MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016148	AAT	2	6	407008	407013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419223
7003	NC_016148	GGA	2	6	407046	407051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419223
7004	NC_016148	AAG	2	6	407068	407073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419223
7005	NC_016148	AT	3	6	407078	407083	50 %	50 %	0 %	0 %	357419223
7006	NC_016148	TGGAGG	2	12	407147	407158	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	357419223
7007	NC_016148	TGG	2	6	407234	407239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419223
7008	NC_016148	AAGA	2	8	407384	407391	75 %	0 %	25 %	0 %	357419223
7009	NC_016148	GCT	3	9	407410	407418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419223
7010	NC_016148	CCT	2	6	407440	407445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419223
7011	NC_016148	GAT	2	6	407488	407493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419223
7012	NC_016148	CGTT	2	8	407498	407505	0 %	50 %	25 %	25 %	357419223
7013	NC_016148	AG	3	6	407646	407651	50 %	0 %	50 %	0 %	357419223
7014	NC_016148	ATTG	2	8	407776	407783	25 %	50 %	25 %	0 %	357419224
7015	NC_016148	CCT	2	6	407821	407826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419224
7016	NC_016148	TGT	2	6	408013	408018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419224
7017	NC_016148	CTT	2	6	408354	408359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419224
7018	NC_016148	GATA	2	8	408573	408580	50 %	25 %	25 %	0 %	357419225
7019	NC_016148	AAAG	2	8	408594	408601	75 %	0 %	25 %	0 %	357419225
7020	NC_016148	CGAA	2	8	408606	408613	50 %	0 %	25 %	25 %	357419225
7021	NC_016148	ATAG	2	8	408619	408626	50 %	25 %	25 %	0 %	357419225
7022	NC_016148	GATA	2	8	408720	408727	50 %	25 %	25 %	0 %	357419225
7023	NC_016148	TGA	2	6	408741	408746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419225
7024	NC_016148	TAG	2	6	408821	408826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419225
7025	NC_016148	TTC	2	6	408865	408870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419225
7026	NC_016148	AG	4	8	408915	408922	50 %	0 %	50 %	0 %	357419225
7027	NC_016148	GCT	2	6	408923	408928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419225
7028	NC_016148	AGCT	2	8	408972	408979	25 %	25 %	25 %	25 %	357419226
7029	NC_016148	CTG	2	6	409010	409015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419226
7030	NC_016148	GTT	2	6	409029	409034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419226
7031	NC_016148	CCA	2	6	409038	409043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419226
7032	NC_016148	CT	3	6	409056	409061	0 %	50 %	0 %	50 %	357419226
7033	NC_016148	T	6	6	409092	409097	0 %	100 %	0 %	0 %	357419226
7034	NC_016148	CGT	2	6	409229	409234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419226
7035	NC_016148	TGCA	2	8	409244	409251	25 %	25 %	25 %	25 %	357419226
7036	NC_016148	G	6	6	409289	409294	0 %	0 %	100 %	0 %	357419226
7037	NC_016148	ACCC	2	8	409375	409382	25 %	0 %	0 %	75 %	357419226
7038	NC_016148	GTG	2	6	409387	409392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419226
7039	NC_016148	TGC	2	6	409406	409411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419226
7040	NC_016148	CCT	2	6	409457	409462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419226
7041	NC_016148	TCCG	2	8	409725	409732	0 %	25 %	25 %	50 %	357419226
7042	NC_016148	CGA	2	6	409739	409744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419226
7043	NC_016148	T	6	6	409770	409775	0 %	100 %	0 %	0 %	357419226
7044	NC_016148	AAC	2	6	409790	409795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419226
7045	NC_016148	TTTC	2	8	409936	409943	0 %	75 %	0 %	25 %	357419226
7046	NC_016148	GTC	2	6	410007	410012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419226
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7048	NC_016148	AGT	2	6	410075	410080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419226
7049	NC_016148	ATT	2	6	410128	410133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419226
7050	NC_016148	CTT	3	9	410165	410173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419226
7051	NC_016148	GCC	2	6	410289	410294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419226
7052	NC_016148	CTG	2	6	410336	410341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419226
7053	NC_016148	CTT	2	6	410366	410371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419226
7054	NC_016148	TAT	2	6	410403	410408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419226
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7056	NC_016148	GTGG	2	8	410736	410743	0 %	25 %	75 %	0 %	357419227
7057	NC_016148	A	8	8	410777	410784	100 %	0 %	0 %	0 %	357419227
7058	NC_016148	GAC	2	6	410829	410834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419227
7059	NC_016148	TGG	2	6	410869	410874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419227
7060	NC_016148	A	6	6	410894	410899	100 %	0 %	0 %	0 %	357419227
7061	NC_016148	TTG	2	6	410911	410916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419227
7062	NC_016148	AT	3	6	411054	411059	50 %	50 %	0 %	0 %	357419227
7063	NC_016148	TGGT	2	8	411064	411071	0 %	50 %	50 %	0 %	357419227
7064	NC_016148	GAG	2	6	411083	411088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419227
7065	NC_016148	CAAT	2	8	411178	411185	50 %	25 %	0 %	25 %	357419227
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7068	NC_016148	TGA	2	6	411329	411334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419228
7069	NC_016148	CTG	2	6	411371	411376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419228
7070	NC_016148	CAG	2	6	411407	411412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419228
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7073	NC_016148	TAA	2	6	411689	411694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419228
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7088	NC_016148	ATGTA	2	10	412317	412326	40 %	40 %	20 %	0 %	357419229
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7092	NC_016148	TGA	2	6	412554	412559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419229
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7099	NC_016148	CTGT	2	8	412840	412847	0 %	50 %	25 %	25 %	357419229
7100	NC_016148	TCG	2	6	412900	412905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419229
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7103	NC_016148	CA	3	6	413265	413270	50 %	0 %	0 %	50 %	357419229
7104	NC_016148	ACG	2	6	413350	413355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419229
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7106	NC_016148	TC	3	6	413477	413482	0 %	50 %	0 %	50 %	357419229
7107	NC_016148	TTG	2	6	413565	413570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419229
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7109	NC_016148	TC	3	6	413672	413677	0 %	50 %	0 %	50 %	357419229
7110	NC_016148	TTG	2	6	413701	413706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419229
7111	NC_016148	GATA	2	8	413778	413785	50 %	25 %	25 %	0 %	357419229
7112	NC_016148	CT	3	6	413872	413877	0 %	50 %	0 %	50 %	357419229
7113	NC_016148	CTA	2	6	413924	413929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419229
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7115	NC_016148	TAT	2	6	414103	414108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419230
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7117	NC_016148	CTGCT	2	10	414215	414224	0 %	40 %	20 %	40 %	357419230
7118	NC_016148	TG	3	6	414259	414264	0 %	50 %	50 %	0 %	357419230
7119	NC_016148	CGGA	2	8	414321	414328	25 %	0 %	50 %	25 %	357419230
7120	NC_016148	GAG	2	6	414337	414342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419230
7121	NC_016148	CTC	2	6	414375	414380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419230
7122	NC_016148	TG	3	6	414381	414386	0 %	50 %	50 %	0 %	357419230
7123	NC_016148	GCT	2	6	414506	414511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419230
7124	NC_016148	GATA	2	8	414579	414586	50 %	25 %	25 %	0 %	357419230
7125	NC_016148	CTC	2	6	414591	414596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419230
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7145	NC_016148	TGC	2	6	415666	415671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419232
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7238	NC_016148	AGCAG	2	10	421623	421632	40 %	0 %	40 %	20 %	357419237
7239	NC_016148	CAGA	2	8	421659	421666	50 %	0 %	25 %	25 %	357419237
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7400	NC_016148	AGC	3	9	429581	429589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419246
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