MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016148	ATGA	2	8	254134	254141	50 %	25 %	25 %	0 %	357419089
4502	NC_016148	T	6	6	254253	254258	0 %	100 %	0 %	0 %	357419089
4503	NC_016148	TGA	2	6	254291	254296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419089
4504	NC_016148	GTTT	2	8	254407	254414	0 %	75 %	25 %	0 %	357419090
4505	NC_016148	A	6	6	254418	254423	100 %	0 %	0 %	0 %	357419090
4506	NC_016148	AGA	2	6	254449	254454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419090
4507	NC_016148	A	6	6	254507	254512	100 %	0 %	0 %	0 %	357419090
4508	NC_016148	GCG	2	6	254528	254533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419090
4509	NC_016148	CCT	2	6	254540	254545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419090
4510	NC_016148	TGT	2	6	254611	254616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419090
4511	NC_016148	TTC	2	6	254717	254722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419090
4512	NC_016148	AGG	2	6	254778	254783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419090
4513	NC_016148	A	6	6	254806	254811	100 %	0 %	0 %	0 %	357419091
4514	NC_016148	A	6	6	254813	254818	100 %	0 %	0 %	0 %	357419091
4515	NC_016148	GA	3	6	254819	254824	50 %	0 %	50 %	0 %	357419091
4516	NC_016148	TAT	2	6	254926	254931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419091
4517	NC_016148	T	6	6	254996	255001	0 %	100 %	0 %	0 %	357419091
4518	NC_016148	GAA	2	6	255034	255039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419091
4519	NC_016148	AAG	2	6	255095	255100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419091
4520	NC_016148	TCC	2	6	255159	255164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419091
4521	NC_016148	TCC	2	6	255261	255266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419091
4522	NC_016148	TGC	2	6	255395	255400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419091
4523	NC_016148	TGG	2	6	255441	255446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419091
4524	NC_016148	T	6	6	255450	255455	0 %	100 %	0 %	0 %	357419091
4525	NC_016148	TTG	2	6	255556	255561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419091
4526	NC_016148	TAG	2	6	255591	255596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419091
4527	NC_016148	AGG	2	6	255640	255645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419091
4528	NC_016148	AAAG	2	8	255683	255690	75 %	0 %	25 %	0 %	357419092
4529	NC_016148	AAG	2	6	255701	255706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419092
4530	NC_016148	GAA	2	6	255765	255770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419092
4531	NC_016148	T	6	6	255835	255840	0 %	100 %	0 %	0 %	357419092
4532	NC_016148	GAA	2	6	255863	255868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419092
4533	NC_016148	TGG	2	6	255917	255922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419092
4534	NC_016148	AAG	2	6	255943	255948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419092
4535	NC_016148	TA	3	6	255966	255971	50 %	50 %	0 %	0 %	357419093
4536	NC_016148	A	6	6	255983	255988	100 %	0 %	0 %	0 %	357419093
4537	NC_016148	AT	3	6	256058	256063	50 %	50 %	0 %	0 %	357419093
4538	NC_016148	A	7	7	256078	256084	100 %	0 %	0 %	0 %	357419093
4539	NC_016148	TA	3	6	256088	256093	50 %	50 %	0 %	0 %	357419093
4540	NC_016148	GAA	2	6	258280	258285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419094
4541	NC_016148	GAA	2	6	258306	258311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419094
4542	NC_016148	GCC	2	6	258340	258345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419094
4543	NC_016148	GAAA	2	8	258355	258362	75 %	0 %	25 %	0 %	357419094
4544	NC_016148	GGGA	2	8	258385	258392	25 %	0 %	75 %	0 %	357419094
4545	NC_016148	TGG	2	6	258400	258405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419094
4546	NC_016148	AG	3	6	258479	258484	50 %	0 %	50 %	0 %	357419095
4547	NC_016148	GAT	2	6	258512	258517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419095
4548	NC_016148	CTC	2	6	258529	258534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419095
4549	NC_016148	GCA	2	6	258589	258594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419095
4550	NC_016148	CCG	2	6	258597	258602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357419095
4551	NC_016148	TGG	2	6	258622	258627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419095
4552	NC_016148	GAT	2	6	258668	258673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419095
4553	NC_016148	T	7	7	258719	258725	0 %	100 %	0 %	0 %	357419095
4554	NC_016148	CAGG	2	8	258742	258749	25 %	0 %	50 %	25 %	357419095
4555	NC_016148	GAAG	2	8	258787	258794	50 %	0 %	50 %	0 %	357419095
4556	NC_016148	GAA	2	6	258860	258865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419095
4557	NC_016148	T	6	6	258881	258886	0 %	100 %	0 %	0 %	357419095
4558	NC_016148	CTT	2	6	258966	258971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419095
4559	NC_016148	AGG	2	6	258991	258996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419095
4560	NC_016148	TTC	2	6	259011	259016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419095
4561	NC_016148	AT	3	6	259059	259064	50 %	50 %	0 %	0 %	357419095
4562	NC_016148	TGT	2	6	259471	259476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419096
4563	NC_016148	A	7	7	259487	259493	100 %	0 %	0 %	0 %	357419096
4564	NC_016148	A	6	6	259498	259503	100 %	0 %	0 %	0 %	357419096
4565	NC_016148	GAC	2	6	259514	259519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419096
4566	NC_016148	TTGC	2	8	259593	259600	0 %	50 %	25 %	25 %	357419096
4567	NC_016148	TAC	2	6	259670	259675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419096
4568	NC_016148	GGA	2	6	259804	259809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419096
4569	NC_016148	CTAAAA	2	12	259842	259853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	357419096
4570	NC_016148	TGG	2	6	259863	259868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419096
4571	NC_016148	GGGAA	2	10	259898	259907	40 %	0 %	60 %	0 %	357419096
4572	NC_016148	TCT	2	6	259913	259918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419096
4573	NC_016148	AGA	2	6	259960	259965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419096
4574	NC_016148	TTTG	2	8	259966	259973	0 %	75 %	25 %	0 %	357419096
4575	NC_016148	GA	3	6	259974	259979	50 %	0 %	50 %	0 %	357419096
4576	NC_016148	GAA	2	6	260073	260078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357419096
4577	NC_016148	ATG	2	6	260110	260115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419096
4578	NC_016148	TTA	2	6	260138	260143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419097
4579	NC_016148	TCC	2	6	260157	260162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419097
4580	NC_016148	TAT	2	6	260267	260272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419097
4581	NC_016148	GGGCC	2	10	260313	260322	0 %	0 %	60 %	40 %	357419097
4582	NC_016148	CT	3	6	260394	260399	0 %	50 %	0 %	50 %	357419097
4583	NC_016148	AT	3	6	260546	260551	50 %	50 %	0 %	0 %	357419097
4584	NC_016148	ACT	2	6	260598	260603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419097
4585	NC_016148	GCT	2	6	260623	260628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419097
4586	NC_016148	TCT	2	6	260694	260699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419097
4587	NC_016148	CTT	2	6	260755	260760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419097
4588	NC_016148	TTA	2	6	260887	260892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419097
4589	NC_016148	TA	4	8	261166	261173	50 %	50 %	0 %	0 %	357419098
4590	NC_016148	CGG	2	6	261199	261204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419098
4591	NC_016148	TC	3	6	261234	261239	0 %	50 %	0 %	50 %	357419098
4592	NC_016148	GTG	2	6	261248	261253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419098
4593	NC_016148	TGG	2	6	261268	261273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419098
4594	NC_016148	GCG	2	6	261282	261287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357419098
4595	NC_016148	A	6	6	261321	261326	100 %	0 %	0 %	0 %	357419098
4596	NC_016148	CTGC	2	8	261361	261368	0 %	25 %	25 %	50 %	357419098
4597	NC_016148	A	6	6	261461	261466	100 %	0 %	0 %	0 %	357419098
4598	NC_016148	TTA	2	6	261477	261482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419098
4599	NC_016148	TAC	2	6	261580	261585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419099
4600	NC_016148	ACT	2	6	261593	261598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419099
4601	NC_016148	AT	3	6	261608	261613	50 %	50 %	0 %	0 %	357419099
4602	NC_016148	TCC	2	6	261631	261636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419099
4603	NC_016148	TGG	2	6	261663	261668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419099
4604	NC_016148	A	6	6	261700	261705	100 %	0 %	0 %	0 %	357419099
4605	NC_016148	AGG	2	6	261754	261759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419099
4606	NC_016148	TCC	2	6	261812	261817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419099
4607	NC_016148	GGA	2	6	261974	261979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419099
4608	NC_016148	GCTG	2	8	262012	262019	0 %	25 %	50 %	25 %	357419099
4609	NC_016148	CTT	2	6	262082	262087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419099
4610	NC_016148	AGC	2	6	262093	262098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419099
4611	NC_016148	CTT	2	6	262134	262139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419099
4612	NC_016148	TGG	2	6	262212	262217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419099
4613	NC_016148	GT	3	6	262241	262246	0 %	50 %	50 %	0 %	357419099
4614	NC_016148	TGA	2	6	262257	262262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419099
4615	NC_016148	CATACG	2	12	262290	262301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357419099
4616	NC_016148	AGG	2	6	262375	262380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419099
4617	NC_016148	AAT	2	6	262381	262386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419099
4618	NC_016148	ATA	2	6	262406	262411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419099
4619	NC_016148	CTT	2	6	262436	262441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419100
4620	NC_016148	T	6	6	262440	262445	0 %	100 %	0 %	0 %	357419100
4621	NC_016148	CTTTT	2	10	262457	262466	0 %	80 %	0 %	20 %	357419100
4622	NC_016148	CGT	2	6	262469	262474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419100
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4624	NC_016148	TGA	2	6	262515	262520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419100
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4747	NC_016148	ATC	2	6	270254	270259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419105
4748	NC_016148	TCA	2	6	270326	270331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419105
4749	NC_016148	CTT	2	6	270372	270377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357419105
4750	NC_016148	ATA	2	6	270391	270396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419105
4751	NC_016148	GA	3	6	270638	270643	50 %	0 %	50 %	0 %	357419106
4752	NC_016148	AT	3	6	270668	270673	50 %	50 %	0 %	0 %	357419106
4753	NC_016148	ACG	2	6	270725	270730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419106
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4756	NC_016148	TCC	2	6	270859	270864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419106
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4758	NC_016148	TTG	2	6	271102	271107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419106
4759	NC_016148	GAT	2	6	271210	271215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419106
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4762	NC_016148	TG	3	6	271327	271332	0 %	50 %	50 %	0 %	357419106
4763	NC_016148	ATT	2	6	271335	271340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357419106
4764	NC_016148	AATA	2	8	271357	271364	75 %	25 %	0 %	0 %	357419106
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4766	NC_016148	ATC	2	6	271405	271410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419107
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4769	NC_016148	GTC	2	6	271574	271579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419107
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4774	NC_016148	AG	5	10	271795	271804	50 %	0 %	50 %	0 %	357419107
4775	NC_016148	T	6	6	271809	271814	0 %	100 %	0 %	0 %	357419107
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4779	NC_016148	T	7	7	271935	271941	0 %	100 %	0 %	0 %	357419107
4780	NC_016148	GGT	2	6	272003	272008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357419107
4781	NC_016148	TAA	2	6	272016	272021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357419107
4782	NC_016148	TTCT	2	8	272026	272033	0 %	75 %	0 %	25 %	357419107
4783	NC_016148	GCT	2	6	272037	272042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357419107
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4786	NC_016148	GCA	2	6	272217	272222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357419107
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4819	NC_016148	AGAGG	2	10	274157	274166	40 %	0 %	60 %	0 %	357419109
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4825	NC_016148	A	8	8	274443	274450	100 %	0 %	0 %	0 %	357419110
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4835	NC_016148	GA	3	6	274953	274958	50 %	0 %	50 %	0 %	357419111
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4853	NC_016148	AAGGA	2	10	276025	276034	60 %	0 %	40 %	0 %	357419111
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4856	NC_016148	AAGCG	2	10	276192	276201	40 %	0 %	40 %	20 %	357419111
4857	NC_016148	TTTCC	2	10	276263	276272	0 %	60 %	0 %	40 %	357419111
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4860	NC_016148	CAT	2	6	276431	276436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357419111
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4862	NC_016148	TAG	2	6	276533	276538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357419111
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4866	NC_016148	GGA	2	6	276680	276685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357419111
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4868	NC_016148	CG	3	6	276808	276813	0 %	0 %	50 %	50 %	357419111
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4992	NC_016148	TC	3	6	288738	288743	0 %	50 %	0 %	50 %	357419119
4993	NC_016148	T	6	6	288745	288750	0 %	100 %	0 %	0 %	357419119
4994	NC_016148	TCTT	2	8	288759	288766	0 %	75 %	0 %	25 %	357419119
4995	NC_016148	TTG	2	6	288795	288800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419119
4996	NC_016148	GATTG	2	10	288829	288838	20 %	40 %	40 %	0 %	357419119
4997	NC_016148	CCT	2	6	288868	288873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357419119
4998	NC_016148	ACC	2	6	288905	288910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357419119
4999	NC_016148	TTG	2	6	288956	288961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357419119
5000	NC_016148	AAC	2	6	289060	289065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357419119

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