MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_016148	CCT	2	6	1843627	1843632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420593
32502	NC_016148	AC	3	6	1843644	1843649	50 %	0 %	0 %	50 %	357420593
32503	NC_016148	T	6	6	1843679	1843684	0 %	100 %	0 %	0 %	357420593
32504	NC_016148	CCA	2	6	1843728	1843733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420593
32505	NC_016148	CTG	2	6	1843778	1843783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420593
32506	NC_016148	AGAA	2	8	1844015	1844022	75 %	0 %	25 %	0 %	357420593
32507	NC_016148	AAT	2	6	1844041	1844046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420593
32508	NC_016148	AGA	2	6	1844127	1844132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420593
32509	NC_016148	AG	3	6	1844165	1844170	50 %	0 %	50 %	0 %	357420593
32510	NC_016148	GAC	2	6	1844236	1844241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420593
32511	NC_016148	AGC	2	6	1844270	1844275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420593
32512	NC_016148	A	6	6	1844297	1844302	100 %	0 %	0 %	0 %	357420593
32513	NC_016148	GAT	2	6	1844344	1844349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420593
32514	NC_016148	AGG	2	6	1844375	1844380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420593
32515	NC_016148	ACC	2	6	1844384	1844389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420593
32516	NC_016148	AAT	2	6	1844398	1844403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420593
32517	NC_016148	AG	3	6	1844477	1844482	50 %	0 %	50 %	0 %	357420593
32518	NC_016148	GTG	2	6	1844501	1844506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420593
32519	NC_016148	TAA	2	6	1844625	1844630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420593
32520	NC_016148	G	6	6	1844774	1844779	0 %	0 %	100 %	0 %	357420593
32521	NC_016148	AGG	2	6	1844808	1844813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420593
32522	NC_016148	GAC	2	6	1844845	1844850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420594
32523	NC_016148	AT	3	6	1844852	1844857	50 %	50 %	0 %	0 %	357420594
32524	NC_016148	AC	3	6	1844867	1844872	50 %	0 %	0 %	50 %	357420594
32525	NC_016148	ACGCA	2	10	1844944	1844953	40 %	0 %	20 %	40 %	357420594
32526	NC_016148	AAG	2	6	1844954	1844959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420594
32527	NC_016148	CTA	2	6	1844968	1844973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420594
32528	NC_016148	A	6	6	1845017	1845022	100 %	0 %	0 %	0 %	357420594
32529	NC_016148	TGA	2	6	1845111	1845116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420594
32530	NC_016148	AT	3	6	1845299	1845304	50 %	50 %	0 %	0 %	357420594
32531	NC_016148	GCAGGA	2	12	1845358	1845369	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357420594
32532	NC_016148	TAC	2	6	1845427	1845432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420594
32533	NC_016148	AAG	2	6	1845567	1845572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420595
32534	NC_016148	CTG	2	6	1846451	1846456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420596
32535	NC_016148	CAA	2	6	1846512	1846517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420596
32536	NC_016148	GCA	3	9	1846529	1846537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420596
32537	NC_016148	GAAG	2	8	1846580	1846587	50 %	0 %	50 %	0 %	357420596
32538	NC_016148	AAG	2	6	1846644	1846649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420596
32539	NC_016148	TAA	2	6	1846656	1846661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420596
32540	NC_016148	ACG	2	6	1846767	1846772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420596
32541	NC_016148	AAT	2	6	1846798	1846803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420596
32542	NC_016148	CT	4	8	1847012	1847019	0 %	50 %	0 %	50 %	357420597
32543	NC_016148	TCC	2	6	1847037	1847042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420597
32544	NC_016148	CAC	2	6	1847062	1847067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420597
32545	NC_016148	TC	3	6	1847232	1847237	0 %	50 %	0 %	50 %	357420597
32546	NC_016148	ACCC	2	8	1847383	1847390	25 %	0 %	0 %	75 %	357420598
32547	NC_016148	TCT	2	6	1847445	1847450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420598
32548	NC_016148	ACC	2	6	1847477	1847482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420598
32549	NC_016148	GGC	2	6	1847553	1847558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420598
32550	NC_016148	TCCT	2	8	1847586	1847593	0 %	50 %	0 %	50 %	357420598
32551	NC_016148	CCA	2	6	1847598	1847603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420598
32552	NC_016148	CTT	2	6	1847627	1847632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420598
32553	NC_016148	ATGA	2	8	1847715	1847722	50 %	25 %	25 %	0 %	357420598
32554	NC_016148	ATC	2	6	1847741	1847746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420598
32555	NC_016148	TCT	2	6	1847777	1847782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420598
32556	NC_016148	TCC	2	6	1847816	1847821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420598
32557	NC_016148	AGA	2	6	1847888	1847893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420598
32558	NC_016148	ATTC	2	8	1847904	1847911	25 %	50 %	0 %	25 %	357420598
32559	NC_016148	CA	3	6	1847950	1847955	50 %	0 %	0 %	50 %	357420598
32560	NC_016148	AG	3	6	1848029	1848034	50 %	0 %	50 %	0 %	357420598
32561	NC_016148	AGG	2	6	1848091	1848096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420598
32562	NC_016148	TC	3	6	1848130	1848135	0 %	50 %	0 %	50 %	357420598
32563	NC_016148	CTT	2	6	1848160	1848165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420598
32564	NC_016148	ATG	2	6	1848341	1848346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420599
32565	NC_016148	CAT	2	6	1848367	1848372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420599
32566	NC_016148	CAG	2	6	1848376	1848381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420599
32567	NC_016148	AGGG	2	8	1848413	1848420	25 %	0 %	75 %	0 %	357420599
32568	NC_016148	GGT	2	6	1848459	1848464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420599
32569	NC_016148	CTA	2	6	1848468	1848473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420599
32570	NC_016148	T	6	6	1848537	1848542	0 %	100 %	0 %	0 %	357420599
32571	NC_016148	TCGTG	2	10	1848594	1848603	0 %	40 %	40 %	20 %	357420599
32572	NC_016148	TCT	2	6	1848645	1848650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420599
32573	NC_016148	TC	3	6	1848706	1848711	0 %	50 %	0 %	50 %	357420599
32574	NC_016148	AGG	2	6	1848738	1848743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420599
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32576	NC_016148	AG	3	6	1848878	1848883	50 %	0 %	50 %	0 %	357420599
32577	NC_016148	TCT	2	6	1848887	1848892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420599
32578	NC_016148	TCC	2	6	1848893	1848898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420599
32579	NC_016148	CTC	2	6	1848931	1848936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420599
32580	NC_016148	TTAG	2	8	1848989	1848996	25 %	50 %	25 %	0 %	357420599
32581	NC_016148	CGTA	2	8	1849032	1849039	25 %	25 %	25 %	25 %	357420599
32582	NC_016148	CCT	2	6	1849176	1849181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420600
32583	NC_016148	GCT	2	6	1849268	1849273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420600
32584	NC_016148	AGA	2	6	1849276	1849281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420600
32585	NC_016148	AAC	2	6	1849289	1849294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420600
32586	NC_016148	TGGCAA	2	12	1849305	1849316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357420600
32587	NC_016148	ATC	2	6	1849340	1849345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420600
32588	NC_016148	AGA	2	6	1849499	1849504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420600
32589	NC_016148	CAG	2	6	1849516	1849521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420600
32590	NC_016148	GGA	2	6	1849551	1849556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420600
32591	NC_016148	AAGGC	2	10	1849626	1849635	40 %	0 %	40 %	20 %	357420600
32592	NC_016148	GGCAT	2	10	1849679	1849688	20 %	20 %	40 %	20 %	357420600
32593	NC_016148	CCA	2	6	1849752	1849757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420600
32594	NC_016148	TTA	2	6	1849775	1849780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420600
32595	NC_016148	TCCTG	2	10	1849877	1849886	0 %	40 %	20 %	40 %	357420600
32596	NC_016148	TAT	2	6	1849891	1849896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420600
32597	NC_016148	AGGA	2	8	1849906	1849913	50 %	0 %	50 %	0 %	357420600
32598	NC_016148	TGA	2	6	1849983	1849988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420600
32599	NC_016148	ATCT	2	8	1850044	1850051	25 %	50 %	0 %	25 %	357420600
32600	NC_016148	CAT	2	6	1850068	1850073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420600
32601	NC_016148	GAA	2	6	1850074	1850079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420600
32602	NC_016148	TC	3	6	1850209	1850214	0 %	50 %	0 %	50 %	357420600
32603	NC_016148	AAC	2	6	1850216	1850221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420600
32604	NC_016148	GAA	2	6	1850336	1850341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420601
32605	NC_016148	GAA	2	6	1850378	1850383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420601
32606	NC_016148	CCT	2	6	1850392	1850397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420601
32607	NC_016148	CAG	2	6	1850406	1850411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420601
32608	NC_016148	GAA	2	6	1850701	1850706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420602
32609	NC_016148	ATC	2	6	1850746	1850751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420602
32610	NC_016148	ACC	2	6	1850765	1850770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420602
32611	NC_016148	CGC	2	6	1850811	1850816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420602
32612	NC_016148	AG	3	6	1850817	1850822	50 %	0 %	50 %	0 %	357420602
32613	NC_016148	CAG	2	6	1850949	1850954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420602
32614	NC_016148	A	7	7	1851035	1851041	100 %	0 %	0 %	0 %	357420602
32615	NC_016148	T	7	7	1851051	1851057	0 %	100 %	0 %	0 %	357420602
32616	NC_016148	CCT	2	6	1851074	1851079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420603
32617	NC_016148	T	7	7	1851087	1851093	0 %	100 %	0 %	0 %	357420603
32618	NC_016148	TCC	2	6	1851135	1851140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420603
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32967	NC_016148	TTC	2	6	1874965	1874970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420622
32968	NC_016148	CTAC	2	8	1874980	1874987	25 %	25 %	0 %	50 %	357420622
32969	NC_016148	AT	4	8	1875091	1875098	50 %	50 %	0 %	0 %	357420622
32970	NC_016148	CAT	2	6	1875110	1875115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420622
32971	NC_016148	CAA	2	6	1875117	1875122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420622
32972	NC_016148	CTT	2	6	1875167	1875172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420622
32973	NC_016148	TCA	2	6	1875195	1875200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420622
32974	NC_016148	ATC	2	6	1875230	1875235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420622
32975	NC_016148	AGA	2	6	1875366	1875371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420622
32976	NC_016148	CCA	2	6	1875480	1875485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420622
32977	NC_016148	T	6	6	1875609	1875614	0 %	100 %	0 %	0 %	357420622
32978	NC_016148	CTT	2	6	1875616	1875621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420622
32979	NC_016148	TCC	2	6	1875644	1875649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420622
32980	NC_016148	AGCA	2	8	1875663	1875670	50 %	0 %	25 %	25 %	357420622
32981	NC_016148	CA	3	6	1875683	1875688	50 %	0 %	0 %	50 %	357420622
32982	NC_016148	CATGAC	2	12	1875792	1875803	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357420622
32983	NC_016148	CAAC	2	8	1875872	1875879	50 %	0 %	0 %	50 %	357420622
32984	NC_016148	GAA	2	6	1875895	1875900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420622
32985	NC_016148	CTC	2	6	1875943	1875948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420622
32986	NC_016148	TTC	2	6	1875971	1875976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420622
32987	NC_016148	GAGT	2	8	1876008	1876015	25 %	25 %	50 %	0 %	357420622
32988	NC_016148	ATA	2	6	1876026	1876031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420622
32989	NC_016148	ATA	2	6	1876092	1876097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420623
32990	NC_016148	AAAG	2	8	1876111	1876118	75 %	0 %	25 %	0 %	357420623
32991	NC_016148	ACA	2	6	1876160	1876165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420623
32992	NC_016148	GGC	3	9	1876238	1876246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420623
32993	NC_016148	AGGT	2	8	1876272	1876279	25 %	25 %	50 %	0 %	357420623
32994	NC_016148	GAA	2	6	1876322	1876327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420623
32995	NC_016148	A	6	6	1876345	1876350	100 %	0 %	0 %	0 %	357420623
32996	NC_016148	ACT	2	6	1876381	1876386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420623
32997	NC_016148	TTGG	2	8	1876391	1876398	0 %	50 %	50 %	0 %	357420623
32998	NC_016148	CAG	3	9	1876445	1876453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420623
32999	NC_016148	ACCAGA	2	12	1876480	1876491	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357420623
33000	NC_016148	GCA	2	6	1876540	1876545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420623

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