MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_016148	CTT	2	6	1355737	1355742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24002	NC_016148	GTC	2	6	1355746	1355751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24003	NC_016148	GCA	2	6	1355763	1355768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24004	NC_016148	TCTCT	2	10	1355790	1355799	0 %	60 %	0 %	40 %	357420122
24005	NC_016148	GCC	2	6	1355807	1355812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420122
24006	NC_016148	TCC	2	6	1355819	1355824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420122
24007	NC_016148	GAAG	2	8	1355845	1355852	50 %	0 %	50 %	0 %	357420122
24008	NC_016148	TCATT	2	10	1355919	1355928	20 %	60 %	0 %	20 %	357420122
24009	NC_016148	TCT	2	6	1356042	1356047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24010	NC_016148	TGC	2	6	1356073	1356078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24011	NC_016148	CAG	2	6	1356117	1356122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24012	NC_016148	CGT	2	6	1356168	1356173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24013	NC_016148	TTA	2	6	1356279	1356284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420122
24014	NC_016148	TTC	2	6	1356359	1356364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24015	NC_016148	TGC	2	6	1356519	1356524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24016	NC_016148	CT	3	6	1356567	1356572	0 %	50 %	0 %	50 %	357420122
24017	NC_016148	CCT	2	6	1356591	1356596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420122
24018	NC_016148	TTC	2	6	1356622	1356627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24019	NC_016148	TTC	2	6	1356644	1356649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24020	NC_016148	CTC	2	6	1356672	1356677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420122
24021	NC_016148	AGG	2	6	1356701	1356706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420122
24022	NC_016148	GCA	2	6	1356748	1356753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24023	NC_016148	CCT	2	6	1356789	1356794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420122
24024	NC_016148	CTT	2	6	1356804	1356809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24025	NC_016148	TCT	2	6	1356818	1356823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420122
24026	NC_016148	ATTC	2	8	1356858	1356865	25 %	50 %	0 %	25 %	357420122
24027	NC_016148	AT	3	6	1356945	1356950	50 %	50 %	0 %	0 %	357420122
24028	NC_016148	ATT	2	6	1356980	1356985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420122
24029	NC_016148	GCT	3	9	1357044	1357052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420122
24030	NC_016148	TC	3	6	1357158	1357163	0 %	50 %	0 %	50 %	357420122
24031	NC_016148	CT	3	6	1357173	1357178	0 %	50 %	0 %	50 %	357420122
24032	NC_016148	CT	3	6	1358691	1358696	0 %	50 %	0 %	50 %	357420123
24033	NC_016148	CAT	2	6	1358745	1358750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420123
24034	NC_016148	TTC	2	6	1358760	1358765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420123
24035	NC_016148	AT	3	6	1358889	1358894	50 %	50 %	0 %	0 %	357420123
24036	NC_016148	GAA	2	6	1358914	1358919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420123
24037	NC_016148	CTG	2	6	1358957	1358962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420123
24038	NC_016148	CTG	2	6	1358976	1358981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420123
24039	NC_016148	CTC	2	6	1359069	1359074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420124
24040	NC_016148	CCGGC	2	10	1359080	1359089	0 %	0 %	40 %	60 %	357420124
24041	NC_016148	AGG	2	6	1359109	1359114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420124
24042	NC_016148	AGC	2	6	1359202	1359207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420125
24043	NC_016148	TGG	2	6	1359231	1359236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420125
24044	NC_016148	TCT	2	6	1359275	1359280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420125
24045	NC_016148	CCT	2	6	1359299	1359304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420125
24046	NC_016148	GGCA	2	8	1359408	1359415	25 %	0 %	50 %	25 %	357420125
24047	NC_016148	TCA	2	6	1359455	1359460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420125
24048	NC_016148	CTT	2	6	1359540	1359545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420125
24049	NC_016148	AGG	2	6	1359597	1359602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420125
24050	NC_016148	CTTCT	2	10	1359605	1359614	0 %	60 %	0 %	40 %	357420125
24051	NC_016148	AGTGT	2	10	1359623	1359632	20 %	40 %	40 %	0 %	357420125
24052	NC_016148	CAA	2	6	1359654	1359659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420125
24053	NC_016148	GTT	2	6	1359706	1359711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420125
24054	NC_016148	GTT	2	6	1359727	1359732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420125
24055	NC_016148	AAT	2	6	1359763	1359768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420125
24056	NC_016148	TCCA	2	8	1359772	1359779	25 %	25 %	0 %	50 %	357420125
24057	NC_016148	GCA	2	6	1359867	1359872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420125
24058	NC_016148	CAT	2	6	1359951	1359956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420125
24059	NC_016148	ATA	2	6	1359988	1359993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420125
24060	NC_016148	AGC	2	6	1360021	1360026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420125
24061	NC_016148	CTT	2	6	1360050	1360055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420125
24062	NC_016148	AAC	2	6	1360072	1360077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420125
24063	NC_016148	GAT	2	6	1360129	1360134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420125
24064	NC_016148	TCCT	2	8	1360135	1360142	0 %	50 %	0 %	50 %	357420125
24065	NC_016148	T	6	6	1360371	1360376	0 %	100 %	0 %	0 %	357420125
24066	NC_016148	TCT	2	6	1360382	1360387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420125
24067	NC_016148	TCT	2	6	1360422	1360427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420125
24068	NC_016148	C	6	6	1360428	1360433	0 %	0 %	0 %	100 %	357420125
24069	NC_016148	AGC	2	6	1360516	1360521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420126
24070	NC_016148	CT	3	6	1360529	1360534	0 %	50 %	0 %	50 %	357420126
24071	NC_016148	CTC	2	6	1360707	1360712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420126
24072	NC_016148	ACT	2	6	1360768	1360773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420126
24073	NC_016148	ATC	2	6	1360825	1360830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420126
24074	NC_016148	ATC	2	6	1360968	1360973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420127
24075	NC_016148	TAC	2	6	1361048	1361053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420127
24076	NC_016148	TGA	2	6	1361086	1361091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420127
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24078	NC_016148	GAT	2	6	1361174	1361179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420127
24079	NC_016148	TC	3	6	1361209	1361214	0 %	50 %	0 %	50 %	357420127
24080	NC_016148	CAC	3	9	1361237	1361245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420127
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24082	NC_016148	ACCTT	2	10	1361269	1361278	20 %	40 %	0 %	40 %	357420127
24083	NC_016148	TCG	2	6	1361320	1361325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420127
24084	NC_016148	CAT	2	6	1361832	1361837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420128
24085	NC_016148	TGA	2	6	1361867	1361872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420128
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24087	NC_016148	ATT	2	6	1361904	1361909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420128
24088	NC_016148	A	6	6	1361914	1361919	100 %	0 %	0 %	0 %	357420128
24089	NC_016148	AGA	2	6	1362007	1362012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420128
24090	NC_016148	AG	3	6	1362019	1362024	50 %	0 %	50 %	0 %	357420128
24091	NC_016148	AT	3	6	1362047	1362052	50 %	50 %	0 %	0 %	357420128
24092	NC_016148	AAC	2	6	1362085	1362090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420128
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24099	NC_016148	GAA	2	6	1362436	1362441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420128
24100	NC_016148	AGAAAA	2	12	1362445	1362456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	357420128
24101	NC_016148	CTCTC	2	10	1362494	1362503	0 %	40 %	0 %	60 %	357420128
24102	NC_016148	AAG	2	6	1362521	1362526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420128
24103	NC_016148	GAT	2	6	1362559	1362564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420128
24104	NC_016148	A	6	6	1362701	1362706	100 %	0 %	0 %	0 %	357420128
24105	NC_016148	TGG	2	6	1362794	1362799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420128
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24109	NC_016148	AGCGAT	2	12	1362978	1362989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357420129
24110	NC_016148	TTG	2	6	1363051	1363056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420129
24111	NC_016148	CTT	2	6	1363061	1363066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420129
24112	NC_016148	CAG	2	6	1363227	1363232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420129
24113	NC_016148	CATTT	2	10	1363276	1363285	20 %	60 %	0 %	20 %	357420129
24114	NC_016148	AGA	2	6	1363315	1363320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420129
24115	NC_016148	AAG	2	6	1363357	1363362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420129
24116	NC_016148	TGA	2	6	1363418	1363423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420129
24117	NC_016148	AAAC	2	8	1363519	1363526	75 %	0 %	0 %	25 %	357420129
24118	NC_016148	GCA	2	6	1363534	1363539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420129
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24121	NC_016148	AGA	2	6	1363610	1363615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420129
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24188	NC_016148	GAA	2	6	1367640	1367645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420133
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24223	NC_016148	TC	3	6	1369565	1369570	0 %	50 %	0 %	50 %	357420135
24224	NC_016148	TTC	2	6	1369602	1369607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420135
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24234	NC_016148	TC	3	6	1369949	1369954	0 %	50 %	0 %	50 %	357420135
24235	NC_016148	CTG	2	6	1369974	1369979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420135
24236	NC_016148	TC	4	8	1369995	1370002	0 %	50 %	0 %	50 %	357420135
24237	NC_016148	CTT	2	6	1370006	1370011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420135
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24340	NC_016148	CCGC	2	8	1375182	1375189	0 %	0 %	25 %	75 %	357420141
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24347	NC_016148	TCG	2	6	1375724	1375729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420141
24348	NC_016148	CTT	2	6	1375785	1375790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420141
24349	NC_016148	CA	3	6	1375796	1375801	50 %	0 %	0 %	50 %	357420141
24350	NC_016148	CTT	2	6	1375846	1375851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420141
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24352	NC_016148	CAT	2	6	1375928	1375933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420142
24353	NC_016148	TAC	2	6	1375956	1375961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420142
24354	NC_016148	TCT	2	6	1376026	1376031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420142
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24469	NC_016148	CAT	2	6	1381955	1381960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420148
24470	NC_016148	TCT	2	6	1381983	1381988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420148
24471	NC_016148	GCT	2	6	1382025	1382030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420148
24472	NC_016148	TGG	2	6	1382171	1382176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420148
24473	NC_016148	TCA	2	6	1382217	1382222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420148
24474	NC_016148	AT	3	6	1382288	1382293	50 %	50 %	0 %	0 %	357420148
24475	NC_016148	TGG	2	6	1382316	1382321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420148
24476	NC_016148	TTA	2	6	1382387	1382392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420149
24477	NC_016148	TTC	2	6	1382517	1382522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420149
24478	NC_016148	TCG	2	6	1382563	1382568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420149
24479	NC_016148	TCC	2	6	1382686	1382691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420149
24480	NC_016148	TC	3	6	1382777	1382782	0 %	50 %	0 %	50 %	357420149
24481	NC_016148	TCTT	2	8	1382886	1382893	0 %	75 %	0 %	25 %	357420149
24482	NC_016148	GTA	2	6	1382931	1382936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420149
24483	NC_016148	GAG	2	6	1382996	1383001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420149
24484	NC_016148	AAC	2	6	1383033	1383038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420149
24485	NC_016148	TCC	2	6	1383045	1383050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420149
24486	NC_016148	CGT	2	6	1383053	1383058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420149
24487	NC_016148	AAAG	2	8	1383102	1383109	75 %	0 %	25 %	0 %	357420149
24488	NC_016148	TCA	2	6	1383142	1383147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24489	NC_016148	AGGA	2	8	1383198	1383205	50 %	0 %	50 %	0 %	357420149
24490	NC_016148	TAT	2	6	1383240	1383245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420149
24491	NC_016148	CAC	2	6	1383363	1383368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420149
24492	NC_016148	CAT	2	6	1383390	1383395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24493	NC_016148	TCA	2	6	1383487	1383492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24494	NC_016148	CAGG	2	8	1383549	1383556	25 %	0 %	50 %	25 %	357420149
24495	NC_016148	CAT	2	6	1383570	1383575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24496	NC_016148	CTC	2	6	1383675	1383680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420149
24497	NC_016148	CAT	2	6	1383705	1383710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24498	NC_016148	TAC	2	6	1383753	1383758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420149
24499	NC_016148	CCG	3	9	1383811	1383819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420150
24500	NC_016148	ACCTA	2	10	1383903	1383912	40 %	20 %	0 %	40 %	357420150

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