MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016148	GCT	2	6	1212945	1212950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419993
21502	NC_016148	TCT	2	6	1212975	1212980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419993
21503	NC_016148	CTCTA	2	10	1212992	1213001	20 %	40 %	0 %	40 %	357419993
21504	NC_016148	TGC	2	6	1213082	1213087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419993
21505	NC_016148	CTC	2	6	1213111	1213116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419993
21506	NC_016148	CCG	2	6	1213174	1213179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419993
21507	NC_016148	TATC	2	8	1213200	1213207	25 %	50 %	0 %	25 %	357419993
21508	NC_016148	TCCT	2	8	1213232	1213239	0 %	50 %	0 %	50 %	357419993
21509	NC_016148	TCA	2	6	1213272	1213277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419993
21510	NC_016148	CCA	2	6	1213314	1213319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419993
21511	NC_016148	CTT	2	6	1213333	1213338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419993
21512	NC_016148	CT	3	6	1213458	1213463	0 %	50 %	0 %	50 %	357419993
21513	NC_016148	AG	3	6	1213473	1213478	50 %	0 %	50 %	0 %	357419993
21514	NC_016148	TA	3	6	1213486	1213491	50 %	50 %	0 %	0 %	357419993
21515	NC_016148	C	6	6	1213495	1213500	0 %	0 %	0 %	100 %	357419993
21516	NC_016148	ACC	2	6	1213545	1213550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419993
21517	NC_016148	GCAA	2	8	1213629	1213636	50 %	0 %	25 %	25 %	357419993
21518	NC_016148	AAC	2	6	1213655	1213660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419993
21519	NC_016148	TCCTA	2	10	1213683	1213692	20 %	40 %	0 %	40 %	357419994
21520	NC_016148	T	6	6	1213717	1213722	0 %	100 %	0 %	0 %	357419994
21521	NC_016148	TTC	2	6	1213812	1213817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419994
21522	NC_016148	ACA	2	6	1213937	1213942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419994
21523	NC_016148	TTCC	2	8	1213959	1213966	0 %	50 %	0 %	50 %	357419994
21524	NC_016148	TCC	2	6	1214033	1214038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419994
21525	NC_016148	GAT	2	6	1214074	1214079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419994
21526	NC_016148	GCA	2	6	1214093	1214098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419994
21527	NC_016148	CAG	2	6	1214121	1214126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419994
21528	NC_016148	ATC	2	6	1214207	1214212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419994
21529	NC_016148	CGG	2	6	1214217	1214222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419994
21530	NC_016148	CCA	2	6	1214274	1214279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419994
21531	NC_016148	CTG	2	6	1214331	1214336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419994
21532	NC_016148	CCA	2	6	1214370	1214375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419994
21533	NC_016148	T	7	7	1214531	1214537	0 %	100 %	0 %	0 %	357419994
21534	NC_016148	TAT	2	6	1214557	1214562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419994
21535	NC_016148	CTTC	2	8	1214577	1214584	0 %	50 %	0 %	50 %	357419994
21536	NC_016148	AC	3	6	1214667	1214672	50 %	0 %	0 %	50 %	357419994
21537	NC_016148	CAT	2	6	1216102	1216107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419995
21538	NC_016148	GTC	2	6	1216134	1216139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419995
21539	NC_016148	CTT	2	6	1216175	1216180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419995
21540	NC_016148	ATG	2	6	1216189	1216194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419995
21541	NC_016148	AAC	2	6	1216221	1216226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419995
21542	NC_016148	A	6	6	1216251	1216256	100 %	0 %	0 %	0 %	357419995
21543	NC_016148	T	7	7	1216310	1216316	0 %	100 %	0 %	0 %	357419995
21544	NC_016148	T	7	7	1216345	1216351	0 %	100 %	0 %	0 %	357419995
21545	NC_016148	CTT	2	6	1216382	1216387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419995
21546	NC_016148	CTTT	2	8	1216395	1216402	0 %	75 %	0 %	25 %	357419995
21547	NC_016148	ATG	2	6	1216432	1216437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419995
21548	NC_016148	CATCC	2	10	1216469	1216478	20 %	20 %	0 %	60 %	357419995
21549	NC_016148	TGG	2	6	1216583	1216588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419995
21550	NC_016148	TCCA	2	8	1216665	1216672	25 %	25 %	0 %	50 %	357419995
21551	NC_016148	T	7	7	1216702	1216708	0 %	100 %	0 %	0 %	357419995
21552	NC_016148	CAGC	2	8	1216712	1216719	25 %	0 %	25 %	50 %	357419995
21553	NC_016148	ACA	2	6	1216768	1216773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419995
21554	NC_016148	GCT	2	6	1216792	1216797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419995
21555	NC_016148	TCCC	2	8	1216821	1216828	0 %	25 %	0 %	75 %	357419995
21556	NC_016148	CCT	2	6	1216886	1216891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419995
21557	NC_016148	TGGT	2	8	1216919	1216926	0 %	50 %	50 %	0 %	357419995
21558	NC_016148	ACC	2	6	1217023	1217028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419995
21559	NC_016148	GCA	2	6	1217171	1217176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419996
21560	NC_016148	CTT	3	9	1217208	1217216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419996
21561	NC_016148	TA	3	6	1217223	1217228	50 %	50 %	0 %	0 %	357419996
21562	NC_016148	CCCAT	2	10	1217305	1217314	20 %	20 %	0 %	60 %	357419996
21563	NC_016148	CCT	2	6	1217395	1217400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419996
21564	NC_016148	GAT	2	6	1217422	1217427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419996
21565	NC_016148	CAT	2	6	1217454	1217459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419996
21566	NC_016148	AT	3	6	1217458	1217463	50 %	50 %	0 %	0 %	357419996
21567	NC_016148	CAGC	2	8	1217490	1217497	25 %	0 %	25 %	50 %	357419996
21568	NC_016148	TA	3	6	1217554	1217559	50 %	50 %	0 %	0 %	357419996
21569	NC_016148	CGC	2	6	1217587	1217592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419996
21570	NC_016148	CCT	2	6	1217679	1217684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419996
21571	NC_016148	AGG	2	6	1217724	1217729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419996
21572	NC_016148	CCA	2	6	1217799	1217804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419996
21573	NC_016148	CGT	2	6	1217866	1217871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419996
21574	NC_016148	TCT	2	6	1217951	1217956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419996
21575	NC_016148	CT	3	6	1217989	1217994	0 %	50 %	0 %	50 %	357419996
21576	NC_016148	TGT	2	6	1218111	1218116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419996
21577	NC_016148	ATC	2	6	1218185	1218190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419996
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21579	NC_016148	TTG	2	6	1218276	1218281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419996
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21582	NC_016148	TGA	2	6	1218369	1218374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419996
21583	NC_016148	TGA	2	6	1218542	1218547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419997
21584	NC_016148	AT	3	6	1218611	1218616	50 %	50 %	0 %	0 %	357419997
21585	NC_016148	GCA	2	6	1218663	1218668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419997
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21587	NC_016148	ACG	2	6	1218784	1218789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419997
21588	NC_016148	GCA	2	6	1218831	1218836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419997
21589	NC_016148	CT	3	6	1218848	1218853	0 %	50 %	0 %	50 %	357419997
21590	NC_016148	AGA	2	6	1218902	1218907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419997
21591	NC_016148	GAAA	2	8	1218992	1218999	75 %	0 %	25 %	0 %	357419997
21592	NC_016148	AAC	2	6	1219016	1219021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419997
21593	NC_016148	A	6	6	1219104	1219109	100 %	0 %	0 %	0 %	357419997
21594	NC_016148	ATAA	2	8	1219126	1219133	75 %	25 %	0 %	0 %	357419997
21595	NC_016148	TTC	2	6	1219155	1219160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419998
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21598	NC_016148	CT	3	6	1219256	1219261	0 %	50 %	0 %	50 %	357419998
21599	NC_016148	AGA	2	6	1219271	1219276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419998
21600	NC_016148	CTTCA	2	10	1219310	1219319	20 %	40 %	0 %	40 %	357419998
21601	NC_016148	TCCT	2	8	1219337	1219344	0 %	50 %	0 %	50 %	357419998
21602	NC_016148	CCA	2	6	1219552	1219557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419998
21603	NC_016148	TGAACT	2	12	1219804	1219815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357419998
21604	NC_016148	TGCCGG	2	12	1219858	1219869	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357419998
21605	NC_016148	TC	3	6	1219932	1219937	0 %	50 %	0 %	50 %	357419998
21606	NC_016148	TCC	3	9	1219994	1220002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419998
21607	NC_016148	TAT	2	6	1220009	1220014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419998
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21609	NC_016148	TTTC	2	8	1220371	1220378	0 %	75 %	0 %	25 %	357419999
21610	NC_016148	CTG	2	6	1220403	1220408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419999
21611	NC_016148	G	6	6	1220457	1220462	0 %	0 %	100 %	0 %	357419999
21612	NC_016148	AAG	2	6	1220468	1220473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419999
21613	NC_016148	CCA	2	6	1220533	1220538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419999
21614	NC_016148	TC	3	6	1220607	1220612	0 %	50 %	0 %	50 %	357419999
21615	NC_016148	TCA	2	6	1220646	1220651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419999
21616	NC_016148	TC	5	10	1220660	1220669	0 %	50 %	0 %	50 %	357419999
21617	NC_016148	TAT	2	6	1220707	1220712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419999
21618	NC_016148	ATC	2	6	1220776	1220781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419999
21619	NC_016148	T	6	6	1220938	1220943	0 %	100 %	0 %	0 %	357419999
21620	NC_016148	CAT	2	6	1220977	1220982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419999
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21731	NC_016148	T	6	6	1227605	1227610	0 %	100 %	0 %	0 %	357420007
21732	NC_016148	AAAAGC	2	12	1227657	1227668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	357420007
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21960	NC_016148	CGT	2	6	1241140	1241145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420019
21961	NC_016148	AGC	3	9	1241165	1241173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420019
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21965	NC_016148	CTTT	2	8	1241326	1241333	0 %	75 %	0 %	25 %	357420019
21966	NC_016148	TC	3	6	1241355	1241360	0 %	50 %	0 %	50 %	357420019
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21968	NC_016148	T	6	6	1241408	1241413	0 %	100 %	0 %	0 %	357420019
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21970	NC_016148	CAA	2	6	1241525	1241530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420020
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21972	NC_016148	CTT	2	6	1241623	1241628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420020
21973	NC_016148	TCG	2	6	1241727	1241732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420020
21974	NC_016148	TCAA	2	8	1241751	1241758	50 %	25 %	0 %	25 %	357420020
21975	NC_016148	TC	4	8	1241833	1241840	0 %	50 %	0 %	50 %	357420020
21976	NC_016148	CTA	2	6	1241848	1241853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420020
21977	NC_016148	CTC	2	6	1241874	1241879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420020
21978	NC_016148	CT	4	8	1241917	1241924	0 %	50 %	0 %	50 %	357420020
21979	NC_016148	T	6	6	1241924	1241929	0 %	100 %	0 %	0 %	357420020
21980	NC_016148	GCA	2	6	1241934	1241939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420020
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21988	NC_016148	AT	3	6	1242220	1242225	50 %	50 %	0 %	0 %	357420020
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21992	NC_016148	AG	3	6	1242609	1242614	50 %	0 %	50 %	0 %	357420021
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22000	NC_016148	ATAC	2	8	1243019	1243026	50 %	25 %	0 %	25 %	357420022

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