_016148	C	6	6	1949345	1949350	0 %	0 %	0 %	100 %	357420683
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34236	NC_016148	CAA	2	6	1949377	1949382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420683
34237	NC_016148	TC	3	6	1949419	1949424	0 %	50 %	0 %	50 %	357420683
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34240	NC_016148	TGC	2	6	1949593	1949598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420683
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34247	NC_016148	CTG	2	6	1950565	1950570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420685
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34251	NC_016148	TGGCC	2	10	1950857	1950866	0 %	20 %	40 %	40 %	357420685
34252	NC_016148	CTGC	2	8	1950926	1950933	0 %	25 %	25 %	50 %	357420685
34253	NC_016148	TCT	2	6	1951016	1951021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420685
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34260	NC_016148	TC	3	6	1951206	1951211	0 %	50 %	0 %	50 %	357420685
34261	NC_016148	GCA	2	6	1951259	1951264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420685
34262	NC_016148	CTC	2	6	1951425	1951430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420685
34263	NC_016148	TC	3	6	1951472	1951477	0 %	50 %	0 %	50 %	357420685
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34338	NC_016148	ATC	2	6	1955427	1955432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420691
34339	NC_016148	CTT	2	6	1955450	1955455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420691
34340	NC_016148	GAG	2	6	1955468	1955473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420691
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34342	NC_016148	AGAA	2	8	1955660	1955667	75 %	0 %	25 %	0 %	357420691
34343	NC_016148	CAT	2	6	1955897	1955902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420692
34344	NC_016148	GGA	2	6	1956110	1956115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420692
34345	NC_016148	GGA	2	6	1956117	1956122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420692
34346	NC_016148	AGG	2	6	1956173	1956178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420692
34347	NC_016148	TAC	2	6	1956246	1956251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420692
34348	NC_016148	AGGG	2	8	1956268	1956275	25 %	0 %	75 %	0 %	357420692
34349	NC_016148	A	6	6	1956279	1956284	100 %	0 %	0 %	0 %	357420692
34350	NC_016148	AG	3	6	1956297	1956302	50 %	0 %	50 %	0 %	357420692
34351	NC_016148	ATG	2	6	1956414	1956419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420693
34352	NC_016148	TCA	2	6	1956496	1956501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420693
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34463	NC_016148	AAGG	2	8	1963181	1963188	50 %	0 %	50 %	0 %	357420697
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