MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_016148	CAAT	2	8	1909465	1909472	50 %	25 %	0 %	25 %	357420647
33502	NC_016148	CTA	2	6	1909474	1909479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420647
33503	NC_016148	T	6	6	1909532	1909537	0 %	100 %	0 %	0 %	357420647
33504	NC_016148	TGG	2	6	1909553	1909558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420647
33505	NC_016148	GCA	2	6	1909584	1909589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420647
33506	NC_016148	TGC	2	6	1909640	1909645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420647
33507	NC_016148	GCA	2	6	1909725	1909730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420647
33508	NC_016148	A	6	6	1909730	1909735	100 %	0 %	0 %	0 %	357420647
33509	NC_016148	TAG	2	6	1909744	1909749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420647
33510	NC_016148	T	7	7	1909759	1909765	0 %	100 %	0 %	0 %	357420647
33511	NC_016148	AAC	2	6	1909808	1909813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420647
33512	NC_016148	ACC	2	6	1909818	1909823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420647
33513	NC_016148	CCT	2	6	1909867	1909872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420648
33514	NC_016148	TTA	2	6	1909880	1909885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420648
33515	NC_016148	TCC	2	6	1909912	1909917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420648
33516	NC_016148	CTA	2	6	1909923	1909928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420648
33517	NC_016148	TAA	2	6	1909961	1909966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420648
33518	NC_016148	GCT	2	6	1910141	1910146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420648
33519	NC_016148	GTG	2	6	1910157	1910162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420648
33520	NC_016148	CAA	2	6	1910202	1910207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420648
33521	NC_016148	T	6	6	1910226	1910231	0 %	100 %	0 %	0 %	357420648
33522	NC_016148	ATCT	2	8	1910278	1910285	25 %	50 %	0 %	25 %	357420648
33523	NC_016148	CTCA	2	8	1910380	1910387	25 %	25 %	0 %	50 %	357420649
33524	NC_016148	TGC	3	9	1910426	1910434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420649
33525	NC_016148	CTG	2	6	1910437	1910442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420649
33526	NC_016148	TCC	2	6	1910479	1910484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420649
33527	NC_016148	CTT	2	6	1910617	1910622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420649
33528	NC_016148	AT	3	6	1910636	1910641	50 %	50 %	0 %	0 %	357420649
33529	NC_016148	CTA	2	6	1910713	1910718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420649
33530	NC_016148	CAT	2	6	1910788	1910793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420649
33531	NC_016148	CAGA	2	8	1910848	1910855	50 %	0 %	25 %	25 %	357420649
33532	NC_016148	TTGT	2	8	1910870	1910877	0 %	75 %	25 %	0 %	357420649
33533	NC_016148	CTT	2	6	1910884	1910889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420649
33534	NC_016148	GAC	2	6	1910903	1910908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420649
33535	NC_016148	AT	3	6	1910934	1910939	50 %	50 %	0 %	0 %	357420649
33536	NC_016148	TCA	2	6	1910952	1910957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420649
33537	NC_016148	ATC	2	6	1911017	1911022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420649
33538	NC_016148	TC	3	6	1911091	1911096	0 %	50 %	0 %	50 %	357420649
33539	NC_016148	GAA	2	6	1911106	1911111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420649
33540	NC_016148	GCA	2	6	1911246	1911251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420649
33541	NC_016148	GTT	2	6	1911264	1911269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420649
33542	NC_016148	CAA	2	6	1911307	1911312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420649
33543	NC_016148	TAT	2	6	1911326	1911331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420649
33544	NC_016148	TCCC	2	8	1911344	1911351	0 %	25 %	0 %	75 %	357420649
33545	NC_016148	AG	3	6	1911357	1911362	50 %	0 %	50 %	0 %	357420649
33546	NC_016148	CT	3	6	1911386	1911391	0 %	50 %	0 %	50 %	357420649
33547	NC_016148	ATA	2	6	1911434	1911439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420649
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33549	NC_016148	GTT	2	6	1911497	1911502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420649
33550	NC_016148	TTTC	2	8	1911589	1911596	0 %	75 %	0 %	25 %	357420649
33551	NC_016148	T	6	6	1911616	1911621	0 %	100 %	0 %	0 %	357420649
33552	NC_016148	AACA	2	8	1911963	1911970	75 %	0 %	0 %	25 %	357420650
33553	NC_016148	AAG	2	6	1911975	1911980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420650
33554	NC_016148	TC	3	6	1912019	1912024	0 %	50 %	0 %	50 %	357420650
33555	NC_016148	ATT	2	6	1912061	1912066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420650
33556	NC_016148	TCT	2	6	1912094	1912099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420650
33557	NC_016148	GCT	2	6	1912115	1912120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420650
33558	NC_016148	TCC	2	6	1912147	1912152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420650
33559	NC_016148	GAAG	2	8	1912236	1912243	50 %	0 %	50 %	0 %	357420650
33560	NC_016148	CGG	2	6	1912387	1912392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420650
33561	NC_016148	T	7	7	1912470	1912476	0 %	100 %	0 %	0 %	357420650
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33563	NC_016148	TTA	2	6	1912520	1912525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420650
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33567	NC_016148	TAT	2	6	1912753	1912758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420650
33568	NC_016148	TC	3	6	1912768	1912773	0 %	50 %	0 %	50 %	357420650
33569	NC_016148	TAA	2	6	1912827	1912832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420650
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33571	NC_016148	TATC	2	8	1912901	1912908	25 %	50 %	0 %	25 %	357420651
33572	NC_016148	TAT	2	6	1912949	1912954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420651
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33578	NC_016148	CTCTA	2	10	1913226	1913235	20 %	40 %	0 %	40 %	357420651
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33582	NC_016148	TAT	2	6	1913436	1913441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420651
33583	NC_016148	CGG	2	6	1913456	1913461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420651
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33586	NC_016148	C	6	6	1913550	1913555	0 %	0 %	0 %	100 %	357420651
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33592	NC_016148	TCCT	2	8	1913904	1913911	0 %	50 %	0 %	50 %	357420651
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33598	NC_016148	ATC	2	6	1914397	1914402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420652
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33600	NC_016148	CTG	2	6	1914452	1914457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420652
33601	NC_016148	TCT	2	6	1914546	1914551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420652
33602	NC_016148	AGC	2	6	1914561	1914566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420652
33603	NC_016148	T	6	6	1914628	1914633	0 %	100 %	0 %	0 %	357420652
33604	NC_016148	TCT	2	6	1914646	1914651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420652
33605	NC_016148	CAA	2	6	1914828	1914833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420652
33606	NC_016148	T	6	6	1914940	1914945	0 %	100 %	0 %	0 %	357420652
33607	NC_016148	CT	3	6	1914954	1914959	0 %	50 %	0 %	50 %	357420652
33608	NC_016148	ATT	2	6	1914975	1914980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420652
33609	NC_016148	A	6	6	1915233	1915238	100 %	0 %	0 %	0 %	357420653
33610	NC_016148	TCGC	2	8	1915256	1915263	0 %	25 %	25 %	50 %	357420653
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33612	NC_016148	GACAG	2	10	1915361	1915370	40 %	0 %	40 %	20 %	357420653
33613	NC_016148	TGA	2	6	1915413	1915418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420653
33614	NC_016148	AAG	2	6	1915419	1915424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420653
33615	NC_016148	AGCA	2	8	1915497	1915504	50 %	0 %	25 %	25 %	357420653
33616	NC_016148	GCCT	2	8	1915511	1915518	0 %	25 %	25 %	50 %	357420653
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