MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016148	GTG	2	6	377675	377680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419195
6502	NC_016148	GCC	2	6	377810	377815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419195
6503	NC_016148	AAAC	2	8	377888	377895	75 %	0 %	0 %	25 %	357419195
6504	NC_016148	GAG	2	6	378026	378031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419195
6505	NC_016148	ATA	2	6	378077	378082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419195
6506	NC_016148	GATG	2	8	378121	378128	25 %	25 %	50 %	0 %	357419195
6507	NC_016148	AGGAT	2	10	378342	378351	40 %	20 %	40 %	0 %	357419195
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6510	NC_016148	TGG	2	6	378500	378505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419196
6511	NC_016148	TAT	2	6	378513	378518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419196
6512	NC_016148	GAT	2	6	378563	378568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419196
6513	NC_016148	GGC	2	6	378593	378598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419196
6514	NC_016148	GAGCAC	2	12	378606	378617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419196
6515	NC_016148	GAG	2	6	378627	378632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419196
6516	NC_016148	GAA	2	6	378740	378745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419196
6517	NC_016148	C	6	6	378884	378889	0 %	0 %	0 %	100 %	357419197
6518	NC_016148	GGC	2	6	378949	378954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419197
6519	NC_016148	TCA	2	6	378990	378995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419197
6520	NC_016148	TAGG	2	8	379062	379069	25 %	25 %	50 %	0 %	357419197
6521	NC_016148	TAT	2	6	379078	379083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419197
6522	NC_016148	AAGA	2	8	379111	379118	75 %	0 %	25 %	0 %	357419197
6523	NC_016148	CGTGCT	2	12	379297	379308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419197
6524	NC_016148	TAG	2	6	379312	379317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419197
6525	NC_016148	TCCA	2	8	379464	379471	25 %	25 %	0 %	50 %	357419197
6526	NC_016148	TTCGG	2	10	379549	379558	0 %	40 %	40 %	20 %	357419197
6527	NC_016148	ATG	2	6	379583	379588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419197
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6529	NC_016148	CCA	2	6	379682	379687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419197
6530	NC_016148	AGCA	2	8	379703	379710	50 %	0 %	25 %	25 %	357419197
6531	NC_016148	T	6	6	379724	379729	0 %	100 %	0 %	0 %	357419197
6532	NC_016148	TACCG	2	10	379731	379740	20 %	20 %	20 %	40 %	357419197
6533	NC_016148	AAG	2	6	379747	379752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419197
6534	NC_016148	CCAGG	2	10	379773	379782	20 %	0 %	40 %	40 %	357419197
6535	NC_016148	GAAG	2	8	379789	379796	50 %	0 %	50 %	0 %	357419197
6536	NC_016148	GAA	2	6	379831	379836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419197
6537	NC_016148	GA	3	6	380090	380095	50 %	0 %	50 %	0 %	357419198
6538	NC_016148	TAT	2	6	380102	380107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419198
6539	NC_016148	CAGG	2	8	380113	380120	25 %	0 %	50 %	25 %	357419198
6540	NC_016148	CAA	2	6	380123	380128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419198
6541	NC_016148	CAG	2	6	380207	380212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419198
6542	NC_016148	GCA	3	9	380226	380234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419198
6543	NC_016148	GGC	2	6	380294	380299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419198
6544	NC_016148	AAG	2	6	380309	380314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419198
6545	NC_016148	GCT	2	6	380389	380394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419198
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6547	NC_016148	CGT	2	6	380521	380526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419198
6548	NC_016148	CCT	2	6	380541	380546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419199
6549	NC_016148	TCT	2	6	380582	380587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419199
6550	NC_016148	AAT	2	6	380725	380730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419199
6551	NC_016148	CGC	2	6	380856	380861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419199
6552	NC_016148	T	6	6	380892	380897	0 %	100 %	0 %	0 %	357419199
6553	NC_016148	CAT	2	6	380902	380907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419199
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6555	NC_016148	CTA	2	6	380937	380942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419199
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6557	NC_016148	CCA	2	6	381018	381023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419199
6558	NC_016148	TTA	2	6	381030	381035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419199
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6561	NC_016148	TA	3	6	381202	381207	50 %	50 %	0 %	0 %	357419199
6562	NC_016148	GAA	2	6	381280	381285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419199
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6565	NC_016148	GGA	2	6	381409	381414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419199
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6570	NC_016148	ATG	2	6	381519	381524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419199
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6578	NC_016148	AGGT	2	8	382112	382119	25 %	25 %	50 %	0 %	357419200
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6589	NC_016148	CTT	2	6	382737	382742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419200
6590	NC_016148	TCC	2	6	382752	382757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419200
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6593	NC_016148	GGCT	2	8	382879	382886	0 %	25 %	50 %	25 %	357419200
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6604	NC_016148	T	7	7	383523	383529	0 %	100 %	0 %	0 %	357419202
6605	NC_016148	A	6	6	383596	383601	100 %	0 %	0 %	0 %	357419202
6606	NC_016148	CGG	2	6	383615	383620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419202
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6608	NC_016148	TTC	2	6	383660	383665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419202
6609	NC_016148	AGTTC	2	10	383673	383682	20 %	40 %	20 %	20 %	357419202
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6617	NC_016148	GCT	2	6	384154	384159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419203
6618	NC_016148	GCA	2	6	384317	384322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419203
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6620	NC_016148	GCT	2	6	384373	384378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419203
6621	NC_016148	A	6	6	384392	384397	100 %	0 %	0 %	0 %	357419203
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6991	NC_016148	TGTC	2	8	405826	405833	0 %	50 %	25 %	25 %	357419222
6992	NC_016148	TTC	2	6	405920	405925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419222
6993	NC_016148	ATT	2	6	405960	405965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419222
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6995	NC_016148	CCAGG	2	10	406560	406569	20 %	0 %	40 %	40 %	357419223
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6999	NC_016148	GGT	2	6	406721	406726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419223
7000	NC_016148	AAG	2	6	406790	406795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419223

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