MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_016148	GAA	2	6	1876616	1876621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420623
33003	NC_016148	AGG	2	6	1876657	1876662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420623
33004	NC_016148	AAAGG	2	10	1876769	1876778	60 %	0 %	40 %	0 %	357420623
33005	NC_016148	AGATTG	2	12	1876854	1876865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420623
33006	NC_016148	CCCA	2	8	1876916	1876923	25 %	0 %	0 %	75 %	357420623
33007	NC_016148	CTCA	2	8	1877015	1877022	25 %	25 %	0 %	50 %	357420623
33008	NC_016148	TTC	2	6	1877133	1877138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420624
33009	NC_016148	TTA	2	6	1877395	1877400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420624
33010	NC_016148	ATGT	2	8	1877402	1877409	25 %	50 %	25 %	0 %	357420624
33011	NC_016148	TAT	2	6	1877501	1877506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420624
33012	NC_016148	T	6	6	1877511	1877516	0 %	100 %	0 %	0 %	357420624
33013	NC_016148	ACCC	2	8	1877531	1877538	25 %	0 %	0 %	75 %	357420624
33014	NC_016148	ATA	2	6	1877580	1877585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420624
33015	NC_016148	TCCA	2	8	1877588	1877595	25 %	25 %	0 %	50 %	357420624
33016	NC_016148	ACC	2	6	1877622	1877627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420624
33017	NC_016148	CT	3	6	1877666	1877671	0 %	50 %	0 %	50 %	357420624
33018	NC_016148	ATCC	2	8	1877758	1877765	25 %	25 %	0 %	50 %	357420625
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33020	NC_016148	CAT	2	6	1877915	1877920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420625
33021	NC_016148	AGC	2	6	1877924	1877929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420625
33022	NC_016148	CTC	2	6	1877947	1877952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420625
33023	NC_016148	GCA	2	6	1877955	1877960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420625
33024	NC_016148	ACC	2	6	1877967	1877972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420625
33025	NC_016148	CTT	2	6	1878072	1878077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420625
33026	NC_016148	CTT	2	6	1878177	1878182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420625
33027	NC_016148	CA	3	6	1878210	1878215	50 %	0 %	0 %	50 %	357420625
33028	NC_016148	CCG	2	6	1878259	1878264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420625
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33031	NC_016148	A	7	7	1878951	1878957	100 %	0 %	0 %	0 %	357420626
33032	NC_016148	AGA	2	6	1879192	1879197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420626
33033	NC_016148	AGA	3	9	1879249	1879257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420626
33034	NC_016148	GAA	2	6	1879292	1879297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420626
33035	NC_016148	ACG	2	6	1879335	1879340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420626
33036	NC_016148	TGG	2	6	1879344	1879349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420626
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33038	NC_016148	TATC	2	8	1879463	1879470	25 %	50 %	0 %	25 %	357420626
33039	NC_016148	GCC	2	6	1879508	1879513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420626
33040	NC_016148	TAA	2	6	1879536	1879541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420626
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33042	NC_016148	TTC	2	6	1879634	1879639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420626
33043	NC_016148	AG	3	6	1879823	1879828	50 %	0 %	50 %	0 %	357420627
33044	NC_016148	A	6	6	1879861	1879866	100 %	0 %	0 %	0 %	357420627
33045	NC_016148	GAG	2	6	1879910	1879915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420627
33046	NC_016148	GCT	2	6	1879924	1879929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420627
33047	NC_016148	AAG	2	6	1880001	1880006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420627
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33050	NC_016148	AC	3	6	1880307	1880312	50 %	0 %	0 %	50 %	357420627
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33052	NC_016148	CT	3	6	1880787	1880792	0 %	50 %	0 %	50 %	357420628
33053	NC_016148	AT	3	6	1880793	1880798	50 %	50 %	0 %	0 %	357420628
33054	NC_016148	CTC	2	6	1880801	1880806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420628
33055	NC_016148	ATT	2	6	1880860	1880865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420628
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33057	NC_016148	TACA	2	8	1881024	1881031	50 %	25 %	0 %	25 %	357420628
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33059	NC_016148	TAT	2	6	1881086	1881091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420629
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33061	NC_016148	TCT	2	6	1881148	1881153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420629
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33067	NC_016148	G	6	6	1882310	1882315	0 %	0 %	100 %	0 %	357420630
33068	NC_016148	TCA	2	6	1882343	1882348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420630
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33070	NC_016148	A	7	7	1882435	1882441	100 %	0 %	0 %	0 %	357420630
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33090	NC_016148	CAT	2	6	1883589	1883594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420631
33091	NC_016148	TCATA	2	10	1883708	1883717	40 %	40 %	0 %	20 %	357420631
33092	NC_016148	TAT	2	6	1883736	1883741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420631
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33099	NC_016148	TTC	3	9	1883920	1883928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420632
33100	NC_016148	TAG	2	6	1883979	1883984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420632
33101	NC_016148	CATAC	2	10	1884078	1884087	40 %	20 %	0 %	40 %	357420632
33102	NC_016148	TCTT	2	8	1884100	1884107	0 %	75 %	0 %	25 %	357420632
33103	NC_016148	ATT	2	6	1884118	1884123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420632
33104	NC_016148	GC	3	6	1884175	1884180	0 %	0 %	50 %	50 %	357420632
33105	NC_016148	A	7	7	1884299	1884305	100 %	0 %	0 %	0 %	357420632
33106	NC_016148	GAA	2	6	1884336	1884341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420632
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33108	NC_016148	TCA	2	6	1884362	1884367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420632
33109	NC_016148	A	8	8	1884506	1884513	100 %	0 %	0 %	0 %	357420632
33110	NC_016148	AT	3	6	1884522	1884527	50 %	50 %	0 %	0 %	357420632
33111	NC_016148	A	7	7	1884542	1884548	100 %	0 %	0 %	0 %	357420632
33112	NC_016148	TTC	2	6	1884676	1884681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420633
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33114	NC_016148	CTT	2	6	1884762	1884767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420633
33115	NC_016148	AGT	2	6	1884822	1884827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420633
33116	NC_016148	GACT	2	8	1884843	1884850	25 %	25 %	25 %	25 %	357420633
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33118	NC_016148	ATC	2	6	1884881	1884886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420633
33119	NC_016148	A	6	6	1884887	1884892	100 %	0 %	0 %	0 %	357420633
33120	NC_016148	T	6	6	1884956	1884961	0 %	100 %	0 %	0 %	357420633
33121	NC_016148	ATT	2	6	1885028	1885033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420633
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33132	NC_016148	GAT	2	6	1885326	1885331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420633
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33220	NC_016148	A	8	8	1888851	1888858	100 %	0 %	0 %	0 %	357420636
33221	NC_016148	T	6	6	1888866	1888871	0 %	100 %	0 %	0 %	357420636
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33226	NC_016148	T	7	7	1889017	1889023	0 %	100 %	0 %	0 %	357420636
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33231	NC_016148	A	6	6	1889206	1889211	100 %	0 %	0 %	0 %	357420636
33232	NC_016148	AAT	2	6	1889217	1889222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420636
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33355	NC_016148	CCTG	2	8	1899883	1899890	0 %	25 %	25 %	50 %	357420642
33356	NC_016148	T	6	6	1899907	1899912	0 %	100 %	0 %	0 %	357420642
33357	NC_016148	TC	3	6	1899943	1899948	0 %	50 %	0 %	50 %	357420642
33358	NC_016148	TTCCA	2	10	1899993	1900002	20 %	40 %	0 %	40 %	357420642
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33460	NC_016148	ACA	2	6	1905764	1905769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420646
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33462	NC_016148	CAAC	2	8	1905987	1905994	50 %	0 %	0 %	50 %	357420646
33463	NC_016148	A	6	6	1905997	1906002	100 %	0 %	0 %	0 %	357420646
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33469	NC_016148	CCT	2	6	1906215	1906220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420646
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