MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_016148	A	6	6	1701558	1701563	100 %	0 %	0 %	0 %	357420464
30002	NC_016148	CCT	2	6	1701568	1701573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420464
30003	NC_016148	CTGA	2	8	1701810	1701817	25 %	25 %	25 %	25 %	357420464
30004	NC_016148	CGAAG	2	10	1701821	1701830	40 %	0 %	40 %	20 %	357420464
30005	NC_016148	A	6	6	1701845	1701850	100 %	0 %	0 %	0 %	357420464
30006	NC_016148	A	6	6	1701860	1701865	100 %	0 %	0 %	0 %	357420464
30007	NC_016148	CGA	2	6	1701905	1701910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420464
30008	NC_016148	GCC	2	6	1701981	1701986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420464
30009	NC_016148	AGA	2	6	1702121	1702126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420464
30010	NC_016148	AGGA	2	8	1702183	1702190	50 %	0 %	50 %	0 %	357420464
30011	NC_016148	TTC	2	6	1702203	1702208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420464
30012	NC_016148	GAG	2	6	1702224	1702229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420464
30013	NC_016148	AGA	3	9	1702271	1702279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420464
30014	NC_016148	GTG	2	6	1702284	1702289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420464
30015	NC_016148	TAG	2	6	1702303	1702308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420464
30016	NC_016148	CTG	2	6	1702332	1702337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420464
30017	NC_016148	GCC	2	6	1702404	1702409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420464
30018	NC_016148	ACA	2	6	1702438	1702443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420464
30019	NC_016148	TGA	2	6	1702493	1702498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420464
30020	NC_016148	GAA	2	6	1702572	1702577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420464
30021	NC_016148	CAA	2	6	1702612	1702617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420464
30022	NC_016148	A	8	8	1702655	1702662	100 %	0 %	0 %	0 %	357420464
30023	NC_016148	CAT	2	6	1702663	1702668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420465
30024	NC_016148	TGA	2	6	1702803	1702808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420465
30025	NC_016148	GAAG	2	8	1702861	1702868	50 %	0 %	50 %	0 %	357420465
30026	NC_016148	GCGT	2	8	1702895	1702902	0 %	25 %	50 %	25 %	357420465
30027	NC_016148	ATG	2	6	1702985	1702990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420465
30028	NC_016148	A	6	6	1703003	1703008	100 %	0 %	0 %	0 %	357420465
30029	NC_016148	TGG	2	6	1703046	1703051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420465
30030	NC_016148	AG	3	6	1703063	1703068	50 %	0 %	50 %	0 %	357420465
30031	NC_016148	CAC	2	6	1703069	1703074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420465
30032	NC_016148	TAGCAA	2	12	1703112	1703123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357420465
30033	NC_016148	AAT	2	6	1703135	1703140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420465
30034	NC_016148	CAGT	2	8	1703187	1703194	25 %	25 %	25 %	25 %	357420465
30035	NC_016148	AAT	2	6	1703200	1703205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420465
30036	NC_016148	T	6	6	1703211	1703216	0 %	100 %	0 %	0 %	357420465
30037	NC_016148	ACG	2	6	1703226	1703231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420465
30038	NC_016148	ATA	2	6	1703246	1703251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420465
30039	NC_016148	CTTC	2	8	1703277	1703284	0 %	50 %	0 %	50 %	357420465
30040	NC_016148	AAT	2	6	1703357	1703362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420466
30041	NC_016148	AAAT	2	8	1703390	1703397	75 %	25 %	0 %	0 %	357420466
30042	NC_016148	GCC	2	6	1703439	1703444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420466
30043	NC_016148	TAA	3	9	1703446	1703454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420466
30044	NC_016148	GCG	2	6	1703551	1703556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420466
30045	NC_016148	ACCAA	2	10	1703577	1703586	60 %	0 %	0 %	40 %	357420466
30046	NC_016148	ATA	2	6	1703808	1703813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420466
30047	NC_016148	ATAA	2	8	1703874	1703881	75 %	25 %	0 %	0 %	357420466
30048	NC_016148	CTG	2	6	1703904	1703909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420466
30049	NC_016148	GAC	2	6	1703946	1703951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420466
30050	NC_016148	A	6	6	1703980	1703985	100 %	0 %	0 %	0 %	357420466
30051	NC_016148	CAG	2	6	1704061	1704066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420466
30052	NC_016148	AAC	2	6	1704079	1704084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420466
30053	NC_016148	TAA	2	6	1704088	1704093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420466
30054	NC_016148	GCC	2	6	1704162	1704167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420466
30055	NC_016148	CGTTAC	2	12	1704260	1704271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357420466
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30057	NC_016148	GGA	2	6	1704372	1704377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420466
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30059	NC_016148	GTG	2	6	1704414	1704419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420466
30060	NC_016148	GTA	2	6	1704703	1704708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420467
30061	NC_016148	TCA	2	6	1704758	1704763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420467
30062	NC_016148	GCT	2	6	1704816	1704821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420467
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30064	NC_016148	A	6	6	1704896	1704901	100 %	0 %	0 %	0 %	357420467
30065	NC_016148	GCT	2	6	1704934	1704939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420467
30066	NC_016148	CT	3	6	1704962	1704967	0 %	50 %	0 %	50 %	357420467
30067	NC_016148	GAA	2	6	1705024	1705029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420467
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30070	NC_016148	CAAGG	2	10	1705174	1705183	40 %	0 %	40 %	20 %	357420467
30071	NC_016148	CGA	2	6	1705296	1705301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420467
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30077	NC_016148	TCG	2	6	1705603	1705608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420468
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30081	NC_016148	TGGC	2	8	1705801	1705808	0 %	25 %	50 %	25 %	357420468
30082	NC_016148	GCG	2	6	1705855	1705860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420468
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30084	NC_016148	TTTC	2	8	1706014	1706021	0 %	75 %	0 %	25 %	357420468
30085	NC_016148	TTTTG	2	10	1706087	1706096	0 %	80 %	20 %	0 %	357420469
30086	NC_016148	A	6	6	1706244	1706249	100 %	0 %	0 %	0 %	357420469
30087	NC_016148	CAGTT	2	10	1706296	1706305	20 %	40 %	20 %	20 %	357420469
30088	NC_016148	CCT	2	6	1706320	1706325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420469
30089	NC_016148	AGG	2	6	1706352	1706357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420469
30090	NC_016148	G	6	6	1706369	1706374	0 %	0 %	100 %	0 %	357420469
30091	NC_016148	GAA	2	6	1706394	1706399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420469
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30095	NC_016148	TACAG	2	10	1706454	1706463	40 %	20 %	20 %	20 %	357420469
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30102	NC_016148	TTC	2	6	1706701	1706706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420470
30103	NC_016148	TCAT	2	8	1706747	1706754	25 %	50 %	0 %	25 %	357420470
30104	NC_016148	GA	3	6	1706779	1706784	50 %	0 %	50 %	0 %	357420470
30105	NC_016148	TGC	2	6	1706799	1706804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420470
30106	NC_016148	AAG	2	6	1706863	1706868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420470
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30108	NC_016148	ATT	2	6	1706894	1706899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420470
30109	NC_016148	GAG	2	6	1707001	1707006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420470
30110	NC_016148	AAC	2	6	1707043	1707048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420470
30111	NC_016148	AAG	2	6	1707150	1707155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420470
30112	NC_016148	TCTT	2	8	1707249	1707256	0 %	75 %	0 %	25 %	357420470
30113	NC_016148	GCTG	2	8	1707328	1707335	0 %	25 %	50 %	25 %	357420470
30114	NC_016148	TTTTG	2	10	1707387	1707396	0 %	80 %	20 %	0 %	357420470
30115	NC_016148	TCT	2	6	1707443	1707448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420471
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30117	NC_016148	AGA	2	6	1707618	1707623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420471
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30342	NC_016148	T	7	7	1719214	1719220	0 %	100 %	0 %	0 %	357420481
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30352	NC_016148	TGG	2	6	1719958	1719963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420482
30353	NC_016148	GAA	2	6	1720103	1720108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420482
30354	NC_016148	A	7	7	1720126	1720132	100 %	0 %	0 %	0 %	357420482
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30356	NC_016148	GCA	2	6	1720244	1720249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420482
30357	NC_016148	AG	3	6	1720250	1720255	50 %	0 %	50 %	0 %	357420482
30358	NC_016148	ACT	3	9	1720395	1720403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420482
30359	NC_016148	CAC	2	6	1720480	1720485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420482
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30449	NC_016148	CTC	2	6	1725169	1725174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420486
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30455	NC_016148	CTG	2	6	1725475	1725480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420486
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30460	NC_016148	CGT	2	6	1725727	1725732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420487
30461	NC_016148	TC	3	6	1725760	1725765	0 %	50 %	0 %	50 %	357420487
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30465	NC_016148	TC	3	6	1725905	1725910	0 %	50 %	0 %	50 %	357420487
30466	NC_016148	AT	3	6	1726018	1726023	50 %	50 %	0 %	0 %	357420487
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