MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_016148	GCCA	2	8	1327984	1327991	25 %	0 %	25 %	50 %	357420101
23502	NC_016148	CAAC	2	8	1328025	1328032	50 %	0 %	0 %	50 %	357420101
23503	NC_016148	CAT	2	6	1328046	1328051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23504	NC_016148	ATC	2	6	1328052	1328057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23505	NC_016148	GCAA	2	8	1328083	1328090	50 %	0 %	25 %	25 %	357420101
23506	NC_016148	CG	3	6	1328165	1328170	0 %	0 %	50 %	50 %	357420101
23507	NC_016148	GCC	2	6	1328224	1328229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420101
23508	NC_016148	TAC	2	6	1328370	1328375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23509	NC_016148	TGC	2	6	1328442	1328447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420101
23510	NC_016148	ACC	2	6	1328535	1328540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420101
23511	NC_016148	CAG	2	6	1328582	1328587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420101
23512	NC_016148	CATC	2	8	1328594	1328601	25 %	25 %	0 %	50 %	357420101
23513	NC_016148	CAA	2	6	1328636	1328641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420101
23514	NC_016148	AACA	2	8	1328642	1328649	75 %	0 %	0 %	25 %	357420101
23515	NC_016148	AAT	2	6	1328662	1328667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420101
23516	NC_016148	TCA	2	6	1328755	1328760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23517	NC_016148	TCCAT	2	10	1328799	1328808	20 %	40 %	0 %	40 %	357420101
23518	NC_016148	T	8	8	1328813	1328820	0 %	100 %	0 %	0 %	357420101
23519	NC_016148	GCA	2	6	1328828	1328833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420101
23520	NC_016148	CAA	2	6	1328840	1328845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420101
23521	NC_016148	TGAA	2	8	1328852	1328859	50 %	25 %	25 %	0 %	357420101
23522	NC_016148	TTCT	2	8	1328866	1328873	0 %	75 %	0 %	25 %	357420101
23523	NC_016148	AAGAT	2	10	1328893	1328902	60 %	20 %	20 %	0 %	357420101
23524	NC_016148	CAA	2	6	1328955	1328960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420101
23525	NC_016148	CTGGC	2	10	1329042	1329051	0 %	20 %	40 %	40 %	357420101
23526	NC_016148	CAT	2	6	1329080	1329085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23527	NC_016148	TCT	2	6	1329109	1329114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420101
23528	NC_016148	GTT	2	6	1329127	1329132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420101
23529	NC_016148	CCA	2	6	1329155	1329160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420101
23530	NC_016148	CAC	2	6	1329203	1329208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420101
23531	NC_016148	TCCT	2	8	1329225	1329232	0 %	50 %	0 %	50 %	357420101
23532	NC_016148	CAA	2	6	1329243	1329248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420101
23533	NC_016148	CGTG	2	8	1329556	1329563	0 %	25 %	50 %	25 %	357420102
23534	NC_016148	CAA	2	6	1329600	1329605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420102
23535	NC_016148	TC	3	6	1329654	1329659	0 %	50 %	0 %	50 %	357420102
23536	NC_016148	CCA	2	6	1329723	1329728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420102
23537	NC_016148	AACC	2	8	1329812	1329819	50 %	0 %	0 %	50 %	357420102
23538	NC_016148	TTC	2	6	1329941	1329946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23539	NC_016148	TTC	2	6	1329961	1329966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23540	NC_016148	ATA	2	6	1329988	1329993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420102
23541	NC_016148	TCCA	2	8	1330018	1330025	25 %	25 %	0 %	50 %	357420102
23542	NC_016148	GTT	2	6	1330035	1330040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420102
23543	NC_016148	ATC	2	6	1330099	1330104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420102
23544	NC_016148	GCG	2	6	1330141	1330146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420102
23545	NC_016148	TCAT	2	8	1330205	1330212	25 %	50 %	0 %	25 %	357420102
23546	NC_016148	CTT	2	6	1330230	1330235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23547	NC_016148	CAAT	2	8	1330344	1330351	50 %	25 %	0 %	25 %	357420102
23548	NC_016148	TTGTCA	2	12	1330352	1330363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357420102
23549	NC_016148	ACG	2	6	1330456	1330461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23550	NC_016148	TCG	2	6	1330463	1330468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23551	NC_016148	GAA	2	6	1330630	1330635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420102
23552	NC_016148	CTC	2	6	1330645	1330650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420102
23553	NC_016148	GCT	2	6	1330671	1330676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23554	NC_016148	TCT	3	9	1330751	1330759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23555	NC_016148	TTG	2	6	1330765	1330770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420102
23556	NC_016148	CT	3	6	1330963	1330968	0 %	50 %	0 %	50 %	357420102
23557	NC_016148	A	6	6	1330983	1330988	100 %	0 %	0 %	0 %	357420102
23558	NC_016148	AAAG	2	8	1331009	1331016	75 %	0 %	25 %	0 %	357420102
23559	NC_016148	GCTTT	2	10	1331063	1331072	0 %	60 %	20 %	20 %	357420102
23560	NC_016148	CAG	2	6	1331161	1331166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23561	NC_016148	TTC	2	6	1331227	1331232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23562	NC_016148	TCG	2	6	1331303	1331308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23563	NC_016148	ACA	2	6	1331322	1331327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420102
23564	NC_016148	TTC	2	6	1331452	1331457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23565	NC_016148	CGT	2	6	1331545	1331550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420102
23566	NC_016148	CTT	2	6	1331583	1331588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420102
23567	NC_016148	TGT	2	6	1331685	1331690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420102
23568	NC_016148	GTGG	2	8	1331794	1331801	0 %	25 %	75 %	0 %	357420102
23569	NC_016148	CCTTT	2	10	1331853	1331862	0 %	60 %	0 %	40 %	357420102
23570	NC_016148	TAA	2	6	1331919	1331924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420102
23571	NC_016148	CCA	2	6	1331942	1331947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420102
23572	NC_016148	GTT	2	6	1331971	1331976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420102
23573	NC_016148	TCCT	2	8	1332151	1332158	0 %	50 %	0 %	50 %	357420102
23574	NC_016148	TAC	2	6	1332175	1332180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420102
23575	NC_016148	TTG	2	6	1332209	1332214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420102
23576	NC_016148	TCTCCA	2	12	1332261	1332272	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	357420102
23577	NC_016148	AGAGT	2	10	1332293	1332302	40 %	20 %	40 %	0 %	357420102
23578	NC_016148	T	6	6	1332341	1332346	0 %	100 %	0 %	0 %	357420102
23579	NC_016148	TCA	3	9	1332353	1332361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420102
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23581	NC_016148	CA	3	6	1332486	1332491	50 %	0 %	0 %	50 %	357420102
23582	NC_016148	CCT	2	6	1332554	1332559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420103
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23584	NC_016148	GTA	2	6	1332658	1332663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420103
23585	NC_016148	GTG	2	6	1332730	1332735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420103
23586	NC_016148	CAGG	2	8	1332747	1332754	25 %	0 %	50 %	25 %	357420103
23587	NC_016148	CGC	2	6	1332764	1332769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420103
23588	NC_016148	CA	3	6	1332819	1332824	50 %	0 %	0 %	50 %	357420103
23589	NC_016148	CAA	2	6	1332846	1332851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420103
23590	NC_016148	CTT	2	6	1332881	1332886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420103
23591	NC_016148	TTC	2	6	1333011	1333016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420103
23592	NC_016148	T	6	6	1333024	1333029	0 %	100 %	0 %	0 %	357420103
23593	NC_016148	GCG	2	6	1333030	1333035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420103
23594	NC_016148	CGG	2	6	1333036	1333041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420103
23595	NC_016148	GCA	2	6	1333102	1333107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420103
23596	NC_016148	TTCT	2	8	1333116	1333123	0 %	75 %	0 %	25 %	357420103
23597	NC_016148	ACA	2	6	1333201	1333206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420103
23598	NC_016148	GCT	2	6	1333265	1333270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420103
23599	NC_016148	CAA	2	6	1333271	1333276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420103
23600	NC_016148	TTG	2	6	1333320	1333325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420103
23601	NC_016148	GCT	2	6	1333343	1333348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420103
23602	NC_016148	TCT	2	6	1333427	1333432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420103
23603	NC_016148	CAT	2	6	1333475	1333480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420103
23604	NC_016148	ATC	2	6	1333483	1333488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420103
23605	NC_016148	AGT	2	6	1333562	1333567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420103
23606	NC_016148	CT	3	6	1333594	1333599	0 %	50 %	0 %	50 %	357420103
23607	NC_016148	CG	3	6	1333613	1333618	0 %	0 %	50 %	50 %	357420103
23608	NC_016148	ATA	2	6	1333702	1333707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420103
23609	NC_016148	GT	3	6	1333713	1333718	0 %	50 %	50 %	0 %	357420103
23610	NC_016148	TGG	2	6	1333737	1333742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420103
23611	NC_016148	CG	3	6	1333748	1333753	0 %	0 %	50 %	50 %	357420103
23612	NC_016148	CCGC	2	8	1333754	1333761	0 %	0 %	25 %	75 %	357420103
23613	NC_016148	CAA	2	6	1333784	1333789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420103
23614	NC_016148	TCC	2	6	1333795	1333800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420103
23615	NC_016148	TTGC	2	8	1333831	1333838	0 %	50 %	25 %	25 %	357420103
23616	NC_016148	CTG	2	6	1333850	1333855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420103
23617	NC_016148	CAT	2	6	1333871	1333876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420103
23618	NC_016148	CAT	2	6	1333914	1333919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420103
23619	NC_016148	TGT	2	6	1334063	1334068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420103
23620	NC_016148	GGT	2	6	1334166	1334171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420103
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23853	NC_016148	AGG	2	6	1346689	1346694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420114
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23954	NC_016148	ACT	2	6	1352417	1352422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420119
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23960	NC_016148	TAG	2	6	1352614	1352619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420119
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23962	NC_016148	TCA	2	6	1352657	1352662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420119
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23967	NC_016148	CTC	2	6	1353092	1353097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420120
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23969	NC_016148	ATGT	2	8	1353166	1353173	25 %	50 %	25 %	0 %	357420120
23970	NC_016148	GTACCA	2	12	1353189	1353200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357420120
23971	NC_016148	GA	3	6	1353241	1353246	50 %	0 %	50 %	0 %	357420120
23972	NC_016148	AC	3	6	1353366	1353371	50 %	0 %	0 %	50 %	357420120
23973	NC_016148	AGC	2	6	1353597	1353602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420120
23974	NC_016148	GGT	2	6	1353843	1353848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420120
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23978	NC_016148	CCG	2	6	1353913	1353918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420120
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23980	NC_016148	CTTT	2	8	1354142	1354149	0 %	75 %	0 %	25 %	357420120
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23984	NC_016148	TA	4	8	1354564	1354571	50 %	50 %	0 %	0 %	357420121
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23988	NC_016148	CTT	3	9	1354763	1354771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420121
23989	NC_016148	TCG	2	6	1354772	1354777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420121
23990	NC_016148	CCTG	2	8	1354819	1354826	0 %	25 %	25 %	50 %	357420121
23991	NC_016148	GCT	2	6	1354876	1354881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420121
23992	NC_016148	A	6	6	1355027	1355032	100 %	0 %	0 %	0 %	357420121
23993	NC_016148	CA	3	6	1355067	1355072	50 %	0 %	0 %	50 %	357420121
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23998	NC_016148	AAC	2	6	1355538	1355543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420121
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24000	NC_016148	CTC	2	6	1355724	1355729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420122

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