MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016148	GGA	2	6	289200	289205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5002	NC_016148	GAG	2	6	289327	289332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5003	NC_016148	AGG	2	6	289389	289394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5004	NC_016148	CTT	2	6	289444	289449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419119
5005	NC_016148	GGA	2	6	289476	289481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5006	NC_016148	GGA	2	6	289489	289494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5007	NC_016148	AGG	2	6	289545	289550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5008	NC_016148	AGGA	2	8	289572	289579	50 %	0 %	50 %	0 %	357419119
5009	NC_016148	AGG	2	6	289740	289745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419119
5010	NC_016148	GTA	2	6	289772	289777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419119
5011	NC_016148	AG	3	6	289826	289831	50 %	0 %	50 %	0 %	357419119
5012	NC_016148	GCC	2	6	290015	290020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419119
5013	NC_016148	ACCA	2	8	290039	290046	50 %	0 %	0 %	50 %	357419119
5014	NC_016148	T	6	6	290088	290093	0 %	100 %	0 %	0 %	357419119
5015	NC_016148	ATC	2	6	290099	290104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419119
5016	NC_016148	GCT	2	6	290210	290215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419119
5017	NC_016148	GAT	2	6	290281	290286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419119
5018	NC_016148	A	6	6	290328	290333	100 %	0 %	0 %	0 %	357419120
5019	NC_016148	CTG	2	6	290334	290339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419120
5020	NC_016148	CAG	2	6	290390	290395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419120
5021	NC_016148	GAA	2	6	290451	290456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419120
5022	NC_016148	GTT	2	6	290544	290549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419120
5023	NC_016148	TAA	2	6	290566	290571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419120
5024	NC_016148	TTGC	2	8	290619	290626	0 %	50 %	25 %	25 %	357419120
5025	NC_016148	GGA	2	6	290780	290785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419120
5026	NC_016148	A	6	6	290785	290790	100 %	0 %	0 %	0 %	357419120
5027	NC_016148	AG	3	6	290793	290798	50 %	0 %	50 %	0 %	357419120
5028	NC_016148	CTA	2	6	290820	290825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419120
5029	NC_016148	AAC	2	6	290857	290862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419120
5030	NC_016148	AAG	2	6	290882	290887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419120
5031	NC_016148	CAG	2	6	290935	290940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419120
5032	NC_016148	AGG	2	6	290941	290946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419120
5033	NC_016148	CCT	2	6	291029	291034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419120
5034	NC_016148	AT	3	6	291117	291122	50 %	50 %	0 %	0 %	357419120
5035	NC_016148	GGA	2	6	291131	291136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419120
5036	NC_016148	GCAG	2	8	291373	291380	25 %	0 %	50 %	25 %	357419120
5037	NC_016148	CTT	2	6	291516	291521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419121
5038	NC_016148	AAGCC	2	10	291525	291534	40 %	0 %	20 %	40 %	357419121
5039	NC_016148	CTT	2	6	291569	291574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419121
5040	NC_016148	TCT	2	6	291577	291582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419121
5041	NC_016148	ATC	2	6	291640	291645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419121
5042	NC_016148	A	6	6	291657	291662	100 %	0 %	0 %	0 %	357419121
5043	NC_016148	ACA	2	6	291712	291717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419121
5044	NC_016148	CTTTT	2	10	291728	291737	0 %	80 %	0 %	20 %	357419121
5045	NC_016148	TTACA	2	10	291803	291812	40 %	40 %	0 %	20 %	357419121
5046	NC_016148	TGA	2	6	291875	291880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419121
5047	NC_016148	TGA	2	6	291887	291892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419121
5048	NC_016148	CATGC	2	10	291928	291937	20 %	20 %	20 %	40 %	357419121
5049	NC_016148	CTT	2	6	291986	291991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419121
5050	NC_016148	TTC	2	6	292076	292081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419121
5051	NC_016148	CTTT	2	8	292213	292220	0 %	75 %	0 %	25 %	357419122
5052	NC_016148	TC	3	6	292354	292359	0 %	50 %	0 %	50 %	357419122
5053	NC_016148	CGT	2	6	292360	292365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419122
5054	NC_016148	CTG	2	6	292456	292461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419122
5055	NC_016148	CCTG	2	8	292466	292473	0 %	25 %	25 %	50 %	357419122
5056	NC_016148	ACC	2	6	292524	292529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419122
5057	NC_016148	CCA	2	6	292675	292680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419122
5058	NC_016148	ATC	2	6	292682	292687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419122
5059	NC_016148	TC	3	6	292686	292691	0 %	50 %	0 %	50 %	357419122
5060	NC_016148	CAC	2	6	292895	292900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419122
5061	NC_016148	CTT	2	6	293061	293066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419123
5062	NC_016148	CTT	2	6	293078	293083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419123
5063	NC_016148	ACT	2	6	293201	293206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419123
5064	NC_016148	TGC	2	6	293212	293217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419123
5065	NC_016148	ATGA	2	8	293230	293237	50 %	25 %	25 %	0 %	357419123
5066	NC_016148	CCTT	2	8	293243	293250	0 %	50 %	0 %	50 %	357419123
5067	NC_016148	GCT	2	6	293333	293338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419123
5068	NC_016148	TC	3	6	293379	293384	0 %	50 %	0 %	50 %	357419123
5069	NC_016148	TGC	2	6	293434	293439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419123
5070	NC_016148	AG	3	6	293448	293453	50 %	0 %	50 %	0 %	357419123
5071	NC_016148	TGC	2	6	293471	293476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419123
5072	NC_016148	CCT	2	6	293569	293574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419123
5073	NC_016148	CTTTTG	2	12	293625	293636	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	357419123
5074	NC_016148	GAA	2	6	293702	293707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419123
5075	NC_016148	TCG	2	6	293726	293731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419123
5076	NC_016148	ATTT	2	8	293846	293853	25 %	75 %	0 %	0 %	357419124
5077	NC_016148	ATTGG	2	10	293863	293872	20 %	40 %	40 %	0 %	357419124
5078	NC_016148	GT	3	6	293897	293902	0 %	50 %	50 %	0 %	357419124
5079	NC_016148	TCT	2	6	293961	293966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419124
5080	NC_016148	AGC	2	6	293978	293983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419124
5081	NC_016148	CTT	2	6	293999	294004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419124
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5084	NC_016148	GGT	2	6	294089	294094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419124
5085	NC_016148	CTG	2	6	294126	294131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419124
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5087	NC_016148	ACG	2	6	294315	294320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419124
5088	NC_016148	TGG	2	6	294344	294349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419124
5089	NC_016148	ATC	2	6	294351	294356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419124
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5092	NC_016148	ATG	2	6	294492	294497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419124
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5094	NC_016148	C	6	6	294579	294584	0 %	0 %	0 %	100 %	357419124
5095	NC_016148	GTT	2	6	294620	294625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419124
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5100	NC_016148	CCG	2	6	295061	295066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419125
5101	NC_016148	TTGC	2	8	295093	295100	0 %	50 %	25 %	25 %	357419125
5102	NC_016148	AGT	3	9	295221	295229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419125
5103	NC_016148	CCT	2	6	295254	295259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419125
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5105	NC_016148	TGC	2	6	295277	295282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419125
5106	NC_016148	GCC	2	6	295345	295350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419125
5107	NC_016148	CATC	2	8	295368	295375	25 %	25 %	0 %	50 %	357419125
5108	NC_016148	AG	3	6	295382	295387	50 %	0 %	50 %	0 %	357419125
5109	NC_016148	CCA	2	6	295560	295565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419125
5110	NC_016148	CTT	2	6	295608	295613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419125
5111	NC_016148	CAA	2	6	295615	295620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419125
5112	NC_016148	AGA	2	6	295746	295751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419126
5113	NC_016148	TTC	2	6	295752	295757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419126
5114	NC_016148	TGC	2	6	295789	295794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419126
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5116	NC_016148	GGC	2	6	295861	295866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419126
5117	NC_016148	ATC	2	6	295988	295993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419126
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5119	NC_016148	GAT	2	6	296095	296100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419126
5120	NC_016148	AGG	2	6	296152	296157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419126
5121	NC_016148	AGG	2	6	296213	296218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419126
5122	NC_016148	ATG	2	6	296225	296230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419126
5123	NC_016148	CCA	2	6	296339	296344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419126
5124	NC_016148	CCAC	2	8	296351	296358	25 %	0 %	0 %	75 %	357419126
5125	NC_016148	ATC	2	6	296372	296377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419126
5126	NC_016148	TGG	2	6	296385	296390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419126
5127	NC_016148	CCT	2	6	296403	296408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419126
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5130	NC_016148	TGA	2	6	296553	296558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419126
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5132	NC_016148	TTTG	2	8	296692	296699	0 %	75 %	25 %	0 %	357419126
5133	NC_016148	CAC	2	6	296755	296760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419126
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5137	NC_016148	CTT	3	9	296908	296916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419126
5138	NC_016148	CCG	2	6	296928	296933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419126
5139	NC_016148	T	6	6	296949	296954	0 %	100 %	0 %	0 %	357419126
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5143	NC_016148	GGT	2	6	297396	297401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419127
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5145	NC_016148	GGTGC	2	10	297475	297484	0 %	20 %	60 %	20 %	357419127
5146	NC_016148	CCAG	2	8	297490	297497	25 %	0 %	25 %	50 %	357419127
5147	NC_016148	GT	3	6	297574	297579	0 %	50 %	50 %	0 %	357419127
5148	NC_016148	TG	3	6	297618	297623	0 %	50 %	50 %	0 %	357419127
5149	NC_016148	TCTTTT	2	12	297691	297702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	357419127
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5151	NC_016148	T	6	6	297733	297738	0 %	100 %	0 %	0 %	357419127
5152	NC_016148	ATG	2	6	297739	297744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419127
5153	NC_016148	T	6	6	297843	297848	0 %	100 %	0 %	0 %	357419127
5154	NC_016148	TTCCT	2	10	297858	297867	0 %	60 %	0 %	40 %	357419127
5155	NC_016148	AAC	2	6	297876	297881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419127
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5158	NC_016148	TCT	2	6	298051	298056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419127
5159	NC_016148	TATC	2	8	298094	298101	25 %	50 %	0 %	25 %	357419127
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5161	NC_016148	GAAT	2	8	298130	298137	50 %	25 %	25 %	0 %	357419127
5162	NC_016148	CAT	2	6	298202	298207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419127
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5221	NC_016148	GGCA	2	8	301174	301181	25 %	0 %	50 %	25 %	357419130
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5224	NC_016148	CAAA	2	8	301273	301280	75 %	0 %	0 %	25 %	357419130
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5230	NC_016148	TGC	2	6	301525	301530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419130
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5233	NC_016148	TAT	2	6	301591	301596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419130
5234	NC_016148	ATG	2	6	301649	301654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419130
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5237	NC_016148	GGT	2	6	301758	301763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419130
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5239	NC_016148	GGT	2	6	301900	301905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419130
5240	NC_016148	AGAT	2	8	301919	301926	50 %	25 %	25 %	0 %	357419130
5241	NC_016148	GGA	2	6	301933	301938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419130
5242	NC_016148	AAT	2	6	301939	301944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419130
5243	NC_016148	TGAAT	2	10	301989	301998	40 %	40 %	20 %	0 %	357419130
5244	NC_016148	TA	4	8	302002	302009	50 %	50 %	0 %	0 %	357419130
5245	NC_016148	AAG	2	6	302023	302028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419130
5246	NC_016148	TCC	2	6	302072	302077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419130
5247	NC_016148	GCTT	2	8	302115	302122	0 %	50 %	25 %	25 %	357419130
5248	NC_016148	AGGA	2	8	302131	302138	50 %	0 %	50 %	0 %	357419130
5249	NC_016148	AGCC	2	8	302153	302160	25 %	0 %	25 %	50 %	357419130
5250	NC_016148	TCC	2	6	302287	302292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419130
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5258	NC_016148	G	6	6	302959	302964	0 %	0 %	100 %	0 %	357419131
5259	NC_016148	GATA	2	8	303121	303128	50 %	25 %	25 %	0 %	357419131
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5261	NC_016148	GAT	2	6	303218	303223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419131
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5348	NC_016148	GCAG	2	8	309163	309170	25 %	0 %	50 %	25 %	357419135
5349	NC_016148	GA	3	6	309197	309202	50 %	0 %	50 %	0 %	357419135
5350	NC_016148	GA	3	6	309222	309227	50 %	0 %	50 %	0 %	357419135
5351	NC_016148	GTG	2	6	309239	309244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419135
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5353	NC_016148	GCCC	2	8	309346	309353	0 %	0 %	25 %	75 %	357419135
5354	NC_016148	GGC	2	6	309367	309372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419135
5355	NC_016148	TGA	2	6	309411	309416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419135
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5357	NC_016148	GAA	2	6	309428	309433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419135
5358	NC_016148	ACT	2	6	309451	309456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419135
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5360	NC_016148	ACGGC	2	10	309537	309546	20 %	0 %	40 %	40 %	357419135
5361	NC_016148	AG	3	6	309589	309594	50 %	0 %	50 %	0 %	357419135
5362	NC_016148	TCC	2	6	309666	309671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419136
5363	NC_016148	AT	3	6	309697	309702	50 %	50 %	0 %	0 %	357419136
5364	NC_016148	AGGAC	2	10	309776	309785	40 %	0 %	40 %	20 %	357419136
5365	NC_016148	TA	3	6	309802	309807	50 %	50 %	0 %	0 %	357419136
5366	NC_016148	CT	3	6	309892	309897	0 %	50 %	0 %	50 %	357419136
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5368	NC_016148	TGG	2	6	310017	310022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419136
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5372	NC_016148	TTC	2	6	310144	310149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419136
5373	NC_016148	CTG	2	6	310214	310219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419136
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5381	NC_016148	GA	3	6	311116	311121	50 %	0 %	50 %	0 %	357419137
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5389	NC_016148	TGG	2	6	311710	311715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419138
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5483	NC_016148	TCCA	2	8	318274	318281	25 %	25 %	0 %	50 %	357419141
5484	NC_016148	GCT	2	6	318287	318292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419141
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