MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016148	CTC	2	6	659257	659262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419456
11502	NC_016148	TTC	2	6	659265	659270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419456
11503	NC_016148	GAA	2	6	659280	659285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419456
11504	NC_016148	CT	3	6	659293	659298	0 %	50 %	0 %	50 %	357419456
11505	NC_016148	TA	3	6	659352	659357	50 %	50 %	0 %	0 %	357419456
11506	NC_016148	ATA	3	9	659385	659393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419456
11507	NC_016148	GGAT	2	8	659403	659410	25 %	25 %	50 %	0 %	357419456
11508	NC_016148	ATT	2	6	659428	659433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419456
11509	NC_016148	TGC	2	6	659458	659463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419456
11510	NC_016148	GTA	2	6	659493	659498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419457
11511	NC_016148	A	8	8	659505	659512	100 %	0 %	0 %	0 %	357419457
11512	NC_016148	ATG	2	6	659526	659531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419457
11513	NC_016148	A	6	6	659538	659543	100 %	0 %	0 %	0 %	357419457
11514	NC_016148	ACA	2	6	659547	659552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419457
11515	NC_016148	TCT	2	6	659596	659601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419457
11516	NC_016148	TTG	2	6	659613	659618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419457
11517	NC_016148	GTTT	2	8	659731	659738	0 %	75 %	25 %	0 %	357419457
11518	NC_016148	GCC	2	6	659741	659746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419457
11519	NC_016148	GCT	2	6	659855	659860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419457
11520	NC_016148	ATG	2	6	659868	659873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419457
11521	NC_016148	GGA	2	6	659878	659883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419457
11522	NC_016148	GTG	2	6	660047	660052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419457
11523	NC_016148	AG	3	6	660189	660194	50 %	0 %	50 %	0 %	357419457
11524	NC_016148	AAG	2	6	660263	660268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419457
11525	NC_016148	ATA	2	6	660287	660292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419457
11526	NC_016148	GAA	2	6	660316	660321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419457
11527	NC_016148	A	6	6	660400	660405	100 %	0 %	0 %	0 %	357419457
11528	NC_016148	GGA	2	6	660415	660420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419457
11529	NC_016148	TCT	2	6	660430	660435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419457
11530	NC_016148	ATCA	2	8	660561	660568	50 %	25 %	0 %	25 %	357419457
11531	NC_016148	CA	3	6	660572	660577	50 %	0 %	0 %	50 %	357419457
11532	NC_016148	GTG	2	6	660594	660599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419457
11533	NC_016148	AAGG	2	8	660677	660684	50 %	0 %	50 %	0 %	357419457
11534	NC_016148	CAA	2	6	660904	660909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419457
11535	NC_016148	AAC	2	6	660929	660934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419457
11536	NC_016148	AGA	2	6	661083	661088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419457
11537	NC_016148	GAGAA	2	10	661095	661104	60 %	0 %	40 %	0 %	357419457
11538	NC_016148	AAAGG	2	10	661112	661121	60 %	0 %	40 %	0 %	357419457
11539	NC_016148	AAGATA	2	12	661170	661181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	357419457
11540	NC_016148	GGT	2	6	661186	661191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419457
11541	NC_016148	GGA	2	6	661246	661251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419457
11542	NC_016148	GA	3	6	661275	661280	50 %	0 %	50 %	0 %	357419457
11543	NC_016148	ATC	2	6	661285	661290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419457
11544	NC_016148	AGA	2	6	661339	661344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419457
11545	NC_016148	C	6	6	661346	661351	0 %	0 %	0 %	100 %	357419457
11546	NC_016148	GA	4	8	661367	661374	50 %	0 %	50 %	0 %	357419457
11547	NC_016148	TCT	2	6	661423	661428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419457
11548	NC_016148	CAG	2	6	661432	661437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419457
11549	NC_016148	CTG	2	6	661444	661449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419457
11550	NC_016148	AAT	2	6	661471	661476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419457
11551	NC_016148	CGAAG	2	10	661488	661497	40 %	0 %	40 %	20 %	357419457
11552	NC_016148	AG	3	6	661549	661554	50 %	0 %	50 %	0 %	357419457
11553	NC_016148	ACCG	2	8	661622	661629	25 %	0 %	25 %	50 %	357419457
11554	NC_016148	ATA	2	6	661772	661777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419457
11555	NC_016148	CTT	2	6	661919	661924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419458
11556	NC_016148	TGG	2	6	662052	662057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419458
11557	NC_016148	TCAT	2	8	662153	662160	25 %	50 %	0 %	25 %	357419458
11558	NC_016148	AGG	2	6	662268	662273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419458
11559	NC_016148	AAC	2	6	662410	662415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419459
11560	NC_016148	A	6	6	662497	662502	100 %	0 %	0 %	0 %	357419459
11561	NC_016148	TC	3	6	662556	662561	0 %	50 %	0 %	50 %	357419459
11562	NC_016148	TGC	3	9	662583	662591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419459
11563	NC_016148	GAT	2	6	662601	662606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419459
11564	NC_016148	GGAC	2	8	662613	662620	25 %	0 %	50 %	25 %	357419459
11565	NC_016148	AAG	2	6	662708	662713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419459
11566	NC_016148	GGAC	2	8	662762	662769	25 %	0 %	50 %	25 %	357419459
11567	NC_016148	TC	3	6	662801	662806	0 %	50 %	0 %	50 %	357419459
11568	NC_016148	GA	3	6	662881	662886	50 %	0 %	50 %	0 %	357419459
11569	NC_016148	GTG	2	6	663024	663029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419460
11570	NC_016148	CGGG	2	8	663122	663129	0 %	0 %	75 %	25 %	357419460
11571	NC_016148	GGA	2	6	663255	663260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419460
11572	NC_016148	GGT	2	6	663284	663289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419460
11573	NC_016148	GCA	2	6	663393	663398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419460
11574	NC_016148	G	7	7	663492	663498	0 %	0 %	100 %	0 %	357419460
11575	NC_016148	GTAA	2	8	663504	663511	50 %	25 %	25 %	0 %	357419460
11576	NC_016148	ATA	2	6	663549	663554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419460
11577	NC_016148	AAT	2	6	663653	663658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419460
11578	NC_016148	ATA	2	6	663756	663761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419460
11579	NC_016148	GGA	2	6	663782	663787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419460
11580	NC_016148	GGA	2	6	663881	663886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419460
11581	NC_016148	AGA	2	6	663911	663916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419460
11582	NC_016148	AGTT	2	8	664041	664048	25 %	50 %	25 %	0 %	357419461
11583	NC_016148	CTG	2	6	664095	664100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419461
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11585	NC_016148	GA	3	6	664164	664169	50 %	0 %	50 %	0 %	357419461
11586	NC_016148	AGG	2	6	664206	664211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419461
11587	NC_016148	TTG	2	6	664213	664218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419461
11588	NC_016148	AAGA	2	8	664257	664264	75 %	0 %	25 %	0 %	357419461
11589	NC_016148	TTC	2	6	664303	664308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419461
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11591	NC_016148	A	6	6	664326	664331	100 %	0 %	0 %	0 %	357419461
11592	NC_016148	TGG	2	6	664392	664397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419461
11593	NC_016148	TGGT	2	8	664471	664478	0 %	50 %	50 %	0 %	357419461
11594	NC_016148	GCCG	2	8	664544	664551	0 %	0 %	50 %	50 %	357419461
11595	NC_016148	TGG	2	6	664808	664813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419461
11596	NC_016148	ATG	2	6	664823	664828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419461
11597	NC_016148	T	8	8	664872	664879	0 %	100 %	0 %	0 %	357419462
11598	NC_016148	GGGT	2	8	664883	664890	0 %	25 %	75 %	0 %	357419462
11599	NC_016148	GGT	2	6	665004	665009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419462
11600	NC_016148	CTT	2	6	665015	665020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419462
11601	NC_016148	AAT	2	6	665119	665124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419462
11602	NC_016148	TG	4	8	665139	665146	0 %	50 %	50 %	0 %	357419462
11603	NC_016148	CAG	2	6	665210	665215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419462
11604	NC_016148	GTG	2	6	665225	665230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419462
11605	NC_016148	T	6	6	665255	665260	0 %	100 %	0 %	0 %	357419462
11606	NC_016148	TGGT	2	8	665328	665335	0 %	50 %	50 %	0 %	357419463
11607	NC_016148	T	6	6	665338	665343	0 %	100 %	0 %	0 %	357419463
11608	NC_016148	TTC	2	6	665383	665388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419463
11609	NC_016148	TCC	2	6	665444	665449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419463
11610	NC_016148	CGA	2	6	665617	665622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419463
11611	NC_016148	A	6	6	665624	665629	100 %	0 %	0 %	0 %	357419463
11612	NC_016148	GGGA	2	8	665831	665838	25 %	0 %	75 %	0 %	357419463
11613	NC_016148	ATA	2	6	665859	665864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419463
11614	NC_016148	GAA	2	6	665947	665952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419463
11615	NC_016148	GATAG	2	10	665991	666000	40 %	20 %	40 %	0 %	357419463
11616	NC_016148	GTG	2	6	666063	666068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419463
11617	NC_016148	CTTG	2	8	666138	666145	0 %	50 %	25 %	25 %	357419463
11618	NC_016148	AAGGAC	2	12	666180	666191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	357419463
11619	NC_016148	ATG	2	6	666198	666203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419463
11620	NC_016148	TCC	2	6	666227	666232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419463
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11622	NC_016148	TAC	2	6	666303	666308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419463
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