MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_016148	ATT	2	6	1524514	1524519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420287
27003	NC_016148	ATA	2	6	1524543	1524548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420287
27004	NC_016148	AT	3	6	1524575	1524580	50 %	50 %	0 %	0 %	357420287
27005	NC_016148	GGC	2	6	1524594	1524599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420287
27006	NC_016148	CT	3	6	1524705	1524710	0 %	50 %	0 %	50 %	357420287
27007	NC_016148	CAA	2	6	1524749	1524754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420287
27008	NC_016148	CCA	2	6	1524771	1524776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420287
27009	NC_016148	CCA	2	6	1524920	1524925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420287
27010	NC_016148	TCC	2	6	1524933	1524938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420287
27011	NC_016148	TA	3	6	1524954	1524959	50 %	50 %	0 %	0 %	357420287
27012	NC_016148	CAG	2	6	1525007	1525012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420287
27013	NC_016148	TA	3	6	1525019	1525024	50 %	50 %	0 %	0 %	357420287
27014	NC_016148	TAT	2	6	1525041	1525046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420287
27015	NC_016148	GGA	2	6	1525109	1525114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420287
27016	NC_016148	CCAAGG	2	12	1525117	1525128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420287
27017	NC_016148	CAA	2	6	1525211	1525216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420287
27018	NC_016148	AAG	2	6	1525327	1525332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420287
27019	NC_016148	A	6	6	1525424	1525429	100 %	0 %	0 %	0 %	357420287
27020	NC_016148	AAGA	2	8	1525542	1525549	75 %	0 %	25 %	0 %	357420287
27021	NC_016148	CCAA	2	8	1525590	1525597	50 %	0 %	0 %	50 %	357420287
27022	NC_016148	AG	3	6	1525619	1525624	50 %	0 %	50 %	0 %	357420287
27023	NC_016148	CCCTT	2	10	1525720	1525729	0 %	40 %	0 %	60 %	357420287
27024	NC_016148	TAG	2	6	1525857	1525862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420288
27025	NC_016148	CTT	2	6	1525884	1525889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420288
27026	NC_016148	TTC	3	9	1525939	1525947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420288
27027	NC_016148	CCA	2	6	1526124	1526129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420288
27028	NC_016148	GCT	2	6	1526165	1526170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420288
27029	NC_016148	GCA	2	6	1526189	1526194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420288
27030	NC_016148	GTA	3	9	1526227	1526235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420288
27031	NC_016148	CCTT	2	8	1526258	1526265	0 %	50 %	0 %	50 %	357420288
27032	NC_016148	TGT	2	6	1526388	1526393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420288
27033	NC_016148	CAA	2	6	1526466	1526471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420288
27034	NC_016148	AGG	2	6	1526503	1526508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420288
27035	NC_016148	CTT	2	6	1526572	1526577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420288
27036	NC_016148	CAG	2	6	1526601	1526606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420288
27037	NC_016148	TTC	2	6	1526683	1526688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420288
27038	NC_016148	AGG	2	6	1526712	1526717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420288
27039	NC_016148	TCC	2	6	1526732	1526737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420288
27040	NC_016148	AGA	2	6	1526919	1526924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420288
27041	NC_016148	CAAT	2	8	1526948	1526955	50 %	25 %	0 %	25 %	357420288
27042	NC_016148	TTGC	2	8	1526981	1526988	0 %	50 %	25 %	25 %	357420288
27043	NC_016148	CA	3	6	1527003	1527008	50 %	0 %	0 %	50 %	357420288
27044	NC_016148	CATC	2	8	1527033	1527040	25 %	25 %	0 %	50 %	357420288
27045	NC_016148	TCA	2	6	1527074	1527079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420288
27046	NC_016148	GAA	2	6	1527127	1527132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420288
27047	NC_016148	TAATG	2	10	1527138	1527147	40 %	40 %	20 %	0 %	357420288
27048	NC_016148	TCT	2	6	1527194	1527199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420289
27049	NC_016148	TCCA	2	8	1527244	1527251	25 %	25 %	0 %	50 %	357420289
27050	NC_016148	CCA	2	6	1527410	1527415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420289
27051	NC_016148	TCA	2	6	1527448	1527453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420289
27052	NC_016148	CTT	2	6	1527533	1527538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420289
27053	NC_016148	CCA	2	6	1527584	1527589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420289
27054	NC_016148	TCC	2	6	1527610	1527615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420289
27055	NC_016148	ATG	2	6	1527637	1527642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420289
27056	NC_016148	CAC	2	6	1527706	1527711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420289
27057	NC_016148	GAA	2	6	1527730	1527735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420289
27058	NC_016148	TCTGAG	2	12	1527857	1527868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357420289
27059	NC_016148	CGG	2	6	1527908	1527913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420289
27060	NC_016148	AGG	2	6	1527927	1527932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420289
27061	NC_016148	AC	3	6	1527973	1527978	50 %	0 %	0 %	50 %	357420289
27062	NC_016148	CTG	2	6	1528035	1528040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420289
27063	NC_016148	CGA	2	6	1528073	1528078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420289
27064	NC_016148	CAT	2	6	1528092	1528097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420289
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27066	NC_016148	AG	3	6	1528194	1528199	50 %	0 %	50 %	0 %	357420289
27067	NC_016148	ACGA	2	8	1528332	1528339	50 %	0 %	25 %	25 %	357420289
27068	NC_016148	CGG	2	6	1528349	1528354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420289
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27070	NC_016148	CTT	3	9	1528391	1528399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420289
27071	NC_016148	CAC	2	6	1528404	1528409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420289
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27075	NC_016148	CAT	2	6	1528639	1528644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420290
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27078	NC_016148	CTG	2	6	1528851	1528856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420290
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27083	NC_016148	CAC	2	6	1529383	1529388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420292
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27088	NC_016148	AGC	2	6	1529632	1529637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420292
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27091	NC_016148	TCCT	2	8	1529850	1529857	0 %	50 %	0 %	50 %	357420293
27092	NC_016148	TTTTA	2	10	1529913	1529922	20 %	80 %	0 %	0 %	357420293
27093	NC_016148	CTTT	2	8	1529941	1529948	0 %	75 %	0 %	25 %	357420293
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27100	NC_016148	CTC	2	6	1530300	1530305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420293
27101	NC_016148	CAG	2	6	1530320	1530325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420293
27102	NC_016148	AT	3	6	1530383	1530388	50 %	50 %	0 %	0 %	357420293
27103	NC_016148	AG	3	6	1530459	1530464	50 %	0 %	50 %	0 %	357420293
27104	NC_016148	CT	3	6	1530477	1530482	0 %	50 %	0 %	50 %	357420293
27105	NC_016148	CT	4	8	1530509	1530516	0 %	50 %	0 %	50 %	357420293
27106	NC_016148	GAT	2	6	1530681	1530686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420293
27107	NC_016148	TCCA	2	8	1530688	1530695	25 %	25 %	0 %	50 %	357420293
27108	NC_016148	CA	3	6	1530715	1530720	50 %	0 %	0 %	50 %	357420293
27109	NC_016148	ACA	2	6	1530739	1530744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420293
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27111	NC_016148	T	7	7	1530750	1530756	0 %	100 %	0 %	0 %	357420293
27112	NC_016148	CACAT	2	10	1530801	1530810	40 %	20 %	0 %	40 %	357420293
27113	NC_016148	CCA	2	6	1530866	1530871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420293
27114	NC_016148	AAG	2	6	1530882	1530887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420293
27115	NC_016148	TCA	2	6	1531121	1531126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420294
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27117	NC_016148	AT	3	6	1531190	1531195	50 %	50 %	0 %	0 %	357420294
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27225	NC_016148	GAT	3	9	1536300	1536308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420296
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27231	NC_016148	ACCT	2	8	1536563	1536570	25 %	25 %	0 %	50 %	357420297
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27234	NC_016148	TAT	2	6	1536618	1536623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420297
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27354	NC_016148	TCG	2	6	1544064	1544069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420304
27355	NC_016148	GAA	2	6	1544163	1544168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420304
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27357	NC_016148	TCT	2	6	1544773	1544778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420305
27358	NC_016148	AAGC	2	8	1544795	1544802	50 %	0 %	25 %	25 %	357420305
27359	NC_016148	CTG	2	6	1544974	1544979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420305
27360	NC_016148	CAT	2	6	1545045	1545050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420305
27361	NC_016148	AT	3	6	1545146	1545151	50 %	50 %	0 %	0 %	357420305
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27369	NC_016148	TCC	2	6	1545748	1545753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420305
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27382	NC_016148	TTA	2	6	1546364	1546369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420306
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27384	NC_016148	GCA	2	6	1546420	1546425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420306
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27392	NC_016148	TC	3	6	1546817	1546822	0 %	50 %	0 %	50 %	357420306
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27455	NC_016148	CAC	2	6	1551186	1551191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420311
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27457	NC_016148	CAC	2	6	1551295	1551300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420311
27458	NC_016148	CAAC	2	8	1551415	1551422	50 %	0 %	0 %	50 %	357420311
27459	NC_016148	AT	3	6	1551428	1551433	50 %	50 %	0 %	0 %	357420311
27460	NC_016148	AT	3	6	1551481	1551486	50 %	50 %	0 %	0 %	357420311
27461	NC_016148	TGG	2	6	1551499	1551504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420311
27462	NC_016148	CTTC	2	8	1551603	1551610	0 %	50 %	0 %	50 %	357420311
27463	NC_016148	AGG	2	6	1551814	1551819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420312
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27465	NC_016148	CTT	2	6	1551919	1551924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420312
27466	NC_016148	TCG	2	6	1551993	1551998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420312
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27468	NC_016148	GAT	2	6	1552061	1552066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420312
27469	NC_016148	CCT	2	6	1552090	1552095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420312
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27471	NC_016148	ATC	2	6	1552136	1552141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420312
27472	NC_016148	AAG	2	6	1552189	1552194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420313
27473	NC_016148	TGC	2	6	1552201	1552206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420313
27474	NC_016148	CAG	2	6	1552334	1552339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420313
27475	NC_016148	CT	3	6	1552365	1552370	0 %	50 %	0 %	50 %	357420313
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27478	NC_016148	TGC	2	6	1552571	1552576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420314
27479	NC_016148	TCCT	2	8	1552582	1552589	0 %	50 %	0 %	50 %	357420314
27480	NC_016148	CT	3	6	1552606	1552611	0 %	50 %	0 %	50 %	357420314
27481	NC_016148	TAGC	2	8	1552618	1552625	25 %	25 %	25 %	25 %	357420314
27482	NC_016148	CTTT	2	8	1552642	1552649	0 %	75 %	0 %	25 %	357420314
27483	NC_016148	TATC	2	8	1552693	1552700	25 %	50 %	0 %	25 %	357420314
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27491	NC_016148	AAG	2	6	1553375	1553380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420314
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27499	NC_016148	TGAA	2	8	1553643	1553650	50 %	25 %	25 %	0 %	357420314
27500	NC_016148	T	7	7	1553671	1553677	0 %	100 %	0 %	0 %	357420314

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