MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

< Previous12...58596061626364656667686970Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_016148	TGC	2	6	1813224	1813229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420567
32003	NC_016148	GGA	2	6	1813258	1813263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420567
32004	NC_016148	TGG	2	6	1813338	1813343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420567
32005	NC_016148	TGA	2	6	1813456	1813461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420567
32006	NC_016148	A	6	6	1813522	1813527	100 %	0 %	0 %	0 %	357420567
32007	NC_016148	GAG	2	6	1813793	1813798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420567
32008	NC_016148	GCC	2	6	1814208	1814213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420568
32009	NC_016148	CCA	2	6	1814311	1814316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420568
32010	NC_016148	CA	3	6	1814421	1814426	50 %	0 %	0 %	50 %	357420568
32011	NC_016148	GCC	2	6	1814442	1814447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420568
32012	NC_016148	AGG	2	6	1814512	1814517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420568
32013	NC_016148	GTGG	2	8	1814526	1814533	0 %	25 %	75 %	0 %	357420568
32014	NC_016148	AGA	2	6	1814564	1814569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420568
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32017	NC_016148	TGGA	2	8	1814872	1814879	25 %	25 %	50 %	0 %	357420568
32018	NC_016148	TGG	2	6	1814914	1814919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420568
32019	NC_016148	GAG	2	6	1814965	1814970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420568
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32042	NC_016148	AGA	2	6	1816330	1816335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420569
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32049	NC_016148	AGT	2	6	1816519	1816524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420569
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32051	NC_016148	T	6	6	1816617	1816622	0 %	100 %	0 %	0 %	357420570
32052	NC_016148	ATC	2	6	1816630	1816635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420570
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32054	NC_016148	CGG	2	6	1816718	1816723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420570
32055	NC_016148	GGT	2	6	1816740	1816745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420570
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32058	NC_016148	TGA	2	6	1816919	1816924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420570
32059	NC_016148	CATAGT	2	12	1817010	1817021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357420570
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32062	NC_016148	CTGT	2	8	1817096	1817103	0 %	50 %	25 %	25 %	357420570
32063	NC_016148	CCA	2	6	1817162	1817167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420570
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32093	NC_016148	GAAA	2	8	1818823	1818830	75 %	0 %	25 %	0 %	357420571
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32117	NC_016148	GTA	2	6	1820355	1820360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420572
32118	NC_016148	TCC	2	6	1820361	1820366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420572
32119	NC_016148	A	6	6	1820385	1820390	100 %	0 %	0 %	0 %	357420572
32120	NC_016148	TAC	2	6	1820525	1820530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420573
32121	NC_016148	GAAAA	2	10	1820594	1820603	80 %	0 %	20 %	0 %	357420573
32122	NC_016148	TAT	2	6	1820609	1820614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420573
32123	NC_016148	TGG	2	6	1820626	1820631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420573
32124	NC_016148	CT	3	6	1820632	1820637	0 %	50 %	0 %	50 %	357420573
32125	NC_016148	CTC	2	6	1820647	1820652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420573
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32128	NC_016148	TAT	2	6	1820780	1820785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420573
32129	NC_016148	TATC	2	8	1820790	1820797	25 %	50 %	0 %	25 %	357420573
32130	NC_016148	CCAAA	2	10	1820882	1820891	60 %	0 %	0 %	40 %	357420573
32131	NC_016148	GAA	2	6	1820906	1820911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420573
32132	NC_016148	ATC	2	6	1821036	1821041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420573
32133	NC_016148	TACC	2	8	1821112	1821119	25 %	25 %	0 %	50 %	357420573
32134	NC_016148	TTG	2	6	1821141	1821146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420573
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32137	NC_016148	TGG	2	6	1821319	1821324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420573
32138	NC_016148	GCT	2	6	1821474	1821479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420573
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32140	NC_016148	GTT	2	6	1821524	1821529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420573
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32143	NC_016148	GAG	2	6	1821574	1821579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420574
32144	NC_016148	ATG	2	6	1821638	1821643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420574
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32146	NC_016148	ATT	2	6	1821692	1821697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420574
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32148	NC_016148	TCT	2	6	1821747	1821752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420574
32149	NC_016148	CTT	2	6	1821860	1821865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420574
32150	NC_016148	TGA	2	6	1821872	1821877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420574
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32152	NC_016148	CT	4	8	1822257	1822264	0 %	50 %	0 %	50 %	357420574
32153	NC_016148	AGA	2	6	1822315	1822320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420574
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32187	NC_016148	CTT	2	6	1824787	1824792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420576
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32192	NC_016148	GA	3	6	1825090	1825095	50 %	0 %	50 %	0 %	357420576
32193	NC_016148	GTC	2	6	1825193	1825198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420576
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32206	NC_016148	CCAT	2	8	1825894	1825901	25 %	25 %	0 %	50 %	357420577
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32217	NC_016148	CAT	2	6	1826821	1826826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420578
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32219	NC_016148	CAA	2	6	1826841	1826846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420578
32220	NC_016148	CTC	2	6	1826894	1826899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420578
32221	NC_016148	GCCC	2	8	1826905	1826912	0 %	0 %	25 %	75 %	357420578
32222	NC_016148	GCA	3	9	1826945	1826953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420578
32223	NC_016148	GCG	2	6	1827014	1827019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420578
32224	NC_016148	CCG	2	6	1827048	1827053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420578
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32226	NC_016148	T	6	6	1827096	1827101	0 %	100 %	0 %	0 %	357420578
32227	NC_016148	CCA	2	6	1827113	1827118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420578
32228	NC_016148	AG	3	6	1827166	1827171	50 %	0 %	50 %	0 %	357420578
32229	NC_016148	GAT	2	6	1827211	1827216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420578
32230	NC_016148	TCCT	2	8	1827265	1827272	0 %	50 %	0 %	50 %	357420578
32231	NC_016148	ATCT	2	8	1827306	1827313	25 %	50 %	0 %	25 %	357420579
32232	NC_016148	TGC	2	6	1827357	1827362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420579
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32351	NC_016148	TTAT	2	8	1835128	1835135	25 %	75 %	0 %	0 %	357420584
32352	NC_016148	GTT	2	6	1835238	1835243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420584
32353	NC_016148	GTA	2	6	1835244	1835249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420584
32354	NC_016148	TA	3	6	1835263	1835268	50 %	50 %	0 %	0 %	357420584
32355	NC_016148	T	6	6	1835296	1835301	0 %	100 %	0 %	0 %	357420584
32356	NC_016148	AAG	2	6	1835351	1835356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420584
32357	NC_016148	ACC	2	6	1835446	1835451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420584
32358	NC_016148	TGACC	2	10	1835453	1835462	20 %	20 %	20 %	40 %	357420584
32359	NC_016148	TTA	2	6	1835513	1835518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420584
32360	NC_016148	TCT	2	6	1835545	1835550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420584
32361	NC_016148	GCA	2	6	1835573	1835578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420584
32362	NC_016148	TGA	2	6	1835880	1835885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420585
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32364	NC_016148	ATG	2	6	1835993	1835998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420585
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32367	NC_016148	GTA	2	6	1836092	1836097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420585
32368	NC_016148	GCA	2	6	1836122	1836127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420585
32369	NC_016148	CAA	2	6	1836133	1836138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420585
32370	NC_016148	GAA	3	9	1836140	1836148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420585
32371	NC_016148	AGC	2	6	1836175	1836180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420585
32372	NC_016148	GGA	2	6	1836218	1836223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420585
32373	NC_016148	GGC	2	6	1836302	1836307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420585
32374	NC_016148	GAC	2	6	1836311	1836316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420585
32375	NC_016148	GAT	2	6	1836355	1836360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420585
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32377	NC_016148	GAAG	2	8	1836397	1836404	50 %	0 %	50 %	0 %	357420585
32378	NC_016148	TCC	2	6	1836410	1836415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420585
32379	NC_016148	TGG	2	6	1836598	1836603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420586
32380	NC_016148	GAT	2	6	1836650	1836655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420586
32381	NC_016148	AG	3	6	1836671	1836676	50 %	0 %	50 %	0 %	357420586
32382	NC_016148	CCT	2	6	1836683	1836688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420586
32383	NC_016148	GGC	2	6	1836698	1836703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420586
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32385	NC_016148	TCC	2	6	1836792	1836797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420586
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32387	NC_016148	TGC	2	6	1836838	1836843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420586
32388	NC_016148	ACCT	2	8	1836925	1836932	25 %	25 %	0 %	50 %	357420586
32389	NC_016148	ATA	2	6	1836939	1836944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420586
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32392	NC_016148	AT	3	6	1837035	1837040	50 %	50 %	0 %	0 %	357420586
32393	NC_016148	GGC	2	6	1837161	1837166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420586
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32422	NC_016148	ATGGAG	2	12	1838620	1838631	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	357420588
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32424	NC_016148	GC	3	6	1838817	1838822	0 %	0 %	50 %	50 %	357420588
32425	NC_016148	TCCT	2	8	1838908	1838915	0 %	50 %	0 %	50 %	357420588
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32452	NC_016148	GAC	2	6	1840363	1840368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420589
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32455	NC_016148	CAG	2	6	1840508	1840513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420589
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32457	NC_016148	GGA	2	6	1840753	1840758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420589
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32459	NC_016148	ACC	2	6	1840926	1840931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420590
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32462	NC_016148	ATA	2	6	1841077	1841082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420590
32463	NC_016148	AGATG	2	10	1841108	1841117	40 %	20 %	40 %	0 %	357420590
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32467	NC_016148	C	6	6	1841423	1841428	0 %	0 %	0 %	100 %	357420590
32468	NC_016148	GCC	2	6	1841455	1841460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420590
32469	NC_016148	GAA	2	6	1841494	1841499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420590
32470	NC_016148	CAA	2	6	1841607	1841612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420590
32471	NC_016148	ACC	2	6	1841663	1841668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420590
32472	NC_016148	CAT	2	6	1841694	1841699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420590
32473	NC_016148	ACC	2	6	1841717	1841722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420590
32474	NC_016148	T	6	6	1841945	1841950	0 %	100 %	0 %	0 %	357420591
32475	NC_016148	ATA	2	6	1842005	1842010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420591
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32477	NC_016148	T	7	7	1842170	1842176	0 %	100 %	0 %	0 %	357420591
32478	NC_016148	TTC	2	6	1842267	1842272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420591
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32480	NC_016148	CGA	2	6	1842393	1842398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420592
32481	NC_016148	GAACC	2	10	1842399	1842408	40 %	0 %	20 %	40 %	357420592
32482	NC_016148	TGG	2	6	1842446	1842451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420592
32483	NC_016148	TAA	2	6	1842455	1842460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420592
32484	NC_016148	CTTT	2	8	1842528	1842535	0 %	75 %	0 %	25 %	357420592
32485	NC_016148	CT	3	6	1842825	1842830	0 %	50 %	0 %	50 %	357420592
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32488	NC_016148	CTG	2	6	1843051	1843056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420592
32489	NC_016148	GCA	2	6	1843078	1843083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420592
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32491	NC_016148	GGCA	2	8	1843194	1843201	25 %	0 %	50 %	25 %	357420592
32492	NC_016148	AAT	2	6	1843206	1843211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420592
32493	NC_016148	A	6	6	1843309	1843314	100 %	0 %	0 %	0 %	357420592
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32495	NC_016148	GAG	2	6	1843402	1843407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420592
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32497	NC_016148	C	6	6	1843466	1843471	0 %	0 %	0 %	100 %	357420593
32498	NC_016148	TTC	2	6	1843553	1843558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420593
32499	NC_016148	GGA	2	6	1843601	1843606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420593
32500	NC_016148	TGC	3	9	1843615	1843623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420593

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