MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016148	CCT	2	6	858726	858731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419646
15003	NC_016148	GGA	2	6	858775	858780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419646
15004	NC_016148	AAC	2	6	858870	858875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419646
15005	NC_016148	T	6	6	858894	858899	0 %	100 %	0 %	0 %	357419646
15006	NC_016148	GCA	2	6	859050	859055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419647
15007	NC_016148	GAG	2	6	859061	859066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419647
15008	NC_016148	CAG	2	6	859122	859127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419647
15009	NC_016148	GAACA	2	10	859286	859295	60 %	0 %	20 %	20 %	357419647
15010	NC_016148	A	6	6	859307	859312	100 %	0 %	0 %	0 %	357419647
15011	NC_016148	TAA	2	6	859362	859367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419647
15012	NC_016148	TTGA	2	8	859397	859404	25 %	50 %	25 %	0 %	357419647
15013	NC_016148	TAGG	2	8	859449	859456	25 %	25 %	50 %	0 %	357419647
15014	NC_016148	GCC	2	6	859470	859475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419647
15015	NC_016148	GGA	2	6	859477	859482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419647
15016	NC_016148	CTT	2	6	859523	859528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419647
15017	NC_016148	ATC	2	6	859545	859550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419647
15018	NC_016148	TA	3	6	859551	859556	50 %	50 %	0 %	0 %	357419647
15019	NC_016148	GGT	2	6	859583	859588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419647
15020	NC_016148	CAG	2	6	859595	859600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419647
15021	NC_016148	AAG	2	6	859634	859639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419647
15022	NC_016148	TTG	2	6	859673	859678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419647
15023	NC_016148	TG	3	6	859723	859728	0 %	50 %	50 %	0 %	357419647
15024	NC_016148	CGC	2	6	859734	859739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419647
15025	NC_016148	GTT	2	6	859813	859818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419647
15026	NC_016148	GAA	2	6	859835	859840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419647
15027	NC_016148	AG	3	6	859844	859849	50 %	0 %	50 %	0 %	357419647
15028	NC_016148	GGA	2	6	859855	859860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419647
15029	NC_016148	A	6	6	859866	859871	100 %	0 %	0 %	0 %	357419647
15030	NC_016148	GGT	2	6	859921	859926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419647
15031	NC_016148	CTG	2	6	859938	859943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419647
15032	NC_016148	GGA	2	6	860062	860067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419647
15033	NC_016148	TAG	2	6	860079	860084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419647
15034	NC_016148	GGAA	2	8	860165	860172	50 %	0 %	50 %	0 %	357419647
15035	NC_016148	ATC	2	6	860176	860181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419647
15036	NC_016148	AG	3	6	860201	860206	50 %	0 %	50 %	0 %	357419647
15037	NC_016148	TAG	2	6	860297	860302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419648
15038	NC_016148	TA	3	6	860308	860313	50 %	50 %	0 %	0 %	357419648
15039	NC_016148	TCCT	2	8	860317	860324	0 %	50 %	0 %	50 %	357419648
15040	NC_016148	GGT	2	6	860353	860358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419648
15041	NC_016148	A	6	6	860590	860595	100 %	0 %	0 %	0 %	357419648
15042	NC_016148	ATG	2	6	860723	860728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419648
15043	NC_016148	ATA	2	6	860782	860787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419648
15044	NC_016148	ACA	2	6	860795	860800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419648
15045	NC_016148	A	7	7	860823	860829	100 %	0 %	0 %	0 %	357419648
15046	NC_016148	TTG	2	6	860837	860842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419648
15047	NC_016148	AAAG	2	8	861029	861036	75 %	0 %	25 %	0 %	357419648
15048	NC_016148	ACG	2	6	861067	861072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419648
15049	NC_016148	GAT	2	6	861096	861101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419648
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15051	NC_016148	AGT	2	6	861197	861202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419649
15052	NC_016148	GAT	2	6	861225	861230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419649
15053	NC_016148	TGC	2	6	861238	861243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419649
15054	NC_016148	T	7	7	861298	861304	0 %	100 %	0 %	0 %	357419649
15055	NC_016148	A	6	6	861325	861330	100 %	0 %	0 %	0 %	357419649
15056	NC_016148	ATT	2	6	861370	861375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419650
15057	NC_016148	CTG	2	6	861390	861395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419650
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15059	NC_016148	TCC	2	6	861486	861491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419650
15060	NC_016148	TTG	2	6	861565	861570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419650
15061	NC_016148	GTT	2	6	861653	861658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419650
15062	NC_016148	GTA	2	6	861688	861693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419650
15063	NC_016148	GTTT	2	8	861760	861767	0 %	75 %	25 %	0 %	357419650
15064	NC_016148	TCT	2	6	861792	861797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419650
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15073	NC_016148	AGT	2	6	862434	862439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419650
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15077	NC_016148	AT	3	6	862575	862580	50 %	50 %	0 %	0 %	357419650
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15089	NC_016148	CTA	2	6	863208	863213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419651
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15091	NC_016148	ATGG	2	8	863366	863373	25 %	25 %	50 %	0 %	357419651
15092	NC_016148	TCTCC	2	10	863376	863385	0 %	40 %	0 %	60 %	357419651
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15105	NC_016148	TGGCT	2	10	864009	864018	0 %	40 %	40 %	20 %	357419651
15106	NC_016148	A	6	6	864032	864037	100 %	0 %	0 %	0 %	357419651
15107	NC_016148	TAGC	2	8	864103	864110	25 %	25 %	25 %	25 %	357419652
15108	NC_016148	G	6	6	864172	864177	0 %	0 %	100 %	0 %	357419652
15109	NC_016148	GTG	2	6	864199	864204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419652
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15111	NC_016148	GTC	2	6	864291	864296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419652
15112	NC_016148	CTG	2	6	864316	864321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419652
15113	NC_016148	TGG	2	6	864359	864364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419652
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15119	NC_016148	TAAT	2	8	864707	864714	50 %	50 %	0 %	0 %	357419652
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15244	NC_016148	GA	3	6	872588	872593	50 %	0 %	50 %	0 %	357419660
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15360	NC_016148	A	6	6	878727	878732	100 %	0 %	0 %	0 %	357419664
15361	NC_016148	GGC	2	6	878741	878746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419664
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15487	NC_016148	CTT	2	6	885341	885346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419673
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