MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016148	CTC	2	6	349245	349250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419168
6002	NC_016148	AGG	2	6	349274	349279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419168
6003	NC_016148	ATT	2	6	349312	349317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419168
6004	NC_016148	TAAG	2	8	349354	349361	50 %	25 %	25 %	0 %	357419168
6005	NC_016148	TGG	2	6	349491	349496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419169
6006	NC_016148	AG	3	6	349536	349541	50 %	0 %	50 %	0 %	357419169
6007	NC_016148	TGGC	2	8	349592	349599	0 %	25 %	50 %	25 %	357419169
6008	NC_016148	GAG	2	6	349607	349612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419169
6009	NC_016148	AGGG	2	8	349619	349626	25 %	0 %	75 %	0 %	357419169
6010	NC_016148	ATT	2	6	349629	349634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419169
6011	NC_016148	T	7	7	349746	349752	0 %	100 %	0 %	0 %	357419170
6012	NC_016148	CTT	2	6	349843	349848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419170
6013	NC_016148	AG	3	6	349872	349877	50 %	0 %	50 %	0 %	357419170
6014	NC_016148	AAGGG	2	10	350029	350038	40 %	0 %	60 %	0 %	357419170
6015	NC_016148	GC	3	6	350166	350171	0 %	0 %	50 %	50 %	357419170
6016	NC_016148	CAGG	2	8	350205	350212	25 %	0 %	50 %	25 %	357419170
6017	NC_016148	CCG	2	6	350222	350227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419170
6018	NC_016148	TTC	2	6	350333	350338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419170
6019	NC_016148	G	6	6	350408	350413	0 %	0 %	100 %	0 %	357419170
6020	NC_016148	C	6	6	350480	350485	0 %	0 %	0 %	100 %	357419170
6021	NC_016148	AAGA	2	8	350556	350563	75 %	0 %	25 %	0 %	357419170
6022	NC_016148	GAC	2	6	350662	350667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419170
6023	NC_016148	T	6	6	350702	350707	0 %	100 %	0 %	0 %	357419170
6024	NC_016148	G	6	6	350806	350811	0 %	0 %	100 %	0 %	357419170
6025	NC_016148	AT	3	6	350837	350842	50 %	50 %	0 %	0 %	357419170
6026	NC_016148	ACC	2	6	350997	351002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419171
6027	NC_016148	AGCA	2	8	351006	351013	50 %	0 %	25 %	25 %	357419171
6028	NC_016148	GAA	2	6	351026	351031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419171
6029	NC_016148	AGGA	2	8	351055	351062	50 %	0 %	50 %	0 %	357419171
6030	NC_016148	ATC	2	6	351076	351081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419171
6031	NC_016148	GGC	2	6	351267	351272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419172
6032	NC_016148	CAT	2	6	351324	351329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419172
6033	NC_016148	TGG	2	6	351380	351385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419172
6034	NC_016148	A	7	7	351415	351421	100 %	0 %	0 %	0 %	357419172
6035	NC_016148	TGC	2	6	351422	351427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419172
6036	NC_016148	CAGC	2	8	351434	351441	25 %	0 %	25 %	50 %	357419172
6037	NC_016148	ATGAA	2	10	351558	351567	60 %	20 %	20 %	0 %	357419173
6038	NC_016148	TGCT	2	8	351597	351604	0 %	50 %	25 %	25 %	357419173
6039	NC_016148	GCT	2	6	351653	351658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6040	NC_016148	AG	3	6	351692	351697	50 %	0 %	50 %	0 %	357419173
6041	NC_016148	CTA	2	6	351704	351709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419173
6042	NC_016148	TTC	2	6	351725	351730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419173
6043	NC_016148	GT	3	6	351747	351752	0 %	50 %	50 %	0 %	357419173
6044	NC_016148	CAG	2	6	351761	351766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6045	NC_016148	TGC	2	6	351820	351825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6046	NC_016148	GGTAC	2	10	351833	351842	20 %	20 %	40 %	20 %	357419173
6047	NC_016148	CCTT	2	8	351921	351928	0 %	50 %	0 %	50 %	357419173
6048	NC_016148	AAT	2	6	351958	351963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419173
6049	NC_016148	ATA	2	6	352034	352039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419173
6050	NC_016148	GAA	3	9	352067	352075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419173
6051	NC_016148	ATA	2	6	352119	352124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419173
6052	NC_016148	TGG	2	6	352161	352166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419173
6053	NC_016148	GCT	2	6	352190	352195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6054	NC_016148	GCA	2	6	352220	352225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6055	NC_016148	TGC	2	6	352249	352254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419173
6056	NC_016148	CGAG	2	8	352306	352313	25 %	0 %	50 %	25 %	357419173
6057	NC_016148	G	6	6	352453	352458	0 %	0 %	100 %	0 %	357419173
6058	NC_016148	TTCT	2	8	352462	352469	0 %	75 %	0 %	25 %	357419173
6059	NC_016148	T	6	6	352478	352483	0 %	100 %	0 %	0 %	357419173
6060	NC_016148	GCG	2	6	352496	352501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419173
6061	NC_016148	AAG	2	6	352633	352638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419173
6062	NC_016148	GAA	2	6	352776	352781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419174
6063	NC_016148	TCC	2	6	353005	353010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419174
6064	NC_016148	TGC	2	6	353011	353016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419174
6065	NC_016148	GCC	2	6	353202	353207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419175
6066	NC_016148	T	6	6	353209	353214	0 %	100 %	0 %	0 %	357419175
6067	NC_016148	T	6	6	353315	353320	0 %	100 %	0 %	0 %	357419175
6068	NC_016148	GAA	2	6	353344	353349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419175
6069	NC_016148	GTG	2	6	353409	353414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419175
6070	NC_016148	TA	3	6	353422	353427	50 %	50 %	0 %	0 %	357419175
6071	NC_016148	TCCC	2	8	353510	353517	0 %	25 %	0 %	75 %	357419175
6072	NC_016148	ACC	2	6	353544	353549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419175
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6074	NC_016148	TTGG	2	8	353649	353656	0 %	50 %	50 %	0 %	357419175
6075	NC_016148	CAG	2	6	353663	353668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419175
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6077	NC_016148	TTCA	2	8	353835	353842	25 %	50 %	0 %	25 %	357419175
6078	NC_016148	ATA	2	6	353883	353888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419175
6079	NC_016148	ATAGCT	2	12	353919	353930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357419175
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6081	NC_016148	GGAGA	2	10	354020	354029	40 %	0 %	60 %	0 %	357419175
6082	NC_016148	AAT	2	6	354031	354036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419175
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6086	NC_016148	TATC	2	8	354125	354132	25 %	50 %	0 %	25 %	357419176
6087	NC_016148	GGTTG	2	10	354160	354169	0 %	40 %	60 %	0 %	357419176
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6091	NC_016148	CTT	2	6	354261	354266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419176
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6094	NC_016148	T	7	7	354363	354369	0 %	100 %	0 %	0 %	357419176
6095	NC_016148	GAA	2	6	354407	354412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419176
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6099	NC_016148	GT	3	6	354548	354553	0 %	50 %	50 %	0 %	357419176
6100	NC_016148	AGA	3	9	354585	354593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419176
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6102	NC_016148	TGC	2	6	354694	354699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419176
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6105	NC_016148	CT	3	6	354777	354782	0 %	50 %	0 %	50 %	357419176
6106	NC_016148	CTT	2	6	354837	354842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419176
6107	NC_016148	GCA	2	6	354878	354883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419176
6108	NC_016148	CT	3	6	354954	354959	0 %	50 %	0 %	50 %	357419176
6109	NC_016148	TGG	2	6	354969	354974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419176
6110	NC_016148	TCC	2	6	355026	355031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419176
6111	NC_016148	TAT	2	6	355057	355062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419176
6112	NC_016148	CT	3	6	355073	355078	0 %	50 %	0 %	50 %	357419176
6113	NC_016148	TTG	2	6	355156	355161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419176
6114	NC_016148	TCA	2	6	355191	355196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419177
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6119	NC_016148	TGT	2	6	355453	355458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419177
6120	NC_016148	T	6	6	355464	355469	0 %	100 %	0 %	0 %	357419177
6121	NC_016148	AAGG	2	8	355648	355655	50 %	0 %	50 %	0 %	357419177
6122	NC_016148	CCT	2	6	355656	355661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419177
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6124	NC_016148	GAGG	2	8	355854	355861	25 %	0 %	75 %	0 %	357419177
6125	NC_016148	ACG	2	6	355871	355876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419177
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6133	NC_016148	GCT	2	6	356668	356673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419178
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6135	NC_016148	AGT	2	6	356783	356788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419178
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6139	NC_016148	CGCTG	2	10	357027	357036	0 %	20 %	40 %	40 %	357419178
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6147	NC_016148	CTC	2	6	357441	357446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419178
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6151	NC_016148	AAACA	2	10	357633	357642	80 %	0 %	0 %	20 %	357419178
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6153	NC_016148	GGAA	2	8	357939	357946	50 %	0 %	50 %	0 %	357419179
6154	NC_016148	GGA	3	9	357970	357978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419179
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6233	NC_016148	TTG	2	6	362675	362680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419182
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6236	NC_016148	GTC	2	6	362795	362800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419182
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6238	NC_016148	TCA	2	6	362916	362921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419182
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6241	NC_016148	CAAC	2	8	363145	363152	50 %	0 %	0 %	50 %	357419182
6242	NC_016148	A	6	6	363155	363160	100 %	0 %	0 %	0 %	357419182
6243	NC_016148	C	6	6	363162	363167	0 %	0 %	0 %	100 %	357419182
6244	NC_016148	CTC	2	6	363172	363177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419182
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6492	NC_016148	GGA	2	6	377038	377043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419195
6493	NC_016148	GA	3	6	377123	377128	50 %	0 %	50 %	0 %	357419195
6494	NC_016148	AG	3	6	377130	377135	50 %	0 %	50 %	0 %	357419195
6495	NC_016148	GAAG	2	8	377191	377198	50 %	0 %	50 %	0 %	357419195
6496	NC_016148	GAA	2	6	377251	377256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419195
6497	NC_016148	GTC	2	6	377287	377292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419195
6498	NC_016148	GAA	2	6	377500	377505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419195
6499	NC_016148	AGA	3	9	377569	377577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419195
6500	NC_016148	AGGG	2	8	377624	377631	25 %	0 %	75 %	0 %	357419195

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