MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_016148	CT	3	6	1438311	1438316	0 %	50 %	0 %	50 %	357420201
25502	NC_016148	GAC	2	6	1438594	1438599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420201
25503	NC_016148	GCA	2	6	1438727	1438732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420201
25504	NC_016148	ATT	2	6	1438751	1438756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420201
25505	NC_016148	ACG	2	6	1438826	1438831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420201
25506	NC_016148	ACT	2	6	1438873	1438878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420201
25507	NC_016148	CTC	2	6	1439005	1439010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420202
25508	NC_016148	CGA	2	6	1439064	1439069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420202
25509	NC_016148	GTA	2	6	1439119	1439124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420202
25510	NC_016148	ACG	2	6	1439288	1439293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420202
25511	NC_016148	ATA	2	6	1439326	1439331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420202
25512	NC_016148	TAT	2	6	1439371	1439376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420202
25513	NC_016148	GTT	2	6	1439434	1439439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420202
25514	NC_016148	CAT	2	6	1439481	1439486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420202
25515	NC_016148	TTGA	2	8	1439518	1439525	25 %	50 %	25 %	0 %	357420202
25516	NC_016148	GTAT	2	8	1439576	1439583	25 %	50 %	25 %	0 %	357420202
25517	NC_016148	CT	3	6	1439632	1439637	0 %	50 %	0 %	50 %	357420202
25518	NC_016148	CTC	2	6	1439670	1439675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420202
25519	NC_016148	T	6	6	1439681	1439686	0 %	100 %	0 %	0 %	357420202
25520	NC_016148	CAG	2	6	1439769	1439774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420202
25521	NC_016148	TCC	2	6	1439839	1439844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420202
25522	NC_016148	TTC	2	6	1439866	1439871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420202
25523	NC_016148	TCT	3	9	1439957	1439965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420202
25524	NC_016148	TCT	2	6	1439970	1439975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420202
25525	NC_016148	CAA	2	6	1439985	1439990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420202
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25527	NC_016148	GCTT	2	8	1440014	1440021	0 %	50 %	25 %	25 %	357420202
25528	NC_016148	ATT	2	6	1440140	1440145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420202
25529	NC_016148	TCT	2	6	1440177	1440182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420202
25530	NC_016148	TCT	2	6	1440220	1440225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25531	NC_016148	TGC	2	6	1440342	1440347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420203
25532	NC_016148	ATT	2	6	1440416	1440421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420203
25533	NC_016148	CTTG	2	8	1440494	1440501	0 %	50 %	25 %	25 %	357420203
25534	NC_016148	TCC	2	6	1440601	1440606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420203
25535	NC_016148	TCT	2	6	1440648	1440653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25536	NC_016148	GCC	2	6	1440713	1440718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420203
25537	NC_016148	CTT	2	6	1440794	1440799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25538	NC_016148	TTTG	2	8	1440819	1440826	0 %	75 %	25 %	0 %	357420203
25539	NC_016148	T	6	6	1440856	1440861	0 %	100 %	0 %	0 %	357420203
25540	NC_016148	AT	4	8	1440900	1440907	50 %	50 %	0 %	0 %	357420203
25541	NC_016148	CGT	2	6	1440945	1440950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420203
25542	NC_016148	AGA	2	6	1440983	1440988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420203
25543	NC_016148	TA	3	6	1441014	1441019	50 %	50 %	0 %	0 %	357420203
25544	NC_016148	CCA	2	6	1441023	1441028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420203
25545	NC_016148	CTT	2	6	1441031	1441036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25546	NC_016148	TTC	2	6	1441096	1441101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25547	NC_016148	TTC	2	6	1441120	1441125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420203
25548	NC_016148	TC	3	6	1441124	1441129	0 %	50 %	0 %	50 %	357420203
25549	NC_016148	T	6	6	1441167	1441172	0 %	100 %	0 %	0 %	357420203
25550	NC_016148	TC	4	8	1441206	1441213	0 %	50 %	0 %	50 %	357420203
25551	NC_016148	T	6	6	1441256	1441261	0 %	100 %	0 %	0 %	357420203
25552	NC_016148	GCT	2	6	1441275	1441280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420203
25553	NC_016148	CTGC	2	8	1441322	1441329	0 %	25 %	25 %	50 %	357420203
25554	NC_016148	AGC	2	6	1441367	1441372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420203
25555	NC_016148	A	6	6	1441373	1441378	100 %	0 %	0 %	0 %	357420203
25556	NC_016148	TTA	2	6	1441380	1441385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420203
25557	NC_016148	GC	3	6	1441457	1441462	0 %	0 %	50 %	50 %	357420204
25558	NC_016148	GCCA	2	8	1441481	1441488	25 %	0 %	25 %	50 %	357420204
25559	NC_016148	ATCC	2	8	1441496	1441503	25 %	25 %	0 %	50 %	357420204
25560	NC_016148	GTCA	2	8	1441558	1441565	25 %	25 %	25 %	25 %	357420204
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25562	NC_016148	AC	3	6	1441626	1441631	50 %	0 %	0 %	50 %	357420204
25563	NC_016148	AGC	2	6	1441721	1441726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420204
25564	NC_016148	GATTTC	2	12	1441729	1441740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357420204
25565	NC_016148	CT	3	6	1441741	1441746	0 %	50 %	0 %	50 %	357420204
25566	NC_016148	CAGA	2	8	1441845	1441852	50 %	0 %	25 %	25 %	357420204
25567	NC_016148	CTT	2	6	1441862	1441867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420204
25568	NC_016148	CCT	2	6	1441899	1441904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420204
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25570	NC_016148	CT	3	6	1441918	1441923	0 %	50 %	0 %	50 %	357420204
25571	NC_016148	GGA	2	6	1441973	1441978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420204
25572	NC_016148	GTC	2	6	1441987	1441992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420204
25573	NC_016148	TTC	2	6	1442038	1442043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420204
25574	NC_016148	T	6	6	1442100	1442105	0 %	100 %	0 %	0 %	357420204
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25578	NC_016148	A	7	7	1442228	1442234	100 %	0 %	0 %	0 %	357420204
25579	NC_016148	CGT	2	6	1442242	1442247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420204
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25583	NC_016148	CCTT	2	8	1442339	1442346	0 %	50 %	0 %	50 %	357420205
25584	NC_016148	TC	3	6	1442348	1442353	0 %	50 %	0 %	50 %	357420205
25585	NC_016148	AT	3	6	1442412	1442417	50 %	50 %	0 %	0 %	357420205
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25590	NC_016148	TAG	2	6	1442551	1442556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420205
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25599	NC_016148	TCC	2	6	1442819	1442824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420205
25600	NC_016148	ACCCT	2	10	1442832	1442841	20 %	20 %	0 %	60 %	357420205
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25606	NC_016148	TC	3	6	1443057	1443062	0 %	50 %	0 %	50 %	357420206
25607	NC_016148	ATA	2	6	1443076	1443081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420206
25608	NC_016148	TCC	2	6	1443193	1443198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420206
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25610	NC_016148	CA	3	6	1443223	1443228	50 %	0 %	0 %	50 %	357420206
25611	NC_016148	TCC	2	6	1443237	1443242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420206
25612	NC_016148	TGT	2	6	1443260	1443265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420206
25613	NC_016148	GCT	2	6	1443335	1443340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420206
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25616	NC_016148	T	6	6	1443450	1443455	0 %	100 %	0 %	0 %	357420206
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25618	NC_016148	TGA	2	6	1443602	1443607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420206
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25736	NC_016148	GCT	2	6	1451018	1451023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420213
25737	NC_016148	GTC	2	6	1451054	1451059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420213
25738	NC_016148	TCA	2	6	1451115	1451120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420213
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25840	NC_016148	AGAAAA	2	12	1458719	1458730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	357420218
25841	NC_016148	CTCTC	2	10	1458768	1458777	0 %	40 %	0 %	60 %	357420218
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25845	NC_016148	TGG	2	6	1459068	1459073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420218
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25849	NC_016148	CT	3	6	1459319	1459324	0 %	50 %	0 %	50 %	357420219
25850	NC_016148	GGC	2	6	1459335	1459340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420219
25851	NC_016148	AAT	2	6	1459377	1459382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420219
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