MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016148	TCA	2	6	743542	743547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419548
13003	NC_016148	CTT	2	6	743582	743587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419548
13004	NC_016148	GGAGA	2	10	743604	743613	40 %	0 %	60 %	0 %	357419548
13005	NC_016148	TTTTTC	2	12	743651	743662	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	357419548
13006	NC_016148	TTC	2	6	743667	743672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419548
13007	NC_016148	CCG	2	6	743677	743682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419548
13008	NC_016148	GAA	2	6	743706	743711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419548
13009	NC_016148	GCA	2	6	743875	743880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419548
13010	NC_016148	TGG	2	6	743889	743894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419548
13011	NC_016148	TAG	2	6	743971	743976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419548
13012	NC_016148	T	6	6	744003	744008	0 %	100 %	0 %	0 %	357419548
13013	NC_016148	GTT	2	6	744018	744023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419548
13014	NC_016148	AT	3	6	744056	744061	50 %	50 %	0 %	0 %	357419548
13015	NC_016148	CT	3	6	744084	744089	0 %	50 %	0 %	50 %	357419548
13016	NC_016148	TCT	2	6	744096	744101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419548
13017	NC_016148	T	6	6	744189	744194	0 %	100 %	0 %	0 %	357419548
13018	NC_016148	AAT	2	6	744199	744204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419548
13019	NC_016148	T	6	6	744225	744230	0 %	100 %	0 %	0 %	357419548
13020	NC_016148	TCA	2	6	744236	744241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419548
13021	NC_016148	ATG	2	6	744271	744276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419548
13022	NC_016148	ATA	2	6	744649	744654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419549
13023	NC_016148	A	6	6	744805	744810	100 %	0 %	0 %	0 %	357419550
13024	NC_016148	GCC	2	6	744842	744847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419550
13025	NC_016148	GCT	2	6	744870	744875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419550
13026	NC_016148	GTG	2	6	744935	744940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419550
13027	NC_016148	GGC	2	6	744978	744983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419550
13028	NC_016148	AAG	2	6	745100	745105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419550
13029	NC_016148	CAA	2	6	745123	745128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419550
13030	NC_016148	TAA	2	6	745191	745196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419551
13031	NC_016148	TAA	2	6	745296	745301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419551
13032	NC_016148	GGT	2	6	745355	745360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419551
13033	NC_016148	CAT	2	6	745416	745421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419551
13034	NC_016148	GCA	2	6	745458	745463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419552
13035	NC_016148	ATA	2	6	745527	745532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419552
13036	NC_016148	AAC	2	6	745698	745703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419552
13037	NC_016148	CTC	2	6	745731	745736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419552
13038	NC_016148	CATACT	2	12	745748	745759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419552
13039	NC_016148	TGA	2	6	745774	745779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419552
13040	NC_016148	AGG	2	6	745790	745795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419552
13041	NC_016148	TCTA	2	8	745832	745839	25 %	50 %	0 %	25 %	357419552
13042	NC_016148	GTT	2	6	745889	745894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419552
13043	NC_016148	CGC	2	6	745904	745909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419552
13044	NC_016148	CAG	2	6	745915	745920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419552
13045	NC_016148	TTA	2	6	745923	745928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419552
13046	NC_016148	CAG	3	9	745992	746000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419552
13047	NC_016148	GGA	2	6	746085	746090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419552
13048	NC_016148	TATTG	2	10	746095	746104	20 %	60 %	20 %	0 %	357419552
13049	NC_016148	G	6	6	746104	746109	0 %	0 %	100 %	0 %	357419552
13050	NC_016148	TCT	2	6	746112	746117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419552
13051	NC_016148	AAG	2	6	746313	746318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419553
13052	NC_016148	TGT	2	6	746339	746344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419553
13053	NC_016148	AAG	2	6	746391	746396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419553
13054	NC_016148	TCT	2	6	746432	746437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419553
13055	NC_016148	AAG	2	6	746445	746450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419553
13056	NC_016148	ATT	2	6	746462	746467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419553
13057	NC_016148	GAC	2	6	746508	746513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419553
13058	NC_016148	ATC	2	6	746544	746549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419553
13059	NC_016148	GA	3	6	746563	746568	50 %	0 %	50 %	0 %	357419553
13060	NC_016148	AGA	2	6	746655	746660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419553
13061	NC_016148	AAT	2	6	746759	746764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419553
13062	NC_016148	ACG	2	6	746796	746801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419553
13063	NC_016148	TG	3	6	746829	746834	0 %	50 %	50 %	0 %	357419553
13064	NC_016148	GTA	2	6	746835	746840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419553
13065	NC_016148	AGA	2	6	746903	746908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419553
13066	NC_016148	GCA	2	6	746939	746944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419554
13067	NC_016148	CAT	2	6	746948	746953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419554
13068	NC_016148	TGC	2	6	746962	746967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419554
13069	NC_016148	T	6	6	746975	746980	0 %	100 %	0 %	0 %	357419554
13070	NC_016148	TAAA	2	8	747050	747057	75 %	25 %	0 %	0 %	357419554
13071	NC_016148	TTC	2	6	747065	747070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419554
13072	NC_016148	GA	3	6	747100	747105	50 %	0 %	50 %	0 %	357419554
13073	NC_016148	TTTG	2	8	747214	747221	0 %	75 %	25 %	0 %	357419554
13074	NC_016148	CCTT	2	8	747322	747329	0 %	50 %	0 %	50 %	357419554
13075	NC_016148	AGA	2	6	747389	747394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419554
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13077	NC_016148	GGT	2	6	747494	747499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419554
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13080	NC_016148	CTGA	2	8	747706	747713	25 %	25 %	25 %	25 %	357419555
13081	NC_016148	CTG	2	6	747741	747746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419555
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13084	NC_016148	CGT	2	6	747885	747890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419555
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13086	NC_016148	GCA	2	6	747985	747990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419555
13087	NC_016148	GTA	2	6	748093	748098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419555
13088	NC_016148	AAAG	2	8	748146	748153	75 %	0 %	25 %	0 %	357419555
13089	NC_016148	GGA	2	6	748191	748196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419555
13090	NC_016148	GGA	2	6	748331	748336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419555
13091	NC_016148	GGA	2	6	748374	748379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419555
13092	NC_016148	ATTG	2	8	748574	748581	25 %	50 %	25 %	0 %	357419556
13093	NC_016148	AAGGG	2	10	748825	748834	40 %	0 %	60 %	0 %	357419556
13094	NC_016148	TGA	2	6	748898	748903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419556
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13099	NC_016148	GAA	2	6	749504	749509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419556
13100	NC_016148	CTGG	2	8	749553	749560	0 %	25 %	50 %	25 %	357419556
13101	NC_016148	GGT	2	6	749646	749651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419556
13102	NC_016148	GCG	2	6	749809	749814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419556
13103	NC_016148	ATA	2	6	749817	749822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419556
13104	NC_016148	TAA	2	6	749837	749842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419556
13105	NC_016148	AGA	2	6	749846	749851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419556
13106	NC_016148	A	6	6	752618	752623	100 %	0 %	0 %	0 %	357419557
13107	NC_016148	TCA	2	6	752696	752701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419557
13108	NC_016148	TGG	2	6	752721	752726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419557
13109	NC_016148	GCTC	2	8	752772	752779	0 %	25 %	25 %	50 %	357419557
13110	NC_016148	AGC	2	6	752867	752872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419557
13111	NC_016148	GTT	2	6	752937	752942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419557
13112	NC_016148	CCA	2	6	752982	752987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419557
13113	NC_016148	CAT	2	6	753000	753005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419557
13114	NC_016148	AATA	2	8	753010	753017	75 %	25 %	0 %	0 %	357419557
13115	NC_016148	CAT	2	6	753154	753159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419558
13116	NC_016148	ACT	2	6	753167	753172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419558
13117	NC_016148	TTA	2	6	753205	753210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419558
13118	NC_016148	C	6	6	753390	753395	0 %	0 %	0 %	100 %	357419558
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13120	NC_016148	TTA	2	6	753433	753438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419558
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13360	NC_016148	A	7	7	766223	766229	100 %	0 %	0 %	0 %	357419571
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