MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_016148	CATG	2	8	1727814	1727821	25 %	25 %	25 %	25 %	357420488
30503	NC_016148	GAA	2	6	1727845	1727850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420488
30504	NC_016148	C	6	6	1727935	1727940	0 %	0 %	0 %	100 %	357420488
30505	NC_016148	A	6	6	1727983	1727988	100 %	0 %	0 %	0 %	357420488
30506	NC_016148	AAC	2	6	1727996	1728001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420488
30507	NC_016148	CGGAG	2	10	1728106	1728115	20 %	0 %	60 %	20 %	357420489
30508	NC_016148	TGC	2	6	1728147	1728152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420489
30509	NC_016148	AAAT	2	8	1728375	1728382	75 %	25 %	0 %	0 %	357420489
30510	NC_016148	GTT	2	6	1728532	1728537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420489
30511	NC_016148	TGA	2	6	1728544	1728549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420489
30512	NC_016148	AAC	2	6	1728554	1728559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420489
30513	NC_016148	GAA	2	6	1728605	1728610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420489
30514	NC_016148	AGG	2	6	1728667	1728672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420489
30515	NC_016148	TTG	2	6	1728723	1728728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420489
30516	NC_016148	TAC	2	6	1728752	1728757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420489
30517	NC_016148	GCT	2	6	1728770	1728775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420489
30518	NC_016148	C	6	6	1728850	1728855	0 %	0 %	0 %	100 %	357420489
30519	NC_016148	AG	3	6	1728959	1728964	50 %	0 %	50 %	0 %	357420489
30520	NC_016148	GGA	2	6	1728970	1728975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420489
30521	NC_016148	GAAA	2	8	1729049	1729056	75 %	0 %	25 %	0 %	357420489
30522	NC_016148	A	7	7	1729075	1729081	100 %	0 %	0 %	0 %	357420489
30523	NC_016148	T	6	6	1729113	1729118	0 %	100 %	0 %	0 %	357420489
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30526	NC_016148	GAA	2	6	1729241	1729246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420489
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30528	NC_016148	C	6	6	1729798	1729803	0 %	0 %	0 %	100 %	357420490
30529	NC_016148	GCT	2	6	1729822	1729827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420490
30530	NC_016148	TTTCT	2	10	1729856	1729865	0 %	80 %	0 %	20 %	357420490
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30533	NC_016148	AGAA	2	8	1729957	1729964	75 %	0 %	25 %	0 %	357420490
30534	NC_016148	AAATA	2	10	1730056	1730065	80 %	20 %	0 %	0 %	357420490
30535	NC_016148	CCT	2	6	1730140	1730145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420490
30536	NC_016148	ATC	2	6	1730183	1730188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420490
30537	NC_016148	AGC	2	6	1730203	1730208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420490
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30539	NC_016148	GAA	2	6	1730266	1730271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420490
30540	NC_016148	CCT	2	6	1730321	1730326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420490
30541	NC_016148	CGG	2	6	1730336	1730341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420490
30542	NC_016148	AGT	2	6	1730503	1730508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420490
30543	NC_016148	GGA	2	6	1730533	1730538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420490
30544	NC_016148	ATACC	2	10	1730571	1730580	40 %	20 %	0 %	40 %	357420490
30545	NC_016148	TGC	2	6	1730668	1730673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420490
30546	NC_016148	CGA	2	6	1730728	1730733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420490
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30548	NC_016148	TGG	2	6	1730787	1730792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420490
30549	NC_016148	CTA	2	6	1730839	1730844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420490
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30551	NC_016148	GACCAT	2	12	1730908	1730919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357420490
30552	NC_016148	TGA	2	6	1730920	1730925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420490
30553	NC_016148	TTC	2	6	1730936	1730941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420490
30554	NC_016148	GGAA	2	8	1731005	1731012	50 %	0 %	50 %	0 %	357420490
30555	NC_016148	CTG	2	6	1731017	1731022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420490
30556	NC_016148	ACAT	2	8	1731044	1731051	50 %	25 %	0 %	25 %	357420490
30557	NC_016148	TTC	2	6	1731055	1731060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420490
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30559	NC_016148	GAG	2	6	1731104	1731109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420490
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30570	NC_016148	GAAA	2	8	1731698	1731705	75 %	0 %	25 %	0 %	357420491
30571	NC_016148	ATT	2	6	1731765	1731770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420491
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30588	NC_016148	CTGG	2	8	1732668	1732675	0 %	25 %	50 %	25 %	357420492
30589	NC_016148	T	6	6	1732697	1732702	0 %	100 %	0 %	0 %	357420492
30590	NC_016148	ACGGC	2	10	1732759	1732768	20 %	0 %	40 %	40 %	357420492
30591	NC_016148	TTAC	2	8	1732782	1732789	25 %	50 %	0 %	25 %	357420492
30592	NC_016148	GTG	2	6	1732835	1732840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420492
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30601	NC_016148	GGA	2	6	1733500	1733505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420493
30602	NC_016148	AAG	2	6	1733584	1733589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420493
30603	NC_016148	GTC	2	6	1733592	1733597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420493
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30605	NC_016148	CAG	2	6	1733963	1733968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420494
30606	NC_016148	CCA	2	6	1734038	1734043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420494
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30608	NC_016148	TTGG	2	8	1734258	1734265	0 %	50 %	50 %	0 %	357420494
30609	NC_016148	CAT	2	6	1734270	1734275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420494
30610	NC_016148	G	6	6	1734285	1734290	0 %	0 %	100 %	0 %	357420494
30611	NC_016148	GGA	2	6	1734339	1734344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420494
30612	NC_016148	GGA	2	6	1734403	1734408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420494
30613	NC_016148	CGG	2	6	1734432	1734437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420494
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30615	NC_016148	CTT	2	6	1734594	1734599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420494
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