MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_016148	AAG	2	6	1412015	1412020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420174
25002	NC_016148	CAA	2	6	1412068	1412073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420174
25003	NC_016148	AGC	2	6	1412173	1412178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420174
25004	NC_016148	GTCA	2	8	1412194	1412201	25 %	25 %	25 %	25 %	357420174
25005	NC_016148	ACTC	2	8	1412223	1412230	25 %	25 %	0 %	50 %	357420174
25006	NC_016148	CTC	2	6	1412311	1412316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420174
25007	NC_016148	GAA	2	6	1412332	1412337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420174
25008	NC_016148	ATC	2	6	1412338	1412343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420174
25009	NC_016148	GAA	2	6	1412368	1412373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420174
25010	NC_016148	CGC	2	6	1412478	1412483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420174
25011	NC_016148	ATC	2	6	1412597	1412602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420174
25012	NC_016148	AATCC	2	10	1412631	1412640	40 %	20 %	0 %	40 %	357420174
25013	NC_016148	CCAA	2	8	1412677	1412684	50 %	0 %	0 %	50 %	357420174
25014	NC_016148	ATT	2	6	1412698	1412703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420174
25015	NC_016148	TGA	2	6	1412805	1412810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420174
25016	NC_016148	TACCA	2	10	1412848	1412857	40 %	20 %	0 %	40 %	357420174
25017	NC_016148	GGAA	2	8	1412905	1412912	50 %	0 %	50 %	0 %	357420174
25018	NC_016148	TCT	2	6	1412916	1412921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420174
25019	NC_016148	CT	3	6	1412945	1412950	0 %	50 %	0 %	50 %	357420174
25020	NC_016148	GTG	2	6	1412984	1412989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420174
25021	NC_016148	TTA	2	6	1413002	1413007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420174
25022	NC_016148	CAG	2	6	1413016	1413021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420174
25023	NC_016148	CTT	2	6	1413140	1413145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420174
25024	NC_016148	CTTCAA	2	12	1413165	1413176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420174
25025	NC_016148	AG	3	6	1413194	1413199	50 %	0 %	50 %	0 %	357420174
25026	NC_016148	CAC	2	6	1413267	1413272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420174
25027	NC_016148	CAA	3	9	1413289	1413297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420174
25028	NC_016148	ACT	2	6	1413403	1413408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420174
25029	NC_016148	CT	3	6	1413430	1413435	0 %	50 %	0 %	50 %	357420175
25030	NC_016148	GTT	2	6	1413608	1413613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420175
25031	NC_016148	CAA	2	6	1413689	1413694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420175
25032	NC_016148	CTT	2	6	1413728	1413733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420175
25033	NC_016148	ACC	2	6	1413735	1413740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420175
25034	NC_016148	CCT	2	6	1413754	1413759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420175
25035	NC_016148	TCC	2	6	1413811	1413816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420175
25036	NC_016148	TAC	2	6	1413818	1413823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420175
25037	NC_016148	CTT	2	6	1414103	1414108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420176
25038	NC_016148	CTG	2	6	1414110	1414115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420176
25039	NC_016148	GCT	2	6	1414177	1414182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420176
25040	NC_016148	TCT	2	6	1414229	1414234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420176
25041	NC_016148	TC	3	6	1414282	1414287	0 %	50 %	0 %	50 %	357420176
25042	NC_016148	GTT	2	6	1414344	1414349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420176
25043	NC_016148	GTC	2	6	1414468	1414473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420176
25044	NC_016148	TTG	2	6	1414501	1414506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420176
25045	NC_016148	TTC	2	6	1414513	1414518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420176
25046	NC_016148	CCT	2	6	1414538	1414543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420177
25047	NC_016148	CTT	2	6	1414544	1414549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420177
25048	NC_016148	CTTTT	2	10	1414572	1414581	0 %	80 %	0 %	20 %	357420177
25049	NC_016148	CT	3	6	1414646	1414651	0 %	50 %	0 %	50 %	357420177
25050	NC_016148	GA	3	6	1414676	1414681	50 %	0 %	50 %	0 %	357420177
25051	NC_016148	TAC	2	6	1414697	1414702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420177
25052	NC_016148	ACA	2	6	1414772	1414777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420178
25053	NC_016148	CATGAA	2	12	1414778	1414789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357420178
25054	NC_016148	AACAC	2	10	1414828	1414837	60 %	0 %	0 %	40 %	357420178
25055	NC_016148	TGA	2	6	1414994	1414999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420178
25056	NC_016148	CTA	2	6	1415000	1415005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420178
25057	NC_016148	TAT	2	6	1415049	1415054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420178
25058	NC_016148	ATC	2	6	1415070	1415075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420178
25059	NC_016148	CGT	2	6	1415179	1415184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420179
25060	NC_016148	CAC	2	6	1415234	1415239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420179
25061	NC_016148	AAT	2	6	1415260	1415265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420179
25062	NC_016148	AGG	2	6	1415391	1415396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420179
25063	NC_016148	GCT	2	6	1415514	1415519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420179
25064	NC_016148	AGA	2	6	1415539	1415544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420179
25065	NC_016148	AAG	2	6	1415561	1415566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420179
25066	NC_016148	CTT	2	6	1415598	1415603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420179
25067	NC_016148	TCT	2	6	1415639	1415644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420179
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25069	NC_016148	AGT	2	6	1415804	1415809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420179
25070	NC_016148	TC	3	6	1415855	1415860	0 %	50 %	0 %	50 %	357420179
25071	NC_016148	TCA	2	6	1415994	1415999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420179
25072	NC_016148	CAA	2	6	1416028	1416033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420179
25073	NC_016148	CCA	2	6	1416067	1416072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420179
25074	NC_016148	CTC	2	6	1416083	1416088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420179
25075	NC_016148	CTT	2	6	1416190	1416195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420179
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25079	NC_016148	ACCC	2	8	1416435	1416442	25 %	0 %	0 %	75 %	357420180
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25082	NC_016148	GA	3	6	1416615	1416620	50 %	0 %	50 %	0 %	357420180
25083	NC_016148	TCC	2	6	1416634	1416639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420180
25084	NC_016148	CCA	2	6	1416656	1416661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420180
25085	NC_016148	AAC	2	6	1416714	1416719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420180
25086	NC_016148	AGA	2	6	1416732	1416737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420180
25087	NC_016148	CGC	2	6	1416776	1416781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420180
25088	NC_016148	AAGC	2	8	1416824	1416831	50 %	0 %	25 %	25 %	357420180
25089	NC_016148	GAACC	2	10	1416871	1416880	40 %	0 %	20 %	40 %	357420180
25090	NC_016148	CTA	2	6	1417025	1417030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420180
25091	NC_016148	ATG	2	6	1417075	1417080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420180
25092	NC_016148	CATC	2	8	1417102	1417109	25 %	25 %	0 %	50 %	357420180
25093	NC_016148	TG	3	6	1417131	1417136	0 %	50 %	50 %	0 %	357420180
25094	NC_016148	TAGA	2	8	1417148	1417155	50 %	25 %	25 %	0 %	357420180
25095	NC_016148	TTC	2	6	1417209	1417214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420180
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25098	NC_016148	CAT	2	6	1417445	1417450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420180
25099	NC_016148	CTG	3	9	1417630	1417638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420181
25100	NC_016148	AACT	2	8	1417669	1417676	50 %	25 %	0 %	25 %	357420181
25101	NC_016148	TCT	2	6	1417702	1417707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420181
25102	NC_016148	TTC	2	6	1417709	1417714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420181
25103	NC_016148	CAA	2	6	1417775	1417780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420181
25104	NC_016148	CTTC	2	8	1417788	1417795	0 %	50 %	0 %	50 %	357420181
25105	NC_016148	AGT	2	6	1417835	1417840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420181
25106	NC_016148	TGC	2	6	1417940	1417945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420181
25107	NC_016148	TTCT	2	8	1417946	1417953	0 %	75 %	0 %	25 %	357420181
25108	NC_016148	TCA	2	6	1417956	1417961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420181
25109	NC_016148	TAC	2	6	1417967	1417972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420181
25110	NC_016148	TC	3	6	1417976	1417981	0 %	50 %	0 %	50 %	357420181
25111	NC_016148	TTC	2	6	1418099	1418104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420181
25112	NC_016148	ATC	2	6	1418132	1418137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420181
25113	NC_016148	AAC	2	6	1418156	1418161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420181
25114	NC_016148	CAAG	2	8	1418173	1418180	50 %	0 %	25 %	25 %	357420181
25115	NC_016148	TCT	2	6	1418207	1418212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420181
25116	NC_016148	GGT	2	6	1418224	1418229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420181
25117	NC_016148	ATT	2	6	1418258	1418263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420181
25118	NC_016148	CTG	2	6	1418274	1418279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420181
25119	NC_016148	TCC	2	6	1418280	1418285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420181
25120	NC_016148	CCA	2	6	1418310	1418315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420182
25121	NC_016148	CCT	3	9	1418330	1418338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420182
25122	NC_016148	CTTT	2	8	1418383	1418390	0 %	75 %	0 %	25 %	357420182
25123	NC_016148	AACCA	2	10	1418394	1418403	60 %	0 %	0 %	40 %	357420182
25124	NC_016148	TCC	2	6	1418418	1418423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420182
25125	NC_016148	T	6	6	1418425	1418430	0 %	100 %	0 %	0 %	357420182
25126	NC_016148	GAAG	2	8	1418446	1418453	50 %	0 %	50 %	0 %	357420182
25127	NC_016148	CCA	2	6	1418498	1418503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420182
25128	NC_016148	TTA	2	6	1418506	1418511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420182
25129	NC_016148	CTTT	2	8	1418627	1418634	0 %	75 %	0 %	25 %	357420182
25130	NC_016148	CTA	2	6	1418687	1418692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420182
25131	NC_016148	AGA	2	6	1418788	1418793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420182
25132	NC_016148	CTTTTC	2	12	1418799	1418810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420182
25133	NC_016148	CAAC	2	8	1418846	1418853	50 %	0 %	0 %	50 %	357420182
25134	NC_016148	GGA	2	6	1418872	1418877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420182
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25137	NC_016148	ATCTT	2	10	1419028	1419037	20 %	60 %	0 %	20 %	357420182
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25140	NC_016148	ACC	2	6	1419131	1419136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420182
25141	NC_016148	TTC	2	6	1419150	1419155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420182
25142	NC_016148	TCC	2	6	1419232	1419237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420183
25143	NC_016148	GACAA	2	10	1419331	1419340	60 %	0 %	20 %	20 %	357420183
25144	NC_016148	CCCCT	2	10	1419374	1419383	0 %	20 %	0 %	80 %	357420183
25145	NC_016148	AAG	2	6	1419445	1419450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420183
25146	NC_016148	AGC	2	6	1419475	1419480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420183
25147	NC_016148	GGAA	2	8	1419486	1419493	50 %	0 %	50 %	0 %	357420183
25148	NC_016148	ATC	2	6	1419514	1419519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420183
25149	NC_016148	A	7	7	1419563	1419569	100 %	0 %	0 %	0 %	357420183
25150	NC_016148	G	6	6	1419578	1419583	0 %	0 %	100 %	0 %	357420183
25151	NC_016148	TCCA	2	8	1419595	1419602	25 %	25 %	0 %	50 %	357420183
25152	NC_016148	ACCTTT	2	12	1419659	1419670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	357420183
25153	NC_016148	TCC	2	6	1419694	1419699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420183
25154	NC_016148	CA	3	6	1419819	1419824	50 %	0 %	0 %	50 %	357420183
25155	NC_016148	TCC	2	6	1419932	1419937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420183
25156	NC_016148	TGTCC	2	10	1419963	1419972	0 %	40 %	20 %	40 %	357420183
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25169	NC_016148	TCTG	2	8	1420668	1420675	0 %	50 %	25 %	25 %	357420184
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25173	NC_016148	ATTCT	2	10	1420743	1420752	20 %	60 %	0 %	20 %	357420184
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25179	NC_016148	TAG	2	6	1421163	1421168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420184
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25187	NC_016148	GAA	2	6	1421426	1421431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420184
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25202	NC_016148	CTC	2	6	1422287	1422292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420185
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25217	NC_016148	ATCC	2	8	1422907	1422914	25 %	25 %	0 %	50 %	357420186
25218	NC_016148	TCC	2	6	1423007	1423012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420186
25219	NC_016148	GA	3	6	1423044	1423049	50 %	0 %	50 %	0 %	357420186
25220	NC_016148	GAT	2	6	1423073	1423078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420186
25221	NC_016148	AT	3	6	1423143	1423148	50 %	50 %	0 %	0 %	357420186
25222	NC_016148	GGT	2	6	1423170	1423175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420186
25223	NC_016148	AGT	2	6	1423190	1423195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420186
25224	NC_016148	GCT	2	6	1423214	1423219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420186
25225	NC_016148	AAGCA	2	10	1423264	1423273	60 %	0 %	20 %	20 %	357420186
25226	NC_016148	TCC	2	6	1423284	1423289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420186
25227	NC_016148	TCA	2	6	1423331	1423336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420186
25228	NC_016148	ATG	2	6	1423378	1423383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420186
25229	NC_016148	GAA	2	6	1423455	1423460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420186
25230	NC_016148	CTG	2	6	1423470	1423475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420186
25231	NC_016148	AC	3	6	1423496	1423501	50 %	0 %	0 %	50 %	357420186
25232	NC_016148	CTTTT	2	10	1423559	1423568	0 %	80 %	0 %	20 %	357420186
25233	NC_016148	TCC	2	6	1423706	1423711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420186
25234	NC_016148	ACA	2	6	1423817	1423822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420186
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25236	NC_016148	CGT	2	6	1424131	1424136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420187
25237	NC_016148	GT	3	6	1424135	1424140	0 %	50 %	50 %	0 %	357420187
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25352	NC_016148	TAT	2	6	1430749	1430754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420194
25353	NC_016148	AG	3	6	1430770	1430775	50 %	0 %	50 %	0 %	357420194
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25461	NC_016148	ATCC	2	8	1436245	1436252	25 %	25 %	0 %	50 %	357420199
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25465	NC_016148	ATC	2	6	1436415	1436420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420199
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25470	NC_016148	A	7	7	1436531	1436537	100 %	0 %	0 %	0 %	357420199
25471	NC_016148	TTA	2	6	1436893	1436898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420200
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