MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_016148	TGGCCT	2	12	1613401	1613412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420378
28502	NC_016148	ACC	2	6	1613523	1613528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420378
28503	NC_016148	GCG	2	6	1613544	1613549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420378
28504	NC_016148	TGG	2	6	1613557	1613562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420378
28505	NC_016148	TCC	2	6	1613572	1613577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420378
28506	NC_016148	AT	3	6	1613595	1613600	50 %	50 %	0 %	0 %	357420378
28507	NC_016148	TGC	2	6	1613615	1613620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420378
28508	NC_016148	GAC	2	6	1613721	1613726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420378
28509	NC_016148	CCCCAT	2	12	1613753	1613764	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	357420378
28510	NC_016148	TAT	2	6	1613829	1613834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420378
28511	NC_016148	CT	3	6	1613895	1613900	0 %	50 %	0 %	50 %	357420378
28512	NC_016148	TAG	2	6	1613954	1613959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420379
28513	NC_016148	AAGA	2	8	1614004	1614011	75 %	0 %	25 %	0 %	357420379
28514	NC_016148	ATA	2	6	1614184	1614189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420379
28515	NC_016148	GAAGC	2	10	1614194	1614203	40 %	0 %	40 %	20 %	357420379
28516	NC_016148	ATA	2	6	1614208	1614213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420379
28517	NC_016148	GTA	2	6	1614388	1614393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420379
28518	NC_016148	AAG	2	6	1614451	1614456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420379
28519	NC_016148	GAA	2	6	1614505	1614510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420379
28520	NC_016148	A	6	6	1614535	1614540	100 %	0 %	0 %	0 %	357420379
28521	NC_016148	GCT	2	6	1614598	1614603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420379
28522	NC_016148	AAG	2	6	1614692	1614697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420379
28523	NC_016148	CCA	2	6	1614833	1614838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420379
28524	NC_016148	CAC	2	6	1614852	1614857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420379
28525	NC_016148	ATC	2	6	1614860	1614865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420379
28526	NC_016148	CATA	2	8	1614942	1614949	50 %	25 %	0 %	25 %	357420379
28527	NC_016148	GCC	2	6	1615073	1615078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420380
28528	NC_016148	CTT	2	6	1615139	1615144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420380
28529	NC_016148	CAT	2	6	1615169	1615174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420380
28530	NC_016148	TCT	2	6	1615325	1615330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420380
28531	NC_016148	TTC	2	6	1615410	1615415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420380
28532	NC_016148	TGG	2	6	1615419	1615424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420380
28533	NC_016148	T	7	7	1615490	1615496	0 %	100 %	0 %	0 %	357420380
28534	NC_016148	GAA	2	6	1615504	1615509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420380
28535	NC_016148	ATAG	2	8	1615565	1615572	50 %	25 %	25 %	0 %	357420380
28536	NC_016148	CCA	2	6	1615581	1615586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420380
28537	NC_016148	GCT	2	6	1615595	1615600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420380
28538	NC_016148	TATCG	2	10	1615614	1615623	20 %	40 %	20 %	20 %	357420380
28539	NC_016148	T	6	6	1615674	1615679	0 %	100 %	0 %	0 %	357420380
28540	NC_016148	GCA	2	6	1615708	1615713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420380
28541	NC_016148	TTG	2	6	1615756	1615761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420380
28542	NC_016148	GCT	2	6	1615774	1615779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420380
28543	NC_016148	AGC	2	6	1615868	1615873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420381
28544	NC_016148	GAAAG	2	10	1615929	1615938	60 %	0 %	40 %	0 %	357420381
28545	NC_016148	AAC	2	6	1616115	1616120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420381
28546	NC_016148	GTA	2	6	1616206	1616211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420381
28547	NC_016148	GAG	2	6	1616249	1616254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420381
28548	NC_016148	TAT	2	6	1616328	1616333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420381
28549	NC_016148	CAC	2	6	1616334	1616339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420381
28550	NC_016148	TC	4	8	1616372	1616379	0 %	50 %	0 %	50 %	357420381
28551	NC_016148	TGC	2	6	1616443	1616448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420381
28552	NC_016148	ATCCAA	2	12	1616457	1616468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	357420381
28553	NC_016148	TCT	2	6	1616516	1616521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420381
28554	NC_016148	TCA	2	6	1616539	1616544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420381
28555	NC_016148	CGGA	2	8	1616624	1616631	25 %	0 %	50 %	25 %	357420381
28556	NC_016148	TAT	2	6	1616667	1616672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420381
28557	NC_016148	GGT	2	6	1616839	1616844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420381
28558	NC_016148	AGG	2	6	1616850	1616855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420381
28559	NC_016148	CCACT	2	10	1616894	1616903	20 %	20 %	0 %	60 %	357420381
28560	NC_016148	G	6	6	1616954	1616959	0 %	0 %	100 %	0 %	357420381
28561	NC_016148	TGC	2	6	1617015	1617020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420381
28562	NC_016148	A	6	6	1617193	1617198	100 %	0 %	0 %	0 %	357420381
28563	NC_016148	ACC	2	6	1617256	1617261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420381
28564	NC_016148	A	6	6	1617265	1617270	100 %	0 %	0 %	0 %	357420381
28565	NC_016148	CATGC	2	10	1617380	1617389	20 %	20 %	20 %	40 %	357420381
28566	NC_016148	GCT	2	6	1617544	1617549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420382
28567	NC_016148	GCT	2	6	1617551	1617556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420382
28568	NC_016148	GCA	2	6	1617587	1617592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420382
28569	NC_016148	AAC	2	6	1617748	1617753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420382
28570	NC_016148	TCA	2	6	1617758	1617763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420382
28571	NC_016148	TA	4	8	1617940	1617947	50 %	50 %	0 %	0 %	357420382
28572	NC_016148	GGT	2	6	1617976	1617981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420382
28573	NC_016148	TGG	2	6	1618044	1618049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420382
28574	NC_016148	CCTC	2	8	1618085	1618092	0 %	25 %	0 %	75 %	357420382
28575	NC_016148	CAC	2	6	1618135	1618140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420382
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28577	NC_016148	TTTC	2	8	1618189	1618196	0 %	75 %	0 %	25 %	357420382
28578	NC_016148	ACA	2	6	1618370	1618375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420382
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28583	NC_016148	CGAT	2	8	1618678	1618685	25 %	25 %	25 %	25 %	357420383
28584	NC_016148	ATT	2	6	1618696	1618701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420383
28585	NC_016148	CCT	2	6	1618763	1618768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420383
28586	NC_016148	CAT	2	6	1618821	1618826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420383
28587	NC_016148	TTGA	2	8	1618833	1618840	25 %	50 %	25 %	0 %	357420383
28588	NC_016148	CCT	2	6	1618880	1618885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420383
28589	NC_016148	CCT	2	6	1618925	1618930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420383
28590	NC_016148	AT	3	6	1618992	1618997	50 %	50 %	0 %	0 %	357420383
28591	NC_016148	CAT	2	6	1619040	1619045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420383
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28593	NC_016148	AG	3	6	1619164	1619169	50 %	0 %	50 %	0 %	357420383
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28596	NC_016148	AT	3	6	1619315	1619320	50 %	50 %	0 %	0 %	357420383
28597	NC_016148	CAC	2	6	1619326	1619331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420383
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28600	NC_016148	CGG	2	6	1619610	1619615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420384
28601	NC_016148	TGC	2	6	1619634	1619639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420384
28602	NC_016148	TCA	2	6	1619646	1619651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420384
28603	NC_016148	GTGA	2	8	1619692	1619699	25 %	25 %	50 %	0 %	357420384
28604	NC_016148	TTC	2	6	1619722	1619727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420384
28605	NC_016148	CT	3	6	1619844	1619849	0 %	50 %	0 %	50 %	357420384
28606	NC_016148	TCC	2	6	1619857	1619862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420384
28607	NC_016148	GAA	2	6	1619870	1619875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420384
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28609	NC_016148	CTT	2	6	1619936	1619941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420384
28610	NC_016148	TCTT	3	12	1619938	1619949	0 %	75 %	0 %	25 %	357420384
28611	NC_016148	T	6	6	1620067	1620072	0 %	100 %	0 %	0 %	357420384
28612	NC_016148	CAAC	2	8	1620126	1620133	50 %	0 %	0 %	50 %	357420384
28613	NC_016148	T	6	6	1620202	1620207	0 %	100 %	0 %	0 %	357420384
28614	NC_016148	CTC	2	6	1620274	1620279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420384
28615	NC_016148	CTC	2	6	1620337	1620342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420384
28616	NC_016148	TCAC	2	8	1620359	1620366	25 %	25 %	0 %	50 %	357420384
28617	NC_016148	TCCTC	2	10	1620374	1620383	0 %	40 %	0 %	60 %	357420385
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28622	NC_016148	TCT	2	6	1620497	1620502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420385
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28731	NC_016148	AAT	2	6	1627552	1627557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420393
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28735	NC_016148	GAT	2	6	1627951	1627956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420393
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28853	NC_016148	GAA	2	6	1634587	1634592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420398
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