MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016148	ATG	2	6	579460	579465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419381
10002	NC_016148	AGA	2	6	580133	580138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419382
10003	NC_016148	AGGC	2	8	580170	580177	25 %	0 %	50 %	25 %	357419382
10004	NC_016148	TA	3	6	580231	580236	50 %	50 %	0 %	0 %	357419382
10005	NC_016148	GTCAAC	2	12	580286	580297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357419382
10006	NC_016148	GAG	2	6	580328	580333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419382
10007	NC_016148	TAA	2	6	580374	580379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419382
10008	NC_016148	A	6	6	580378	580383	100 %	0 %	0 %	0 %	357419382
10009	NC_016148	GAT	2	6	580426	580431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419382
10010	NC_016148	CCA	2	6	580433	580438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419382
10011	NC_016148	ATA	2	6	580460	580465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419382
10012	NC_016148	GGA	2	6	580486	580491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419382
10013	NC_016148	AG	3	6	580511	580516	50 %	0 %	50 %	0 %	357419382
10014	NC_016148	TGG	3	9	580521	580529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419382
10015	NC_016148	TGG	2	6	580534	580539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419382
10016	NC_016148	TAA	2	6	580542	580547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419382
10017	NC_016148	TAG	2	6	580620	580625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419382
10018	NC_016148	CTT	2	6	580655	580660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419382
10019	NC_016148	T	6	6	580659	580664	0 %	100 %	0 %	0 %	357419382
10020	NC_016148	GAA	2	6	580781	580786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419383
10021	NC_016148	TTC	2	6	580791	580796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419383
10022	NC_016148	GGA	2	6	580806	580811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419383
10023	NC_016148	AG	3	6	580812	580817	50 %	0 %	50 %	0 %	357419383
10024	NC_016148	AGC	2	6	580823	580828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419383
10025	NC_016148	AGA	2	6	580830	580835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419383
10026	NC_016148	GAG	2	6	580885	580890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419383
10027	NC_016148	TCT	2	6	580916	580921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419383
10028	NC_016148	AGG	2	6	580973	580978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419383
10029	NC_016148	TGG	2	6	580982	580987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419383
10030	NC_016148	TAC	2	6	581050	581055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419383
10031	NC_016148	AG	3	6	581087	581092	50 %	0 %	50 %	0 %	357419383
10032	NC_016148	CGA	2	6	581148	581153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419383
10033	NC_016148	GAG	2	6	581188	581193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419383
10034	NC_016148	AG	3	6	581208	581213	50 %	0 %	50 %	0 %	357419383
10035	NC_016148	GGA	2	6	581352	581357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419383
10036	NC_016148	A	6	6	581436	581441	100 %	0 %	0 %	0 %	357419384
10037	NC_016148	AGA	2	6	581487	581492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419384
10038	NC_016148	AGA	2	6	581579	581584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419384
10039	NC_016148	GTAAA	2	10	581596	581605	60 %	20 %	20 %	0 %	357419384
10040	NC_016148	TGC	2	6	581669	581674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419384
10041	NC_016148	AGA	2	6	581720	581725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419384
10042	NC_016148	TTG	2	6	581770	581775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419384
10043	NC_016148	GAA	2	6	581922	581927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419384
10044	NC_016148	TTTGTA	2	12	581951	581962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	357419384
10045	NC_016148	AG	3	6	581990	581995	50 %	0 %	50 %	0 %	357419384
10046	NC_016148	AATAA	2	10	582002	582011	80 %	20 %	0 %	0 %	357419384
10047	NC_016148	GTA	2	6	582025	582030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419385
10048	NC_016148	GTTT	2	8	582074	582081	0 %	75 %	25 %	0 %	357419385
10049	NC_016148	TAT	2	6	582082	582087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419385
10050	NC_016148	TGG	2	6	582139	582144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419385
10051	NC_016148	GT	3	6	582154	582159	0 %	50 %	50 %	0 %	357419385
10052	NC_016148	ACA	2	6	582256	582261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419385
10053	NC_016148	CGG	2	6	582314	582319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419385
10054	NC_016148	CCA	2	6	582352	582357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419385
10055	NC_016148	GAG	2	6	582399	582404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419385
10056	NC_016148	GGA	2	6	582521	582526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419385
10057	NC_016148	GTA	2	6	582546	582551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419385
10058	NC_016148	TCG	2	6	582562	582567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419385
10059	NC_016148	CAT	2	6	582584	582589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419385
10060	NC_016148	A	7	7	582603	582609	100 %	0 %	0 %	0 %	357419385
10061	NC_016148	TAA	2	6	582622	582627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419385
10062	NC_016148	GA	3	6	582631	582636	50 %	0 %	50 %	0 %	357419385
10063	NC_016148	CTC	2	6	582639	582644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419385
10064	NC_016148	AAC	2	6	582690	582695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419385
10065	NC_016148	CTT	2	6	582710	582715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419385
10066	NC_016148	AGA	2	6	582793	582798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419385
10067	NC_016148	GGA	2	6	583010	583015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419385
10068	NC_016148	GAG	2	6	583020	583025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419385
10069	NC_016148	ACT	2	6	583048	583053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419385
10070	NC_016148	ACG	2	6	583054	583059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419385
10071	NC_016148	AAG	2	6	583092	583097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419385
10072	NC_016148	CGA	2	6	583106	583111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419385
10073	NC_016148	TGG	2	6	583195	583200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419385
10074	NC_016148	ACT	2	6	583225	583230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419385
10075	NC_016148	ATCCT	2	10	583274	583283	20 %	40 %	0 %	40 %	357419385
10076	NC_016148	GAC	2	6	583332	583337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419385
10077	NC_016148	TAC	2	6	583380	583385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419385
10078	NC_016148	TTC	3	9	583481	583489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419385
10079	NC_016148	ACG	3	9	583552	583560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419385
10080	NC_016148	TGA	2	6	583571	583576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419385
10081	NC_016148	TCT	2	6	583636	583641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419385
10082	NC_016148	GGT	2	6	583802	583807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419385
10083	NC_016148	GTC	2	6	583866	583871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419386
10084	NC_016148	AGG	2	6	583903	583908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419386
10085	NC_016148	GAAGC	2	10	583997	584006	40 %	0 %	40 %	20 %	357419386
10086	NC_016148	CTTT	2	8	584171	584178	0 %	75 %	0 %	25 %	357419386
10087	NC_016148	CCTTC	2	10	584240	584249	0 %	40 %	0 %	60 %	357419386
10088	NC_016148	GAA	2	6	584349	584354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419386
10089	NC_016148	CAGG	2	8	584543	584550	25 %	0 %	50 %	25 %	357419386
10090	NC_016148	GGA	2	6	584564	584569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419386
10091	NC_016148	AGGTGG	2	12	584599	584610	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	357419386
10092	NC_016148	TCC	2	6	584631	584636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419386
10093	NC_016148	GGAGC	2	10	584865	584874	20 %	0 %	60 %	20 %	357419386
10094	NC_016148	GAT	2	6	584886	584891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419386
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10096	NC_016148	AG	3	6	585033	585038	50 %	0 %	50 %	0 %	357419386
10097	NC_016148	GGTA	2	8	585062	585069	25 %	25 %	50 %	0 %	357419386
10098	NC_016148	AGG	2	6	585076	585081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419386
10099	NC_016148	GAT	2	6	585096	585101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419387
10100	NC_016148	AGCT	2	8	585128	585135	25 %	25 %	25 %	25 %	357419387
10101	NC_016148	TGG	2	6	585140	585145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419387
10102	NC_016148	GAAA	2	8	585166	585173	75 %	0 %	25 %	0 %	357419387
10103	NC_016148	TGGCA	2	10	585227	585236	20 %	20 %	40 %	20 %	357419387
10104	NC_016148	TGG	2	6	585254	585259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419387
10105	NC_016148	GTT	2	6	585277	585282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419387
10106	NC_016148	GGAA	2	8	585300	585307	50 %	0 %	50 %	0 %	357419387
10107	NC_016148	GCTT	2	8	585336	585343	0 %	50 %	25 %	25 %	357419387
10108	NC_016148	AAGA	2	8	585373	585380	75 %	0 %	25 %	0 %	357419387
10109	NC_016148	CGG	2	6	585404	585409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419387
10110	NC_016148	AGCG	2	8	585441	585448	25 %	0 %	50 %	25 %	357419387
10111	NC_016148	TCA	2	6	585464	585469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419387
10112	NC_016148	A	6	6	585469	585474	100 %	0 %	0 %	0 %	357419387
10113	NC_016148	GTG	2	6	585496	585501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419387
10114	NC_016148	ATG	2	6	585578	585583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419387
10115	NC_016148	GCA	2	6	585734	585739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419387
10116	NC_016148	TG	3	6	585838	585843	0 %	50 %	50 %	0 %	357419387
10117	NC_016148	TGG	2	6	585845	585850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419387
10118	NC_016148	GGCA	2	8	585855	585862	25 %	0 %	50 %	25 %	357419387
10119	NC_016148	GCAG	2	8	585865	585872	25 %	0 %	50 %	25 %	357419387
10120	NC_016148	GCG	2	6	585911	585916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419387
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