MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29003	NC_016148	CAA	2	6	1643364	1643369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420405
29004	NC_016148	ACT	2	6	1643407	1643412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420405
29005	NC_016148	CCA	2	6	1643465	1643470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420405
29006	NC_016148	ATT	2	6	1643579	1643584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420406
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29008	NC_016148	TCG	2	6	1643615	1643620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420406
29009	NC_016148	TTC	2	6	1643692	1643697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420406
29010	NC_016148	TC	3	6	1643729	1643734	0 %	50 %	0 %	50 %	357420406
29011	NC_016148	AT	3	6	1643744	1643749	50 %	50 %	0 %	0 %	357420406
29012	NC_016148	TCG	2	6	1643753	1643758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420406
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29014	NC_016148	TCT	2	6	1643825	1643830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420406
29015	NC_016148	AGT	2	6	1643886	1643891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420406
29016	NC_016148	AGC	3	9	1643935	1643943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420406
29017	NC_016148	CAG	2	6	1644039	1644044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420406
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29019	NC_016148	TTA	2	6	1644206	1644211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420406
29020	NC_016148	TCA	2	6	1644248	1644253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420406
29021	NC_016148	ACTG	2	8	1644303	1644310	25 %	25 %	25 %	25 %	357420406
29022	NC_016148	CTTC	2	8	1644435	1644442	0 %	50 %	0 %	50 %	357420406
29023	NC_016148	TCA	2	6	1644453	1644458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420406
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29030	NC_016148	AAGG	2	8	1645157	1645164	50 %	0 %	50 %	0 %	357420407
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29033	NC_016148	A	7	7	1645432	1645438	100 %	0 %	0 %	0 %	357420407
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29091	NC_016148	TC	3	6	1647942	1647947	0 %	50 %	0 %	50 %	357420409
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29101	NC_016148	CTCC	2	8	1648522	1648529	0 %	25 %	0 %	75 %	357420409
29102	NC_016148	TGCCA	2	10	1648585	1648594	20 %	20 %	20 %	40 %	357420409
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29118	NC_016148	GA	4	8	1649518	1649525	50 %	0 %	50 %	0 %	357420410
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29224	NC_016148	AACC	2	8	1655105	1655112	50 %	0 %	0 %	50 %	357420416
29225	NC_016148	AAG	2	6	1655208	1655213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420416
29226	NC_016148	ACT	2	6	1655271	1655276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420416
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29229	NC_016148	AAAGAT	2	12	1655393	1655404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	357420416
29230	NC_016148	A	6	6	1655452	1655457	100 %	0 %	0 %	0 %	357420416
29231	NC_016148	CAAA	2	8	1655512	1655519	75 %	0 %	0 %	25 %	357420416
29232	NC_016148	CAG	2	6	1655521	1655526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420416
29233	NC_016148	TCCC	2	8	1655578	1655585	0 %	25 %	0 %	75 %	357420416
29234	NC_016148	AC	3	6	1655681	1655686	50 %	0 %	0 %	50 %	357420416
29235	NC_016148	CGC	2	6	1655696	1655701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420416
29236	NC_016148	CCA	2	6	1655704	1655709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420416
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29238	NC_016148	CCA	2	6	1655856	1655861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420417
29239	NC_016148	TCA	2	6	1655933	1655938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420417
29240	NC_016148	TTC	2	6	1656008	1656013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420417
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29351	NC_016148	TCT	2	6	1662126	1662131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420421
29352	NC_016148	C	6	6	1662157	1662162	0 %	0 %	0 %	100 %	357420422
29353	NC_016148	TA	3	6	1662163	1662168	50 %	50 %	0 %	0 %	357420422
29354	NC_016148	TC	3	6	1662250	1662255	0 %	50 %	0 %	50 %	357420422
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29472	NC_016148	ATC	2	6	1669053	1669058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420428
29473	NC_016148	GCG	2	6	1669099	1669104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420428
29474	NC_016148	CAG	2	6	1669112	1669117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420428
29475	NC_016148	ATT	2	6	1669143	1669148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420428
29476	NC_016148	ACT	2	6	1669176	1669181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420428
29477	NC_016148	TCT	2	6	1669207	1669212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420428
29478	NC_016148	ACC	2	6	1669265	1669270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420428
29479	NC_016148	CTG	2	6	1669325	1669330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420428
29480	NC_016148	GCCT	2	8	1669518	1669525	0 %	25 %	25 %	50 %	357420428
29481	NC_016148	TCC	2	6	1669604	1669609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420428
29482	NC_016148	CA	3	6	1669642	1669647	50 %	0 %	0 %	50 %	357420428
29483	NC_016148	CCT	3	9	1669686	1669694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420428
29484	NC_016148	ATG	2	6	1669707	1669712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420428
29485	NC_016148	CTT	2	6	1669724	1669729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420428
29486	NC_016148	TCCAT	2	10	1669731	1669740	20 %	40 %	0 %	40 %	357420428
29487	NC_016148	T	6	6	1669873	1669878	0 %	100 %	0 %	0 %	357420428
29488	NC_016148	ACT	2	6	1669995	1670000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420428
29489	NC_016148	TTCC	2	8	1670077	1670084	0 %	50 %	0 %	50 %	357420428
29490	NC_016148	GCCT	2	8	1670097	1670104	0 %	25 %	25 %	50 %	357420428
29491	NC_016148	CCA	2	6	1670149	1670154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420428
29492	NC_016148	CTTC	2	8	1670172	1670179	0 %	50 %	0 %	50 %	357420428
29493	NC_016148	TCC	2	6	1670204	1670209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420428
29494	NC_016148	AGTT	2	8	1670230	1670237	25 %	50 %	25 %	0 %	357420428
29495	NC_016148	TTTC	2	8	1670604	1670611	0 %	75 %	0 %	25 %	357420429
29496	NC_016148	GCT	2	6	1670616	1670621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420429
29497	NC_016148	CTT	2	6	1670639	1670644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420429
29498	NC_016148	GTT	2	6	1670743	1670748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420429
29499	NC_016148	CCA	2	6	1670819	1670824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420429
29500	NC_016148	AGGGCC	2	12	1670848	1670859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357420429

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