MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_016148	CGC	2	6	1270670	1270675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420053
22503	NC_016148	GCA	2	6	1270710	1270715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420053
22504	NC_016148	CCA	2	6	1270719	1270724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420053
22505	NC_016148	AAG	2	6	1270763	1270768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420053
22506	NC_016148	AGA	2	6	1271008	1271013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420053
22507	NC_016148	CAG	2	6	1271023	1271028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420053
22508	NC_016148	CAC	2	6	1271089	1271094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420053
22509	NC_016148	GA	3	6	1271107	1271112	50 %	0 %	50 %	0 %	357420053
22510	NC_016148	ATG	2	6	1271148	1271153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420053
22511	NC_016148	CCG	2	6	1271212	1271217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420053
22512	NC_016148	TTA	2	6	1271227	1271232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420053
22513	NC_016148	TAT	2	6	1271318	1271323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420053
22514	NC_016148	CCA	2	6	1271335	1271340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420053
22515	NC_016148	CGA	2	6	1271344	1271349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420053
22516	NC_016148	TATC	2	8	1271373	1271380	25 %	50 %	0 %	25 %	357420053
22517	NC_016148	GAA	2	6	1271447	1271452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420053
22518	NC_016148	GTA	2	6	1271571	1271576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420053
22519	NC_016148	AGA	2	6	1271578	1271583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420053
22520	NC_016148	TTC	2	6	1271618	1271623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420053
22521	NC_016148	TTCC	2	8	1271640	1271647	0 %	50 %	0 %	50 %	357420053
22522	NC_016148	CCAA	2	8	1271681	1271688	50 %	0 %	0 %	50 %	357420053
22523	NC_016148	GTT	2	6	1271732	1271737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420054
22524	NC_016148	TCA	2	6	1271751	1271756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420054
22525	NC_016148	AGA	2	6	1271795	1271800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420054
22526	NC_016148	GGC	2	6	1271852	1271857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357420054
22527	NC_016148	T	6	6	1271896	1271901	0 %	100 %	0 %	0 %	357420054
22528	NC_016148	TCTT	2	8	1272133	1272140	0 %	75 %	0 %	25 %	357420055
22529	NC_016148	TTG	2	6	1272321	1272326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420055
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22531	NC_016148	TC	3	6	1272367	1272372	0 %	50 %	0 %	50 %	357420055
22532	NC_016148	TAT	2	6	1272392	1272397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420055
22533	NC_016148	CT	4	8	1272524	1272531	0 %	50 %	0 %	50 %	357420055
22534	NC_016148	GGAT	2	8	1272563	1272570	25 %	25 %	50 %	0 %	357420055
22535	NC_016148	CTC	2	6	1272584	1272589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420055
22536	NC_016148	TTC	2	6	1272593	1272598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420055
22537	NC_016148	AGT	2	6	1272631	1272636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420055
22538	NC_016148	AATC	2	8	1272649	1272656	50 %	25 %	0 %	25 %	357420055
22539	NC_016148	AATA	2	8	1272657	1272664	75 %	25 %	0 %	0 %	357420055
22540	NC_016148	TCTT	2	8	1272749	1272756	0 %	75 %	0 %	25 %	357420055
22541	NC_016148	AAC	2	6	1272764	1272769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420055
22542	NC_016148	TGC	2	6	1272775	1272780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420055
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22544	NC_016148	ATC	2	6	1272866	1272871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420055
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22546	NC_016148	GTC	2	6	1273034	1273039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420055
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22550	NC_016148	T	6	6	1273156	1273161	0 %	100 %	0 %	0 %	357420055
22551	NC_016148	AGTT	2	8	1273163	1273170	25 %	50 %	25 %	0 %	357420055
22552	NC_016148	CTTTT	2	10	1273174	1273183	0 %	80 %	0 %	20 %	357420055
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22554	NC_016148	TGTT	2	8	1274057	1274064	0 %	75 %	25 %	0 %	357420056
22555	NC_016148	ACGC	2	8	1274077	1274084	25 %	0 %	25 %	50 %	357420056
22556	NC_016148	ATTTT	2	10	1274116	1274125	20 %	80 %	0 %	0 %	357420056
22557	NC_016148	AG	3	6	1274186	1274191	50 %	0 %	50 %	0 %	357420056
22558	NC_016148	CATAC	2	10	1274198	1274207	40 %	20 %	0 %	40 %	357420056
22559	NC_016148	CTT	2	6	1274293	1274298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420056
22560	NC_016148	GAA	2	6	1274316	1274321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420056
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22562	NC_016148	TA	3	6	1274364	1274369	50 %	50 %	0 %	0 %	357420056
22563	NC_016148	GAA	2	6	1274493	1274498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420056
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22566	NC_016148	ACC	2	6	1274580	1274585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420056
22567	NC_016148	ACTC	2	8	1274608	1274615	25 %	25 %	0 %	50 %	357420056
22568	NC_016148	TTG	2	6	1274716	1274721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420056
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22570	NC_016148	GGA	2	6	1274856	1274861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420056
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22575	NC_016148	CTG	2	6	1275343	1275348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420057
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22584	NC_016148	AGC	2	6	1275910	1275915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420057
22585	NC_016148	TCCC	2	8	1275961	1275968	0 %	25 %	0 %	75 %	357420057
22586	NC_016148	GCC	2	6	1276012	1276017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357420057
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22588	NC_016148	GTC	2	6	1276105	1276110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420057
22589	NC_016148	TCA	2	6	1276166	1276171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420057
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22591	NC_016148	GCTC	2	8	1276242	1276249	0 %	25 %	25 %	50 %	357420057
22592	NC_016148	AGC	2	6	1276337	1276342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420057
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22597	NC_016148	TGA	2	6	1276547	1276552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420058
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22599	NC_016148	AGGG	2	8	1276582	1276589	25 %	0 %	75 %	0 %	357420058
22600	NC_016148	CAT	2	6	1276624	1276629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420058
22601	NC_016148	ACT	2	6	1276637	1276642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420058
22602	NC_016148	A	6	6	1276692	1276697	100 %	0 %	0 %	0 %	357420058
22603	NC_016148	CAA	2	6	1276739	1276744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420058
22604	NC_016148	A	6	6	1276743	1276748	100 %	0 %	0 %	0 %	357420058
22605	NC_016148	ACC	2	6	1276761	1276766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420058
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22607	NC_016148	GAA	2	6	1276915	1276920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420058
22608	NC_016148	TAT	2	6	1276976	1276981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420058
22609	NC_016148	ATT	2	6	1276997	1277002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420058
22610	NC_016148	A	6	6	1277123	1277128	100 %	0 %	0 %	0 %	357420058
22611	NC_016148	CATAGG	2	12	1277130	1277141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357420058
22612	NC_016148	TGC	2	6	1277154	1277159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420058
22613	NC_016148	AG	4	8	1277194	1277201	50 %	0 %	50 %	0 %	357420058
22614	NC_016148	AAACCC	2	12	1277229	1277240	50 %	0 %	0 %	50 %	357420058
22615	NC_016148	AT	3	6	1277295	1277300	50 %	50 %	0 %	0 %	357420058
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22617	NC_016148	ATA	2	6	1277317	1277322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420058
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22972	NC_016148	TTTC	2	8	1296807	1296814	0 %	75 %	0 %	25 %	357420081
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22978	NC_016148	CCAT	2	8	1297376	1297383	25 %	25 %	0 %	50 %	357420081
22979	NC_016148	CTT	2	6	1297441	1297446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420081
22980	NC_016148	GCTTC	2	10	1297459	1297468	0 %	40 %	20 %	40 %	357420081
22981	NC_016148	A	6	6	1297489	1297494	100 %	0 %	0 %	0 %	357420081
22982	NC_016148	GAC	2	6	1297501	1297506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420081
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22998	NC_016148	TGG	2	6	1298785	1298790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420084
22999	NC_016148	A	6	6	1298848	1298853	100 %	0 %	0 %	0 %	357420084
23000	NC_016148	GAA	2	6	1298889	1298894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420084

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