MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_016148	ATT	2	6	1553784	1553789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420314
27503	NC_016148	CT	3	6	1553792	1553797	0 %	50 %	0 %	50 %	357420314
27504	NC_016148	ACTG	2	8	1553822	1553829	25 %	25 %	25 %	25 %	357420314
27505	NC_016148	A	7	7	1553862	1553868	100 %	0 %	0 %	0 %	357420314
27506	NC_016148	GTCC	2	8	1553964	1553971	0 %	25 %	25 %	50 %	357420315
27507	NC_016148	TTC	2	6	1553987	1553992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420315
27508	NC_016148	CTT	2	6	1554041	1554046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420315
27509	NC_016148	GGA	2	6	1554172	1554177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420315
27510	NC_016148	CT	3	6	1554286	1554291	0 %	50 %	0 %	50 %	357420315
27511	NC_016148	CTATC	2	10	1554342	1554351	20 %	40 %	0 %	40 %	357420315
27512	NC_016148	TTC	2	6	1554398	1554403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420315
27513	NC_016148	CCA	2	6	1554503	1554508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420315
27514	NC_016148	CAT	2	6	1554576	1554581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420315
27515	NC_016148	CTA	2	6	1554585	1554590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420315
27516	NC_016148	GAA	2	6	1554591	1554596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420315
27517	NC_016148	A	6	6	1554649	1554654	100 %	0 %	0 %	0 %	357420316
27518	NC_016148	CT	3	6	1554682	1554687	0 %	50 %	0 %	50 %	357420316
27519	NC_016148	T	6	6	1554709	1554714	0 %	100 %	0 %	0 %	357420316
27520	NC_016148	AAG	2	6	1554742	1554747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420316
27521	NC_016148	AAG	2	6	1554953	1554958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420316
27522	NC_016148	TGT	2	6	1554975	1554980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420316
27523	NC_016148	AGTA	2	8	1555072	1555079	50 %	25 %	25 %	0 %	357420316
27524	NC_016148	ATG	2	6	1555178	1555183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420316
27525	NC_016148	TCC	2	6	1555199	1555204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420316
27526	NC_016148	CTT	2	6	1555231	1555236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420316
27527	NC_016148	T	6	6	1555266	1555271	0 %	100 %	0 %	0 %	357420316
27528	NC_016148	TCC	2	6	1555274	1555279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420316
27529	NC_016148	CAA	3	9	1555405	1555413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420316
27530	NC_016148	T	6	6	1555574	1555579	0 %	100 %	0 %	0 %	357420317
27531	NC_016148	CAC	2	6	1555626	1555631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420317
27532	NC_016148	GTA	2	6	1555635	1555640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420317
27533	NC_016148	GAG	2	6	1555661	1555666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420317
27534	NC_016148	TAG	2	6	1555715	1555720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420317
27535	NC_016148	CTG	2	6	1555860	1555865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420317
27536	NC_016148	ACTG	2	8	1555885	1555892	25 %	25 %	25 %	25 %	357420317
27537	NC_016148	AAC	2	6	1555900	1555905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420317
27538	NC_016148	GT	3	6	1555958	1555963	0 %	50 %	50 %	0 %	357420317
27539	NC_016148	TC	3	6	1556012	1556017	0 %	50 %	0 %	50 %	357420317
27540	NC_016148	GC	3	6	1556024	1556029	0 %	0 %	50 %	50 %	357420317
27541	NC_016148	ACAA	2	8	1556082	1556089	75 %	0 %	0 %	25 %	357420317
27542	NC_016148	TCC	2	6	1556356	1556361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420318
27543	NC_016148	TCT	2	6	1556400	1556405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420318
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27545	NC_016148	CTT	2	6	1556535	1556540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420318
27546	NC_016148	TC	3	6	1556708	1556713	0 %	50 %	0 %	50 %	357420318
27547	NC_016148	GTTC	2	8	1556722	1556729	0 %	50 %	25 %	25 %	357420318
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27550	NC_016148	TCAAG	2	10	1556866	1556875	40 %	20 %	20 %	20 %	357420318
27551	NC_016148	TC	3	6	1556972	1556977	0 %	50 %	0 %	50 %	357420318
27552	NC_016148	ACG	2	6	1557000	1557005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420318
27553	NC_016148	TGG	2	6	1557133	1557138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420318
27554	NC_016148	CT	3	6	1557161	1557166	0 %	50 %	0 %	50 %	357420318
27555	NC_016148	A	6	6	1557286	1557291	100 %	0 %	0 %	0 %	357420318
27556	NC_016148	A	6	6	1557478	1557483	100 %	0 %	0 %	0 %	357420318
27557	NC_016148	TTC	2	6	1557530	1557535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420318
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27559	NC_016148	TCT	2	6	1557734	1557739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420318
27560	NC_016148	CTG	2	6	1557767	1557772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420318
27561	NC_016148	TCG	2	6	1557784	1557789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420318
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27567	NC_016148	AC	3	6	1558186	1558191	50 %	0 %	0 %	50 %	357420319
27568	NC_016148	CGC	2	6	1558217	1558222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420319
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27570	NC_016148	TATCAT	2	12	1558271	1558282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	357420319
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27572	NC_016148	CTT	2	6	1558426	1558431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420319
27573	NC_016148	TCCTTT	2	12	1558521	1558532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420319
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27577	NC_016148	T	6	6	1558722	1558727	0 %	100 %	0 %	0 %	357420320
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27585	NC_016148	GA	4	8	1559041	1559048	50 %	0 %	50 %	0 %	357420320
27586	NC_016148	GATA	2	8	1559071	1559078	50 %	25 %	25 %	0 %	357420320
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27588	NC_016148	AAT	2	6	1559329	1559334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420320
27589	NC_016148	CCG	2	6	1559392	1559397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420320
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27594	NC_016148	AAAG	2	8	1559507	1559514	75 %	0 %	25 %	0 %	357420320
27595	NC_016148	CGT	2	6	1559518	1559523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420320
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27600	NC_016148	CAC	2	6	1559948	1559953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420320
27601	NC_016148	TCA	2	6	1559976	1559981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420320
27602	NC_016148	AT	3	6	1560069	1560074	50 %	50 %	0 %	0 %	357420320
27603	NC_016148	TTTC	2	8	1560112	1560119	0 %	75 %	0 %	25 %	357420321
27604	NC_016148	T	6	6	1560153	1560158	0 %	100 %	0 %	0 %	357420321
27605	NC_016148	CTC	2	6	1560257	1560262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420321
27606	NC_016148	TCG	2	6	1560346	1560351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420321
27607	NC_016148	TGC	2	6	1560364	1560369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420321
27608	NC_016148	TCA	2	6	1560418	1560423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420321
27609	NC_016148	GTA	2	6	1560425	1560430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420321
27610	NC_016148	TTG	2	6	1560456	1560461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420321
27611	NC_016148	TCT	2	6	1560464	1560469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420321
27612	NC_016148	TCC	2	6	1560472	1560477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420321
27613	NC_016148	CCCTGT	2	12	1560494	1560505	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	357420321
27614	NC_016148	AGC	2	6	1560531	1560536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420321
27615	NC_016148	TCC	2	6	1560687	1560692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420321
27616	NC_016148	TGG	2	6	1560693	1560698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420321
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27618	NC_016148	CTTC	2	8	1560724	1560731	0 %	50 %	0 %	50 %	357420321
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27972	NC_016148	ATA	2	6	1580364	1580369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420343
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27976	NC_016148	CT	3	6	1580547	1580552	0 %	50 %	0 %	50 %	357420343
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27980	NC_016148	A	6	6	1580796	1580801	100 %	0 %	0 %	0 %	357420344
27981	NC_016148	GA	3	6	1581081	1581086	50 %	0 %	50 %	0 %	357420344
27982	NC_016148	CCAA	2	8	1581113	1581120	50 %	0 %	0 %	50 %	357420344
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