MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus tenax Kra 1

Total Repeats: 37187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016070	GC	3	6	141	146	0 %	0 %	50 %	50 %	352681235
2	NC_016070	GAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681235
3	NC_016070	ACT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681235
4	NC_016070	GTA	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681235
5	NC_016070	AGA	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681235
6	NC_016070	CGG	2	6	260	265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681235
7	NC_016070	TTC	2	6	299	304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681235
8	NC_016070	GGA	3	9	397	405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681235
9	NC_016070	AG	3	6	423	428	50 %	0 %	50 %	0 %	352681235
10	NC_016070	AG	3	6	461	466	50 %	0 %	50 %	0 %	352681235
11	NC_016070	AGTT	2	8	513	520	25 %	50 %	25 %	0 %	352681235
12	NC_016070	AT	3	6	550	555	50 %	50 %	0 %	0 %	352681235
13	NC_016070	ATA	2	6	583	588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681235
14	NC_016070	CCG	2	6	632	637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681236
15	NC_016070	GAG	2	6	643	648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681236
16	NC_016070	CGC	2	6	698	703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681236
17	NC_016070	AG	3	6	712	717	50 %	0 %	50 %	0 %	352681236
18	NC_016070	GTA	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681236
19	NC_016070	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681236
20	NC_016070	TTG	2	6	766	771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681236
21	NC_016070	AG	3	6	787	792	50 %	0 %	50 %	0 %	352681236
22	NC_016070	GGT	2	6	797	802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681236
23	NC_016070	ATA	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681236
24	NC_016070	GAG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681236
25	NC_016070	GTC	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681236
26	NC_016070	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681236
27	NC_016070	GAG	3	9	955	963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681236
28	NC_016070	GCTC	2	8	1022	1029	0 %	25 %	25 %	50 %	352681236
29	NC_016070	AAT	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681236
30	NC_016070	CGG	2	6	1193	1198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681236
31	NC_016070	AT	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	352681236
32	NC_016070	GCC	2	6	1366	1371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681236
33	NC_016070	CGG	2	6	1481	1486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681236
34	NC_016070	CCG	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681236
35	NC_016070	GAG	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681236
36	NC_016070	AAG	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681237
37	NC_016070	A	6	6	1630	1635	100 %	0 %	0 %	0 %	352681237
38	NC_016070	TA	3	6	1651	1656	50 %	50 %	0 %	0 %	352681237
39	NC_016070	CCG	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681237
40	NC_016070	AG	3	6	1732	1737	50 %	0 %	50 %	0 %	352681237
41	NC_016070	TC	3	6	1890	1895	0 %	50 %	0 %	50 %	352681237
42	NC_016070	CA	3	6	1941	1946	50 %	0 %	0 %	50 %	352681237
43	NC_016070	ATG	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681237
44	NC_016070	AT	3	6	2104	2109	50 %	50 %	0 %	0 %	352681238
45	NC_016070	C	6	6	2180	2185	0 %	0 %	0 %	100 %	352681238
46	NC_016070	CA	4	8	2194	2201	50 %	0 %	0 %	50 %	352681238
47	NC_016070	ATA	3	9	2213	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681238
48	NC_016070	GCG	2	6	2247	2252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681238
49	NC_016070	CGG	2	6	2253	2258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681238
50	NC_016070	CA	3	6	2261	2266	50 %	0 %	0 %	50 %	352681238
51	NC_016070	GA	3	6	2288	2293	50 %	0 %	50 %	0 %	352681238
52	NC_016070	CAC	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681238
53	NC_016070	CTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681238
54	NC_016070	TGG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681238
55	NC_016070	CAC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681238
56	NC_016070	CT	3	6	2599	2604	0 %	50 %	0 %	50 %	352681238
57	NC_016070	GAG	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681238
58	NC_016070	G	6	6	2740	2745	0 %	0 %	100 %	0 %	352681238
59	NC_016070	CGA	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681238
60	NC_016070	GA	3	6	2807	2812	50 %	0 %	50 %	0 %	352681238
61	NC_016070	CTT	2	6	2830	2835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681238
62	NC_016070	CTT	2	6	2877	2882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681239
63	NC_016070	ACA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681239
64	NC_016070	TC	3	6	2908	2913	0 %	50 %	0 %	50 %	352681239
65	NC_016070	CCT	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681239
66	NC_016070	GGC	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681239
67	NC_016070	CGT	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681239
68	NC_016070	AGG	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681239
69	NC_016070	CCTC	2	8	3135	3142	0 %	25 %	0 %	75 %	352681239
70	NC_016070	CGG	2	6	3171	3176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681239
71	NC_016070	AGA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681239
72	NC_016070	CCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681239
73	NC_016070	GACG	2	8	3256	3263	25 %	0 %	50 %	25 %	352681239
74	NC_016070	GAG	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681239
75	NC_016070	CGC	2	6	3283	3288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681239
76	NC_016070	CCG	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681239
77	NC_016070	GAAGCG	2	12	3424	3435	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	352681239
78	NC_016070	GCG	2	6	3438	3443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681239
79	NC_016070	AGGG	2	8	3524	3531	25 %	0 %	75 %	0 %	352681239
80	NC_016070	CGG	2	6	3571	3576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681239
81	NC_016070	CTGA	2	8	3614	3621	25 %	25 %	25 %	25 %	352681239
82	NC_016070	CCG	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681239
83	NC_016070	GCC	2	6	3682	3687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681239
84	NC_016070	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681239
85	NC_016070	CTCC	2	8	3807	3814	0 %	25 %	0 %	75 %	352681239
86	NC_016070	CT	3	6	3856	3861	0 %	50 %	0 %	50 %	352681239
87	NC_016070	TGT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681239
88	NC_016070	GAG	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681239
89	NC_016070	GCG	2	6	3940	3945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681239
90	NC_016070	GAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681239
91	NC_016070	GC	3	6	3965	3970	0 %	0 %	50 %	50 %	352681239
92	NC_016070	AGT	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681239
93	NC_016070	GAC	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681239
94	NC_016070	TC	3	6	4146	4151	0 %	50 %	0 %	50 %	352681240
95	NC_016070	TCC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681240
96	NC_016070	TA	3	6	4330	4335	50 %	50 %	0 %	0 %	352681240
97	NC_016070	CT	3	6	4340	4345	0 %	50 %	0 %	50 %	352681240
98	NC_016070	CCT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681240
99	NC_016070	CCT	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681240
100	NC_016070	CGAGGT	2	12	4368	4379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	352681240
101	NC_016070	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681240
102	NC_016070	CTC	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681240
103	NC_016070	AG	3	6	4514	4519	50 %	0 %	50 %	0 %	352681240
104	NC_016070	TGT	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681240
105	NC_016070	GCC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681240
106	NC_016070	GCC	2	6	4637	4642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681240
107	NC_016070	AT	3	6	4666	4671	50 %	50 %	0 %	0 %	352681240
108	NC_016070	CT	4	8	4716	4723	0 %	50 %	0 %	50 %	352681240
109	NC_016070	CG	3	6	4724	4729	0 %	0 %	50 %	50 %	352681240
110	NC_016070	CTC	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681240
111	NC_016070	TCT	2	6	4834	4839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681241
112	NC_016070	AGA	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681241
113	NC_016070	GA	3	6	5039	5044	50 %	0 %	50 %	0 %	352681241
114	NC_016070	AGT	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681241
115	NC_016070	GA	3	6	5065	5070	50 %	0 %	50 %	0 %	352681241
116	NC_016070	AAG	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681241
117	NC_016070	GGC	2	6	5198	5203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681241
118	NC_016070	GGCG	2	8	5235	5242	0 %	0 %	75 %	25 %	352681241
119	NC_016070	CCA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681241
120	NC_016070	GC	3	6	5329	5334	0 %	0 %	50 %	50 %	352681241
121	NC_016070	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	352681241
122	NC_016070	GGC	2	6	5434	5439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681241
123	NC_016070	ATC	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681241
124	NC_016070	GCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681241
125	NC_016070	ACA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681241
126	NC_016070	TTGC	2	8	5555	5562	0 %	50 %	25 %	25 %	352681241
127	NC_016070	A	6	6	5581	5586	100 %	0 %	0 %	0 %	352681241
128	NC_016070	TGA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681241
129	NC_016070	GGA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681241
130	NC_016070	CT	3	6	5683	5688	0 %	50 %	0 %	50 %	352681241
131	NC_016070	ATT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352681241
132	NC_016070	AGGCCA	2	12	5934	5945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681241
133	NC_016070	CAA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681241
134	NC_016070	CAC	2	6	5974	5979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681241
135	NC_016070	AGT	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352681241
136	NC_016070	GTG	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352681241
137	NC_016070	ACG	2	6	6234	6239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681242
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269	NC_016070	GGCG	2	8	14801	14808	0 %	0 %	75 %	25 %	352681251
270	NC_016070	TA	3	6	15021	15026	50 %	50 %	0 %	0 %	352681251
271	NC_016070	CGG	2	6	15083	15088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
272	NC_016070	TGT	2	6	15124	15129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352681251
273	NC_016070	ATT	2	6	15137	15142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352681251
274	NC_016070	TCG	2	6	15181	15186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681251
275	NC_016070	TAC	2	6	15197	15202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681251
276	NC_016070	AGG	2	6	15218	15223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681251
277	NC_016070	GGC	2	6	15243	15248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
278	NC_016070	CCG	2	6	15250	15255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681251
279	NC_016070	GGC	3	9	15276	15284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
280	NC_016070	GGC	2	6	15309	15314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
281	NC_016070	AGGCTC	2	12	15332	15343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	352681251
282	NC_016070	GGC	2	6	15348	15353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
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284	NC_016070	GCG	2	6	15385	15390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681251
285	NC_016070	CGC	2	6	15423	15428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681252
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287	NC_016070	G	6	6	15548	15553	0 %	0 %	100 %	0 %	352681252
288	NC_016070	GGC	2	6	15581	15586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681252
289	NC_016070	CAA	2	6	15613	15618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681252
290	NC_016070	AG	3	6	15691	15696	50 %	0 %	50 %	0 %	352681252
291	NC_016070	ACT	2	6	15708	15713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681252
292	NC_016070	CATA	2	8	15741	15748	50 %	25 %	0 %	25 %	352681252
293	NC_016070	GCC	2	6	15754	15759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681252
294	NC_016070	TAC	2	6	15779	15784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352681252
295	NC_016070	AT	3	6	15808	15813	50 %	50 %	0 %	0 %	352681252
296	NC_016070	CCG	2	6	15819	15824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681252
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299	NC_016070	AAT	2	6	15952	15957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681252
300	NC_016070	GGA	2	6	15975	15980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681252
301	NC_016070	TC	3	6	16420	16425	0 %	50 %	0 %	50 %	352681253
302	NC_016070	AGGG	2	8	16543	16550	25 %	0 %	75 %	0 %	352681253
303	NC_016070	AG	3	6	16577	16582	50 %	0 %	50 %	0 %	352681253
304	NC_016070	TAA	2	6	16587	16592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352681253
305	NC_016070	GAA	2	6	16624	16629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352681253
306	NC_016070	CGT	2	6	16645	16650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681253
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309	NC_016070	TC	3	6	16710	16715	0 %	50 %	0 %	50 %	352681253
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320	NC_016070	CAA	2	6	17529	17534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352681254
321	NC_016070	TA	3	6	17540	17545	50 %	50 %	0 %	0 %	352681254
322	NC_016070	ACC	2	6	17594	17599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681254
323	NC_016070	CATAC	2	10	17609	17618	40 %	20 %	0 %	40 %	352681254
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329	NC_016070	AGG	2	6	17833	17838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681255
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332	NC_016070	CGC	2	6	18132	18137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681256
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338	NC_016070	AT	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	352681256
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344	NC_016070	CTC	2	6	18744	18749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681256
345	NC_016070	CT	3	6	18765	18770	0 %	50 %	0 %	50 %	352681256
346	NC_016070	TCC	2	6	18785	18790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681256
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390	NC_016070	GAG	2	6	21212	21217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681258
391	NC_016070	CG	3	6	21310	21315	0 %	0 %	50 %	50 %	352681258
392	NC_016070	AG	3	6	21652	21657	50 %	0 %	50 %	0 %	352681259
393	NC_016070	GTC	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681259
394	NC_016070	CCCT	2	8	21836	21843	0 %	25 %	0 %	75 %	352681259
395	NC_016070	CGC	2	6	21850	21855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352681259
396	NC_016070	AGC	2	6	22079	22084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681259
397	NC_016070	ACG	2	6	22133	22138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352681259
398	NC_016070	CG	3	6	22206	22211	0 %	0 %	50 %	50 %	352681259
399	NC_016070	GTC	2	6	22214	22219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352681259
400	NC_016070	CG	3	6	22230	22235	0 %	0 %	50 %	50 %	352681259
401	NC_016070	CCT	2	6	22248	22253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681259
402	NC_016070	TC	3	6	22268	22273	0 %	50 %	0 %	50 %	352681259
403	NC_016070	ATATT	2	10	22292	22301	40 %	60 %	0 %	0 %	352681259
404	NC_016070	GGA	2	6	22303	22308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352681259
405	NC_016070	CCA	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352681259
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410	NC_016070	CT	4	8	23195	23202	0 %	50 %	0 %	50 %	352681260
411	NC_016070	CTT	2	6	23209	23214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681260
412	NC_016070	TCT	3	9	23226	23234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352681260
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418	NC_016070	CTCTAT	2	12	23776	23787	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	352681260
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422	NC_016070	CGCA	2	8	23976	23983	25 %	0 %	25 %	50 %	352681261
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430	NC_016070	TCCC	2	8	24524	24531	0 %	25 %	0 %	75 %	352681261
431	NC_016070	AGCG	2	8	24609	24616	25 %	0 %	50 %	25 %	352681261
432	NC_016070	CTC	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352681261
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436	NC_016070	CGG	2	6	25008	25013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352681261
437	NC_016070	GCTGAG	2	12	25173	25184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	352681262
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454	NC_016070	CAGCG	2	10	26069	26078	20 %	0 %	40 %	40 %	352681262
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