MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016148	CT	3	6	886433	886438	0 %	50 %	0 %	50 %	357419674
15502	NC_016148	AGG	2	6	886456	886461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419674
15503	NC_016148	CAA	2	6	886543	886548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419674
15504	NC_016148	CCT	2	6	886551	886556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419674
15505	NC_016148	TC	3	6	886586	886591	0 %	50 %	0 %	50 %	357419674
15506	NC_016148	GTT	2	6	886610	886615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419674
15507	NC_016148	ATGCT	2	10	886860	886869	20 %	40 %	20 %	20 %	357419675
15508	NC_016148	ATG	2	6	886935	886940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419675
15509	NC_016148	AGG	2	6	886956	886961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419675
15510	NC_016148	TGG	2	6	887083	887088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419675
15511	NC_016148	TAT	2	6	887241	887246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419675
15512	NC_016148	GAA	2	6	887252	887257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419675
15513	NC_016148	TGTC	2	8	887270	887277	0 %	50 %	25 %	25 %	357419675
15514	NC_016148	CGTGG	2	10	887375	887384	0 %	20 %	60 %	20 %	357419675
15515	NC_016148	TGG	2	6	887388	887393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419675
15516	NC_016148	TGG	2	6	887466	887471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419675
15517	NC_016148	GGCTG	2	10	887503	887512	0 %	20 %	60 %	20 %	357419675
15518	NC_016148	ATATC	2	10	887586	887595	40 %	40 %	0 %	20 %	357419675
15519	NC_016148	CGA	2	6	887842	887847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419675
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15521	NC_016148	AAG	2	6	887889	887894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419675
15522	NC_016148	TAA	2	6	887910	887915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419675
15523	NC_016148	AT	3	6	887996	888001	50 %	50 %	0 %	0 %	357419676
15524	NC_016148	TTG	2	6	888019	888024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419676
15525	NC_016148	ATC	2	6	888077	888082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419676
15526	NC_016148	TTG	2	6	888196	888201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419676
15527	NC_016148	AG	3	6	888367	888372	50 %	0 %	50 %	0 %	357419676
15528	NC_016148	ATA	2	6	888373	888378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419676
15529	NC_016148	CGC	2	6	888456	888461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419676
15530	NC_016148	GGA	2	6	888486	888491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419676
15531	NC_016148	GTC	2	6	888496	888501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419676
15532	NC_016148	AGA	2	6	888563	888568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419676
15533	NC_016148	CAAACT	2	12	888615	888626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	357419676
15534	NC_016148	GTTC	2	8	888896	888903	0 %	50 %	25 %	25 %	357419676
15535	NC_016148	AGA	2	6	888963	888968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419676
15536	NC_016148	CTG	2	6	888992	888997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419676
15537	NC_016148	CTTTC	2	10	889034	889043	0 %	60 %	0 %	40 %	357419676
15538	NC_016148	GTT	2	6	889050	889055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419676
15539	NC_016148	AAGG	2	8	889077	889084	50 %	0 %	50 %	0 %	357419676
15540	NC_016148	AGG	2	6	889161	889166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419676
15541	NC_016148	TA	3	6	889167	889172	50 %	50 %	0 %	0 %	357419676
15542	NC_016148	AT	3	6	889235	889240	50 %	50 %	0 %	0 %	357419676
15543	NC_016148	GGT	2	6	889242	889247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419676
15544	NC_016148	GGAA	2	8	889253	889260	50 %	0 %	50 %	0 %	357419676
15545	NC_016148	CAG	2	6	889305	889310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419676
15546	NC_016148	GTG	2	6	889449	889454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419677
15547	NC_016148	GTA	2	6	889501	889506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419677
15548	NC_016148	TGG	2	6	889559	889564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419677
15549	NC_016148	AAG	2	6	889650	889655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419677
15550	NC_016148	GGA	2	6	889690	889695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419677
15551	NC_016148	TAGACA	2	12	889699	889710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357419677
15552	NC_016148	CT	3	6	889729	889734	0 %	50 %	0 %	50 %	357419677
15553	NC_016148	AG	3	6	889737	889742	50 %	0 %	50 %	0 %	357419677
15554	NC_016148	GAA	2	6	889835	889840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419677
15555	NC_016148	TA	3	6	889927	889932	50 %	50 %	0 %	0 %	357419678
15556	NC_016148	TA	3	6	890020	890025	50 %	50 %	0 %	0 %	357419678
15557	NC_016148	CAT	2	6	890225	890230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419679
15558	NC_016148	ATC	2	6	890292	890297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419679
15559	NC_016148	AGG	2	6	890388	890393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419679
15560	NC_016148	TGA	2	6	890413	890418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419679
15561	NC_016148	AGGA	2	8	890457	890464	50 %	0 %	50 %	0 %	357419679
15562	NC_016148	GCT	2	6	890508	890513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419679
15563	NC_016148	AG	4	8	890537	890544	50 %	0 %	50 %	0 %	357419679
15564	NC_016148	GAA	2	6	890628	890633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419679
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15567	NC_016148	TTG	2	6	890853	890858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419679
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15569	NC_016148	CAGA	2	8	891056	891063	50 %	0 %	25 %	25 %	357419680
15570	NC_016148	CTTC	2	8	891067	891074	0 %	50 %	0 %	50 %	357419680
15571	NC_016148	AAT	2	6	891114	891119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419680
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15574	NC_016148	AG	3	6	891426	891431	50 %	0 %	50 %	0 %	357419680
15575	NC_016148	CCTG	2	8	891444	891451	0 %	25 %	25 %	50 %	357419680
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15580	NC_016148	GAA	2	6	891733	891738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419680
15581	NC_016148	AATA	2	8	891744	891751	75 %	25 %	0 %	0 %	357419680
15582	NC_016148	AAG	2	6	891822	891827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419680
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15589	NC_016148	AAT	2	6	892178	892183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419680
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15591	NC_016148	CT	3	6	892316	892321	0 %	50 %	0 %	50 %	357419681
15592	NC_016148	ATA	2	6	892532	892537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419681
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15594	NC_016148	ATGG	2	8	892597	892604	25 %	25 %	50 %	0 %	357419681
15595	NC_016148	GGCTT	2	10	892660	892669	0 %	40 %	40 %	20 %	357419681
15596	NC_016148	ATG	2	6	892711	892716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419681
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15601	NC_016148	TGC	2	6	893190	893195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419682
15602	NC_016148	GA	3	6	893226	893231	50 %	0 %	50 %	0 %	357419682
15603	NC_016148	CAA	2	6	893250	893255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419682
15604	NC_016148	AGAA	2	8	893263	893270	75 %	0 %	25 %	0 %	357419682
15605	NC_016148	CCA	2	6	893288	893293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419682
15606	NC_016148	GAA	2	6	893305	893310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419682
15607	NC_016148	GGA	2	6	893346	893351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419682
15608	NC_016148	AGCT	2	8	893384	893391	25 %	25 %	25 %	25 %	357419682
15609	NC_016148	A	6	6	893424	893429	100 %	0 %	0 %	0 %	357419682
15610	NC_016148	GA	3	6	893432	893437	50 %	0 %	50 %	0 %	357419682
15611	NC_016148	AAC	2	6	893466	893471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419682
15612	NC_016148	TCT	2	6	893494	893499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419682
15613	NC_016148	TA	3	6	893614	893619	50 %	50 %	0 %	0 %	357419682
15614	NC_016148	AG	3	6	893674	893679	50 %	0 %	50 %	0 %	357419682
15615	NC_016148	GA	3	6	893714	893719	50 %	0 %	50 %	0 %	357419682
15616	NC_016148	TGA	2	6	893742	893747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419682
15617	NC_016148	GA	3	6	893807	893812	50 %	0 %	50 %	0 %	357419683
15618	NC_016148	GAA	2	6	893849	893854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419683
15619	NC_016148	GA	3	6	893969	893974	50 %	0 %	50 %	0 %	357419683
15620	NC_016148	GCA	2	6	893985	893990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419683
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