MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016148	AGC	2	6	495154	495159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8502	NC_016148	AC	3	6	495191	495196	50 %	0 %	0 %	50 %	357419303
8503	NC_016148	GACA	2	8	495221	495228	50 %	0 %	25 %	25 %	357419303
8504	NC_016148	TCC	3	9	495247	495255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419303
8505	NC_016148	GAA	2	6	495258	495263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419303
8506	NC_016148	CGA	2	6	495299	495304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8507	NC_016148	GGA	2	6	495320	495325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419303
8508	NC_016148	AGT	2	6	495354	495359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419303
8509	NC_016148	CGAC	2	8	495371	495378	25 %	0 %	25 %	50 %	357419303
8510	NC_016148	AGG	2	6	495385	495390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419303
8511	NC_016148	GGT	2	6	495467	495472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419303
8512	NC_016148	GAT	2	6	495528	495533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419303
8513	NC_016148	GCG	2	6	495548	495553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419303
8514	NC_016148	AG	3	6	495571	495576	50 %	0 %	50 %	0 %	357419303
8515	NC_016148	CAC	2	6	495662	495667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419303
8516	NC_016148	GCA	2	6	495686	495691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8517	NC_016148	GGA	2	6	495692	495697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419303
8518	NC_016148	CGT	2	6	495725	495730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8519	NC_016148	GAG	2	6	495768	495773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419303
8520	NC_016148	TCA	2	6	495820	495825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419303
8521	NC_016148	GGT	2	6	495836	495841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419303
8522	NC_016148	GGC	2	6	495855	495860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419303
8523	NC_016148	CAG	2	6	495867	495872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8524	NC_016148	CACC	2	8	495895	495902	25 %	0 %	0 %	75 %	357419303
8525	NC_016148	CCT	2	6	495941	495946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419303
8526	NC_016148	ACGGC	2	10	496009	496018	20 %	0 %	40 %	40 %	357419303
8527	NC_016148	GCT	2	6	496088	496093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419303
8528	NC_016148	ATG	2	6	496175	496180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419304
8529	NC_016148	AGC	2	6	496188	496193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419304
8530	NC_016148	ACT	2	6	496419	496424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419304
8531	NC_016148	TGA	2	6	496428	496433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419304
8532	NC_016148	TGC	2	6	496485	496490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419304
8533	NC_016148	CCAT	2	8	496502	496509	25 %	25 %	0 %	50 %	357419304
8534	NC_016148	CAT	2	6	496539	496544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419304
8535	NC_016148	ACTA	2	8	496618	496625	50 %	25 %	0 %	25 %	357419304
8536	NC_016148	ACTT	2	8	496628	496635	25 %	50 %	0 %	25 %	357419304
8537	NC_016148	GGA	2	6	496650	496655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419304
8538	NC_016148	T	6	6	496702	496707	0 %	100 %	0 %	0 %	357419304
8539	NC_016148	GAC	2	6	496729	496734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419304
8540	NC_016148	GCCG	2	8	496822	496829	0 %	0 %	50 %	50 %	357419304
8541	NC_016148	CCGG	2	8	496873	496880	0 %	0 %	50 %	50 %	357419304
8542	NC_016148	TGA	2	6	496889	496894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419304
8543	NC_016148	GA	4	8	496905	496912	50 %	0 %	50 %	0 %	357419304
8544	NC_016148	ATC	2	6	496999	497004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419304
8545	NC_016148	AGA	2	6	497139	497144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419304
8546	NC_016148	CGT	2	6	497145	497150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419304
8547	NC_016148	AGA	2	6	497250	497255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419304
8548	NC_016148	GAT	2	6	497272	497277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419304
8549	NC_016148	GAG	2	6	497386	497391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419304
8550	NC_016148	CGGG	2	8	497635	497642	0 %	0 %	75 %	25 %	357419305
8551	NC_016148	GAT	2	6	497727	497732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419305
8552	NC_016148	GAA	2	6	497751	497756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419305
8553	NC_016148	TAT	2	6	497765	497770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419305
8554	NC_016148	TGG	2	6	497794	497799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419305
8555	NC_016148	TGG	2	6	497830	497835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419305
8556	NC_016148	TGA	2	6	498080	498085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419305
8557	NC_016148	TTG	2	6	498100	498105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419305
8558	NC_016148	CCG	2	6	498107	498112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419305
8559	NC_016148	CTT	2	6	498141	498146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419305
8560	NC_016148	AGA	2	6	498317	498322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419305
8561	NC_016148	GCC	2	6	498396	498401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419305
8562	NC_016148	AGCCCC	2	12	498409	498420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357419305
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8564	NC_016148	GATTG	2	10	498543	498552	20 %	40 %	40 %	0 %	357419305
8565	NC_016148	GGT	2	6	498585	498590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419305
8566	NC_016148	TTG	2	6	498613	498618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419305
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8568	NC_016148	TTG	2	6	498696	498701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419305
8569	NC_016148	GAAG	2	8	498794	498801	50 %	0 %	50 %	0 %	357419305
8570	NC_016148	CTT	2	6	498884	498889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419305
8571	NC_016148	TGA	2	6	499070	499075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419305
8572	NC_016148	GCCT	2	8	499118	499125	0 %	25 %	25 %	50 %	357419305
8573	NC_016148	CAG	2	6	499152	499157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419305
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8577	NC_016148	CAG	2	6	499481	499486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419307
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8580	NC_016148	TCG	2	6	499595	499600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419307
8581	NC_016148	GAC	2	6	499654	499659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419307
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8583	NC_016148	TGC	2	6	499790	499795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419307
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8585	NC_016148	AGA	2	6	499818	499823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419307
8586	NC_016148	GTG	2	6	499873	499878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419307
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8590	NC_016148	AGCC	2	8	500063	500070	25 %	0 %	25 %	50 %	357419307
8591	NC_016148	TCG	2	6	500122	500127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419307
8592	NC_016148	GGGTC	2	10	500156	500165	0 %	20 %	60 %	20 %	357419307
8593	NC_016148	C	6	6	500492	500497	0 %	0 %	0 %	100 %	357419308
8594	NC_016148	ATGG	2	8	500579	500586	25 %	25 %	50 %	0 %	357419308
8595	NC_016148	TA	3	6	500589	500594	50 %	50 %	0 %	0 %	357419308
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8597	NC_016148	TAC	2	6	500793	500798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419308
8598	NC_016148	TCT	2	6	500906	500911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419308
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8600	NC_016148	TC	3	6	501168	501173	0 %	50 %	0 %	50 %	357419308
8601	NC_016148	TA	3	6	501209	501214	50 %	50 %	0 %	0 %	357419308
8602	NC_016148	CCA	2	6	501237	501242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419308
8603	NC_016148	AAAT	2	8	501268	501275	75 %	25 %	0 %	0 %	357419308
8604	NC_016148	CAT	2	6	501318	501323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419308
8605	NC_016148	GT	3	6	501455	501460	0 %	50 %	50 %	0 %	357419308
8606	NC_016148	TTG	2	6	501461	501466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419308
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8608	NC_016148	CTA	2	6	501591	501596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419308
8609	NC_016148	GCT	2	6	501662	501667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419308
8610	NC_016148	CTCA	2	8	501712	501719	25 %	25 %	0 %	50 %	357419308
8611	NC_016148	AC	3	6	501728	501733	50 %	0 %	0 %	50 %	357419308
8612	NC_016148	CTTC	2	8	501738	501745	0 %	50 %	0 %	50 %	357419308
8613	NC_016148	ACA	2	6	501776	501781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419308
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8615	NC_016148	ATCC	2	8	502071	502078	25 %	25 %	0 %	50 %	357419309
8616	NC_016148	GATG	2	8	502129	502136	25 %	25 %	50 %	0 %	357419309
8617	NC_016148	GAAG	2	8	502174	502181	50 %	0 %	50 %	0 %	357419309
8618	NC_016148	CTT	2	6	502231	502236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419309
8619	NC_016148	GCA	2	6	502243	502248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419309
8620	NC_016148	TTC	2	6	502390	502395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419309
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8992	NC_016148	GGA	2	6	523374	523379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419330
8993	NC_016148	ATGCA	2	10	523405	523414	40 %	20 %	20 %	20 %	357419330
8994	NC_016148	GGC	2	6	523484	523489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419330
8995	NC_016148	GGC	2	6	523532	523537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419330
8996	NC_016148	CAGT	2	8	523619	523626	25 %	25 %	25 %	25 %	357419330
8997	NC_016148	TGGAT	2	10	523745	523754	20 %	40 %	40 %	0 %	357419330
8998	NC_016148	ATG	2	6	523758	523763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419330
8999	NC_016148	TCT	2	6	523780	523785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419330
9000	NC_016148	CTT	2	6	523793	523798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419330

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