MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_016148	A	6	6	1298893	1298898	100 %	0 %	0 %	0 %	357420084
23002	NC_016148	AAAAC	2	10	1298929	1298938	80 %	0 %	0 %	20 %	357420084
23003	NC_016148	AAT	2	6	1298978	1298983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420084
23004	NC_016148	TGA	2	6	1298999	1299004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420084
23005	NC_016148	GTT	2	6	1299174	1299179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420084
23006	NC_016148	CGA	2	6	1299188	1299193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420084
23007	NC_016148	CAAG	2	8	1299360	1299367	50 %	0 %	25 %	25 %	357420084
23008	NC_016148	AAGG	2	8	1299429	1299436	50 %	0 %	50 %	0 %	357420084
23009	NC_016148	GCG	2	6	1299454	1299459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420084
23010	NC_016148	CAAA	2	8	1299529	1299536	75 %	0 %	0 %	25 %	357420084
23011	NC_016148	CAA	2	6	1299553	1299558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420084
23012	NC_016148	CAA	2	6	1299563	1299568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420084
23013	NC_016148	GGC	2	6	1299690	1299695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420084
23014	NC_016148	TGG	2	6	1299884	1299889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420084
23015	NC_016148	TTC	2	6	1299936	1299941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420084
23016	NC_016148	GA	3	6	1300020	1300025	50 %	0 %	50 %	0 %	357420084
23017	NC_016148	CTG	2	6	1300062	1300067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420084
23018	NC_016148	A	6	6	1300188	1300193	100 %	0 %	0 %	0 %	357420084
23019	NC_016148	AGAT	2	8	1300321	1300328	50 %	25 %	25 %	0 %	357420084
23020	NC_016148	AGG	2	6	1300397	1300402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420084
23021	NC_016148	A	6	6	1300472	1300477	100 %	0 %	0 %	0 %	357420085
23022	NC_016148	GGA	2	6	1300549	1300554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420085
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23026	NC_016148	CCTGC	2	10	1300736	1300745	0 %	20 %	20 %	60 %	357420085
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23029	NC_016148	GAA	2	6	1300900	1300905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420085
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23031	NC_016148	GA	3	6	1300970	1300975	50 %	0 %	50 %	0 %	357420085
23032	NC_016148	TAG	2	6	1301012	1301017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420085
23033	NC_016148	GAG	2	6	1301018	1301023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420085
23034	NC_016148	CTA	2	6	1301046	1301051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420085
23035	NC_016148	ATG	2	6	1301110	1301115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420085
23036	NC_016148	GGA	2	6	1301235	1301240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420085
23037	NC_016148	A	6	6	1301244	1301249	100 %	0 %	0 %	0 %	357420085
23038	NC_016148	ATA	2	6	1301401	1301406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420085
23039	NC_016148	GGC	2	6	1301407	1301412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420085
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23042	NC_016148	AGA	2	6	1301523	1301528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420085
23043	NC_016148	GAA	2	6	1301536	1301541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420085
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23049	NC_016148	TCA	2	6	1301892	1301897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420085
23050	NC_016148	GTA	2	6	1301941	1301946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420085
23051	NC_016148	GAT	2	6	1301950	1301955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420085
23052	NC_016148	TAC	2	6	1302232	1302237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420085
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23054	NC_016148	TG	3	6	1302403	1302408	0 %	50 %	50 %	0 %	357420085
23055	NC_016148	AG	3	6	1302435	1302440	50 %	0 %	50 %	0 %	357420085
23056	NC_016148	GAA	2	6	1302548	1302553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420085
23057	NC_016148	TCGAT	2	10	1302621	1302630	20 %	40 %	20 %	20 %	357420085
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23072	NC_016148	GATA	2	8	1303093	1303100	50 %	25 %	25 %	0 %	357420085
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23102	NC_016148	T	6	6	1304544	1304549	0 %	100 %	0 %	0 %	357420086
23103	NC_016148	TGA	2	6	1304586	1304591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420086
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23105	NC_016148	TTCGAA	2	12	1304742	1304753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357420086
23106	NC_016148	T	6	6	1304823	1304828	0 %	100 %	0 %	0 %	357420086
23107	NC_016148	GGA	2	6	1304847	1304852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420086
23108	NC_016148	T	6	6	1304853	1304858	0 %	100 %	0 %	0 %	357420086
23109	NC_016148	TC	3	6	1304864	1304869	0 %	50 %	0 %	50 %	357420086
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23113	NC_016148	CGG	2	6	1305164	1305169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420086
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23117	NC_016148	ATT	2	6	1305367	1305372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420086
23118	NC_016148	TCT	3	9	1305424	1305432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420086
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23122	NC_016148	CTT	2	6	1305570	1305575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420086
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23222	NC_016148	CTT	2	6	1310923	1310928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420090
23223	NC_016148	A	7	7	1310996	1311002	100 %	0 %	0 %	0 %	357420090
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23230	NC_016148	TCC	2	6	1311801	1311806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420091
23231	NC_016148	G	6	6	1311810	1311815	0 %	0 %	100 %	0 %	357420091
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23233	NC_016148	TCT	2	6	1311884	1311889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420091
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23235	NC_016148	TCC	2	6	1312078	1312083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420091
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23472	NC_016148	T	7	7	1326069	1326075	0 %	100 %	0 %	0 %	357420101
23473	NC_016148	AGGA	2	8	1326171	1326178	50 %	0 %	50 %	0 %	357420101
23474	NC_016148	CAT	2	6	1326317	1326322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23475	NC_016148	GAT	2	6	1326383	1326388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420101
23476	NC_016148	TAT	2	6	1326422	1326427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420101
23477	NC_016148	ATT	2	6	1326490	1326495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420101
23478	NC_016148	CCA	2	6	1326513	1326518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420101
23479	NC_016148	TTC	2	6	1326537	1326542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420101
23480	NC_016148	CTG	2	6	1326666	1326671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420101
23481	NC_016148	T	6	6	1326711	1326716	0 %	100 %	0 %	0 %	357420101
23482	NC_016148	TC	3	6	1326722	1326727	0 %	50 %	0 %	50 %	357420101
23483	NC_016148	GAT	2	6	1326745	1326750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420101
23484	NC_016148	TTG	2	6	1326753	1326758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420101
23485	NC_016148	CTC	2	6	1326870	1326875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420101
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23488	NC_016148	ATC	2	6	1327035	1327040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
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23490	NC_016148	CAT	2	6	1327178	1327183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420101
23491	NC_016148	ATG	2	6	1327398	1327403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420101
23492	NC_016148	GAT	2	6	1327404	1327409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420101
23493	NC_016148	AGAA	2	8	1327424	1327431	75 %	0 %	25 %	0 %	357420101
23494	NC_016148	GTC	2	6	1327443	1327448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420101
23495	NC_016148	GCG	2	6	1327625	1327630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420101
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23497	NC_016148	TTCC	2	8	1327758	1327765	0 %	50 %	0 %	50 %	357420101
23498	NC_016148	CCGG	2	8	1327803	1327810	0 %	0 %	50 %	50 %	357420101
23499	NC_016148	TAG	2	6	1327815	1327820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420101
23500	NC_016148	CTT	2	6	1327901	1327906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420101

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