MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016148	TCA	2	6	1183955	1183960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419964
21003	NC_016148	CT	3	6	1183989	1183994	0 %	50 %	0 %	50 %	357419964
21004	NC_016148	T	7	7	1184098	1184104	0 %	100 %	0 %	0 %	357419964
21005	NC_016148	TTC	2	6	1184145	1184150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419964
21006	NC_016148	CTC	2	6	1184174	1184179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419964
21007	NC_016148	ATT	2	6	1184220	1184225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419964
21008	NC_016148	CTG	2	6	1184249	1184254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419964
21009	NC_016148	ACTGT	2	10	1184624	1184633	20 %	40 %	20 %	20 %	357419964
21010	NC_016148	ACT	2	6	1184784	1184789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419964
21011	NC_016148	ACC	2	6	1184808	1184813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419964
21012	NC_016148	TGC	2	6	1184836	1184841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419964
21013	NC_016148	A	7	7	1184847	1184853	100 %	0 %	0 %	0 %	357419964
21014	NC_016148	A	6	6	1184877	1184882	100 %	0 %	0 %	0 %	357419964
21015	NC_016148	TTC	2	6	1184904	1184909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419965
21016	NC_016148	CCT	2	6	1184925	1184930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419965
21017	NC_016148	ATC	2	6	1184947	1184952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419965
21018	NC_016148	GAC	2	6	1185021	1185026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419965
21019	NC_016148	ATA	2	6	1185097	1185102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419965
21020	NC_016148	TCCA	2	8	1185159	1185166	25 %	25 %	0 %	50 %	357419965
21021	NC_016148	TC	3	6	1185200	1185205	0 %	50 %	0 %	50 %	357419965
21022	NC_016148	TCT	2	6	1185259	1185264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419965
21023	NC_016148	CT	3	6	1185263	1185268	0 %	50 %	0 %	50 %	357419965
21024	NC_016148	CTT	2	6	1185351	1185356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419965
21025	NC_016148	ACA	2	6	1185376	1185381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419965
21026	NC_016148	TGC	2	6	1185392	1185397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419965
21027	NC_016148	AGC	2	6	1185405	1185410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419965
21028	NC_016148	TA	3	6	1185470	1185475	50 %	50 %	0 %	0 %	357419965
21029	NC_016148	A	6	6	1185494	1185499	100 %	0 %	0 %	0 %	357419965
21030	NC_016148	TAA	2	6	1185559	1185564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419966
21031	NC_016148	CTAT	2	8	1185621	1185628	25 %	50 %	0 %	25 %	357419966
21032	NC_016148	TCC	2	6	1185678	1185683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419966
21033	NC_016148	TC	3	6	1185729	1185734	0 %	50 %	0 %	50 %	357419966
21034	NC_016148	AAC	2	6	1185821	1185826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419966
21035	NC_016148	GGA	2	6	1186059	1186064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419966
21036	NC_016148	CTTT	2	8	1186147	1186154	0 %	75 %	0 %	25 %	357419966
21037	NC_016148	TCC	2	6	1186246	1186251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419967
21038	NC_016148	CTT	2	6	1186354	1186359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419967
21039	NC_016148	CTA	3	9	1186588	1186596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419967
21040	NC_016148	GT	3	6	1186599	1186604	0 %	50 %	50 %	0 %	357419967
21041	NC_016148	CAT	2	6	1186625	1186630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419967
21042	NC_016148	A	6	6	1186718	1186723	100 %	0 %	0 %	0 %	357419967
21043	NC_016148	CA	3	6	1186753	1186758	50 %	0 %	0 %	50 %	357419967
21044	NC_016148	AGG	2	6	1186764	1186769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419967
21045	NC_016148	ATC	2	6	1186833	1186838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419967
21046	NC_016148	TCCATG	2	12	1186978	1186989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357419967
21047	NC_016148	GTT	2	6	1187108	1187113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419968
21048	NC_016148	GTGCCT	2	12	1187129	1187140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419968
21049	NC_016148	TTC	2	6	1187141	1187146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419968
21050	NC_016148	CTC	2	6	1187208	1187213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419968
21051	NC_016148	CAGC	2	8	1187262	1187269	25 %	0 %	25 %	50 %	357419968
21052	NC_016148	GCC	2	6	1187279	1187284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419968
21053	NC_016148	TTG	2	6	1187315	1187320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419968
21054	NC_016148	CTA	2	6	1187331	1187336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419968
21055	NC_016148	TCT	2	6	1187486	1187491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419968
21056	NC_016148	CTCC	2	8	1187558	1187565	0 %	25 %	0 %	75 %	357419969
21057	NC_016148	GCAA	2	8	1187637	1187644	50 %	0 %	25 %	25 %	357419969
21058	NC_016148	CCA	2	6	1187680	1187685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419969
21059	NC_016148	TTTC	2	8	1187742	1187749	0 %	75 %	0 %	25 %	357419969
21060	NC_016148	ATC	2	6	1187895	1187900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419969
21061	NC_016148	TCG	2	6	1187904	1187909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419969
21062	NC_016148	A	6	6	1187924	1187929	100 %	0 %	0 %	0 %	357419969
21063	NC_016148	AGC	2	6	1187981	1187986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419969
21064	NC_016148	TCT	2	6	1188033	1188038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419969
21065	NC_016148	TGT	2	6	1188056	1188061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419969
21066	NC_016148	CTT	2	6	1188064	1188069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419969
21067	NC_016148	AGA	2	6	1188258	1188263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419969
21068	NC_016148	CTG	2	6	1188309	1188314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419969
21069	NC_016148	GCC	2	6	1188393	1188398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419970
21070	NC_016148	CTT	2	6	1188400	1188405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419970
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21072	NC_016148	TTG	2	6	1188476	1188481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419970
21073	NC_016148	CTTT	2	8	1188573	1188580	0 %	75 %	0 %	25 %	357419970
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21086	NC_016148	AGCC	2	8	1189524	1189531	25 %	0 %	25 %	50 %	357419971
21087	NC_016148	TGA	2	6	1189550	1189555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419971
21088	NC_016148	TCAGC	2	10	1189560	1189569	20 %	20 %	20 %	40 %	357419971
21089	NC_016148	CGT	2	6	1189645	1189650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419971
21090	NC_016148	CTTT	2	8	1189696	1189703	0 %	75 %	0 %	25 %	357419971
21091	NC_016148	TCT	2	6	1189709	1189714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419971
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21093	NC_016148	ATTT	2	8	1189842	1189849	25 %	75 %	0 %	0 %	357419971
21094	NC_016148	GCT	2	6	1189883	1189888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419971
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21096	NC_016148	T	6	6	1190061	1190066	0 %	100 %	0 %	0 %	357419971
21097	NC_016148	TAT	2	6	1190089	1190094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419971
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21099	NC_016148	CTTT	2	8	1190619	1190626	0 %	75 %	0 %	25 %	357419973
21100	NC_016148	GCA	2	6	1190635	1190640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419973
21101	NC_016148	CTG	2	6	1190668	1190673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419973
21102	NC_016148	GAA	2	6	1190679	1190684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419973
21103	NC_016148	CAT	2	6	1190738	1190743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419973
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21105	NC_016148	TAT	2	6	1190780	1190785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419973
21106	NC_016148	TC	3	6	1190839	1190844	0 %	50 %	0 %	50 %	357419973
21107	NC_016148	AC	3	6	1190906	1190911	50 %	0 %	0 %	50 %	357419973
21108	NC_016148	TCA	2	6	1190977	1190982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419973
21109	NC_016148	CTCAGA	2	12	1190993	1191004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357419973
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21111	NC_016148	CAA	2	6	1191110	1191115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419973
21112	NC_016148	TTC	2	6	1191125	1191130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419973
21113	NC_016148	AAGG	2	8	1191159	1191166	50 %	0 %	50 %	0 %	357419973
21114	NC_016148	CTC	2	6	1191178	1191183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419973
21115	NC_016148	CTT	2	6	1191220	1191225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419973
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21236	NC_016148	A	6	6	1198967	1198972	100 %	0 %	0 %	0 %	357419979
21237	NC_016148	AAGG	2	8	1199033	1199040	50 %	0 %	50 %	0 %	357419979
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21265	NC_016148	TCT	2	6	1200607	1200612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419980
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21340	NC_016148	AAAG	2	8	1204817	1204824	75 %	0 %	25 %	0 %	357419984
21341	NC_016148	TGC	2	6	1204850	1204855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419984
21342	NC_016148	GCT	2	6	1204954	1204959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419984
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21349	NC_016148	A	6	6	1205288	1205293	100 %	0 %	0 %	0 %	357419985
21350	NC_016148	TCC	2	6	1205370	1205375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419985
21351	NC_016148	G	6	6	1205417	1205422	0 %	0 %	100 %	0 %	357419985
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21353	NC_016148	ATCA	2	8	1205596	1205603	50 %	25 %	0 %	25 %	357419985
21354	NC_016148	CCT	2	6	1205610	1205615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419985
21355	NC_016148	AAC	2	6	1205679	1205684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419985
21356	NC_016148	AGC	2	6	1205693	1205698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419985
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21358	NC_016148	GC	3	6	1205773	1205778	0 %	0 %	50 %	50 %	357419985
21359	NC_016148	GTA	2	6	1205829	1205834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419985
21360	NC_016148	A	6	6	1205851	1205856	100 %	0 %	0 %	0 %	357419985
21361	NC_016148	A	6	6	1205967	1205972	100 %	0 %	0 %	0 %	357419985
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21392	NC_016148	TACCA	2	10	1207690	1207699	40 %	20 %	0 %	40 %	357419987
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21462	NC_016148	GCA	2	6	1210930	1210935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419989
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