MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016148	TATGA	2	10	132722	132731	40 %	40 %	20 %	0 %	357418976
2502	NC_016148	GAG	2	6	132758	132763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418976
2503	NC_016148	T	6	6	132779	132784	0 %	100 %	0 %	0 %	357418976
2504	NC_016148	CTG	2	6	132839	132844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418976
2505	NC_016148	ATG	2	6	132922	132927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418977
2506	NC_016148	ATGG	2	8	133072	133079	25 %	25 %	50 %	0 %	357418977
2507	NC_016148	TGG	2	6	133208	133213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418977
2508	NC_016148	TCA	2	6	133262	133267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418977
2509	NC_016148	AAGG	2	8	133328	133335	50 %	0 %	50 %	0 %	357418977
2510	NC_016148	AGG	2	6	133386	133391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418977
2511	NC_016148	AGG	2	6	133400	133405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418977
2512	NC_016148	TCC	2	6	133462	133467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418977
2513	NC_016148	TTC	2	6	133485	133490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418978
2514	NC_016148	GTT	2	6	133529	133534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418978
2515	NC_016148	TTC	2	6	133599	133604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418978
2516	NC_016148	TCT	2	6	133657	133662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418978
2517	NC_016148	TGC	2	6	133670	133675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418978
2518	NC_016148	AG	3	6	133680	133685	50 %	0 %	50 %	0 %	357418978
2519	NC_016148	GCA	2	6	133708	133713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418978
2520	NC_016148	GTT	2	6	133728	133733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418978
2521	NC_016148	GGT	2	6	133810	133815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418978
2522	NC_016148	G	6	6	133825	133830	0 %	0 %	100 %	0 %	357418978
2523	NC_016148	CTT	2	6	133877	133882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418978
2524	NC_016148	TAA	2	6	133897	133902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418978
2525	NC_016148	ATG	2	6	133918	133923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418978
2526	NC_016148	A	6	6	133951	133956	100 %	0 %	0 %	0 %	357418978
2527	NC_016148	CAT	2	6	134431	134436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418979
2528	NC_016148	TGA	2	6	134466	134471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418979
2529	NC_016148	A	6	6	134477	134482	100 %	0 %	0 %	0 %	357418979
2530	NC_016148	ATT	2	6	134503	134508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418979
2531	NC_016148	A	6	6	134513	134518	100 %	0 %	0 %	0 %	357418979
2532	NC_016148	AGA	2	6	134606	134611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418979
2533	NC_016148	AG	3	6	134618	134623	50 %	0 %	50 %	0 %	357418979
2534	NC_016148	AT	3	6	134646	134651	50 %	50 %	0 %	0 %	357418979
2535	NC_016148	AAC	2	6	134684	134689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418979
2536	NC_016148	A	6	6	134699	134704	100 %	0 %	0 %	0 %	357418979
2537	NC_016148	CTA	2	6	134731	134736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418979
2538	NC_016148	CCA	2	6	134813	134818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418979
2539	NC_016148	TGC	2	6	134827	134832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418979
2540	NC_016148	TTC	2	6	134996	135001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418979
2541	NC_016148	CGG	2	6	135025	135030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418979
2542	NC_016148	GAA	2	6	135035	135040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418979
2543	NC_016148	AGAAAA	2	12	135044	135055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	357418979
2544	NC_016148	CTCTC	2	10	135093	135102	0 %	40 %	0 %	60 %	357418979
2545	NC_016148	AAG	2	6	135120	135125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418979
2546	NC_016148	GAT	2	6	135158	135163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418979
2547	NC_016148	A	6	6	135300	135305	100 %	0 %	0 %	0 %	357418979
2548	NC_016148	TGG	2	6	135393	135398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418979
2549	NC_016148	CCA	2	6	135424	135429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418979
2550	NC_016148	AGG	2	6	135628	135633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418980
2551	NC_016148	CGT	2	6	135634	135639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418980
2552	NC_016148	GT	3	6	135638	135643	0 %	50 %	50 %	0 %	357418980
2553	NC_016148	TGAG	2	8	135652	135659	25 %	25 %	50 %	0 %	357418980
2554	NC_016148	AGC	2	6	135704	135709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418980
2555	NC_016148	GAAG	2	8	135730	135737	50 %	0 %	50 %	0 %	357418980
2556	NC_016148	TAG	2	6	135775	135780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418980
2557	NC_016148	AGG	2	6	135889	135894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418980
2558	NC_016148	CAA	2	6	135905	135910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418980
2559	NC_016148	GAG	3	9	135929	135937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418980
2560	NC_016148	GAAG	2	8	136008	136015	50 %	0 %	50 %	0 %	357418980
2561	NC_016148	TGG	2	6	136129	136134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418980
2562	NC_016148	TG	3	6	136414	136419	0 %	50 %	50 %	0 %	357418980
2563	NC_016148	AGA	2	6	136460	136465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418980
2564	NC_016148	GTA	2	6	136573	136578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418980
2565	NC_016148	AAG	2	6	136738	136743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418980
2566	NC_016148	CCAT	2	8	136785	136792	25 %	25 %	0 %	50 %	357418980
2567	NC_016148	G	6	6	136874	136879	0 %	0 %	100 %	0 %	357418980
2568	NC_016148	CTG	2	6	137182	137187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2569	NC_016148	CTG	2	6	137265	137270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2570	NC_016148	GTT	2	6	137332	137337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2571	NC_016148	AGC	2	6	137374	137379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2572	NC_016148	TAT	2	6	137413	137418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418981
2573	NC_016148	GCG	2	6	137432	137437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418981
2574	NC_016148	CT	4	8	137438	137445	0 %	50 %	0 %	50 %	357418981
2575	NC_016148	TAT	2	6	137596	137601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418981
2576	NC_016148	TGG	2	6	137613	137618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418981
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2578	NC_016148	CCA	2	6	137724	137729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418981
2579	NC_016148	GTC	2	6	137821	137826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2580	NC_016148	GCT	2	6	137866	137871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2581	NC_016148	GAT	2	6	137924	137929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418981
2582	NC_016148	TTG	2	6	137945	137950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2583	NC_016148	TGG	2	6	138012	138017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418981
2584	NC_016148	GTC	2	6	138034	138039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2585	NC_016148	CTT	2	6	138061	138066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418981
2586	NC_016148	GAT	2	6	138079	138084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418981
2587	NC_016148	GAG	2	6	138106	138111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418981
2588	NC_016148	CGC	2	6	138117	138122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418981
2589	NC_016148	CCA	2	6	138228	138233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418981
2590	NC_016148	CGT	2	6	138264	138269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2591	NC_016148	GTT	2	6	138277	138282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2592	NC_016148	AGT	2	6	138351	138356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418981
2593	NC_016148	TTG	2	6	138359	138364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2594	NC_016148	AGC	2	6	138424	138429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2595	NC_016148	TCCA	2	8	138574	138581	25 %	25 %	0 %	50 %	357418981
2596	NC_016148	TGTAGC	2	12	138657	138668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357418981
2597	NC_016148	GTT	2	6	138757	138762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2598	NC_016148	CCG	2	6	138785	138790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418981
2599	NC_016148	ATC	2	6	138877	138882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418981
2600	NC_016148	GGT	2	6	138904	138909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418981
2601	NC_016148	CTGA	2	8	138924	138931	25 %	25 %	25 %	25 %	357418981
2602	NC_016148	GCA	2	6	138947	138952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2603	NC_016148	TCT	2	6	138953	138958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418981
2604	NC_016148	CAC	3	9	138981	138989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418981
2605	NC_016148	TTG	2	6	139082	139087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
2606	NC_016148	GGC	2	6	139132	139137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418981
2607	NC_016148	TGC	2	6	139231	139236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2608	NC_016148	ACT	2	6	139244	139249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418981
2609	NC_016148	TGC	2	6	139255	139260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418981
2610	NC_016148	CT	3	6	139289	139294	0 %	50 %	0 %	50 %	357418981
2611	NC_016148	CGC	2	6	139299	139304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418981
2612	NC_016148	CCTG	2	8	139355	139362	0 %	25 %	25 %	50 %	357418981
2613	NC_016148	TCGT	2	8	139394	139401	0 %	50 %	25 %	25 %	357418981
2614	NC_016148	TCCA	2	8	139465	139472	25 %	25 %	0 %	50 %	357418981
2615	NC_016148	GTG	3	9	139493	139501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418981
2616	NC_016148	GCC	2	6	139586	139591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418981
2617	NC_016148	TCT	2	6	139725	139730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418981
2618	NC_016148	GCG	2	6	139748	139753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418981
2619	NC_016148	GCG	2	6	139760	139765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418981
2620	NC_016148	TGT	2	6	139860	139865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418981
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2622	NC_016148	CCT	2	6	139889	139894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418981
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2746	NC_016148	CTT	2	6	145897	145902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418989
2747	NC_016148	CTT	2	6	145921	145926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418989
2748	NC_016148	AG	3	6	145955	145960	50 %	0 %	50 %	0 %	357418989
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2854	NC_016148	ACG	3	9	152328	152336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418995
2855	NC_016148	GGCA	2	8	152442	152449	25 %	0 %	50 %	25 %	357418995
2856	NC_016148	GGA	2	6	152450	152455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418995
2857	NC_016148	TGCGG	2	10	152486	152495	0 %	20 %	60 %	20 %	357418995
2858	NC_016148	C	6	6	152508	152513	0 %	0 %	0 %	100 %	357418995
2859	NC_016148	TAT	2	6	152598	152603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418995
2860	NC_016148	ATA	2	6	152621	152626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418995
2861	NC_016148	GGA	2	6	152809	152814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418995
2862	NC_016148	GT	3	6	152819	152824	0 %	50 %	50 %	0 %	357418995
2863	NC_016148	CGG	2	6	152931	152936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418995
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2993	NC_016148	GGA	2	6	160048	160053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419002
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