MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016148	CTC	2	6	1107157	1107162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419887
19503	NC_016148	ATT	2	6	1107186	1107191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419887
19504	NC_016148	TCTA	2	8	1107200	1107207	25 %	50 %	0 %	25 %	357419887
19505	NC_016148	TCA	2	6	1107256	1107261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419887
19506	NC_016148	ACC	2	6	1107371	1107376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419887
19507	NC_016148	TGA	2	6	1107385	1107390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419887
19508	NC_016148	GCA	2	6	1107466	1107471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419887
19509	NC_016148	ACC	2	6	1107509	1107514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419887
19510	NC_016148	TTG	2	6	1107531	1107536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419887
19511	NC_016148	CTT	2	6	1107547	1107552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419887
19512	NC_016148	TCC	2	6	1107645	1107650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419887
19513	NC_016148	ATC	2	6	1107689	1107694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419887
19514	NC_016148	T	8	8	1107696	1107703	0 %	100 %	0 %	0 %	357419887
19515	NC_016148	AATA	2	8	1107726	1107733	75 %	25 %	0 %	0 %	357419887
19516	NC_016148	CTT	2	6	1107752	1107757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419887
19517	NC_016148	TTA	2	6	1107766	1107771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419887
19518	NC_016148	AGC	2	6	1107791	1107796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419887
19519	NC_016148	AGA	2	6	1107924	1107929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419888
19520	NC_016148	ATG	2	6	1107993	1107998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419888
19521	NC_016148	CCTC	2	8	1108021	1108028	0 %	25 %	0 %	75 %	357419888
19522	NC_016148	GAG	2	6	1108031	1108036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419888
19523	NC_016148	A	7	7	1108117	1108123	100 %	0 %	0 %	0 %	357419888
19524	NC_016148	CA	3	6	1108138	1108143	50 %	0 %	0 %	50 %	357419888
19525	NC_016148	G	6	6	1108210	1108215	0 %	0 %	100 %	0 %	357419888
19526	NC_016148	A	7	7	1108270	1108276	100 %	0 %	0 %	0 %	357419888
19527	NC_016148	CT	3	6	1108310	1108315	0 %	50 %	0 %	50 %	357419888
19528	NC_016148	CCA	2	6	1108359	1108364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419888
19529	NC_016148	TAT	2	6	1108418	1108423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419888
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19531	NC_016148	AAG	2	6	1108459	1108464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419888
19532	NC_016148	CAA	2	6	1108516	1108521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419888
19533	NC_016148	A	6	6	1108520	1108525	100 %	0 %	0 %	0 %	357419888
19534	NC_016148	GAAA	2	8	1108546	1108553	75 %	0 %	25 %	0 %	357419888
19535	NC_016148	CAA	2	6	1108577	1108582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419888
19536	NC_016148	ACC	2	6	1108625	1108630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419888
19537	NC_016148	ATT	2	6	1108647	1108652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419888
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19539	NC_016148	TC	3	6	1108853	1108858	0 %	50 %	0 %	50 %	357419889
19540	NC_016148	TTA	2	6	1108868	1108873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419889
19541	NC_016148	TCG	2	6	1108927	1108932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419889
19542	NC_016148	GGA	2	6	1108947	1108952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419889
19543	NC_016148	TCC	2	6	1108998	1109003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419889
19544	NC_016148	TCT	2	6	1109083	1109088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419889
19545	NC_016148	TTC	2	6	1109102	1109107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419889
19546	NC_016148	T	7	7	1109150	1109156	0 %	100 %	0 %	0 %	357419889
19547	NC_016148	T	6	6	1109167	1109172	0 %	100 %	0 %	0 %	357419889
19548	NC_016148	CTT	2	6	1109195	1109200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419889
19549	NC_016148	CT	4	8	1109282	1109289	0 %	50 %	0 %	50 %	357419889
19550	NC_016148	CTTT	2	8	1109331	1109338	0 %	75 %	0 %	25 %	357419889
19551	NC_016148	T	6	6	1109336	1109341	0 %	100 %	0 %	0 %	357419889
19552	NC_016148	ATT	2	6	1109365	1109370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419889
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19554	NC_016148	TATC	2	8	1109472	1109479	25 %	50 %	0 %	25 %	357419890
19555	NC_016148	TTA	2	6	1109553	1109558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419890
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19557	NC_016148	TTG	2	6	1109735	1109740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419890
19558	NC_016148	GGC	2	6	1109741	1109746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419890
19559	NC_016148	TAC	2	6	1109755	1109760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419890
19560	NC_016148	TCT	2	6	1109777	1109782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419890
19561	NC_016148	CT	3	6	1109781	1109786	0 %	50 %	0 %	50 %	357419890
19562	NC_016148	TCT	3	9	1109858	1109866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419890
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19587	NC_016148	AT	3	6	1111018	1111023	50 %	50 %	0 %	0 %	357419892
19588	NC_016148	TC	3	6	1111117	1111122	0 %	50 %	0 %	50 %	357419892
19589	NC_016148	CTC	3	9	1111156	1111164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419892
19590	NC_016148	GCT	3	9	1111172	1111180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419892
19591	NC_016148	AT	3	6	1111291	1111296	50 %	50 %	0 %	0 %	357419892
19592	NC_016148	ACT	2	6	1111319	1111324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419892
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19600	NC_016148	TCT	2	6	1111649	1111654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419892
19601	NC_016148	TAT	2	6	1111711	1111716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419892
19602	NC_016148	CCT	2	6	1111719	1111724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419892
19603	NC_016148	GAG	2	6	1111725	1111730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419892
19604	NC_016148	C	6	6	1111734	1111739	0 %	0 %	0 %	100 %	357419892
19605	NC_016148	TAT	2	6	1111813	1111818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419892
19606	NC_016148	CTT	2	6	1111821	1111826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419892
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19608	NC_016148	ACT	2	6	1111961	1111966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419892
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19612	NC_016148	C	6	6	1112066	1112071	0 %	0 %	0 %	100 %	357419893
19613	NC_016148	GCA	2	6	1112150	1112155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419893
19614	NC_016148	AGC	2	6	1112173	1112178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419893
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19616	NC_016148	TTC	2	6	1112540	1112545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419893
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19980	NC_016148	CTAT	2	8	1132048	1132055	25 %	50 %	0 %	25 %	357419909
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19999	NC_016148	G	6	6	1132943	1132948	0 %	0 %	100 %	0 %	357419909
20000	NC_016148	T	6	6	1132977	1132982	0 %	100 %	0 %	0 %	357419909

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