MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_016148	TGG	2	6	1243162	1243167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420022
22003	NC_016148	A	6	6	1243201	1243206	100 %	0 %	0 %	0 %	357420022
22004	NC_016148	ACA	2	6	1243266	1243271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420022
22005	NC_016148	TTTCTT	2	12	1243371	1243382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	357420022
22006	NC_016148	CTAG	2	8	1243992	1243999	25 %	25 %	25 %	25 %	357420023
22007	NC_016148	CA	3	6	1244014	1244019	50 %	0 %	0 %	50 %	357420023
22008	NC_016148	CCTC	2	8	1244089	1244096	0 %	25 %	0 %	75 %	357420023
22009	NC_016148	CTC	2	6	1244222	1244227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420023
22010	NC_016148	TCA	2	6	1244248	1244253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420023
22011	NC_016148	ATC	2	6	1244267	1244272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420023
22012	NC_016148	GAG	2	6	1244403	1244408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420024
22013	NC_016148	ACCA	2	8	1244455	1244462	50 %	0 %	0 %	50 %	357420024
22014	NC_016148	TACCC	2	10	1244473	1244482	20 %	20 %	0 %	60 %	357420024
22015	NC_016148	TCTTT	2	10	1244498	1244507	0 %	80 %	0 %	20 %	357420024
22016	NC_016148	CTTT	2	8	1244513	1244520	0 %	75 %	0 %	25 %	357420024
22017	NC_016148	CCA	2	6	1244584	1244589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420024
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22019	NC_016148	GTTT	2	8	1244642	1244649	0 %	75 %	25 %	0 %	357420024
22020	NC_016148	AAT	2	6	1244662	1244667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420024
22021	NC_016148	TTC	2	6	1244673	1244678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420024
22022	NC_016148	A	7	7	1244706	1244712	100 %	0 %	0 %	0 %	357420025
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22039	NC_016148	ACTT	2	8	1245319	1245326	25 %	50 %	0 %	25 %	357420025
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22041	NC_016148	ATT	2	6	1245461	1245466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420025
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22045	NC_016148	CAT	2	6	1245640	1245645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420025
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22047	NC_016148	A	6	6	1245669	1245674	100 %	0 %	0 %	0 %	357420025
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22052	NC_016148	A	7	7	1246116	1246122	100 %	0 %	0 %	0 %	357420025
22053	NC_016148	CCA	2	6	1246152	1246157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420025
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22103	NC_016148	TA	3	6	1248586	1248591	50 %	50 %	0 %	0 %	357420028
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22117	NC_016148	GTA	2	6	1249163	1249168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420029
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22119	NC_016148	AAT	2	6	1249289	1249294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420029
22120	NC_016148	ACC	2	6	1249322	1249327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420029
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22122	NC_016148	GTA	2	6	1249426	1249431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420029
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22221	NC_016148	ACTAC	2	10	1255516	1255525	40 %	20 %	0 %	40 %	357420033
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22223	NC_016148	TCCC	2	8	1255617	1255624	0 %	25 %	0 %	75 %	357420033
22224	NC_016148	TTC	2	6	1255645	1255650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420033
22225	NC_016148	ATTTC	2	10	1255706	1255715	20 %	60 %	0 %	20 %	357420033
22226	NC_016148	TCTCA	2	10	1255761	1255770	20 %	40 %	0 %	40 %	357420033
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22229	NC_016148	TGT	2	6	1256018	1256023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420033
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22231	NC_016148	AAG	2	6	1256060	1256065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420033
22232	NC_016148	CTC	2	6	1256082	1256087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420033
22233	NC_016148	TCA	2	6	1256101	1256106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420033
22234	NC_016148	TTA	2	6	1256131	1256136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420033
22235	NC_016148	TTCC	2	8	1256153	1256160	0 %	50 %	0 %	50 %	357420033
22236	NC_016148	CTG	2	6	1256186	1256191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420033
22237	NC_016148	CAT	2	6	1256249	1256254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420033
22238	NC_016148	CTT	2	6	1256267	1256272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420033
22239	NC_016148	CAA	2	6	1256276	1256281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420033
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22242	NC_016148	GTT	2	6	1256324	1256329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420033
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22253	NC_016148	AG	3	6	1257010	1257015	50 %	0 %	50 %	0 %	357420034
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22343	NC_016148	GCT	2	6	1262678	1262683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420041
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22348	NC_016148	GA	3	6	1263008	1263013	50 %	0 %	50 %	0 %	357420041
22349	NC_016148	TAT	2	6	1263025	1263030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420041
22350	NC_016148	AG	3	6	1263101	1263106	50 %	0 %	50 %	0 %	357420041
22351	NC_016148	AGCA	2	8	1263125	1263132	50 %	0 %	25 %	25 %	357420041
22352	NC_016148	CAG	2	6	1263141	1263146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420041
22353	NC_016148	CAG	2	6	1263273	1263278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420041
22354	NC_016148	CAT	2	6	1263331	1263336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420041
22355	NC_016148	GCTT	2	8	1263370	1263377	0 %	50 %	25 %	25 %	357420041
22356	NC_016148	CCA	2	6	1263408	1263413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420041
22357	NC_016148	AAG	2	6	1263452	1263457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420041
22358	NC_016148	AAG	2	6	1263502	1263507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420041
22359	NC_016148	TAGT	2	8	1263554	1263561	25 %	50 %	25 %	0 %	357420041
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22365	NC_016148	CAT	2	6	1263945	1263950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420042
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22384	NC_016148	TGT	2	6	1264835	1264840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420044
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22391	NC_016148	CGA	2	6	1264992	1264997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420045
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22452	NC_016148	GCTC	2	8	1268014	1268021	0 %	25 %	25 %	50 %	357420050
22453	NC_016148	AGC	2	6	1268109	1268114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420050
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22455	NC_016148	CCA	2	6	1268224	1268229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420050
22456	NC_016148	CAT	2	6	1268242	1268247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420050
22457	NC_016148	AATA	2	8	1268252	1268259	75 %	25 %	0 %	0 %	357420050
22458	NC_016148	A	8	8	1268469	1268476	100 %	0 %	0 %	0 %	357420051
22459	NC_016148	TC	3	6	1268485	1268490	0 %	50 %	0 %	50 %	357420051
22460	NC_016148	GCT	2	6	1268570	1268575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420051
22461	NC_016148	ATG	2	6	1268650	1268655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420051
22462	NC_016148	AAG	2	6	1268703	1268708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420051
22463	NC_016148	TA	3	6	1268736	1268741	50 %	50 %	0 %	0 %	357420051
22464	NC_016148	GAA	2	6	1268880	1268885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420051
22465	NC_016148	CT	3	6	1268928	1268933	0 %	50 %	0 %	50 %	357420051
22466	NC_016148	A	6	6	1268970	1268975	100 %	0 %	0 %	0 %	357420051
22467	NC_016148	TTCT	2	8	1269035	1269042	0 %	75 %	0 %	25 %	357420052
22468	NC_016148	A	6	6	1269047	1269052	100 %	0 %	0 %	0 %	357420052
22469	NC_016148	TCA	2	6	1269098	1269103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420052
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22471	NC_016148	TCT	2	6	1269212	1269217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420052
22472	NC_016148	CAC	2	6	1269232	1269237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420052
22473	NC_016148	AAG	2	6	1269259	1269264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420052
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